Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LVKFMDENSIDRVFIAKPVNVYYFSGTSPLGGGYIIVDGDEATLYVPELEYEMAKEESKLPVVKFKKFDEIYEILKNTET
LGIEGTLSYSMVENFKEKSVKEFKKIDDVIKDLRIIKTKEEIEIIEKACEIADKAVMAAIEEITEGKREREVAAKVEYLM
KMNGAEKPAFDTIIASGHRSALPHGVASDKRIERGDLVVIDLGALYNHYNSDITRTIVVGSPNEKQREIYEIVLEAQKRA
VEAAKPGMTAKELDSIAREIIKEYGYGDYFIHSLGHGVGLEIHEWPRISQYDETVLKEGMVITIEPGIYIPKLGGVRIED
TVLITENGAKRLTKTER

The query sequence (length=337) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1pv9:A 337 337 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 1pv9:B 318 338 0.9288 0.9843 0.9260 0.0
3 1wy2:A 351 338 0.8101 0.7778 0.8077 0.0 1wy2:B
4 3q6d:A 355 344 0.4362 0.4141 0.4273 1.84e-84 3q6d:B, 3q6d:C, 3q6d:D
5 2zsg:A 356 347 0.4303 0.4073 0.4179 4.00e-84
6 5cnx:A 360 348 0.4184 0.3917 0.4052 2.96e-77 5cnx:B, 5cnx:C
7 7k3u:A 362 348 0.3858 0.3591 0.3736 6.22e-75 7k3u:B, 7k3u:C, 7k3u:D, 7k3u:E, 7k3u:F, 7k3u:G, 7k3u:H, 7k3u:I, 7k3u:J, 7n02:A, 7n02:B, 6xmr:A, 6xmr:B, 4zng:C, 4zng:B, 4zng:A
8 5cdl:A 349 342 0.3976 0.3840 0.3918 2.60e-73 5cdv:A, 5giq:A
9 4fkc:A 370 339 0.4184 0.3811 0.4159 1.93e-70 4rgz:A, 4rgz:N, 4rgz:1, 4rgz:e
10 1wn1:A 356 351 0.3976 0.3764 0.3818 1.36e-68 1wn1:B
11 4ege:A 371 223 0.2611 0.2372 0.3946 3.72e-49
12 5cde:A 398 350 0.2819 0.2387 0.2714 4.07e-41 5cde:B, 5fcf:A, 5fcf:B, 5fch:A, 5fch:B, 4r60:A, 4r60:B
13 3ig4:A 419 238 0.2582 0.2076 0.3655 8.71e-38 3ig4:B, 3ig4:C, 3ig4:D, 3ig4:E, 3ig4:F
14 2bh3:A 440 255 0.2433 0.1864 0.3216 7.74e-37 1a16:A, 2bha:A, 2bhb:A, 2bhd:A, 2bn7:A, 2bws:A, 2bwt:A, 2bwv:A, 2bww:A, 2bwx:A, 2bwy:A, 1jaw:A, 1m35:A, 1m35:B, 1m35:C, 1m35:D, 1m35:E, 1m35:F, 1n51:A, 2v3x:A, 2v3y:A, 2v3z:A, 1w2m:A, 1w2m:B, 1w2m:C, 1w2m:D, 1w2m:E, 1w2m:F, 1w7v:A, 1w7v:B, 1w7v:C, 1w7v:D, 1wbq:A, 1wbq:B, 1wbq:C, 1wbq:D, 1wl6:A, 1wl9:A
15 5wze:B 449 267 0.2552 0.1915 0.3221 2.34e-36 5wze:A, 5wze:C, 5wze:D
16 4pv4:A 436 324 0.2819 0.2179 0.2932 2.98e-33 4pv4:B
17 5x49:A 441 261 0.2463 0.1882 0.3180 9.22e-30 5x49:B
18 6a9t:A 417 270 0.2285 0.1847 0.2852 7.68e-27 6a9u:A, 6a9v:A
19 5mc1:B 485 401 0.3056 0.2124 0.2569 3.05e-25 6h2p:A, 6h2p:B, 6h2q:A, 6h2q:B, 5m4g:A, 5m4g:B, 5m4j:A, 5m4j:B, 5m4l:A, 5m4l:B, 5m4q:A, 5m4q:B, 5mby:A, 5mby:B, 5mbz:A, 5mbz:B, 5mc0:A, 5mc0:B, 5mc1:A, 5mc2:A, 5mc2:B, 5mc3:A, 5mc3:B, 5mc4:A, 5mc4:B, 5mc5:A, 5mc5:B, 2okn:A, 2okn:B, 6qsb:A, 6qsb:B, 6qsc:A, 6qsc:B, 6sre:A, 6sre:B, 6srf:A, 6srf:B, 6srg:B
20 6srg:A 455 387 0.2878 0.2132 0.2506 1.75e-22
21 8khn:A 287 244 0.1780 0.2091 0.2459 3.64e-19 8kho:A
22 4s2r:P 615 244 0.2107 0.1154 0.2910 2.35e-17 4s2r:Q, 4s2t:P, 4s2t:Q
23 6yo9:A 398 257 0.1751 0.1482 0.2296 8.18e-17 6twk:A, 6twk:B, 6yo9:B
24 5jqk:A 631 224 0.2107 0.1125 0.3170 1.31e-16 5jqk:B, 5jr6:A
25 1chm:A 401 247 0.1929 0.1621 0.2632 3.11e-16 1chm:B
26 3s6b:A 345 248 0.1929 0.1884 0.2621 6.94e-16
27 3ctz:A 617 165 0.1602 0.0875 0.3273 1.04e-15
28 5jr6:B 545 276 0.2344 0.1450 0.2862 1.47e-15
29 1qxw:A 249 209 0.1988 0.2691 0.3206 1.44e-14 1qxy:A, 1qxz:A
30 8p2k:MA 315 244 0.1751 0.1873 0.2418 3.01e-14 2b3h:A, 2b3k:A, 9f1d:EA, 4fli:A, 4flj:A, 4flk:A, 4fll:A, 2g6p:A, 2gz5:A, 4hxx:A, 4ikr:A, 4iks:A, 4ikt:A, 4iku:A, 4iu6:A, 6lzb:A, 6lzc:A, 2nq6:A, 2nq7:A, 4u1b:A, 4u69:A, 4u6c:A, 4u6e:A, 4u6j:A, 4u6w:A, 4u6z:A, 4u70:A, 4u71:A, 4u73:A, 4u75:A, 4u76:A, 5ykp:A, 5yr4:A, 5yr5:A, 5yr6:A, 5yr7:A
31 4fuk:A 329 226 0.1662 0.1702 0.2478 1.40e-13 4fuk:B
32 4a6v:A 264 172 0.1395 0.1780 0.2733 1.56e-13 4a6v:B, 4a6w:A, 2bb7:A, 1c21:A, 1c22:A, 1c23:A, 1c24:A, 1c27:A, 3d27:A, 2evc:A, 2evm:A, 2evo:A, 2evo:B, 2gg0:A, 2gg2:A, 2gg3:A, 2gg5:A, 2gg7:A, 2gg8:A, 2gg9:A, 2ggb:A, 2ggc:A, 2gtx:A, 2gtx:B, 2gu4:A, 2gu4:B, 2gu5:A, 2gu5:B, 2gu6:A, 2gu6:B, 2gu7:A, 2gu7:B, 1mat:A, 2mat:A, 3mat:A, 2p98:A, 2p99:A, 2p9a:A, 4pnc:A, 2q92:A, 2q93:A, 2q94:A, 2q95:A, 2q96:A, 1xnz:A, 1yvm:A, 4z7m:A, 4z7m:B
33 3l24:B 417 273 0.2047 0.1655 0.2527 1.02e-12 3l24:C, 3l7g:B, 3l7g:C
34 3mx6:B 260 147 0.1187 0.1538 0.2721 1.24e-12 3mr1:A, 3mr1:B, 3mr1:C, 3mr1:D, 3mx6:A
35 8bqd:x 367 263 0.2166 0.1989 0.2776 1.57e-12 8bqx:x
36 3iu7:A 284 244 0.1810 0.2148 0.2500 2.67e-12 4iec:A, 4if7:A, 3iu8:A, 3iu9:A, 4ook:A, 3pka:A, 3pkb:A, 3pkc:A, 3pkd:A, 3pke:A, 3ror:A, 1yj3:A, 5yoh:A, 5yoi:A, 5ypd:A, 5ypj:A, 5yxf:A
37 4qr8:A 441 293 0.2136 0.1633 0.2457 3.18e-12 4qr8:B
38 4fo8:C 266 245 0.1780 0.2256 0.2449 6.46e-12 4fo7:A, 4fo7:B, 4fo7:C, 4fo7:D, 4fo8:A, 4fo8:B, 4fo8:D, 4juq:A, 4juq:B, 4juq:C, 4juq:D
39 4zwu:A 435 287 0.2018 0.1563 0.2369 4.65e-10 3l24:A, 3l7g:A, 4zwo:A, 4zwo:B, 4zwp:A, 4zwp:B, 4zwu:B
40 3rva:A 445 283 0.1869 0.1416 0.2226 6.38e-10
41 6ah7:A 439 292 0.2047 0.1572 0.2363 1.18e-09 6ah7:B, 6ah7:C, 6ah7:D, 6ah8:A, 6ah8:B, 6ah8:C, 6ah8:D, 7e5c:A, 7e5c:B, 7e5c:C, 7e5c:D
42 4b28:A 437 266 0.2107 0.1625 0.2669 1.76e-08
43 5xev:A 409 185 0.1513 0.1247 0.2757 2.15e-08
44 4rzy:A 439 244 0.1751 0.1344 0.2418 2.14e-07 4rzy:B, 4rzy:C, 4rzy:D, 4rzz:A, 4rzz:B, 4rzz:C, 4rzz:D, 4s00:A, 4s00:B, 4s00:C, 4s00:D, 4s01:A, 4s01:B, 4s01:C, 4s01:D
45 2dfi:A 301 196 0.1721 0.1927 0.2959 5.63e-06 2dfi:B, 6m00:A, 1wkm:A, 1wkm:B, 1xgm:A, 1xgm:B, 1xgn:A, 1xgn:B, 1xgs:A, 1xgs:B
46 2dfi:A 301 91 0.0890 0.0997 0.3297 0.31 2dfi:B, 6m00:A, 1wkm:A, 1wkm:B, 1xgm:A, 1xgm:B, 1xgn:A, 1xgn:B, 1xgs:A, 1xgs:B
47 3tav:A 264 239 0.1721 0.2197 0.2427 2.39e-05 3tav:B
48 2ycb:B 635 89 0.0742 0.0394 0.2809 0.67 2ycb:A
49 7uoo:4 538 124 0.0890 0.0558 0.2419 0.77 6ft6:4, 3jct:4, 6m62:4, 6rzz:r, 7uqb:4, 7uqz:4, 7v08:4, 6ylg:4, 6ylh:4
50 4v7f:l 380 119 0.0772 0.0684 0.2185 0.80 5jcs:u, 4v8t:t
51 8hfr:pT 580 124 0.0890 0.0517 0.2419 0.99 5apn:x, 5apo:x, 7z34:4
52 7vbq:A 276 47 0.0475 0.0580 0.3404 1.0
53 7bhp:A 322 79 0.0742 0.0776 0.3165 2.4
54 8on7:A 525 83 0.0653 0.0419 0.2651 2.6 8on7:B, 8on7:C, 8on9:A, 8on9:B, 8on9:C, 8ona:A, 8ona:B, 8ona:C
55 8opc:Aa 226 80 0.0623 0.0929 0.2625 3.4 6hxx:AA, 6hxx:AB, 6hxx:AC, 6hxx:AD, 6hxx:AE, 6hxx:AF, 6hxx:AG, 6hxx:AH, 6hxx:AI, 6hxx:AJ, 6hxx:AK, 6hxx:AL, 6hxx:AM, 6hxx:AN, 6hxx:AO, 6hxx:AP, 6hxx:AQ, 6hxx:AR, 6hxx:AS, 6hxx:AT, 6hxx:AU, 6hxx:AV, 6hxx:AW, 6hxx:AX, 6hxx:AY, 6hxx:AZ, 6hxx:BA, 6hxx:BB, 6hxx:BC, 6hxx:BD, 6hxx:BE, 6hxx:BF, 6hxx:BG, 6hxx:BH, 6hxx:BI, 8opc:Ac, 8opc:Ae, 8opc:Ag, 8opc:Ai, 8opc:Ak, 8opc:Am, 8opc:Ao, 8opc:Aq, 8opc:As, 8opc:Au, 8opc:Aw, 8opc:Ay, 8opc:Ba, 8opc:Bc, 8opc:Be, 8opc:Bg, 8opc:Bi, 8opc:Bk, 8opc:Bm, 8opc:Bo, 8opc:Bq, 8opc:Bs, 8opc:Bu, 8opc:Bw, 8opc:By, 8opc:Ca, 8opc:Cc, 8ope:Aa, 8ope:Ac, 8ope:Ae, 8ope:Ag, 8ope:Ai, 8ope:Ak, 8ope:Am, 8ope:Ao, 8ope:Aq, 8ope:As, 8ope:Au, 8ope:Aw, 8ope:Ay, 8ope:Ba, 8ope:Bc, 8ope:Be, 8ope:Bg, 8ope:Bi, 8ope:Bk, 8ope:Bm, 8ope:Bo, 8opl:Af, 8opl:Aa, 8opl:Ag, 8opl:Ac, 8opl:Ae, 8opl:Ad, 8opl:Ab, 8opl:Ah, 8opl:Ai, 8opl:Az, 8opl:Aw, 8opl:Au, 8opl:Av, 8opl:Ay, 8opl:At, 8opl:As, 8opl:Ax, 8opl:Ba, 8opl:Bp, 8opl:Bl, 8opl:Bn, 8opl:Bs, 8opl:Bq, 8opl:Bo, 8opl:Br, 8opl:Bk, 8opl:Bm
56 5m1j:A6 539 103 0.0564 0.0353 0.1845 3.6
57 4fdg:B 592 88 0.0593 0.0338 0.2273 3.9 8eaf:A, 8eaf:B, 8eaf:C, 8eaf:D, 8eaf:E, 8eaf:F, 8eag:B, 8eag:C, 8eag:D, 8eag:E, 8eag:F, 8eag:A, 8eah:A, 8eah:B, 8eah:C, 8eah:D, 8eah:E, 8eah:F, 8eai:B, 8eai:C, 8eai:D, 8eai:E, 8eai:F, 8eai:A, 8eaj:A, 8eaj:B, 8eaj:C, 8eaj:D, 8eaj:E, 8eaj:F, 8eak:B, 8eak:C, 8eak:D, 8eak:E, 8eak:A, 8eak:F, 8eal:A, 8eal:B, 8eal:C, 8eal:D, 8eal:E, 8eal:F, 8eam:B, 8eam:C, 8eam:D, 8eam:E, 8eam:A, 8eam:F, 4fdg:A, 4fdg:C, 4fdg:D, 4fdg:E, 6mii:A, 6mii:B, 6mii:C, 6mii:D, 6mii:E, 6mii:F, 2vl6:A, 2vl6:B, 2vl6:C, 6wnz:B, 6wnz:A
58 7w6b:A 782 93 0.0564 0.0243 0.2043 4.1 7vcn:C, 7vcn:A, 7vcn:D, 7vcn:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218