Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MATLLTTDDLRRALVESAGETDGTDLSGDFLDLRFEDIGYDSLALMETAARLESRYGVSIPDDVAGRVDTPRELLDLING
ALAEAA

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2k0x:A 86 86 1.0000 1.0000 1.0000 7.65e-55 2kg6:A, 2kg8:A, 2kg9:A, 2kga:A, 2kgc:A, 2kgd:A, 2kge:A, 2mvu:A, 2mvv:A
2 3gzl:A 81 74 0.2558 0.2716 0.2973 5.26e-05 2fq0:A, 2fq2:A, 3gzm:B
3 2fac:A 77 48 0.2209 0.2468 0.3958 9.38e-05 2fac:B, 2fad:A, 2fad:B, 2fae:A, 4keh:C, 4keh:D, 1l0i:A, 6n3p:I, 6n3p:L, 6n3p:J, 3ny7:B, 7nyw:G, 7nyx:G, 7nyy:G, 7nyz:G, 7nz0:G, 7nz2:G1, 7nz2:G2, 7nz2:G3, 7nz2:G4, 7nz3:G1, 7nz3:G2, 7nz4:G1, 7nz4:G2, 1t8k:A, 5usr:K, 5vcb:f, 5vcb:e, 5vcb:d, 5vcb:F, 5vcb:D, 5vcb:X, 6w1d:C, 6w98:B
4 2fva:A 82 55 0.2093 0.2195 0.3273 2.40e-04
5 8e73:AB 85 42 0.1744 0.1765 0.3571 8.55e-04
6 7b0n:U 88 44 0.1628 0.1591 0.3182 0.003 6rfq:Q, 6rfr:Q, 6y79:Q
7 7ak6:U 88 43 0.1860 0.1818 0.3721 0.003 7a5h:w, 7ak6:T, 8c2s:T, 8c2s:U, 8ca3:T, 8ca5:T, 8ca5:U, 6g2j:U, 6g72:U, 5gup:O, 5gup:X, 5lnk:j, 5lnk:X, 6odd:A, 7oi6:w, 7oi8:w, 7oie:w, 8olt:T, 8om1:U, 5ool:w, 5oom:w, 8pw7:T1, 8q0a:T, 8q0a:U, 8q0f:U, 8q0o:U, 8q1p:T, 8q1u:T, 8q1y:U, 8q25:T, 8q45:T, 8q46:T, 8q46:U, 8q47:T, 8q47:U, 8q49:U, 6q9b:AB, 6q9d:AA, 6qa9:AA, 6qa9:AB, 6qbx:AA, 6qbx:AB, 6qc5:AA, 6qc6:AA, 6qc7:AA, 6qc8:AB, 7qsd:T, 7qsl:T, 7qsn:T, 8qu5:w, 7r41:T, 7r43:T, 7r44:T, 7r45:T, 7r46:T, 7r47:T, 7r47:U, 7r48:T, 7r4c:T, 7r4d:T, 7r4f:U, 7r4g:T, 8rgt:T, 8ud1:1U, 8ueo:1T, 8ueo:1U, 8uep:1U, 8ueq:1T, 8ueq:1U, 8uer:1T, 8uer:1U, 8ues:1T, 8ues:1U, 8uet:1T, 8ueu:1T, 8ueu:1U, 8uev:1T, 8uew:1T, 8uew:1U, 8uex:1T, 8uex:1U, 8uey:1T, 8uey:1U, 8uez:1T, 8uez:1U, 8ugh:1U, 8ugi:1U, 8ugj:1U, 8ugn:1T, 8ugn:1U, 8ugn:5U, 8ugr:1U, 8ugr:5T, 8ugr:5U, 7v2d:X, 7v2f:X, 7v2k:X, 7v30:X, 7v32:X, 7v33:G, 7v3m:X, 7vbl:X, 7vbp:X, 7vwj:G, 7vwl:X, 7vy1:X, 7vye:X, 7vyi:X, 7vzv:X, 7w00:X, 7w0h:X, 7w1o:X, 7w1p:X, 7w20:X, 7w2k:X, 7w2l:X, 7w31:G, 7w32:X, 7w35:X, 7w4c:X, 7w4g:X, 7w4j:X, 7w4k:X, 7w4l:X, 7w4n:X, 7zdh:X, 7zdm:j, 7zdm:X, 7zdp:X, 7zdp:j, 6zka:X, 6zkb:X, 6zkc:X, 6zkd:j, 6zke:X, 6zkf:X, 6zkg:X, 6zkh:X, 6zkh:j, 6zki:X, 6zkj:X, 6zkk:X, 6zkl:X, 6zkm:X, 6zkm:j, 6zkn:X, 6zkn:j, 6zko:X, 6zkp:X, 6zkp:j, 6zkr:X, 6zks:X, 6zkt:X, 6zku:X, 6zr2:T, 6zr2:U, 6ztq:U
8 2qnw:A 80 47 0.1977 0.2125 0.3617 0.003
9 8jfh:E 79 33 0.1512 0.1646 0.3939 0.004 8jfn:B
10 2eht:A 77 44 0.1977 0.2208 0.3864 0.004
11 2koo:A 81 59 0.2326 0.2469 0.3390 0.004 2kop:A, 2koq:A, 2kor:A, 2kos:A
12 8bee:U 87 34 0.1512 0.1494 0.3824 0.059 7aqr:U, 7arb:U, 8bpx:U, 8bq5:U, 8bq6:U
13 7ar7:T 84 58 0.1860 0.1905 0.2759 0.11 7ar8:T, 8bq6:T
14 7lo1:A 422 46 0.2209 0.0450 0.4130 0.18 7lo1:B
15 7f2r:B 79 42 0.1744 0.1899 0.3571 0.32
16 8ba0:U 85 42 0.1512 0.1529 0.3095 0.38 8ba0:T, 8esz:AC
17 7arc:U 84 41 0.1860 0.1905 0.3902 0.40 7ard:U
18 8iuf:AB 88 40 0.1395 0.1364 0.3000 0.43 8j9h:AB, 8j9i:AB, 8j9j:AB
19 7mjy:A 448 53 0.2093 0.0402 0.3396 0.58 7mjv:A, 7mjw:A, 7mjw:B, 7mjx:B, 7mjx:A, 7mjz:A
20 8qzi:E 86 37 0.1744 0.1744 0.4054 0.62 7bdw:B, 6rcx:B
21 8bi5:A 355 30 0.1512 0.0366 0.4333 0.71 7a04:A, 7a04:B, 7a06:A, 5afv:A, 5afv:B, 8bi5:B, 8bi6:A, 8bi6:B, 4br3:A, 4br3:B, 4cg8:A, 4cg9:A, 4cga:A, 2ckq:A, 2ckq:B, 4da5:A, 4da5:B, 5eqe:A, 5eqe:B, 5eqp:A, 5eqp:B, 5eqy:A, 5eqy:B, 3f2r:A, 3f2r:B, 5ftg:A, 5fut:A, 3g15:A, 3g15:B, 7nb1:AAA, 7nb1:BBB, 7nb2:AAA, 7nb2:BBB, 7nb3:AAA, 7nb3:BBB, 5w6o:A, 5w6o:B, 3zm9:A, 3zm9:B
22 6sga:Fc 84 68 0.2093 0.2143 0.2647 0.72 6sgb:Fc, 6yxy:EK
23 4k49:C 136 30 0.1628 0.1029 0.4667 0.81 4k49:B, 4k49:D, 4k49:A, 4k4a:A, 4k4a:B, 4k4a:D, 4k4a:C, 4k4b:A, 4k4b:B, 4k4b:C, 4k4b:D, 4k4b:E, 4k4b:F, 4k4b:G, 4k4b:H
24 1v4w:B 146 60 0.1977 0.1164 0.2833 0.94 1v4u:B, 1v4u:D, 1v4w:D, 1v4x:B, 1v4x:D
25 7zmb:Q 85 42 0.1395 0.1412 0.2857 1.0 7zm7:O, 7zmb:O, 7zme:Q, 7zmg:O, 7zmg:Q
26 2x2b:A 76 45 0.1628 0.1842 0.3111 1.0
27 7p43:B 690 51 0.1977 0.0246 0.3333 1.1 7p43:A
28 5hv8:A 95 51 0.1628 0.1474 0.2745 1.1
29 6ote:A 409 64 0.1860 0.0391 0.2500 1.9
30 6lvu:A 78 48 0.1628 0.1795 0.2917 2.1 6lvu:B
31 3iiv:B 262 47 0.1628 0.0534 0.2979 2.1 7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
32 8dsh:B 473 59 0.2209 0.0402 0.3220 3.0 6atb:A, 6atb:B, 6atb:C, 6atb:D, 6azj:A, 6azj:B, 6b75:A, 6b75:B, 6b75:D, 6b76:A, 6b76:B, 6b76:C, 6b76:D, 3dgr:A, 3dgr:B, 3dhd:A, 3dhd:B, 3dhf:A, 3dhf:B, 3dkj:A, 3dkj:B, 3dkl:A, 3dkl:B, 8dsc:A, 8dsc:B, 8dsd:A, 8dsd:B, 8dse:A, 8dse:B, 8dsh:A, 8dsi:A, 8dsi:B, 8dsm:A, 8dsm:B, 8dsm:C, 8dsm:D, 8dtj:A, 8dtj:B, 2e5c:A, 2e5c:B, 2e5d:A, 2e5d:B, 6e68:A, 6e68:B, 7enq:A, 7enq:B, 7enq:C, 7enq:D, 8f7l:A, 8f7l:B, 3g8e:A, 3g8e:B, 2g96:A, 2g96:B, 2g97:A, 2g97:B, 2gvg:A, 2gvg:C, 2gvg:B, 2gvg:D, 2gvg:E, 2gvg:F, 2gvj:A, 2gvj:B, 2h3d:A, 2h3d:B, 8ivu:A, 8ivu:B, 8ivu:C, 8ivu:D, 4jnm:A, 4jnm:B, 4jr5:A, 4jr5:B, 4kfn:A, 4kfn:B, 4kfo:A, 4kfo:B, 4kfp:A, 4kfp:B, 5kit:A, 5kit:B, 4l4l:A, 4l4l:B, 4l4m:A, 4l4m:B, 4lts:A, 4lts:B, 4lv9:A, 4lv9:B, 4lva:A, 4lva:B, 4lvb:A, 4lvb:B, 4lvd:B, 4lvd:A, 4lvf:A, 4lvf:B, 4lvg:A, 4lvg:B, 4lww:A, 4lww:B, 5lx3:A, 5lx3:B, 5lx5:A, 5lx5:B, 4m6p:A, 4m6p:B, 4m6q:A, 4m6q:B, 4n9b:A, 4n9b:B, 4n9c:A, 4n9c:B, 4n9d:A, 4n9d:B, 4n9e:A, 4n9e:B, 5nsd:A, 5nsd:B, 4o0z:A, 4o0z:B, 4o10:A, 4o10:B, 4o12:A, 4o12:B, 4o13:A, 4o13:B, 4o14:A, 4o14:B, 4o15:A, 4o15:B, 4o16:A, 4o17:A, 4o17:B, 4o18:A, 4o18:B, 4o19:A, 4o19:B, 4o1a:A, 4o1a:B, 4o1b:A, 4o1b:B, 4o1c:A, 4o1c:B, 4o1d:A, 4o1d:B, 4o28:A, 4o28:B, 6peb:A, 6peb:B, 6peb:C, 7ppe:A, 7ppe:B, 7ppf:A, 7ppf:B, 7ppg:A, 7ppg:B, 7ppg:C, 7ppg:D, 7pph:A, 7pph:B, 7ppi:A, 7ppi:B, 7ppi:C, 7ppi:D, 7q8t:A, 7q8t:B, 6ta0:A, 6ta0:B, 6ta2:B, 6ta2:A, 6tac:A, 6tac:B, 8tm7:A, 8tm7:B, 5u2m:A, 5u2m:B, 5u2n:A, 5u2n:B, 5upe:A, 5upe:B, 5upf:A, 5upf:B, 5wi0:A, 5wi0:B, 5wi1:A, 5wi1:B, 4wq6:A, 4wq6:B
33 4v4n:AP 120 24 0.1279 0.0917 0.4583 3.2 4v6u:BP
34 3c46:A 1095 47 0.1860 0.0146 0.3404 4.0 3c2p:A, 3c2p:B, 3c3l:A, 3c3l:B, 3c46:B, 4ff1:A, 4ff1:B, 4ff2:A, 4ff2:B, 4ff3:A, 4ff3:B, 4ff4:A, 4ff4:B, 3q0a:A, 3q0a:B, 3q22:A, 3q22:B, 3q23:A, 3q23:B, 3q24:A, 3q24:B
35 7k3u:A 362 55 0.2326 0.0552 0.3636 6.3 7k3u:B, 7k3u:C, 7k3u:D, 7k3u:E, 7k3u:F, 7k3u:G, 7k3u:H, 7k3u:I, 7k3u:J, 7n02:A, 7n02:B, 6xmr:A, 6xmr:B, 4zng:C, 4zng:B, 4zng:A
36 3s55:D 275 56 0.1395 0.0436 0.2143 6.4 3s55:A, 3s55:B, 3s55:C, 3s55:E, 3s55:F, 3s55:G, 3s55:H
37 8fru:Z 134 35 0.1395 0.0896 0.3429 7.2 8brm:La, 8bsi:La, 8bsj:La, 8btd:La, 8btr:La, 7pwg:Z, 7pwo:Z2
38 2gmh:A 581 56 0.2558 0.0379 0.3929 7.3 2gmh:B, 2gmj:A, 2gmj:B
39 8br8:La 119 35 0.1395 0.1008 0.3429 8.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218