BioLiP

>protein
MDEFEMIKRNTSEIISEEELREVLKKDEKSAGIGFEPSGKIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIIELADLHAYLNQKGELD
EIRKIGDYNKKVFEAMGLKAKYVYGSEWMLDKDYTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNSIH
YKGVDVAVGGMEQRKIHMLARELLPKKVVCIHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAVDDSPEEIRAKIKKAYCPAGVVEGNP
IMEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILEPIRKRLLEHH

The query sequence (length=310) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nx2:A	313	310	0.9710	0.9617	0.9710	0.0	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
2	2cyb:A	319	317	0.5613	0.5455	0.5489	8.06e-119	2cyb:B
3	2cyc:A	371	352	0.4355	0.3639	0.3835	3.37e-60	2cyc:B
4	2dlc:X	339	330	0.3387	0.3097	0.3182	2.38e-51
5	7rou:A	335	322	0.3645	0.3373	0.3509	8.98e-51	1q11:A, 4q93:A, 4qbt:A, 5thh:A
6	7sc6:A	349	328	0.3710	0.3295	0.3506	2.86e-50	7scq:A, 7scq:B
7	7ror:B	362	315	0.3645	0.3122	0.3587	5.12e-48	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
8	5usf:A	682	337	0.3161	0.1437	0.2908	7.53e-32	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
9	5usf:A	682	250	0.2258	0.1026	0.2800	2.13e-10	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
10	3p0j:A	657	340	0.3226	0.1522	0.2941	3.36e-30	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
11	3p0j:A	657	218	0.2032	0.0959	0.2890	5.50e-11	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
12	2j5b:A	321	291	0.2677	0.2586	0.2852	1.24e-22	2j5b:B
13	1h3f:B	406	249	0.2226	0.1700	0.2771	1.01e-15	1h3f:A
14	1h3e:A	427	258	0.2226	0.1616	0.2674	1.26e-14
15	6bqz:A	215	210	0.1871	0.2698	0.2762	2.24e-13	6bqz:B
16	2a4m:C	331	303	0.2452	0.2296	0.2508	4.08e-11	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
17	6ncr:A	342	307	0.2548	0.2310	0.2573	1.49e-09	6ncr:B
18	3a04:A	367	212	0.1903	0.1608	0.2783	3.66e-09	3a05:A
19	4j75:A	374	245	0.2129	0.1765	0.2694	1.80e-07	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
20	2g36:A	322	224	0.1839	0.1770	0.2545	2.39e-07
21	2yy5:B	346	326	0.2548	0.2283	0.2423	8.02e-07	2yy5:A, 2yy5:C, 2yy5:D
22	5ekd:A	327	232	0.1935	0.1835	0.2586	9.02e-06	5ekd:B
23	4jfa:C	348	232	0.1839	0.1638	0.2457	2.44e-05
24	3jxe:B	363	221	0.1645	0.1405	0.2308	1.14e-04	3jxe:A
25	3tzl:B	320	245	0.1935	0.1875	0.2449	0.002	3tzl:A
26	6dfu:A	332	301	0.2129	0.1988	0.2193	0.11	6dfu:B
27	6b7o:A	313	169	0.1323	0.1310	0.2426	0.28
28	7cms:A	328	306	0.2226	0.2104	0.2255	0.35	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
29	3sz3:A	341	298	0.2065	0.1877	0.2148	0.47
30	8i1w:B	333	295	0.1935	0.1802	0.2034	0.50	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
31	3ct4:A	318	45	0.0516	0.0503	0.3556	1.4	3ct4:B, 3ct4:C
32	6tm0:A	811	65	0.0581	0.0222	0.2769	2.3	6tlz:A, 6tlz:B, 6tm0:B
33	3ziu:A	621	80	0.0742	0.0370	0.2875	3.1	3ziu:B
34	1up7:A	414	109	0.1000	0.0749	0.2844	3.4	1up6:A, 1up6:C, 1up6:G, 1up7:B, 1up7:C, 1up7:D, 1up7:E, 1up7:F, 1up7:G, 1up7:H
35	4v6w:Ch	123	31	0.0387	0.0976	0.3871	3.6	6xu6:Ch, 6xu7:Ch, 6xu8:Ch
36	7bkb:B	296	91	0.0839	0.0878	0.2857	4.2	7bkb:b, 7bkc:B, 7bkc:b, 7bkd:B, 7bkd:b, 7bke:B, 7bke:b
37	4nv0:B	300	55	0.0645	0.0667	0.3636	4.5	4nv0:A, 4nwi:A, 4nwi:B
38	5ko7:B	200	77	0.0645	0.1000	0.2597	7.7

[Back]