BioLiP

>protein
MDKFRVQGPTRLQGEVTISGAKNAALPILFAALLAEEPVEIQNVPKLKDIDTTMKLLTQLGTKVERDGSVWIDASNVNNF
SAPYDLVKTMRASIWALGPLVARFGQGQVSLPGGCAIGARPVDLHIFGLEKLGAEIKLEEGYVKASVNGRLKGAHIVMDK
VSVGATVTIMSAATLAEGTTIIENAAREPEIVDTANFLVALGAKISGQGTDRITIEGVERLGGGVYRVLPDRIETGTFLV
AAAISGGKIVCRNAQPDTLDAVLAKLREAGADIETGEDWISLDMHGKRPKAVTVRTAPHPAFPTDMQAQFTLLNLVAEGT
GVITETIFENRFMHVPELIRMGAHAEIESNTVICHGVEKLSGAQVMATDLRASASLVLAGCIAEGTTVVDRIYHIDRGYE
RIEDKLRALGANIERVKGE

The query sequence (length=419) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4e7b:A	419	419	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	1a2n:A, 4e7b:B, 4e7b:C, 4e7b:D, 4e7c:A, 4e7c:B, 4e7d:A, 4e7e:A, 4e7e:D, 4e7f:A, 1eyn:A, 3iss:A, 3iss:B, 3iss:C, 3iss:D, 3iss:E, 3iss:F, 3iss:G, 3iss:H, 3iss:I, 3iss:J, 3iss:K, 3iss:L, 3kqa:A, 3kqa:B, 3kqa:C, 3kqa:D, 3kqj:A, 3kr6:A, 3lth:A, 1q3g:A, 1q3g:B, 1q3g:C, 1q3g:D, 1q3g:E, 1q3g:F, 1q3g:G, 1q3g:H, 1q3g:I, 1q3g:J, 1q3g:K, 1q3g:L, 1q3g:W, 1q3g:X, 1q3g:Y, 1q3g:Z, 1ryw:A, 1ryw:B, 1ryw:C, 1ryw:D, 1ryw:E, 1ryw:F, 1ryw:G, 1ryw:H, 3su9:A, 3swa:A, 3swa:B, 3swd:A, 3swd:B, 3swd:C, 3swd:D, 3swd:E, 3swd:F, 3swd:G, 3swd:H, 3swd:I, 3swd:J, 3swd:K, 3swd:L, 3swi:A, 3swq:A, 1uae:A, 3upk:A, 3v4t:A, 3v4t:B, 3v4t:C, 3v4t:D, 3v4t:E, 3v4t:F, 3v4t:G, 3v4t:H, 1ybg:A, 1ybg:B, 1ybg:C, 1ybg:D, 2z2c:A, 2z2c:B, 2z2c:C, 2z2c:D
2	3vcy:A	419	417	0.7995	0.7995	0.8034	0.0	3vcy:B, 3vcy:C, 3vcy:D
3	4r7u:C	419	418	0.8067	0.8067	0.8086	0.0	4r7u:A, 4r7u:B, 4r7u:D
4	2rl1:A	420	420	0.7494	0.7476	0.7476	0.0	2rl2:A, 3swe:A
5	6cn1:A	422	421	0.6301	0.6256	0.6271	0.0	6cn1:B, 6cn1:C, 6cn1:D, 6cn1:E, 6cn1:F, 6cn1:G, 6cn1:H
6	5bq2:A	425	421	0.6158	0.6071	0.6128	0.0	5bq2:B, 5bq2:C, 5bq2:D
7	5u4h:A	420	417	0.5823	0.5810	0.5851	2.43e-175	5u4h:B
8	6q03:A	416	418	0.4988	0.5024	0.5000	1.57e-138	6q0a:A, 6q0y:A, 6q11:A
9	5wi5:A	422	422	0.5107	0.5071	0.5071	8.86e-135	6nkj:A, 6nkj:B, 5wi5:B, 5wi5:C, 5wi5:D
10	8d84:A	420	420	0.4916	0.4905	0.4905	5.87e-118	8d84:B, 8d84:C, 8d84:D, 8d84:E, 8d84:F, 8d84:G, 8d84:H, 8d84:I, 8d84:J, 8d84:K, 8d84:L, 7tb0:A, 7tb0:B, 7tb0:C, 7tb0:D
11	3swg:A	417	419	0.4487	0.4508	0.4487	4.29e-110	2yvw:A
12	1rf4:A	427	424	0.2434	0.2389	0.2406	1.01e-07	1rf4:B, 1rf4:C, 1rf4:D, 1rf6:A, 1rf6:B, 1rf6:C, 1rf6:D
13	1rf4:A	427	254	0.1432	0.1405	0.2362	1.63e-05	1rf4:B, 1rf4:C, 1rf4:D, 1rf6:A, 1rf6:B, 1rf6:C, 1rf6:D
14	2gg6:A	445	441	0.2673	0.2517	0.2540	3.93e-07	2gga:A, 2ggd:A, 2pqb:A, 2pqc:A, 2pqd:A
15	3nvs:A	426	295	0.1718	0.1690	0.2441	7.14e-06
16	3nvs:A	426	190	0.1289	0.1268	0.2842	3.90e-04
17	3slh:D	440	437	0.2506	0.2386	0.2403	1.51e-04	4egr:A, 4egr:B, 4egr:C, 4egr:D, 4egr:E, 4egr:F, 3slh:A, 3slh:B, 3slh:C, 4znd:A
18	2o0b:A	424	183	0.1098	0.1085	0.2514	0.007	2o0d:A, 2o0e:A, 2o0x:A, 2o0z:A
19	8umj:A	443	406	0.2315	0.2190	0.2389	0.085	8umj:B, 8umk:A, 8umk:B, 8uml:A, 8uml:B, 8umm:A, 8umm:B, 8umn:A, 8umn:B
20	4fce:A	441	81	0.0597	0.0567	0.3086	0.58
21	4iug:A	957	200	0.1169	0.0512	0.2450	0.81
22	1yuh:H	218	117	0.0668	0.1284	0.2393	1.4	1yuh:B
23	2oi6:B	452	73	0.0525	0.0487	0.3014	1.6	4aa7:A, 4aa7:B, 1fwy:A, 1fwy:B, 1hv9:A, 1hv9:B, 2oi5:A, 2oi5:B, 2oi6:A, 2oi7:A, 2oi7:B, 3twd:A, 3twd:B
24	3db6:A	287	59	0.0430	0.0627	0.3051	1.7	3d5w:A, 3d5x:A, 3dbe:A
25	7tm5:B	427	52	0.0430	0.0422	0.3462	2.0	7tm5:A, 7tm6:A, 7tm6:B
26	5w81:A	1173	61	0.0501	0.0179	0.3443	2.1
27	4wht:E	208	117	0.0692	0.1394	0.2479	2.8	4wht:A, 4wht:C, 4wht:G, 4wht:I, 4wht:K, 4wht:M, 4wht:O, 4wht:Q, 4wht:S, 4wht:U, 4wht:X, 4why:I, 4why:M, 4why:K, 4why:G
28	3a7a:A	337	78	0.0597	0.0742	0.3205	3.6	3a7a:C, 3a7r:A, 4tvw:A, 4tvw:B, 4tvw:C, 4tvw:D, 4tvy:A, 4tvy:B, 1x2h:A, 1x2h:B
29	7zq3:R	348	117	0.0835	0.1006	0.2991	3.8	7zq3:O, 7zq4:O, 7zq4:R, 7zqk:O, 7zqk:R
30	6skf:BO	148	43	0.0358	0.1014	0.3488	3.8	6skg:BO, 6th6:BO
31	7ney:A	497	52	0.0453	0.0382	0.3654	4.9	7ney:B, 7nf0:A, 7nf0:B, 7nf1:A, 7nf1:B, 7nf2:A, 7nf2:B
32	8v5r:A	944	147	0.0811	0.0360	0.2313	5.2	8g5i:A, 8g5l:A, 8g5m:A, 8g5n:A, 8g5o:A, 8g5p:A, 8t7e:A
33	8v7z:A	1104	62	0.0453	0.0172	0.3065	6.4
34	5uak:A	1139	62	0.0453	0.0167	0.3065	6.6	2bbs:B, 7svr:A, 8v81:A
35	6msm:A	1181	62	0.0453	0.0161	0.3065	6.8	8eig:A, 8eio:A, 8eiq:A, 8fzq:A, 6gjq:A, 6gjq:C, 6gjq:E, 6gjq:G, 6gjs:A, 6gk4:A, 6gk4:D, 6gkd:A, 6gkd:L, 6gkd:F, 6gkd:I, 6gkd:O, 6gkd:R, 8gls:A, 6o1v:A, 6o2p:A, 2pze:A, 2pze:B, 2pzf:A, 2pzf:B, 2pzg:A, 2pzg:B, 7sv7:A, 7svd:A, 5tf7:A, 5tf8:A, 5tfa:A, 5tfb:A, 5tfc:A, 5tfd:A, 5tff:A, 5tfg:A, 5tfi:A, 5tfj:A, 5tgk:A, 8ubr:A, 6wbs:A, 6wbs:B, 6ze1:A
36	8ibv:R	279	65	0.0406	0.0609	0.2615	6.9	8ibu:R
37	6j9f:C	1296	148	0.0907	0.0293	0.2568	7.3
38	2aa9:A	427	52	0.0406	0.0398	0.3269	7.5	2aay:A, 3fjx:A, 3fjz:A, 3fk0:A, 3fk1:A, 1g6s:A, 1g6t:A, 1mi4:A, 2pq9:A, 1q36:A, 2qfq:A, 2qfs:A, 2qft:A, 2qfu:A, 1x8r:A, 1x8t:A
39	8udk:A	1012	66	0.0477	0.0198	0.3030	7.7	5c51:A, 5c52:A, 5c53:A, 4ztu:A, 4ztz:A
40	1igt:B	444	129	0.0740	0.0698	0.2403	8.8	1igt:D, 2otu:B, 2otu:D, 2otu:F, 2otu:H, 2otw:B, 2otw:D, 2qhr:H, 6uqc:C, 6uqc:D, 6uqc:F, 5vaa:A, 5vaa:B, 3zo0:A

[Back]