BioLiP

>protein
MDDQGCPRCKTTKYRNPSLKLMVNVCGHTLCESCVDLLFVRGAGNCPECGTPLRKSNFRVQLFEDPTVDKEVEIRKKVLK
IYNKREEDFPSLREYNDFLEEVEEIVFNLTNNVDLDNTKKKMEIYQKENKDVIQKNKLKLTREQEELEE

The query sequence (length=149) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7lbm:d	275	149	1.0000	0.5418	1.0000	4.04e-107	8byq:7
2	7enc:0	306	149	1.0000	0.4869	1.0000	4.75e-107	1g25:A, 8gxq:HD, 8gxs:HD, 6nmi:H, 7nvw:3, 7nvx:3, 7nvy:3, 7nvz:3, 8wak:0, 8wal:0, 8wan:0, 8wao:0, 8wap:0, 8waq:0, 8war:0, 8was:0
3	7nvr:3	214	149	1.0000	0.6963	1.0000	6.82e-107
4	7egb:0	236	149	1.0000	0.6314	1.0000	7.61e-107	7egc:0
5	6gym:3	138	132	0.4027	0.4348	0.4545	2.17e-34	8cen:3, 8ceo:3, 7ml0:3, 7ml1:3, 7ml2:3, 7ml3:3, 7o4i:3, 7o4j:3, 7o4k:3, 7o4l:3, 7o72:3, 7o73:3, 7o75:3, 5oqj:3, 5oqm:3, 7zs9:3, 7zsa:3, 7zsb:3
6	6yxe:A	89	75	0.1745	0.2921	0.3467	0.021	6yxe:B
7	2ecw:A	85	42	0.0940	0.1647	0.3333	0.10
8	7bbd:B	160	34	0.0738	0.0688	0.3235	0.56	8a58:C, 8a58:D, 8c07:I, 8f1f:C, 8f1f:c, 6fga:A, 6fga:B, 6fga:C, 6fga:D, 6fga:E, 6fga:F, 6fga:G, 6fga:H, 5m93:B, 5m93:C, 7nbb:C, 5o44:E, 6s53:B, 6s53:A, 6s53:H, 6s53:G, 3zlz:B
9	7xyz:B	456	45	0.0940	0.0307	0.3111	1.3	7xv2:A, 7xyy:A, 7xyy:B, 7xyz:A, 7xyz:C, 7xyz:D, 7xz0:A, 7xz0:B, 7xz1:A, 7xz1:B, 7xz2:A, 7xz2:B, 7xz2:C, 7xz2:D
10	6l8n:A	810	57	0.1208	0.0222	0.3158	1.4
11	3fl2:A	116	35	0.0805	0.1034	0.3429	1.4
12	4v3p:Ll	94	45	0.1007	0.1596	0.3333	1.8	8ip8:UA, 8ipa:UA, 8ipb:UA, 8jiv:Cj, 4v7e:Cj
13	2ecv:A	85	39	0.0738	0.1294	0.2821	2.0
14	8p5d:LJJ	89	83	0.1275	0.2135	0.2289	2.2	8p60:LJJ, 8p60:KJJ, 7qca:LJJ
15	5olm:B	132	24	0.0604	0.0682	0.3750	2.6	5jpx:A, 5olm:A
16	2egp:A	79	31	0.0738	0.1392	0.3548	2.7
17	8bal:F	348	34	0.0671	0.0287	0.2941	3.1	8bal:A, 8bal:C, 8bal:D, 8bal:E
18	2ecy:A	66	24	0.0671	0.1515	0.4167	3.1
19	2ysl:A	73	36	0.0872	0.1781	0.3611	3.5	2ysj:A
20	3pih:A	836	23	0.0738	0.0132	0.4783	4.2
21	4v6w:Cj	92	45	0.0940	0.1522	0.3111	4.5	6xu8:Cj
22	4s3o:C	95	28	0.0738	0.1158	0.3929	4.6	4s3o:F
23	6stu:A	204	37	0.0872	0.0637	0.3514	5.0	8ofs:A, 8ofs:B, 8ofs:C
24	7oik:A	4426	28	0.0671	0.0023	0.3571	5.3	7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
25	2ct2:A	88	48	0.1074	0.1818	0.3333	5.5	5fey:A, 5fey:B
26	6zu5:LO0	196	76	0.1678	0.1276	0.3289	6.2
27	8cwp:A	327	42	0.0940	0.0428	0.3333	6.7
28	7lvy:A	431	26	0.0671	0.0232	0.3846	7.7	7mco:A, 7mco:B
29	2pv3:A	284	49	0.1007	0.0528	0.3061	8.6	2pv1:A, 2pv2:A, 2pv2:B, 2pv2:C, 2pv2:D, 2pv3:B
30	3zni:A	390	27	0.0604	0.0231	0.3333	8.9	4a49:A, 5axi:B, 5axi:A, 5axi:C, 9fqh:A, 9fqi:A, 9fqj:A, 9fqj:B, 8gcy:A, 2ldr:A, 3pfv:A, 3pfv:B, 8qng:A, 8qnh:A, 8qni:A, 8qtg:A, 8qth:A, 8qtj:A, 8qtk:A, 8vw4:A, 8vw4:B, 8vw5:A, 8vw5:B, 3zni:E, 3zni:I, 3zni:M
31	6sc6:A	365	53	0.0940	0.0384	0.2642	9.6	5edv:A, 5edv:B, 6gzy:A, 6gzy:B, 6kc5:B, 6kc6:A, 6kc6:C, 6kc6:E, 6kc6:G, 6kc6:I, 6kc6:K, 4ljo:A, 4ljp:A, 4ljq:B, 4ljq:C, 4ljq:A, 4ljq:D, 6sc5:A, 6sc7:A, 6sc8:A, 6sc9:A, 7v8f:B, 7v8g:D, 7v8g:C
32	4xxk:A	149	83	0.1275	0.1275	0.2289	9.8	4xxi:A, 4xxi:B, 4xxk:B

[Back]