BioLiP

>protein
MDEIDLRILKILQYNAKYSLDEIAREIRIPKSTLSYRIKKLEKDGVIKGYYAYINPASLNLDYIVITSVKAKYGKNYHVE
LGNKLAQIPGVWGVYFVLGDNDFIVMARYKTREEFMEKFLERVMSIPEVERTSAQVVVKIIKESPNIVIF

The query sequence (length=150) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2e7w:A	150	150	0.9933	0.9933	0.9933	2.39e-106	2e7x:A, 2efp:A, 2efq:A, 2pmh:A, 2pn6:A, 2yx4:A, 2yx7:A
2	2cyy:A	151	149	0.3933	0.3907	0.3960	2.33e-25	2e1c:A, 2zny:A, 2zny:C, 2zny:E, 2zny:B, 2zny:D, 2zny:F, 2zny:H, 2zny:G, 2znz:A, 2znz:B, 2znz:C, 2znz:D, 2znz:E, 2znz:F, 2znz:G, 2znz:H
3	7fby:A	153	142	0.2933	0.2876	0.3099	1.74e-16
4	2p5v:G	158	147	0.2333	0.2215	0.2381	2.91e-15	2p5v:A, 2p5v:B, 2p5v:C, 2p5v:E, 2p5v:D, 2p5v:F, 2p5v:H, 2p6s:A, 2p6s:G, 2p6s:B, 2p6s:D, 2p6s:C, 2p6s:F, 2p6s:E, 2p6s:H, 2p6t:A, 2p6t:G, 2p6t:B, 2p6t:D, 2p6t:C, 2p6t:F, 2p6t:E, 2p6t:H
5	2vbw:A	147	141	0.2267	0.2313	0.2411	7.46e-10	2vbx:A, 2vby:A, 2vbz:A, 2vc0:A, 2vc1:A, 2w24:A
6	2cg4:A	149	139	0.2067	0.2081	0.2230	1.63e-09	2cg4:B
7	8q7d:p	441	128	0.2133	0.0726	0.2500	0.81	8qek:p, 8qek:D
8	4img:A	293	64	0.1600	0.0819	0.3750	0.85	4imf:A, 4imf:B, 4img:B
9	8ci5:A	1258	87	0.1533	0.0183	0.2644	1.3
10	4lb5:B	63	41	0.0733	0.1746	0.2683	1.5	4lb5:A, 4lb6:B
11	8df7:A	850	63	0.1400	0.0247	0.3333	1.9	8df7:B, 8df8:A, 8df8:B, 8df9:B, 8dfb:A, 8dfb:B, 4gfj:A, 3m6k:B, 3m6z:A, 3m6z:B
12	8df9:A	781	63	0.1400	0.0269	0.3333	1.9
13	2zts:C	226	63	0.1133	0.0752	0.2698	2.3	2zts:A, 2zts:B
14	7n7r:B	348	83	0.1533	0.0661	0.2771	3.5	7k0r:A, 7k0r:B, 7k0r:C, 7k0r:D, 7k0r:E, 7k0r:F, 7k1l:A, 7k1l:B, 7k1o:A, 7k1o:B, 7k1o:C, 7n06:A, 7n06:B, 7n06:C, 7n06:D, 7n06:E, 7n06:F, 7n33:A, 7n33:B, 7n33:C, 7n33:D, 7n33:E, 7n33:F, 7n7u:A, 7n7u:B, 7n7w:B, 7n7y:A, 7n7y:B, 7n83:A, 7n83:B, 5s6x:A, 5s6x:B, 5s6y:A, 5s6y:B, 5s6z:A, 5s6z:B, 5s71:B, 5s72:A, 5sa4:B, 5sa5:B, 5sa6:A, 5sa6:B, 5sa7:A, 5sa8:A, 5sa8:B, 5sa9:B, 5saa:A, 5saa:B, 5sab:B, 5sac:B, 5sad:B, 5sae:A, 5sae:B, 5saf:A, 5saf:B, 5sag:B, 5sah:A, 5sah:B, 5sai:B, 7tj2:A, 7tj2:E, 7tqv:A, 7tqv:C, 7tqv:E, 8ud3:B, 8ud3:A, 8ud4:B, 8ud4:A, 8ud5:D, 8ud5:B, 8ud5:A, 6vww:A, 6wlc:A, 6wlc:B, 6wxc:A, 6wxc:B, 6x1b:A, 6x1b:B, 6x4i:A, 6x4i:B
15	3p0f:A	293	54	0.0867	0.0444	0.2407	4.0	3p0e:A, 3p0e:B, 3p0e:C, 3p0e:D, 3p0e:E, 3p0e:F, 2xrf:A, 2xrf:B, 2xrf:C
16	3f8f:A	114	27	0.0733	0.0965	0.4074	4.2	6do0:A, 6do0:B, 3f8c:A, 3f8f:B, 6fuu:A, 7q34:A, 7q34:B, 7q34:C, 7qz6:A, 7qz6:B, 7qz7:A, 7qz7:B, 7qz8:A, 7qz8:B, 6r1l:A, 6vwe:A, 6vwe:B, 7xuq:A, 8zf1:A
17	6jrs:A	3488	93	0.1933	0.0083	0.3118	4.3	6jrs:D, 6jrs:G, 6jrs:J
18	7qe7:N	682	41	0.0733	0.0161	0.2683	5.4	8s4g:N
19	8pkp:N	652	41	0.0733	0.0169	0.2683	5.5	9gaw:N
20	1dxl:A	467	45	0.0867	0.0278	0.2889	5.9	1dxl:B, 1dxl:C, 1dxl:D
21	5f7q:E	396	40	0.0733	0.0278	0.2750	6.9	5f7p:E, 5f7p:A, 5f7q:C, 5f7q:J, 5f7q:L, 5f7r:E, 5f7r:A
22	3pps:A	564	68	0.1267	0.0337	0.2794	7.2	3pps:B, 3pps:C, 3pps:D
23	5gqv:A	755	64	0.1200	0.0238	0.2812	7.4	5gqx:A, 5gqy:A, 5gr1:A, 5gr4:A
24	6tm5:N	676	41	0.0733	0.0163	0.2683	7.8
25	8cvo:G	214	37	0.1000	0.0701	0.4054	7.9	8crx:G
26	4urs:A	162	51	0.1000	0.0926	0.2941	8.7	4urg:A, 4urs:B
27	7sx3:A	1386	17	0.0667	0.0072	0.5882	8.7	7sx4:A
28	3zpl:E	160	32	0.0667	0.0625	0.3125	9.6	3zpl:A, 3zpl:B, 3zpl:F

[Back]