BioLiP

>protein
MDEFEMIKRNTSEIISEEELREVLKKDEKSAHIGFEPSGKIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIILLADLTAYLNQKGELD
EIRKIGDYNKKVFEAMGLKAKYVYGSEFQLDKDYTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNHAH
YRGVDVAVGGMEQRKIHMLARELLPKKVVCIHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAVDDSPEEIRAKIKKAYCPAGVVEGNP
IMEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILEPIRKRLLEHHH

The query sequence (length=311) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nx2:A	313	311	0.9646	0.9585	0.9646	0.0	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
2	2cyb:A	319	317	0.5595	0.5455	0.5489	4.54e-119	2cyb:B
3	2cyc:A	371	352	0.4309	0.3612	0.3807	1.66e-59	2cyc:B
4	7rou:A	335	322	0.3666	0.3403	0.3540	1.08e-52	1q11:A, 4q93:A, 4qbt:A, 5thh:A
5	2dlc:X	339	330	0.3441	0.3156	0.3242	1.74e-52
6	7sc6:A	349	325	0.3730	0.3324	0.3569	1.15e-50	7scq:A, 7scq:B
7	7ror:B	362	316	0.3601	0.3094	0.3544	4.31e-48	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
8	5usf:A	682	335	0.3119	0.1422	0.2896	1.06e-31	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
9	5usf:A	682	250	0.2283	0.1041	0.2840	2.40e-11	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
10	3p0j:A	657	338	0.3183	0.1507	0.2929	5.40e-30	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
11	3p0j:A	657	247	0.2219	0.1050	0.2794	1.71e-11	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
12	2j5b:A	321	295	0.2733	0.2648	0.2881	2.36e-23	2j5b:B
13	1h3f:B	406	248	0.2154	0.1650	0.2702	3.25e-16	1h3f:A
14	1h3e:A	427	258	0.2251	0.1639	0.2713	8.41e-15
15	6bqz:A	215	209	0.1801	0.2605	0.2679	4.72e-14	6bqz:B
16	2a4m:C	331	303	0.2444	0.2296	0.2508	8.23e-11	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
17	3a04:A	367	212	0.1994	0.1689	0.2925	1.46e-10	3a05:A
18	6ncr:A	342	310	0.2476	0.2251	0.2484	2.02e-08	6ncr:B
19	4j75:A	374	252	0.2186	0.1818	0.2698	6.28e-07	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
20	2g36:A	322	233	0.1897	0.1832	0.2532	7.21e-06
21	4jfa:C	348	239	0.1897	0.1695	0.2469	8.82e-05
22	2yy5:B	346	326	0.2476	0.2225	0.2362	9.96e-05	2yy5:A, 2yy5:C, 2yy5:D
23	3jxe:B	363	211	0.1608	0.1377	0.2370	1.77e-04	3jxe:A
24	5ekd:A	327	233	0.1897	0.1804	0.2532	0.001	5ekd:B
25	3tzl:B	320	245	0.1865	0.1812	0.2367	0.023	3tzl:A
26	3ts1:A	317	64	0.0579	0.0568	0.2812	0.042	4ts1:A, 4ts1:B, 1tya:E, 1tyb:E, 1tyd:E
27	6hb5:B	417	225	0.1576	0.1175	0.2178	0.17	7ap3:A, 7ap3:B, 6hb5:A, 6hb6:A, 6hb6:B, 6hb7:A, 6hb7:B, 6i5y:A, 6i5y:B, 4oud:A, 1vbm:A, 1vbm:B, 1vbn:A, 1vbn:B, 6wn2:A, 6wn2:B, 1wq3:A, 1wq4:A, 1x8x:A, 2yxn:A
28	6dfu:A	332	303	0.2090	0.1958	0.2145	0.94	6dfu:B
29	6otj:B	431	57	0.0514	0.0371	0.2807	1.7	6otj:A
30	3ct4:A	318	45	0.0514	0.0503	0.3556	1.7	3ct4:B, 3ct4:C
31	3kws:A	265	62	0.0707	0.0830	0.3548	2.0	3kws:B
32	7cms:A	328	307	0.2219	0.2104	0.2248	2.9	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
33	3ziu:A	621	85	0.0740	0.0370	0.2706	2.9	3ziu:B
34	5ijx:A	365	188	0.1158	0.0986	0.1915	2.9
35	4v6w:Ch	123	31	0.0386	0.0976	0.3871	3.7	6xu6:Ch, 6xu7:Ch, 6xu8:Ch
36	4nv0:B	300	55	0.0643	0.0667	0.3636	3.9	4nv0:A, 4nwi:A, 4nwi:B
37	2pid:B	324	204	0.1479	0.1420	0.2255	6.0	2pid:A, 3zxi:A, 3zxi:B
38	4eg6:B	515	49	0.0482	0.0291	0.3061	6.2	4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
39	8i1w:B	333	297	0.2154	0.2012	0.2256	6.7	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
40	5ko7:B	200	77	0.0643	0.1000	0.2597	7.1
41	6tm0:A	811	65	0.0579	0.0222	0.2769	7.5	6tlz:A, 6tlz:B, 6tm0:B

[Back]