BioLiP

>protein
MASDVANNKSSLEDGCLSCGSFHPLFEGGLCQCTVCCEGRELLLCCVECLEVLVGTSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRL
QAFF

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7o45:D	84	84	1.0000	1.0000	1.0000	1.84e-57
2	8eik:C	407	131	1.0000	0.2064	0.6412	2.47e-42
3	8eii:B	439	131	1.0000	0.1913	0.6412	2.76e-42	8eih:A, 8eih:B, 8eih:C, 8eii:A, 8eii:C, 8eij:A, 8eij:B, 8eik:A, 8eik:B, 6kda:A, 6kda:D, 6kdb:A, 6kdb:D, 6kdl:A, 6kdl:D, 6kdp:A, 6kdp:D, 6kdt:A, 6kdt:D, 7o45:A, 7o45:B, 7o45:C, 6u8p:A, 6u8p:D, 6u8v:A, 6u8v:D, 6u8w:A, 6u8w:D, 6u8x:A, 6u8x:D, 6u90:A, 6u90:D, 6u91:A, 6u91:D, 7v0e:A, 7v0e:B, 7v0e:C, 7v0e:D, 7v0e:E, 7v0e:F, 7v0e:G, 7v0e:H, 7x9d:A, 7x9d:D
4	8eik:E	378	107	0.7619	0.1693	0.5981	6.07e-28
5	8eih:D	256	100	0.6190	0.2031	0.5200	2.73e-18
6	4u7p:A	426	121	0.5595	0.1103	0.3884	1.00e-16	3a1a:A, 3a1b:A, 8ba5:A, 6brr:A, 6brr:D, 6f57:A, 6f57:D, 6pa7:K, 6pa7:P, 4qbq:C, 4qbq:A, 4qbr:A, 4qbr:C, 4qbs:A, 2qrv:A, 2qrv:D, 2qrv:E, 2qrv:H, 8tdr:A, 8tdr:B, 8tdr:C, 8tdr:D, 8te1:A, 8te1:B, 8te1:C, 8te1:D, 8te3:A, 8te3:B, 8te3:C, 8te3:D, 8te4:A, 8te4:B, 8te4:C, 8te4:D, 4u7t:A, 4u7t:C, 6w89:A, 6w89:D, 6w89:G, 6w89:J, 6w8b:A, 6w8b:D, 6w8b:H, 6w8b:K, 6w8d:A, 6w8d:D, 6w8j:A, 6w8j:D, 5yx2:A, 5yx2:D
7	2pv0:B	347	131	0.5119	0.1239	0.3282	1.23e-14	2pv0:A, 2pv0:C, 2pvc:B, 2pvc:A, 2pvc:C
8	6laa:A	753	34	0.1548	0.0173	0.3824	4.8	6gii:A, 6ldl:A
9	2plj:A	376	37	0.1190	0.0266	0.2703	6.5	2plj:B, 2plk:A, 2plk:B
10	3h9a:A	225	36	0.1310	0.0489	0.3056	6.9	3h7j:A, 3h7j:B, 3h7y:A, 3h7y:B, 3h9a:B
11	1w78:A	414	22	0.1310	0.0266	0.5000	9.1	1w7k:A

[Back]