BioLiP

>protein
LVRPKPLLLKLLKSVGAQKDTYTMKEVLFYLGQYIMTKRLYDEKQQHIVYCSNDLLGDLFGVPSFSVKEHRKIYTMIYRN
LVV

The query sequence (length=83) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2lzg:A	125	83	1.0000	0.6640	1.0000	5.30e-58	6aaw:A, 7ad0:A, 7ad0:F, 7ad0:B, 7ad0:C, 7ad0:D, 7ad0:E, 8aeu:A, 5afg:A, 2axi:A, 7bir:A, 7bit:A, 7biv:A, 7bj0:A, 7bj0:B, 7bj6:A, 7bmg:A, 5c5a:A, 5c5a:B, 4dij:A, 4dij:B, 8ei9:B, 8eia:B, 8eib:B, 8eic:B, 3eqs:A, 4ere:A, 4ere:B, 4erf:A, 4erf:C, 4erf:E, 8f0z:A, 8f10:A, 8f12:A, 8f13:A, 3g03:A, 3g03:C, 6ggn:A, 2gv2:A, 6h22:A, 6h22:B, 4hbm:A, 4hbm:B, 4hbm:C, 4hbm:D, 4hbm:E, 4hbm:F, 4hbm:G, 4hbm:H, 4hfz:A, 4hfz:C, 6hfa:A, 6hfa:B, 4hg7:A, 5hmh:A, 5hmh:B, 5hmi:A, 5hmi:B, 5hmk:A, 5hmk:B, 6i29:A, 6i3s:A, 3iux:A, 3iux:C, 3iwy:A, 3iwy:C, 5j7f:A, 5j7f:D, 5j7f:B, 5j7f:C, 5j7g:A, 5j7g:B, 5j7g:C, 5j7g:D, 8j81:A, 4jv7:A, 4jv9:A, 4jve:A, 4jvr:A, 4jvr:C, 4jvr:E, 4jwr:A, 4jwr:B, 4jwr:C, 3jzk:A, 3jzr:A, 3jzs:A, 7kjm:A, 7kjm:C, 6kzu:A, 5lav:A, 5law:A, 5lay:A, 5lay:B, 5lay:C, 5lay:D, 5lay:E, 5lay:F, 5laz:A, 3lbk:A, 3lbl:A, 3lbl:C, 3lbl:E, 3lnj:A, 3lnj:C, 3lnj:E, 3lnz:A, 3lnz:C, 3lnz:E, 3lnz:G, 3lnz:I, 3lnz:K, 3lnz:M, 3lnz:O, 5ln2:A, 4mdn:A, 4mdq:A, 2mps:A, 7na1:A, 7na1:B, 7na2:A, 7na2:B, 7na3:A, 7na4:A, 7nus:A, 7nus:B, 7nus:C, 4oas:A, 4oas:C, 4oas:E, 5oai:A, 4oba:A, 4oba:B, 4oba:C, 4occ:A, 4occ:C, 4occ:E, 5oc8:A, 4ode:A, 4odf:A, 4ogn:A, 4ogt:A, 4ogv:A, 4ogv:B, 4ogv:C, 4oq3:A, 4oq3:B, 4oq3:C, 4oq3:D, 6q96:A, 6q96:B, 6q9h:A, 6q9l:A, 6q9l:B, 6q9o:A, 6q9o:B, 7qdq:A, 4qo4:A, 4qoc:A, 4qoc:C, 4qoc:G, 4qoc:E, 4qoc:I, 4qoc:K, 1rv1:A, 1rv1:B, 1rv1:C, 6t2d:A, 6t2e:A, 6t2f:A, 1t4e:A, 1t4e:B, 1t4f:M, 3tj2:A, 3tj2:C, 3tpx:A, 3tpx:C, 3tpx:E, 5trf:A, 5trf:B, 5trf:C, 5trf:D, 5trf:E, 3tu1:A, 4ud7:A, 4ud7:B, 4ud7:C, 4ud7:D, 4ue1:A, 4ue1:B, 4ue1:C, 4ue1:D, 4umn:A, 4umn:B, 5umm:A, 5umm:C, 3v3b:B, 3v3b:A, 3vbg:A, 3vbg:B, 3vbg:C, 3vbg:D, 5vk0:A, 5vk0:M, 5vk0:C, 5vk0:E, 5vk0:K, 5vk0:G, 5vk0:Q, 5vk0:I, 5vk0:O, 5vk0:S, 5vk0:U, 5vk0:W, 3vzv:A, 3vzv:B, 3w69:A, 3w69:B, 4wt2:A, 5xxk:A, 5xxk:B, 6y4q:A, 6y4q:B, 1ycr:A, 5z02:A, 4zfi:A, 4zfi:B, 4zfi:C, 4zfi:D, 4zgk:A, 4zgk:B, 5zxf:A, 4zyc:A, 4zyc:C, 4zyc:B, 4zyf:A, 4zyi:A
2	1ttv:A	107	82	0.7711	0.5981	0.7805	1.16e-44	4ipf:A, 4j3e:A, 4j74:A, 4j7d:A, 4j7e:A, 4jrg:A, 4jrg:B, 4jsc:A, 4jsc:B, 4lwt:A, 4lwu:A, 4lwv:A, 4lwv:B, 4lwv:C, 1ycq:A
3	2z5t:O	93	82	0.5422	0.4839	0.5488	4.98e-28	3dac:M, 3dac:A, 8ebk:A, 8gjs:A, 4n5t:A, 6v4e:A, 6v4e:B, 6v4f:A, 6v4g:A, 6v4h:A, 6v4h:C, 2z5s:M, 2z5s:N, 2z5s:O, 2z5t:M, 2z5t:N
4	8hdg:D	98	82	0.5663	0.4796	0.5732	1.69e-22	7c3q:A, 7c3y:A, 7c44:A, 3dab:A, 3dab:C, 3dab:E, 3dab:G, 7el4:A, 3eqy:A, 3eqy:B, 3fdo:A, 3fe7:A, 3fea:A, 8hdg:A, 8hdg:C, 8hdg:B, 8ia5:A, 3jzo:A, 3jzp:A, 3jzq:A, 3jzq:B, 7kjn:A, 3lbj:E, 2mwy:A, 2n06:A, 2n0u:A, 2n0w:A, 2n14:A, 6q9q:A, 6q9q:B, 6q9q:C, 6q9q:D, 6q9s:A, 6q9s:B, 6q9s:C, 6q9u:A, 6q9w:A, 6q9w:B, 6q9y:A, 6q9y:B, 4rxz:A, 4rxz:B, 3u15:A, 3u15:B, 3u15:C, 3u15:D, 5uml:A, 5uml:B, 5uml:E, 5uml:G, 5vk1:A, 5vk1:I, 5vk1:C, 5vk1:E, 5vk1:G, 5vk1:K, 5vk1:M, 5vk1:O
5	8rta:E	169	62	0.1928	0.0947	0.2581	0.34
6	4gvq:A	315	55	0.1807	0.0476	0.2727	1.2	4gvq:B, 4gvs:B
7	3icq:T	949	40	0.1687	0.0148	0.3500	3.3	3icq:U
8	8aic:A	330	25	0.1205	0.0303	0.4000	4.7	8aez:A, 8aic:B
9	1k4y:A	501	20	0.1325	0.0220	0.5500	5.9
10	6agg:Z	420	37	0.1325	0.0262	0.2973	6.5	3amt:A, 3amu:A, 3au7:A, 4rvz:Z, 5xob:Z
11	6puu:A	1309	98	0.2771	0.0176	0.2347	7.2	8e6t:A, 8e6t:B, 8e6t:C, 8e6t:D, 6pur:A, 6pur:B, 6pur:C, 6pur:D, 6pus:A, 6pus:C, 6pus:D, 6pus:B, 6puu:B, 6puu:C, 6puu:D
12	7pua:IA	704	51	0.2048	0.0241	0.3333	9.1	7pub:IA

[Back]