BioLiP

>protein
MAGSRLETVGSIFTRTRDLIRAGVLKEKPLWFDVYNAFPPLREPVFRRPRLRYGKAKSPTQDIYYHEDQIRAKFYAAYGS
GPKAFDLFNPNFKSTCQRFVEKYIELQKLGETDEEKLFVEAGKALLAEGVILRRV

The query sequence (length=135) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5aj3:b	135	134	0.9111	0.9111	0.9179	2.68e-90	5aj4:Ab, 6gaw:Ab, 6gaz:Ab, 3jd5:b, 6neq:b, 6nf8:b, 7nqh:Ab, 7nql:Ab, 7nsi:Ab, 7nsj:Ab, 8oin:AS, 8oip:AS, 6ydp:Ab, 6ydw:Ab
2	8any:AS	135	134	0.8815	0.8815	0.8881	1.32e-87	7a5f:S6, 7a5g:S6, 7a5i:S6, 7a5k:S6, 8csp:S, 8csq:S, 8csr:S, 8css:S, 8cst:S, 8csu:S, 3j9m:AS, 8k2a:SY, 7l08:AS, 6nu2:AS, 6nu3:AS, 7og4:AS, 8oir:AS, 8ois:AS, 7p2e:S, 7pnx:S, 7pny:S, 7pnz:S, 7po0:S, 7po1:S, 7po2:S, 7po3:S, 7qi4:AS, 7qi5:AS, 7qi6:AS, 8qrk:S, 8qrl:S, 8qrm:S, 8qrn:S, 6rw4:S, 6rw5:S, 6vlz:AS, 6vmi:AS, 8xt0:SY, 8xt2:SY, 6zm5:AS, 6zm6:AS, 6zs9:AS, 6zsa:AS, 6zsb:AS, 6zsc:AS, 6zsd:AS, 6zse:AS, 6zsg:AS
3	7pnt:S	136	134	0.8593	0.8529	0.8657	1.74e-85	7pnu:S, 7pnv:S, 7pnw:S
4	8om2:U	237	43	0.1185	0.0675	0.3721	2.69e-04	8d8k:U, 8d8l:U, 5mrc:UU, 5mre:UU, 5mrf:UU, 8om3:U, 8om4:U
5	7ufg:A	1151	39	0.1037	0.0122	0.3590	0.51
6	7ufg:B	1182	39	0.1037	0.0118	0.3590	0.51	8d8o:B
7	8a7e:C	1524	39	0.1037	0.0092	0.3590	0.52	8a7d:C, 8a7e:Q, 7y5n:C, 7y5q:B
8	6gaq:A	146	62	0.1333	0.1233	0.2903	0.84	6gaq:B
9	5xyi:T	146	101	0.2000	0.1849	0.2673	1.8
10	3fwr:B	146	73	0.1630	0.1507	0.3014	1.8	3fwr:A, 3fws:A, 3fws:B
11	7aor:p	242	89	0.1481	0.0826	0.2247	1.8
12	6hiv:Cb	252	34	0.0815	0.0437	0.3235	2.7	6hiw:Cb, 6hiy:Cb, 7pub:Cb, 6sga:Cb, 6sgb:Cb
13	8bbb:A	331	40	0.1185	0.0483	0.4000	9.2	8a4g:A, 8ali:A, 8alj:A, 4bb3:A, 8bb9:A, 8bba:A, 8bbc:A, 8bbd:A, 2bjs:A, 1bk0:A, 1blz:A, 8bsv:A, 8bsw:A, 8bsx:A, 8bsy:A, 2bu9:A, 1hb1:A, 1hb2:A, 1hb3:A, 1hb4:A, 1ips:A, 1ips:B, 2ivi:B, 2ivj:A, 2jb4:A, 1obn:A, 1oc1:A, 1odm:A, 1odn:A, 7p3l:A, 8p46:A, 8p47:A, 8p48:A, 8p7o:A, 8p7p:A, 7poy:A, 7psw:A, 8ptv:A, 8py5:A, 8py6:A, 8py7:A, 8py8:A, 8py9:A, 8pya:A, 1qiq:A, 1qje:A, 1qjf:A, 1uzw:A, 2vau:A, 2vbb:A, 2vbd:A, 2vbp:A, 2vcm:A, 2ve1:A, 1w03:A, 1w04:A, 1w05:A, 1w06:A, 1w3v:A, 1w3x:A, 2wo7:A, 6y0o:A, 6y0p:A, 2y60:A, 2y6f:A, 6zae:A, 6zaf:A, 6zag:A, 6zah:A, 6zai:A, 6zaj:A, 6zak:A, 6zal:A, 6zam:A, 6zan:A, 6zao:A, 6zap:A, 6zaq:A, 3zku:A, 3zky:A, 3zoi:A, 7zoe:A, 6zw8:A

[Back]