BioLiP

>protein
MDFRIGQGYDVHQLVPGRPLIIGGVTIPYERGLLGSDADVLLHAITDALFGAAALGDIGRHFSDTDKGADSRALLRECAS
RVAQAGFAIRNVDSTIIAQAPKLAPHIDAMRANIAADLDLPLDRVNVKAKTNEKLGYLGRGEGIEAQAAALVVR

The query sequence (length=154) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3iew:A	160	158	1.0000	0.9625	0.9747	1.06e-104	3f0d:A, 3f0d:C, 3f0d:D, 3f0d:E, 3f0d:F, 3f0e:A, 3f0e:B, 3f0e:C, 3f0f:A, 3f0f:B, 3f0f:C, 3f0g:A, 3f0g:B, 3f0g:C, 3f0g:D, 3f0g:E, 3f0g:F, 3ieq:A, 3ieq:C, 3ieq:B, 3iew:C, 3iew:B, 3ike:A, 3ike:B, 3ike:C, 3ikf:A, 3ikf:B, 3ikf:C, 3jvh:A, 3jvh:B, 3jvh:C, 3k14:A, 3k14:B, 3k14:C, 3k2x:C, 3k2x:B, 3ke1:A, 3ke1:B, 3ke1:C, 5l03:A, 5l03:B, 5l03:C, 5l12:A, 5l12:B, 5l12:C, 3mbm:A, 3mbm:C, 6mwf:A, 6mwf:B, 6mwf:C, 6mwi:A, 6mwi:B, 6mwi:C, 6mwj:A, 6mwj:B, 6mwj:C, 6mwk:A, 6mwk:B, 6mwk:C, 6nmo:A, 6nmo:B, 6nmo:C, 3p0z:A, 3p0z:C, 3p0z:B, 3p10:A, 3p10:C, 3p10:B, 3q8h:A, 3q8h:B, 3q8h:C, 3qhd:A, 3qhd:C, 3qhd:B, 6v3m:A, 6v3m:B, 6v3m:C
2	4c8e:A	161	158	0.9026	0.8634	0.8797	4.86e-94	4c8e:C, 4c8e:B, 4c8g:A, 4c8g:C, 4c8g:B, 4c8i:A, 4c8i:B, 4c8i:C, 3f0d:B, 3k2x:A, 3mbm:B
3	5iwx:A	158	156	0.6039	0.5886	0.5962	1.44e-59	5iwx:B, 5iwx:C, 5iwx:D, 5iwx:E, 5iwx:F, 5iwy:A, 5iwy:C, 5iwy:B, 5iwy:D, 5iwy:E, 5iwy:F
4	1jn1:A	157	155	0.6169	0.6051	0.6129	2.51e-59	1jn1:B, 1jn1:C, 1vh8:A, 1vh8:B, 1vh8:C, 1vh8:D, 1vh8:E, 1vh8:F, 1vha:A, 1vha:B, 1vha:C, 1vha:D, 1vha:E, 1vha:F
5	5b8f:C	164	155	0.5974	0.5610	0.5935	6.56e-58	5b8f:A, 5b8f:B
6	3fpi:A	161	158	0.6169	0.5901	0.6013	8.14e-57
7	1t0a:A	158	156	0.5844	0.5696	0.5769	1.27e-56	1t0a:B, 1t0a:C
8	3esj:A	162	158	0.6234	0.5926	0.6076	1.53e-54	2amt:A, 2amt:B, 2amt:C, 2amt:D, 2amt:F, 2amt:E, 3elc:A, 3elc:B, 3elc:C, 3eor:A, 3ern:A, 3ern:B, 3ern:C, 3ern:D, 3ern:E, 3ern:F, 3fba:A, 3ghz:A, 3ghz:B, 3ghz:C, 1gx1:A, 1gx1:C, 1gx1:B, 2gzl:A, 1h47:A, 1h47:B, 1h47:C, 1h47:D, 1h47:E, 1h47:F, 1h48:A, 1h48:F, 1h48:C, 1h48:B, 1h48:D, 1h48:E, 1jy8:A, 1knj:A, 1knk:A, 3t80:A, 3t80:B, 3t80:C, 3t80:D, 3t80:E, 3t80:F, 1u3l:A, 1u3p:A, 1u40:A, 1u43:A, 1yqn:A
9	3re3:B	144	155	0.4610	0.4931	0.4581	1.13e-44
10	2pmp:A	160	158	0.4610	0.4437	0.4494	3.11e-42
11	1w55:A	369	143	0.4545	0.1897	0.4895	2.06e-38	1w57:A
12	5esv:G	187	120	0.4481	0.3690	0.5750	1.39e-34	5esv:E, 5esv:F
13	8xkf:C	377	151	0.3766	0.1538	0.3841	7.45e-29	8xhu:A, 8xhu:B, 8xhu:C, 8xkf:A, 8xkf:B, 8xkf:D, 8xkf:F, 8xkf:E
14	3b6n:A	150	158	0.3701	0.3800	0.3608	1.25e-24
15	1iv2:A	150	136	0.3636	0.3733	0.4118	1.06e-23	1iv2:C, 1iv2:B, 1iv2:D, 1iv2:F, 1iv2:E, 1iv3:A, 1iv3:B, 1iv3:C, 1iv3:D, 1iv3:E, 1iv3:F, 1iv4:A, 1iv4:B, 1iv4:C, 1iv4:D, 1iv4:E, 1iv4:F
16	4c81:A	156	154	0.3571	0.3526	0.3571	3.86e-23	4c82:A
17	2uzh:C	155	146	0.3506	0.3484	0.3699	6.75e-18	2uzh:A, 2uzh:B
18	8jjr:r	131	50	0.1039	0.1221	0.3200	0.22
19	8sq0:A	1402	36	0.1039	0.0114	0.4444	0.52	8sq0:B, 8sql:A, 8sqm:A
20	7mqa:SP	2485	48	0.1039	0.0064	0.3333	1.1
21	4wyw:A	479	98	0.1623	0.0522	0.2551	1.2	8c1n:A, 8c1n:B, 8c2p:A, 2d7s:A, 2e9r:X, 2e9t:A, 2e9t:D, 2e9z:A, 2ec0:A, 2ec0:D, 2f8e:X, 6gvy:A, 4iqx:A, 5jxs:A, 3klv:A, 3kmq:A, 3kms:A, 3kna:A, 3koa:A, 5n95:A, 3nl0:A, 3nma:A, 1wne:A, 4wyl:A, 4wzm:A, 4wzq:A, 4x2b:A
22	7voj:A	400	105	0.1818	0.0700	0.2667	1.4	7voj:B
23	8f4b:A	1182	24	0.0779	0.0102	0.5000	6.5
24	6bhu:A	1328	24	0.0779	0.0090	0.5000	6.5	5uja:A, 6uy0:A
25	2uz3:B	207	62	0.1039	0.0773	0.2581	9.3	2b8t:A, 2b8t:B, 2b8t:C, 2b8t:D, 2uz3:A, 2uz3:C, 2uz3:D

[Back]