Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MANVDEAILKRVKGWAPYVDAKLGFRNHWYPVMFSKEINEGEPKTLKLLGENLLVNRIDGKLYCLKDRCLHRGVQLSVKV
ECKTKSTITCWYHAWTYRWEDGVLCDILTNPTSAQIGRQKLKTYPVQEAKGCVFIYLGDGDPPPLARDTPPNFLDDDMEI
LGKNQIIKSNWRLAVENGFDPSHIYIHKDSILVKDNDLALPLGFAPGGDRKQQTRVVDDDVVGRKGVYDLIGEHGVPVFE
GTIGGEVVREGAYGEKIVANDISIWLPGVLKVNPFPNPDMMQFEWYVPIDENTHYYFQTLGKPCANDEERKKYEQEFESK
WKPMALEGFNNDDIWAREAMVDFYADDKGWVNEILFESDEAIVAWRKLASEHNQGIQTQAHVSGLEHH

The query sequence (length=388) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2de6:B 390 388 1.0000 0.9949 1.0000 0.0 7bug:A, 7bug:B, 7bug:C, 7bui:A, 7bui:B, 7bui:C, 2de5:A, 2de5:B, 2de5:C, 2de6:A, 2de6:C, 2de7:A, 2de7:B, 2de7:C, 6ll0:A, 6ll0:B, 6ll0:C, 6ll1:A, 6ll1:B, 6ll1:C, 6ll4:A, 6ll4:B, 6ll4:C, 6llf:A, 6llf:B, 6llf:C, 6llh:A, 6llh:B, 6llh:C, 6llk:A, 6llm:A, 4nb8:A, 4nb8:B, 4nb8:C, 4nb9:A, 4nb9:B, 4nb9:C, 4nba:A, 4nba:B, 4nba:C, 4nbb:A, 4nbb:B, 4nbb:C, 4nbc:A, 4nbc:B, 4nbc:C, 4nbd:A, 4nbd:B, 4nbd:C, 4nbe:A, 4nbe:B, 4nbe:C, 4nbf:A, 4nbf:B, 4nbf:C, 4nbg:A, 4nbg:B, 4nbg:C, 4nbh:A, 4nbh:B, 4nbh:C, 3vmg:A, 3vmg:B, 3vmg:C, 3vmh:A, 3vmh:B, 3vmh:C, 3vmi:A, 3vmi:B, 3vmi:C, 1ww9:A
2 3gkq:A 374 370 0.5644 0.5856 0.5919 1.43e-171 3gkq:B, 3gkq:C, 3gkq:D, 3gkq:E, 3gkq:F
3 3gcf:A 367 366 0.4433 0.4687 0.4699 7.60e-122 3gcf:B, 3gcf:C, 3gcf:D, 3gcf:E, 3gcf:F, 3gcf:G, 3gcf:H, 3gcf:I, 3gcf:J, 3gcf:K, 3gcf:L, 3gcf:M, 3gcf:N, 3gcf:O
4 1z01:A 427 391 0.4175 0.3794 0.4143 6.14e-96 1z01:B, 1z01:C, 1z01:D, 1z01:E, 1z01:F, 1z02:A, 1z02:B, 1z02:C, 1z02:D, 1z02:E, 1z02:F, 1z03:A, 1z03:B, 1z03:C, 1z03:D, 1z03:E, 1z03:F
5 7fhr:A 437 190 0.1314 0.1167 0.2684 2.04e-11
6 7v28:B 425 192 0.1340 0.1224 0.2708 2.85e-11 7fjl:A, 7fjl:B, 7fjl:C, 7fjl:D, 7fjl:E, 7fjl:F, 7v25:B, 7v25:A, 7v25:C, 7v25:D, 7v25:E, 7v25:F, 7v28:A, 7v28:C, 7v28:D, 7v28:E, 7v28:F
7 6icl:A 338 190 0.1340 0.1538 0.2737 2.01e-10
8 6wn3:B 328 210 0.1495 0.1768 0.2762 7.49e-10 7szh:A, 7szh:B, 7szh:C, 6wn3:A, 6wn3:C, 6wnb:A, 6wnb:B, 6wnb:C
9 7sze:B 329 174 0.1314 0.1550 0.2931 8.79e-10 7sze:A, 7sze:C, 7szf:A, 7szf:B, 7szf:C, 7szg:A, 7szg:B, 7szg:C, 6wnc:A, 6wnc:B, 6wnc:C, 6wnd:A, 6wnd:B, 6wnd:C
10 6icn:A 344 123 0.0876 0.0988 0.2764 6.43e-09 6ick:A, 6ick:B, 6ick:C, 6icm:A, 6icm:B, 6icm:C, 6icn:B, 6icn:C, 6ico:A, 6ico:B, 6ico:C, 6icp:A, 6icp:B, 6icp:C, 6icq:A, 6icq:B, 6icq:C
11 6y8j:A 343 199 0.1289 0.1458 0.2513 2.30e-08
12 7qwt:A 352 173 0.1082 0.1193 0.2428 1.88e-07 7qwt:B, 7qwt:C, 7qwt:D, 7qwt:E, 7qwt:F, 7qwt:G, 7qwt:H, 7qwt:I
13 6y9c:A 365 171 0.1082 0.1151 0.2456 8.18e-07 6y8s:A, 6y9d:A, 6y9d:B, 6y9d:C, 6y9d:D, 6y9d:E, 6y9d:F, 6y9d:G, 6y9d:H, 6y9d:I, 6y9d:J, 6y9d:K, 6y9d:L, 6zgp:A, 6zgp:B, 6zgp:C, 6zgp:D, 6zgp:E, 6zgp:F, 6zgp:G, 6zgp:H, 6zgp:I, 6zgp:J, 6zgp:K, 6zgp:L
14 7c8z:A 383 186 0.1366 0.1384 0.2849 1.37e-06 7c8z:C, 7c8z:E, 7c8z:G
15 4qur:A 415 184 0.1289 0.1205 0.2717 8.27e-05 5hl4:A, 4qup:A, 4quq:A, 3vca:A, 3vcp:A
16 7q05:E 409 146 0.0851 0.0807 0.2260 8.42e-05 7q04:D, 7q04:E, 7q04:F, 7q05:D, 7q05:F, 7q06:D, 7q06:E, 7q06:F, 7vju:A, 7vju:C, 7vju:E
17 7yls:B 436 191 0.1134 0.1009 0.2304 1.07e-04 8h2t:B, 8h2t:D, 8h2t:G
18 3n0q:A 402 141 0.0979 0.0945 0.2695 4.93e-04
19 2zyl:A 359 168 0.1186 0.1281 0.2738 7.10e-04 4qck:A
20 4qdc:A 369 175 0.1289 0.1355 0.2857 0.004 4qdd:A, 4qdf:A
21 2ckf:E 433 89 0.0644 0.0577 0.2809 0.008 2ckf:C
22 2b1x:A 441 173 0.0979 0.0862 0.2197 0.013 2b1x:C, 2b1x:E, 2b24:A, 2b24:C, 2b24:E
23 1eg9:A 447 287 0.1907 0.1655 0.2578 0.029 4hjl:A, 4hkv:A, 2hmj:A, 2hmk:A, 2hml:A, 2hmm:A, 2hmn:A, 2hmo:A, 4hm0:A, 4hm1:A, 4hm2:A, 4hm3:A, 4hm4:A, 4hm5:A, 4hm6:A, 4hm7:A, 4hm8:A, 1ndo:A, 1ndo:C, 1ndo:E, 1o7g:A, 1o7h:A, 1o7m:A, 1o7n:A, 1o7p:A, 1o7w:A, 1uuv:A, 1uuw:A
24 1uli:C 425 75 0.0438 0.0400 0.2267 0.032 1uli:A, 1uli:E, 1ulj:A, 1ulj:C, 1ulj:E
25 4qdf:B 357 170 0.0979 0.1064 0.2235 0.035
26 5aeu:A 433 172 0.0979 0.0878 0.2209 0.043 5aeu:C, 5aeu:E, 5aeu:G, 5aew:A, 5aew:C, 5aew:E, 5aew:G, 5aew:I, 5aew:K, 5aew:M, 5aew:O, 5aew:Q, 5aew:S, 5aew:U, 5aew:W, 2xr8:A, 2xr8:C, 2xr8:E, 2xr8:G, 2xr8:I, 2xr8:K, 2xr8:M, 2xr8:O, 2xr8:Q, 2xr8:S, 2xr8:U, 2xr8:W, 2xrx:A, 2xrx:C, 2xrx:E, 2xrx:G, 2xrx:I, 2xrx:K, 2xrx:M, 2xrx:O, 2xrx:Q, 2xrx:S, 2xrx:U, 2xrx:W, 2xsh:A, 2xsh:C, 2xsh:E, 2xsh:G, 2xsh:I, 2xsh:K, 2xso:A, 2xso:C, 2xso:E, 2xso:G, 2xso:I, 2xso:K, 2xso:M, 2xso:O, 2xso:Q, 2xso:S, 2xso:U, 2xso:W, 2yfi:A, 2yfi:C, 2yfi:E, 2yfi:G, 2yfi:I, 2yfi:K, 2yfj:A, 2yfj:C, 2yfj:E, 2yfj:G, 2yfj:I, 2yfj:K, 2yfl:A, 2yfl:C, 2yfl:E, 2yfl:G, 2yfl:I, 2yfl:K
27 3gzx:A 440 157 0.1005 0.0886 0.2484 0.064 3gzy:A
28 3en1:A 424 75 0.0438 0.0401 0.2267 0.071 3eqq:A
29 2bmo:A 437 140 0.0876 0.0778 0.2429 0.079 2bmq:A, 2bmr:A
30 5bok:A 102 101 0.0619 0.2353 0.2376 0.16
31 6zrx:CCC 360 30 0.0387 0.0417 0.5000 0.21 6zrx:AAA, 6zrx:BBB, 6zrx:DDD, 6zry:AAA, 6zry:BBB
32 1wql:A 436 153 0.0851 0.0757 0.2157 0.23
33 5h2u:A 266 150 0.0902 0.1316 0.2333 0.33 6cz3:A, 6cz4:A, 5da3:A, 5h2u:B, 5h2u:C, 5h2u:D
34 1jm1:A 202 71 0.0490 0.0941 0.2676 0.51
35 1fqt:A 109 42 0.0335 0.1193 0.3095 0.71 1fqt:B
36 8juj:B 380 45 0.0412 0.0421 0.3556 1.1 8juj:A
37 1yge:A 839 128 0.0773 0.0358 0.2344 2.9 3bnb:A, 3bnc:A, 3bnd:A, 3bne:A, 5eeo:A, 1f8n:A, 1fgm:A, 1fgo:A, 1fgq:A, 1fgr:A, 1fgt:A, 3pzw:A, 2sbl:B, 2sbl:A, 7soi:A, 7soi:B, 7soj:A, 7soj:B, 5t5v:A, 5t5v:B, 5tqn:A, 5tqn:B, 5tqo:A, 5tqo:B, 5tqp:A, 5tqp:B, 5tr0:A, 5tr0:B, 4wfo:A, 4wha:A, 1y4k:A
38 2qpz:A 103 99 0.0567 0.2136 0.2222 2.9
39 6gw3:A 383 61 0.0541 0.0548 0.3443 4.4 6gw3:B, 6gw3:C, 6gw3:D, 7w6g:C, 7w6g:D
40 3i6d:B 419 36 0.0412 0.0382 0.4444 5.8 3i6d:A
41 7ouj:AAA 540 80 0.0593 0.0426 0.2875 5.9
42 1no3:A 851 127 0.0773 0.0353 0.2362 6.9 1hu9:A, 1ik3:A, 1jnq:A, 1lnh:A, 1n8q:A, 1rov:A, 1rrh:A, 1rrl:A, 1rrl:B
43 5jz9:A 284 82 0.0541 0.0739 0.2561 8.1 5jz9:B, 5jzb:A, 5jzb:B, 5jzs:B, 2wue:B, 2wuf:B, 2wug:A, 2wug:B, 7zm1:A, 7zm1:B, 7zm2:A, 7zm2:B, 7zm3:A, 7zm3:B, 7zm4:A, 7zm4:B
44 5u57:A 190 31 0.0361 0.0737 0.4516 8.5 5u55:A, 5u55:B, 5u55:C, 5u55:D, 5u57:B, 5u57:C, 5u57:D, 5u58:A, 5u58:B, 5u58:C, 5u5d:A, 5u5d:B, 5u5d:D
45 5med:A 569 76 0.0438 0.0299 0.2237 8.6 5med:B, 5mee:A, 5mee:B, 5mef:A, 5mef:B, 5meg:A, 5meg:B
46 7dz9:B 260 34 0.0284 0.0423 0.3235 9.2 7dz9:A
47 8fia:A 1772 64 0.0619 0.0135 0.3750 9.2

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218