Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MAVGACVLCNSQTSLRCGACIRRPFLCCKCCYDHVISTSHKLVLSVNPYVCNAPGCDVTDVTQLYLGGMSYYCKSHKPPI
SFPLCANGQVFGLYKNTCVGSDNVTDFNAIATCDWTNAGDYILANTCTERLKLFAAETLKATEETFKLSYGIATVREVLS
DRELHLSWEVGKPRPPLNRNYVFTGYRVTKNSKVQIGEYTFEKGAVVYRGTTTYKLNVGDYFVLTSHTVMPLSAPTLVPQ
EHYVRITGLYPTLNISDEFSSNVANYQKVGMQKYSTLQGPPGTGKSHFAIGLALYYPSARIVYTACSHAAVDALCEKALK
YLPIDKCSRIIPARARVECFDKFKVNSTLEQYVFCTVNALPETTADIVVFDEISMATNYDLSVVNARLRAKHYVYIGDPA
QLPAPRTLLTKGTLEPEYFNSVCRLMKTIGPDMFLGTCRRCPAEIVDTVSALVYDNKLKAHKDKSAQCFKMFYKGVITHD
VSSAINRPQIGVVREFLTRNPAWRKAVFISPYNSQNAVASKILGLPTQTVDSSQGSEYDYVIFTQTTETAHSCNVNRFNV
AITRAKVGILCIMSDRDLYDKLQFTSLEIP

The query sequence (length=590) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6jyt:A 597 593 0.9949 0.9832 0.9899 0.0 7cxm:E, 7cxm:F, 7cxn:E, 7cxn:F, 7cyq:F, 7cyq:E, 7egq:E, 7egq:R, 7egq:F, 7egq:S, 7eiz:E, 7eiz:F, 8gw1:E, 8gw1:F, 8gwb:F, 8gwb:E, 8gwe:F, 8gwe:E, 8gwf:F, 8gwf:E, 8gwg:F, 8gwg:E, 8gwi:F, 8gwi:E, 8gwk:E, 8gwk:F, 8gwm:E, 8gwm:F, 8gwn:F, 8gwn:E, 8gwo:F, 8gwo:E, 6jyt:B, 7krn:E, 7kro:E, 7kro:F, 7nio:A, 7nio:E, 7nn0:A, 7nn0:B, 7nn0:C, 7nn0:D, 7nng:B, 7rdx:E, 7rdx:F, 7rdy:E, 7rdy:F, 7rdz:E, 7rdz:F, 7re0:E, 7re0:F, 7re1:E, 7re1:F, 7re2:E, 7re3:E, 7re3:F, 7re3:K, 7re3:L, 5rl6:B, 5rl7:B, 5rl8:B, 5rl9:B, 5rlb:B, 5rlc:B, 5rld:B, 5rle:B, 5rlf:B, 5rlg:B, 5rlh:B, 5rli:B, 5rlj:B, 5rlk:B, 5rll:B, 5rlm:B, 5rln:B, 5rlo:B, 5rlp:B, 5rlq:B, 5rlr:B, 5rls:B, 5rlt:B, 5rlu:B, 5rlv:B, 5rlw:B, 5rly:B, 5rlz:B, 5rm0:B, 5rm1:B, 5rm2:B, 5rm3:B, 5rm4:B, 5rm5:B, 5rm6:B, 5rm7:B, 5rm8:B, 5rm9:B, 5rma:B, 5rmb:B, 5rmc:B, 5rmd:B, 5rme:B, 5rmf:B, 5rmg:B, 5rmh:B, 5rmi:B, 5rmj:B, 5rmk:B, 5rml:B, 5rmm:B, 5rob:B, 6xez:E, 6xez:F, 6zsl:B
2 7nng:A 572 588 0.9678 0.9983 0.9711 0.0 5rl6:A, 5rl7:A, 5rl8:A, 5rl9:A, 5rlb:A, 5rlc:A, 5rld:A, 5rle:A, 5rlf:A, 5rlg:A, 5rlh:A, 5rli:A, 5rlj:A, 5rlk:A, 5rll:A, 5rlm:A, 5rln:A, 5rlo:A, 5rlp:A, 5rlq:A, 5rlr:A, 5rls:A, 5rlt:A, 5rlu:A, 5rlv:A, 5rlw:A, 5rly:A, 5rlz:A, 5rm0:A, 5rm1:A, 5rm2:A, 5rm3:A, 5rm4:A, 5rm5:A, 5rm6:A, 5rm7:A, 5rm8:A, 5rm9:A, 5rma:A, 5rmb:A, 5rmc:A, 5rmd:A, 5rme:A, 5rmf:A, 5rmg:A, 5rmh:A, 5rmi:A, 5rmj:A, 5rmk:A, 5rml:A, 5rmm:A, 5rob:A, 6zsl:A
3 5wwp:B 591 590 0.7102 0.7090 0.7102 0.0
4 5wwp:A 515 364 0.4390 0.5029 0.7115 0.0
5 5wwp:A 515 146 0.1881 0.2155 0.7603 2.07e-75
6 6i59:A 682 399 0.1593 0.1378 0.2356 4.92e-07 5mzn:A
7 4b3g:A 614 247 0.1034 0.0993 0.2470 2.79e-04 4b3g:B
8 4pj3:A 1335 105 0.0542 0.0240 0.3048 0.007 7a5p:U, 6icz:Q, 6id1:Q, 7w59:Q, 7w5a:Q, 7w5b:Q, 5xjc:Q
9 4pj3:A 1335 52 0.0305 0.0135 0.3462 0.057 7a5p:U, 6icz:Q, 6id1:Q, 7w59:Q, 7w5a:Q, 7w5b:Q, 5xjc:Q
10 2xzl:A 756 110 0.0508 0.0397 0.2727 0.007
11 2xzl:A 756 242 0.0915 0.0714 0.2231 0.016
12 2wjy:A 773 64 0.0322 0.0246 0.2969 0.15 2gjk:A, 2gk6:A, 2gk6:B, 2gk7:A, 8rxb:E, 8rxb:A, 8rxb:D, 8rxb:I, 8rxb:L, 8rxb:P, 2wjv:A, 2wjv:B, 2xzo:A
13 2wjy:A 773 68 0.0407 0.0310 0.3529 2.7 2gjk:A, 2gk6:A, 2gk6:B, 2gk7:A, 8rxb:E, 8rxb:A, 8rxb:D, 8rxb:I, 8rxb:L, 8rxb:P, 2wjv:A, 2wjv:B, 2xzo:A
14 8ftm:B 731 47 0.0305 0.0246 0.3830 0.17 8ftm:A
15 6lkx:A 441 62 0.0390 0.0522 0.3710 0.41 6jdr:A, 6jds:A, 6jdu:A, 6lkx:B
16 7ykk:E 735 72 0.0424 0.0340 0.3472 0.65 7nku:A, 7nku:F, 7nku:B, 7nku:C, 7nku:D, 7nku:E, 7wbb:A, 7wbb:B, 7wbb:D, 7wbb:E, 7wbb:C, 7wd3:A, 7wd3:B, 7wd3:C, 7wd3:D, 7wd3:E, 7wd3:F, 7ykk:D, 7ykk:F, 7ykk:A, 7ykk:B, 7ykk:C, 7ykl:F, 7ykl:A, 7ykl:B, 7ykl:C, 7ykl:D, 7ykl:E, 7ykt:F, 7ykt:A, 7ykt:B, 7ykt:C, 7ykt:D, 7ykt:E, 7ykz:D, 7ykz:C, 7ykz:F, 7ykz:B, 7ykz:E, 7ykz:A, 7z11:A, 7z11:B, 7z11:C, 7z11:D, 7z11:F, 7z11:E, 7z34:w, 7z34:m, 7z34:n, 7z34:t, 7z34:Aa, 7z34:x
17 7wbb:F 699 72 0.0424 0.0358 0.3472 0.67
18 7wfg:K 167 81 0.0322 0.1138 0.2346 0.77 7wg5:K
19 2dhr:A 458 52 0.0305 0.0393 0.3462 1.1 2dhr:B, 2dhr:C, 2dhr:D, 2dhr:E, 2dhr:F, 4eiw:A, 4eiw:B, 4eiw:C, 4eiw:D, 4eiw:E, 4eiw:F, 1iy0:A, 1iy1:A
20 5vqa:A 368 175 0.0678 0.1087 0.2286 1.4 5wc2:A
21 4etl:A 277 96 0.0458 0.0975 0.2812 2.0 4esm:A, 4jpx:A, 4jpy:A, 1ltv:A, 1ltz:A, 4q3w:A, 4q3x:A, 4q3y:A, 4q3z:A, 3tcy:A, 3tk2:A, 3tk4:A
22 4yp9:B 342 39 0.0237 0.0409 0.3590 2.1 2hj9:A, 2hj9:B, 1jx6:A, 4yp9:A, 4yr7:A, 4yr7:B, 4yrz:A, 4yrz:B
23 8d33:A 974 63 0.0305 0.0185 0.2857 2.3 8d37:A, 8d3r:A, 8d42:A, 8udl:A, 8v54:A
24 3c8v:C 465 90 0.0373 0.0473 0.2444 2.9
25 8q4d:L 247 51 0.0254 0.0607 0.2941 3.4 5bq5:A, 5bq5:B, 5bq5:C, 8q3w:J, 8q3w:A, 8q3w:B, 8q3w:D, 8q3w:C, 8q3w:E, 8q3w:F, 8q3w:G, 8q3w:H, 8q3w:I, 8q4d:N, 8q4d:I, 8q4d:K, 8q4d:V, 8q4d:X, 8q4d:S, 8q4d:U, 8q4d:E, 8q4d:F, 8q4d:G, 8q4d:H, 8q4d:J, 8q4d:M, 8q4d:O, 8q4d:P, 8q4d:Q, 8q4d:R, 8q4d:T, 8q4d:W
26 8g5j:A 941 43 0.0288 0.0181 0.3953 3.8
27 5ean:A 1051 78 0.0373 0.0209 0.2821 4.0 5eaw:A, 5eaw:B, 5eax:A, 5eax:B
28 8c0v:B 1030 81 0.0407 0.0233 0.2963 4.1 8c0v:D, 8c0v:F, 8c0w:A, 8c0w:C, 8c0w:E, 8u0v:D, 8u0v:F, 8u0v:B
29 8v5r:A 944 43 0.0288 0.0180 0.3953 4.1 8g5i:A, 8g5l:A, 8g5m:A, 8g5n:A, 8g5o:A, 8g5p:A, 8t7e:A
30 8udk:A 1012 43 0.0288 0.0168 0.3953 4.2 5c51:A, 5c52:A, 5c53:A, 4ztu:A, 4ztz:A
31 8g5k:A 905 43 0.0288 0.0188 0.3953 4.4
32 4xgu:B 382 114 0.0559 0.0864 0.2895 4.5 4xgu:E
33 8xqw:A 988 30 0.0237 0.0142 0.4667 4.6
34 6nyy:C 491 33 0.0254 0.0305 0.4545 4.8 6nyy:B, 6nyy:D, 6nyy:E, 6nyy:A, 6nyy:F
35 6msj:B 411 64 0.0390 0.0560 0.3594 5.0 8cvt:B, 5gjq:I, 5gjr:I, 5gjr:w, 5l4g:I, 5m32:d, 6msb:B, 6msd:B, 6mse:B, 6msk:B, 7qxn:B, 7qxp:B, 7qxu:B, 7qxw:B, 7qxx:B, 7qy7:B, 7qyb:B, 5t0c:AB, 5t0c:BB, 5t0g:B, 5t0h:B, 5t0i:B, 5vfp:B, 5vfq:B, 5vfr:B, 5vfs:B, 7w37:B, 7w38:B, 7w39:B, 7w3a:B, 7w3c:B, 7w3f:B, 7w3g:B, 7w3h:B, 7w3i:B, 7w3j:B, 7w3k:B, 6wjd:B, 6wjn:B
36 8xqw:E 868 72 0.0390 0.0265 0.3194 5.5
37 2ce7:D 413 38 0.0254 0.0363 0.3947 5.6 2ce7:A, 2ce7:B, 2ce7:E, 2ce7:F, 2cea:A, 2cea:B, 2cea:D, 2cea:E, 2cea:F
38 8av6:I 109 17 0.0169 0.0917 0.5882 6.1 6fml:I, 8oop:I
39 6qem:G 239 134 0.0525 0.1297 0.2313 6.2 6qel:G, 6qel:H, 6qel:I, 6qel:J, 6qel:K, 6qel:L, 6qem:H, 6qem:I, 6qem:J, 6qem:K, 6qem:L
40 8fth:A 1263 42 0.0254 0.0119 0.3571 6.6
41 4a15:A 596 65 0.0339 0.0336 0.3077 6.9 5h8w:A, 2vsf:A
42 6f0x:B 398 51 0.0305 0.0452 0.3529 7.3 6f0x:A, 6f0x:C, 6f0x:D, 6f0x:E, 7l9p:A, 7l9p:B, 7l9p:C, 7l9p:D, 7l9p:E
43 7wi4:A 410 69 0.0373 0.0537 0.3188 7.9 7wi4:D, 7wi4:E, 7wi4:F, 7wi4:B, 7wi4:C
44 2y5p:A 72 22 0.0153 0.1250 0.4091 8.5 2y5p:B
45 3a8t:A 289 26 0.0203 0.0415 0.4615 8.8
46 7z5n:H 307 65 0.0390 0.0749 0.3538 9.2

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218