BioLiP

>protein
LVPRGSHMTQADVLVVGGVGVDHIVRVKSLPLPVVDSMMVPPIVTVVGHTGNGVALGVHALGRASAMADVIGDDAEGRLI
QDAYSAAGIPITFVTHISGTRRSVNLVTEEGQRMSLYDPRHPFEFIPDPSLWREGIERSRHVHVSIMNWARYALRDAVAA
GRSTSTDLHDWDGVADYHKDFAYGADYVFVSAAALRDESGVVADVFARGRAQFVVVMAGSEGARVWRRSDELPLRISPIS
IPGRPVVDSNGAGDSFVAAFLCHYLDHGDIFGAARAGAVGGAWACGTLGTHTSFVDVETLERLLAR

The query sequence (length=306) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6wb4:B	306	306	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6wb4:A, 6wb5:A, 6wb5:B
2	6wb7:A	296	294	0.3824	0.3953	0.3980	7.93e-57	6wb7:B, 6wb7:C, 6wb7:D
3	3in1:A	312	319	0.2418	0.2372	0.2320	8.13e-09	3in1:B
4	2c49:A	299	293	0.2026	0.2074	0.2116	4.58e-07	2c49:B
5	8cqx:A	300	309	0.2451	0.2500	0.2427	3.25e-06	8cqx:B, 8cqx:C, 8cqx:D, 6znx:A, 6znx:B, 6znx:D
6	3ubo:A	338	318	0.2680	0.2426	0.2579	1.04e-04	3ubo:B
7	7fca:D	282	38	0.0588	0.0638	0.4737	0.011	7cf8:A, 7cf8:E, 7fca:A, 7fca:E
8	6ils:B	313	106	0.1078	0.1054	0.3113	0.011	6ils:A, 6ilt:A, 6ilt:B
9	3lki:B	322	238	0.1961	0.1863	0.2521	0.012
10	5c41:A	317	72	0.0850	0.0820	0.3611	0.014	5byf:A, 5byf:B, 5c3y:A, 5c3y:B, 5c3y:C, 5c3y:D, 5c3y:E, 5c3y:F, 5c3y:G, 5c3y:H, 5c3y:I, 5c3y:J, 5c3y:K, 5c3y:L, 5c3z:A, 5c3z:B, 5c40:A, 5c40:B, 5c41:B, 5c41:C, 5c41:D, 2fv7:A, 2fv7:B, 6wjz:A, 6wjz:B, 6wk0:A, 6wk0:B, 6wk0:C, 6wk0:D
11	3loo:B	341	94	0.0915	0.0821	0.2979	0.069	3loo:A, 3loo:C
12	3ven:A	571	59	0.0654	0.0350	0.3390	0.14	3veo:A, 3ver:A, 3ves:A, 3vet:A, 3vew:A, 3vex:A, 3vez:A, 3vf2:A, 3vf4:A
13	6znx:C	265	296	0.2059	0.2377	0.2128	0.17
14	4k8p:A	332	312	0.2745	0.2530	0.2692	0.17	4e3a:A, 4e3a:B, 4jks:A, 4jks:B, 4jku:A, 4jku:B, 4k8c:A, 4k8c:B, 4k8k:A, 4k8k:B, 4k8p:B, 4k8t:A, 4k8t:B, 4k93:A, 4k93:B, 4k9c:A, 4k9c:B, 4k9i:A, 4k9i:B, 4kad:A, 4kad:B, 4kah:A, 4kah:B, 4kal:A, 4kal:B, 4kan:A, 4kan:B, 4kbe:A, 4kbe:B, 4lbg:A, 4lbg:B, 4lbx:A, 4lbx:B, 4lc4:A, 4lc4:B, 4lca:A, 4lca:B
15	8om2:K	151	52	0.0588	0.1192	0.3462	0.19	8d8k:K, 8d8l:K, 5mrc:KK, 5mre:KK, 5mrf:KK, 8om3:K, 8om4:K
16	3vtf:A	432	44	0.0719	0.0509	0.5000	0.43
17	2i6a:A	343	34	0.0425	0.0379	0.3824	0.50	1bx4:A, 2i6a:B, 2i6a:C, 2i6a:D, 2i6b:A, 2i6b:B, 5kb5:A, 5kb6:A, 5kb6:B, 4o1l:A, 4o1l:B
18	1gqt:B	307	100	0.0850	0.0847	0.2600	0.52	1gqt:A, 1gqt:C, 1gqt:D, 1rk2:A, 1rk2:B, 1rk2:C, 1rk2:D, 1rkd:A, 1rks:A
19	3uq6:A	345	67	0.0654	0.0580	0.2985	0.61	4dc3:A, 4dc3:B, 3uq6:B, 3uq9:A, 3uq9:B, 3vaq:A, 3vaq:B, 3vas:A, 3vas:B
20	6d2v:A	315	20	0.0425	0.0413	0.6500	1.2	6d2v:B, 6nd7:A, 6nd7:B
21	3n1c:A	309	104	0.0915	0.0906	0.2692	2.0	3cqd:A, 3cqd:B, 3n1c:D, 3n1c:B, 3n1c:C, 3umo:A, 3umo:B, 3ump:A, 3ump:B, 3uqd:A, 3uqd:C, 3uqd:B, 3uqd:D, 3uqe:A, 3uqe:B
22	3k8d:A	246	74	0.0686	0.0854	0.2838	2.4	3k8d:B, 3k8d:C, 3k8d:D
23	3b1n:B	320	114	0.1013	0.0969	0.2719	2.4	3b1n:A, 3b1p:A, 3b1q:A, 3b1q:B, 3b1q:C, 3b1q:D, 3b1q:E, 3b1q:F, 3b1r:A, 3b1r:B, 3b1r:C, 3b1r:D, 3b1r:E, 3b1r:F
24	8rdj:D	611	158	0.1176	0.0589	0.2278	2.5	8ras:D
25	4wdi:A	277	85	0.0784	0.0866	0.2824	3.6	8d5j:A, 8d5k:A, 2fwo:A, 5gr7:A, 5gsb:A, 5gsr:A, 5gsr:C, 5gsv:A, 5gsx:A, 5gsx:D, 5trz:A, 5trz:C, 5ts1:A, 5ts1:C, 5ts1:E, 5ts1:G, 1vgk:A, 4wdi:D, 4z76:A, 4z76:D, 4z77:A, 4z77:D, 4z78:A, 4z78:D, 4z78:G
26	2a9y:A	351	16	0.0359	0.0313	0.6875	4.5	2a9z:A, 2aa0:A, 2ab8:A, 2abs:A, 1dgm:A, 1lii:A, 1lij:A, 1lik:A
27	1v1a:A	301	281	0.2124	0.2159	0.2313	4.5	1v1a:B, 1v1b:A, 1v1b:D, 1v1b:B, 1v1b:C
28	6rxu:CR	760	73	0.0556	0.0224	0.2329	5.7	6rxv:CR, 6rxx:CR, 6rxz:CR
29	8h0m:A	392	18	0.0359	0.0281	0.6111	6.5	8gqr:A, 8gqr:B
30	4n09:A	345	32	0.0425	0.0377	0.4062	7.7	4n09:B, 4n09:C, 4n09:D, 3otx:A, 3otx:B, 2xtb:A
31	2var:A	311	60	0.0588	0.0579	0.3000	8.2	2var:B, 2var:C
32	7ag6:A	302	247	0.1765	0.1788	0.2186	8.4	7ag6:B, 7agh:C, 7agh:D, 7agh:A, 7agh:B, 7agk:A, 7agk:B, 7agk:C

[Back]