BioLiP

>protein
LVPRGSHMTSVYTIAEVEAMTGLSAEVLRQWERRYGFPKPRRRLYSAEDVEALKTIKRWLEEGATPKAAIRRYLAQEVRP
EDLGTGLLEALLRGDLAGAEALFRRGLRFWGPEGVLEHLLLPVLREVGEAWHRGEIGVAEEHLASTFLRARLQELLDLAG
FPPGPPVLVTTPPGERHEIGAMLAAYHLRRKGVPALYLGPDTPLPDLRALARRLGAGAVVLSAVLSEPLRALPDGALKDL
APRVFLGGQGAGPEEARRLGAEYMEDLKGLAEALWLP

The query sequence (length=277) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5c8d:E	280	274	0.9639	0.9536	0.9745	0.0	8c31:A, 8c31:B, 8c31:C, 8c31:D, 8c32:A, 8c32:B, 8c32:C, 8c32:D, 8c33:A, 8c33:B, 8c33:C, 8c33:D, 8c34:A, 8c34:B, 8c34:C, 8c34:D, 8c35:A, 8c35:B, 8c35:C, 8c35:D, 8c36:A, 8c36:B, 8c36:C, 8c36:D, 8c37:A, 8c37:B, 8c37:C, 8c37:D, 8c73:A, 8c73:B, 8c73:C, 8c73:D, 8c76:A, 8c76:B, 8c76:C, 8c76:D, 5c8a:A, 5c8a:B, 5c8a:C, 5c8a:D, 5c8d:A, 5c8d:B, 5c8d:C, 5c8d:D, 5c8d:F, 5c8d:G, 5c8d:H, 5c8e:A, 5c8e:B, 5c8e:C, 5c8e:E, 5c8e:F, 5c8e:G, 5c8e:D, 5c8e:H, 5c8f:A, 3whp:A
2	7te2:A	205	71	0.1119	0.1512	0.4366	7.53e-10
3	8j2y:A	327	156	0.1805	0.1529	0.3205	1.40e-06	8j2y:B
4	5i44:B	68	63	0.0758	0.3088	0.3333	6.13e-06	5i44:A, 5i44:D, 5i44:E, 5i44:H, 5i44:J, 5i44:K, 5i44:G, 5i44:F, 5i44:I
5	8j2x:A	337	184	0.2130	0.1751	0.3207	4.55e-04	8j2w:A, 8j2w:B
6	4jgi:B	206	147	0.1300	0.1748	0.2449	0.010	4jgi:A
7	4r24:B	85	71	0.0975	0.3176	0.3803	0.041	4r22:B
8	7tec:A	72	58	0.0722	0.2778	0.3448	0.070
9	4z17:A	424	98	0.1191	0.0778	0.3367	0.084	4yws:A, 4z17:B, 4z1y:A, 4z1y:B
10	7tea:B	78	59	0.0722	0.2564	0.3390	0.098	7tea:E, 7tea:A, 7tea:C
11	7xcn:P	215	212	0.1877	0.2419	0.2453	0.10	7xcn:M, 7xcn:N, 7xcn:O, 7xcn:Q, 7xcn:R
12	4r4e:B	84	75	0.0975	0.3214	0.3600	0.10
13	4gcy:A	163	51	0.0758	0.1288	0.4118	0.15	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
14	3c9h:B	339	64	0.0686	0.0560	0.2969	1.1	3c9h:A
15	6jni:A	145	51	0.0614	0.1172	0.3333	2.5	6jgw:B, 6jgw:A, 6jgx:A, 6jgx:B, 6jni:B, 6jni:H, 6jni:C, 6jni:D, 6jni:E, 6jni:F, 6jni:G, 6jyw:A, 6jyw:B
16	2l6e:A	94	14	0.0397	0.1170	0.7857	2.9
17	2fge:A	979	77	0.0866	0.0245	0.3117	4.2	2fge:B
18	7y5f:B	341	39	0.0542	0.0440	0.3846	4.3	7vgn:A, 7y5f:A, 7y5i:A, 7y5i:B, 7y5p:A, 7y5p:B, 7yhe:A, 7yhe:B, 7yw9:A
19	2rh4:B	268	62	0.0794	0.0821	0.3548	4.5	3csd:B, 3csd:A, 4dbz:A, 4dbz:B, 4dc0:A, 4dc0:B, 4dc1:A, 4dc1:B, 3qrw:A, 3qrw:B, 2rh4:A, 2rhc:B, 2rhc:A, 2rhr:B, 2rhr:A, 3ri3:B, 3ri3:A, 1w4z:A, 1w4z:B, 1x7g:A, 1x7g:B, 1x7h:A, 1x7h:B, 1xr3:A, 1xr3:B
20	8swu:A	269	35	0.0578	0.0595	0.4571	5.8	8swu:B, 8swu:C
21	4ua1:B	125	55	0.0650	0.1440	0.3273	6.4	4ua1:A
22	8uau:A	332	95	0.1011	0.0843	0.2947	6.5
23	5af7:B	391	131	0.1047	0.0742	0.2214	7.0	5af7:A, 5ahs:A, 5ahs:B, 5ahs:C, 5ahs:E, 5ahs:F, 5ahs:D
24	4xvi:A	647	122	0.1336	0.0572	0.3033	7.5	4xvk:A, 4xvl:A, 4xvm:A
25	7oxl:A	442	30	0.0505	0.0317	0.4667	8.4
26	7oy0:A	462	30	0.0505	0.0303	0.4667	8.4
27	7acs:A	140	29	0.0469	0.0929	0.4483	8.8	7act:A, 8iv3:D, 8j6x:A, 8j6x:D, 6vyo:A, 6vyo:B, 6vyo:C, 6vyo:D, 6wkp:B, 6wkp:C, 6wkp:D, 7xwz:A, 7xwz:B, 7xx1:A, 7xx1:B, 7xx1:C, 7xx1:D
28	8ppg:B	243	41	0.0542	0.0617	0.3659	9.1
29	7pwd:A	621	31	0.0397	0.0177	0.3548	9.3	6c2y:A, 3cik:A, 5he1:A, 7k7l:A, 3krw:A, 3krx:A, 3pvu:A, 3pvw:A, 5ukk:A, 5wg3:A, 5wg5:A

[Back]