BioLiP

>protein
MAMANNSSVANKVCLIVIDGWGVSEDPYGNAILNAQTPVMDKLCSGNWAQIEAHGLHVGLPEGLMGNSEVGHLNIGAGRV
IYQDIVRINLAVKNNKFVTNESLVDACDRAKNGNGRLHLAGLVSDGGVHSHIDHMFALVKAIKELGVPELYLHFYGDGRD
TSPNSGVGFLEQTLEFLEKTTGYGKLATVVGRYYAMDRDNRWERINVAYEAMIGGVGETSDEAGVVEVVRKRYAADETDE
FLKPIILQGEKGRVQNDDTIIFFDYRADRMREISAAMGMDRYKDCNSKLAHPSNLQVYGMTQYKAEFPFKSLFPPASNKN
VLAEWLAEQKVSQFHCAETEKYAHVTFFFNGGLEKQFEGEERCLVPSPKVATYDLQPEMSAAGVADKMIEQLEAGTHPFI
MCNFAPPDMVGHTGVYEAAVKACEATDIAIGRIYEATQKHGYSLMVTADHGNAEKMKAPDGGKHTAHTCYRVPLTLSHPG
FKFVDPADRHPALCDVAPTVLAIMGLPQPAEMTGVSIVQKIKLAAALEHHH

The query sequence (length=531) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7tl7:A	531	531	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5kgl:A, 5kgl:B, 5kgm:A, 5kgm:B, 5kgn:A, 5kgn:B, 7knf:A, 7knf:B, 7kng:A, 7kng:B, 7tl7:B, 7tl7:C, 7tl7:D
2	1o98:A	509	515	0.4068	0.4244	0.4194	2.70e-142	1ejj:A, 1eqj:A, 1o99:A
3	5vpu:A	509	511	0.4143	0.4322	0.4305	2.45e-138
4	2ify:A	508	516	0.4030	0.4213	0.4147	2.08e-136
5	4nwj:A	504	509	0.3823	0.4028	0.3988	2.07e-124	4my4:A, 4nwx:A, 4qax:A, 7tl8:A
6	3nvl:A	549	534	0.2976	0.2878	0.2959	4.14e-64	3nvl:B
7	3igy:B	549	534	0.3032	0.2933	0.3015	3.45e-55	3igz:B
8	7p24:AAA	494	108	0.0565	0.0607	0.2778	0.021
9	7wxp:A	311	105	0.0546	0.0932	0.2762	0.65
10	6pt4:B	473	65	0.0339	0.0381	0.2769	1.9	6pt4:A, 6pt6:B, 6pt6:A, 6pt9:A, 6pt9:B, 6ptk:A, 6ptk:B, 6ptk:C, 6ptk:D
11	5mlt:A	454	55	0.0301	0.0352	0.2909	2.0	5swa:A, 5swa:B, 5swb:A, 5swb:C, 5swb:D, 5swb:G
12	1ajb:A	449	205	0.0847	0.1002	0.2195	2.4	1ajb:B, 1ajc:A, 1ajc:B, 1ajd:A, 1ajd:B, 1alh:A, 1alh:B, 1ali:A, 1ali:B, 1alj:A, 1alj:B, 1alk:A, 1alk:B, 1ani:A, 1ani:B, 1anj:A, 1anj:B, 2anh:A, 2anh:B, 1b8j:A, 1b8j:B, 3bdh:A, 3bdh:B, 5c66:A, 5c66:B, 3cmr:A, 3cmr:B, 3dpc:B, 3dpc:A, 3dyc:A, 3dyc:B, 1ed8:A, 1ed8:B, 1ed9:A, 1ed9:B, 1elx:A, 1elx:B, 1ely:A, 1ely:B, 1elz:A, 1elz:B, 1ew8:A, 1ew8:B, 1ew9:A, 1ew9:B, 2g9y:A, 2g9y:B, 2ga3:A, 2ga3:B, 1hjk:A, 1hjk:B, 1hqa:A, 1hqa:B, 1kh4:A, 1kh4:B, 1kh5:A, 1kh5:B, 1kh7:A, 1kh7:B, 1kh9:A, 1kh9:B, 1khj:A, 1khj:B, 1khk:A, 1khk:B, 1khl:A, 1khl:B, 1khn:A, 1khn:B, 4km4:A, 4km4:B, 3tg0:A, 3tg0:B, 3tg0:C, 3tg0:D, 5tpq:A, 5tpq:B, 1ura:A, 1ura:B, 1urb:A, 1urb:B, 1y6v:A, 1y6v:B, 1y7a:A, 1y7a:B, 4yr1:A, 4yr1:B
13	2zkt:B	381	66	0.0339	0.0472	0.2727	4.2
14	2zkt:A	330	66	0.0339	0.0545	0.2727	4.5
15	7fi0:A	308	90	0.0433	0.0747	0.2556	5.4	7fi1:A
16	5m3e:A	152	19	0.0207	0.0724	0.5789	8.2
17	3b5q:B	467	108	0.0508	0.0578	0.2500	8.6	3b5q:A, 5g2t:A, 5g2t:B, 5g2t:C, 5g2t:D, 5g2u:A

[Back]