Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LYFQSMFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGV
GAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFV
FRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHK
IDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLL
MDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAWT
AVGLPLQCRRPVHFELMSEWERSYFGNM

The query sequence (length=428) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6hrh:A 429 430 0.9977 0.9953 0.9930 0.0 6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
2 2bwo:B 399 391 0.4673 0.5013 0.5115 5.73e-147 2bwn:A, 2bwn:B, 2bwn:D, 2bwn:E, 2bwo:A, 2bwo:D, 2bwo:E, 2bwp:A, 2bwp:B, 2bwp:D, 2bwp:E
3 5txr:A 479 422 0.4322 0.3862 0.4384 5.86e-132 8eim:A, 8eim:B, 5txr:B
4 3tqx:A 396 349 0.2897 0.3131 0.3553 4.12e-72 3tqx:B
5 1fc4:A 401 359 0.2991 0.3192 0.3565 2.08e-67 1fc4:B
6 7v58:B 400 354 0.2780 0.2975 0.3362 1.77e-66 7v58:A, 7v5i:A, 7v5i:B, 7v5i:C, 7v5i:D
7 7poa:A 398 364 0.2921 0.3141 0.3434 6.83e-59 7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
8 7bxq:A 399 362 0.2944 0.3158 0.3481 6.16e-55 7bxq:B, 7bxr:A, 7bxr:B, 7bxs:A, 7bxs:B
9 4bmk:A 398 365 0.2710 0.2915 0.3178 4.93e-54 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
10 8guh:A 394 384 0.2477 0.2690 0.2760 4.03e-50 3a2b:A, 8h1q:A, 8h1y:A, 8h20:A, 8h21:A, 8h29:A, 8iyp:A, 8iyt:A
11 2x8u:A 399 370 0.2804 0.3008 0.3243 4.76e-50 2x8u:B
12 7yj1:B 502 364 0.2407 0.2052 0.2830 9.16e-42 7cqi:T, 7cqk:T, 7k0i:B, 7k0i:E, 7k0j:B, 7k0k:B, 7k0l:B, 7k0m:B, 7k0m:F, 7k0n:B, 7k0n:F, 7k0o:B, 7k0o:F, 7k0p:B, 7k0p:F, 7k0q:B, 6m4n:B, 6m4n:F, 6m4o:T, 7yiu:B, 7yiy:B, 7yj2:B
13 1dj9:A 383 343 0.2664 0.2977 0.3324 4.81e-41 1dje:A, 8dle:A, 2g6w:A
14 7u7h:A 423 350 0.2407 0.2435 0.2943 5.64e-40 7u7h:B
15 7yjm:B 471 362 0.2477 0.2251 0.2928 2.12e-39 7yjk:B, 7yjk:F, 7yjn:B, 7yjo:B
16 8c81:C 561 403 0.2687 0.2050 0.2854 7.89e-38 8c80:C, 8c82:C, 8c82:G, 8iaj:B, 8iaj:F, 8iak:B, 8iak:F, 8iam:B, 8iam:F, 8qof:C, 8qof:G, 8qog:C
17 2wk8:B 364 377 0.2220 0.2610 0.2520 1.20e-32
18 3hqt:B 386 377 0.2196 0.2435 0.2493 7.58e-32 3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
19 7yjk:A 445 296 0.1893 0.1820 0.2736 8.08e-32 7yjk:E, 7yjn:A, 7yjo:A
20 7k0n:A 464 250 0.1682 0.1552 0.2880 2.54e-29 7cqi:S, 7cqk:S, 7k0i:A, 7k0i:D, 7k0j:A, 7k0k:A, 7k0l:A, 7k0n:E, 7k0o:A, 7k0o:E, 7k0p:A, 7k0p:E, 7k0q:A, 6m4n:A, 6m4n:E, 7yiy:A, 7yj2:A
21 8qog:B 500 254 0.1565 0.1340 0.2638 1.11e-20 8iaj:A, 8iaj:E, 8iak:A, 8iak:E, 8qof:F, 8qof:B
22 8xha:A 401 350 0.2079 0.2219 0.2543 1.56e-14 8i7u:C, 8i7u:F, 8i7u:A, 8i7u:E, 8i7u:B, 8i7u:D, 8xha:B, 8xhd:A, 8xhd:B, 8xhk:C, 8xhk:A, 8xhk:B, 8xhk:E, 8xhk:D, 8xhk:F
23 2dr1:A 381 195 0.1192 0.1339 0.2615 0.010 2dr1:B
24 4uqv:G 429 261 0.1472 0.1469 0.2414 0.040 4uqv:A, 4uqv:B, 4uqv:C, 4uqv:D, 4uqv:E, 4uqv:F, 4uqv:H, 4uqv:I, 4uqv:J, 4uqv:K, 4uqv:L
25 6egr:A 396 177 0.0958 0.1035 0.2316 0.041 5d5s:A, 5e4z:A, 4hf8:A, 3jw9:A, 3jwa:A, 3jwb:A, 5k30:A, 5m3z:A, 3mkj:A, 4oma:A, 6s0c:A
26 2cfb:A 360 158 0.1028 0.1222 0.2785 0.046
27 1vjo:A 377 212 0.1192 0.1353 0.2406 0.050
28 7cep:A 414 96 0.0584 0.0604 0.2604 0.087 7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
29 3bn1:A 368 152 0.0888 0.1033 0.2500 0.10 3bn1:B, 3dr4:A, 3dr4:B, 3dr4:C, 3dr4:D, 3dr7:A, 3dr7:B, 3dr7:C, 3dr7:D
30 8odq:D 410 40 0.0374 0.0390 0.4000 0.12 8odq:B
31 4bhd:B 395 161 0.0935 0.1013 0.2484 0.13
32 6cbk:D 422 174 0.1075 0.1090 0.2644 0.16 6cbk:A, 6cbk:B, 6cbk:C, 6cbl:A, 6cbl:B, 6cbl:C, 6cbl:D, 6cbl:E, 6cbl:F, 6cbl:G, 6cbl:H, 6cbm:A, 6cbm:B, 6cbn:A, 6cbn:B
33 9azb:A 396 45 0.0304 0.0328 0.2889 0.82 9aza:A
34 1t3i:A 406 60 0.0421 0.0443 0.3000 1.1 1t3i:B
35 6a9t:A 417 94 0.0561 0.0576 0.2553 1.2 6a9u:A, 6a9v:A
36 5c37:A 632 26 0.0304 0.0206 0.5000 1.3 5c37:C, 6nna:A, 6nna:B, 4piv:A, 4piv:B
37 8eyi:F 1211 26 0.0304 0.0107 0.5000 1.3 4w9n:A, 4w9n:B, 4w9n:C, 4w9n:D
38 1ibj:A 380 122 0.0701 0.0789 0.2459 1.5 1ibj:C
39 8ffu:A 360 168 0.0818 0.0972 0.2083 1.7 8fft:A, 8fft:B, 8fft:C, 8fft:D, 8ffu:B, 8ffu:C, 8ffu:D
40 1dmu:A 299 55 0.0491 0.0702 0.3818 2.0
41 3w1k:B 452 179 0.1005 0.0951 0.2402 2.0 3w1k:A, 3w1k:C, 3w1k:D, 3w1k:E
42 3k28:A 423 170 0.0981 0.0993 0.2471 2.1 3k28:B, 3k28:C, 3k28:D
43 7kb1:A 428 128 0.0678 0.0678 0.2266 2.7 7kb1:B, 7kb1:C, 7kb1:D
44 3isl:A 387 58 0.0444 0.0491 0.3276 3.5 3isl:B
45 6ndn:A 406 40 0.0327 0.0345 0.3500 3.7 1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
46 1p0c:A 372 95 0.0561 0.0645 0.2526 4.0 1p0c:B, 1p0f:A, 1p0f:B
47 5v1x:D 447 57 0.0350 0.0336 0.2632 4.8 5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
48 8wi0:A 1220 62 0.0421 0.0148 0.2903 4.8 8kci:A, 8wi2:A, 8wi5:A
49 1deh:A 374 88 0.0467 0.0535 0.2273 5.0 1deh:B, 1hdx:A, 1hdx:B, 1hdy:A, 1hdy:B, 1hdz:A, 1hdz:B, 1hso:A, 1hso:B, 1hsz:A, 1hsz:B, 1ht0:A, 1ht0:B, 1htb:A, 1htb:B, 3hud:A, 3hud:B, 1u3t:A, 1u3t:B, 1u3u:A, 1u3u:B, 1u3v:A, 1u3v:B, 1u3w:A, 1u3w:B
50 2yri:A 352 59 0.0374 0.0455 0.2712 5.1 2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
51 6cbo:C 411 33 0.0280 0.0292 0.3636 5.3 6cbo:A, 6cbo:B, 6cbo:D, 5z83:A, 5z83:B, 5z8a:A, 5z8a:B, 5z8k:A, 5z8k:B
52 7td5:F 447 84 0.0537 0.0515 0.2738 6.6
53 1o9a:A 93 15 0.0164 0.0753 0.4667 6.9
54 8v83:b 423 84 0.0467 0.0473 0.2381 7.5 6elz:b, 6em1:b, 6em5:b, 7ohp:b, 7ohr:b, 7ohs:b, 7ohu:b, 7ohv:b, 8v84:b
55 7lm0:A 449 87 0.0537 0.0512 0.2644 8.7 7lm0:B
56 1v0w:A 496 37 0.0397 0.0343 0.4595 8.8 1v0r:A, 1v0t:A, 1v0u:A, 1v0v:A, 1v0y:A
57 5zss:A 388 29 0.0280 0.0309 0.4138 8.8
58 2f6j:A 168 118 0.0584 0.1488 0.2119 9.4 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
59 3bs8:A 430 60 0.0421 0.0419 0.3000 9.6
60 4ihh:E 340 161 0.0864 0.1088 0.2298 9.9 4ihf:D, 4ihf:E, 4ihf:F, 4ihf:A, 4ihf:B, 4ihf:C, 4ihg:E, 4ihg:C, 4ihg:B, 4ihg:D, 4ihh:A, 4ihh:C, 4ihh:B, 4ihh:D, 4ihh:F, 6p83:A, 6p83:C, 6p83:B, 6p84:A, 6p84:C, 6p84:B, 6p85:A, 6p85:C, 6p85:B, 6p86:A, 6p86:C, 6p86:B, 6p87:A, 6p87:C, 6p87:B, 6p88:A, 6p88:C, 6p88:B, 6p89:A, 6p89:C, 6p89:B, 6p8a:A, 6p8a:C, 6p8a:B, 6p8b:A, 6p8b:C, 6p8b:B
61 1l3i:A 186 21 0.0210 0.0484 0.4286 9.9 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218