Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LTVEPNLHSLITSTTHKWIFVGGKGGVGKTTSSCSIAIQMALSQPNKQFLLISTDPAHNLSDAFGEKFGKDARKVTGMNN
LSCMEIDPSAALKDMNDMASIPGIDEALSFMEVMKHIKRQEQGEGETFDTVIFDTAPTGHTLRFLQLPNTLSKLLEKFNV
DISGKLNELKANVETIRQQFTDPDLTTFVCVCISEFLSLYETERLIQELISYDMDVNSIIVNQLLFAENDQEHNCKRCQA
RWKMQKKYLDQIDELYEDFHVVKMPLCAGEIRGLNNLTKFSQFLNKEYNPITDGKVIYELEDKE

The query sequence (length=304) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3sja:A 338 338 0.9934 0.8935 0.8935 0.0 3a36:B, 3a37:B, 3b2e:B, 3b2e:C, 3sja:E
2 3sjd:C 292 301 0.9572 0.9966 0.9668 0.0 3sjd:A, 3sjd:B, 2woj:C, 3zs8:A
3 4xtr:B 311 316 0.9671 0.9453 0.9304 0.0 3b2e:A, 3b2e:D, 5bw8:B, 4pwx:A, 4pwx:B, 3vlc:A, 2woj:A, 2woj:B, 2woj:D, 4xtr:A, 4xvu:H, 4xvu:A, 4xvu:B, 4xvu:G, 4xwo:A, 4xwo:G, 4xwo:M, 4xwo:N, 4xwo:S, 4xwo:B, 4xwo:H, 4xwo:T, 3zs8:B, 3zs9:A, 3zs9:B
4 3a36:A 314 317 0.9572 0.9268 0.9180 0.0 3a37:A, 5bwk:N
5 3idq:A 272 299 0.8717 0.9743 0.8863 0.0
6 2woo:A 303 310 0.5691 0.5710 0.5581 3.37e-104 2woo:B, 2woo:C, 2woo:D, 2woo:E, 2woo:F
7 3io3:A 230 301 0.5493 0.7261 0.5548 4.23e-104
8 3ibg:A 300 313 0.5526 0.5600 0.5367 5.73e-103 3ibg:B, 3ibg:C, 3ibg:D, 3ibg:E, 3ibg:F
9 8odu:A 291 299 0.5362 0.5601 0.5452 2.91e-99
10 3iqx:A 261 290 0.5132 0.5977 0.5379 5.51e-94 3iqw:A, 3iqw:B, 3iqx:B
11 6so5:A 313 323 0.5066 0.4920 0.4768 3.78e-88 7ru9:A, 7ru9:B, 7rua:A, 7rua:B, 7ruc:A, 7ruc:B
12 7sq0:A 306 311 0.4638 0.4608 0.4534 1.32e-77 7sq0:B
13 7spz:A 328 326 0.4638 0.4299 0.4325 1.12e-76 7spy:A
14 8hac:B 327 328 0.4868 0.4526 0.4512 1.74e-75 8hac:A
15 3zq6:B 288 286 0.3783 0.3993 0.4021 1.90e-49 3zq6:C
16 3zq6:D 307 307 0.3717 0.3681 0.3681 1.33e-45 3zq6:A
17 3ug7:A 317 293 0.3125 0.2997 0.3242 7.63e-43 3ug6:A, 3ug6:B, 3ug6:C, 3ug6:D, 3ug7:B, 3ug7:C, 3ug7:D
18 1ii0:B 553 259 0.2632 0.1447 0.3089 1.51e-26 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
19 1ii0:B 553 141 0.1414 0.0778 0.3050 2.32e-04 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
20 5zme:A 638 291 0.2730 0.1301 0.2852 2.58e-25 5zmf:A
21 5zme:A 638 340 0.3026 0.1442 0.2706 1.55e-23 5zmf:A
22 6bs3:A 330 254 0.1743 0.1606 0.2087 5.01e-05 6bs4:A, 6bs5:A
23 8elf:B 384 201 0.1612 0.1276 0.2438 8.44e-05 8elf:A
24 5if9:A 251 177 0.1743 0.2112 0.2994 2.52e-04 5if9:B, 5ihp:A, 5ihp:B
25 6iub:A 264 42 0.0592 0.0682 0.4286 0.008 6iub:B, 6iuc:A, 6iuc:B, 6iuc:C, 6iuc:D, 6iud:B, 6iud:C, 6iud:D, 6iud:A, 8jmj:A, 8jmj:B, 8jmj:C, 8jmj:D, 8jmk:A, 8jmk:B, 8jmk:C, 8jmk:D, 8jml:A, 8jml:B
26 8egk:B 355 64 0.0625 0.0535 0.2969 0.009
27 2ynm:B 268 41 0.0592 0.0672 0.4390 0.031 2ynm:A
28 2bej:A 245 44 0.0559 0.0694 0.3864 0.034 2bek:A, 2bek:B, 2bek:C, 2bek:D
29 5tvk:B 242 123 0.1086 0.1364 0.2683 0.039 3k9g:A, 5tvk:A
30 3q9l:A 257 34 0.0559 0.0661 0.5000 0.064 3q9l:B, 3r9i:A, 3r9i:B, 3r9i:C, 3r9i:D, 3r9j:A, 3r9j:B
31 5k5z:D 314 41 0.0625 0.0605 0.4634 0.11 5k5z:A, 5u1j:B, 5u1j:A, 5u1j:C, 5u1j:D
32 3fwy:A 268 43 0.0592 0.0672 0.4186 0.16 3fwy:B, 6uyk:A, 6uyk:B, 6uyk:C, 6uyk:D
33 6bs3:B 355 170 0.1184 0.1014 0.2118 0.29 6bs4:B
34 4ggv:A 396 55 0.0625 0.0480 0.3455 0.34
35 6riq:C 254 25 0.0428 0.0512 0.5200 0.36 6riq:D, 6riq:G, 6riq:J, 6riq:K, 6riq:M, 6riq:N, 6riq:Q, 6riq:R, 6riq:U, 6riq:V
36 5u1g:D 211 53 0.0691 0.0995 0.3962 0.38 4dzz:A, 4dzz:B, 4e03:A, 4e03:B, 4e07:A, 4e07:B, 4e09:A, 5u1g:B, 5u1g:C, 5u1g:A
37 5h92:B 572 48 0.0559 0.0297 0.3542 0.42 5h8v:A, 5h8v:B, 5h8y:A, 5h8y:B, 5h8y:C, 5h8y:D, 5h92:A
38 4v02:A 244 34 0.0526 0.0656 0.4706 0.72 4v02:B, 4v03:A, 4v03:B
39 2afh:E 289 34 0.0395 0.0415 0.3529 1.6 2afh:F, 2afi:E, 2afi:F, 2afi:G, 2afi:H, 2afi:M, 2afi:N, 2afi:O, 2afi:P, 2c8v:A, 1de0:A, 1de0:B, 8dfc:E, 8dfc:F, 8dfd:E, 8dfd:F, 8dfd:G, 8dfd:H, 1fp6:A, 1fp6:B, 1fp6:C, 1fp6:D, 1g1m:A, 1g1m:B, 1g20:E, 1g20:F, 1g20:G, 1g20:H, 1g21:E, 1g21:F, 1g21:G, 1g21:H, 1g5p:A, 1g5p:B, 1m1y:E, 1m1y:F, 1m1y:G, 1m1y:H, 1m1y:M, 1m1y:N, 1m1y:O, 1m1y:P, 1m34:E, 1m34:F, 1m34:G, 1m34:H, 1m34:M, 1m34:N, 1m34:O, 1m34:P, 1n2c:E, 1n2c:F, 1n2c:G, 1n2c:H, 6n4j:A, 6n4j:B, 6n4k:A, 6n4k:B, 6n4l:A, 6n4m:A, 1nip:B, 1nip:A, 2nip:A, 2nip:B, 6o0b:A, 6o0b:B, 6q93:A, 6q93:B, 6q93:C, 6q93:D, 6q93:E, 6q93:F, 6q93:G, 6q93:H, 1rw4:A, 7t4h:A, 8tc3:A, 8tc3:B, 7tne:A, 7tpn:A, 7tpo:A, 7tpv:A, 7tpw:A, 7tpx:A, 7tpy:A, 7tpz:A, 7tq0:A, 7tq9:A, 7tqc:A, 7tqe:A, 7tqf:A, 7tqh:A, 7tqi:A, 7tqj:A, 7tqk:A, 7ut8:E, 7ut8:F, 7ut9:E, 7ut9:F, 7uta:E, 7uta:F, 7uta:G, 7uta:H, 4wza:E, 4wza:F, 4wza:G, 4wza:H, 4wzb:E, 4wzb:F, 4wzb:G, 4wzb:H, 1xcp:A, 1xcp:B, 1xcp:C, 1xcp:D, 1xd8:A, 1xd8:B, 1xd9:A, 1xd9:B, 1xdb:A, 1xdb:B
40 1g3q:A 237 78 0.0724 0.0928 0.2821 2.0 1g3r:A
41 6nzj:A 273 40 0.0493 0.0549 0.3750 2.0 6nzj:B
42 8r9r:A 255 63 0.0658 0.0784 0.3175 2.1
43 2i4g:A 289 63 0.0592 0.0623 0.2857 2.1 2h02:A, 2h02:B, 2h03:A, 2h04:A, 2i4h:A, 2i5x:A, 2i5x:B, 8jbn:B, 8jby:A, 8jby:B
44 9bhw:B 299 184 0.1349 0.1371 0.2228 2.7 9bhw:C
45 3cwq:A 206 33 0.0493 0.0728 0.4545 3.1 3cwq:B
46 8e77:A 358 64 0.0625 0.0531 0.2969 3.1
47 7lm0:A 449 55 0.0526 0.0356 0.2909 3.9 7lm0:B
48 6a20:A 395 210 0.1612 0.1241 0.2333 3.9 6a1z:A, 7d8v:A, 3gbj:B, 5zbr:B, 5zbr:A, 5zbr:C, 5zbs:B, 5zbs:A
49 1ion:A 243 47 0.0559 0.0700 0.3617 4.6
50 5b1s:A 294 34 0.0395 0.0408 0.3529 5.7 5b1s:B, 5b1s:C, 5b1s:D, 3bwc:A, 3bwc:B, 5y4p:A, 5y4p:B, 5y4p:C, 5y4p:D, 5y4q:A, 5y4q:B, 5y4q:C, 5y4q:D, 4yuv:A, 4yuv:B, 4yuw:A, 4yuw:B, 4yux:A, 4yux:B, 4yuy:A, 4yuy:B, 4yuz:A, 4yuz:B, 4yuz:C, 4yuz:D, 4yv0:A, 4yv0:B, 4yv0:C, 4yv0:D, 4yv1:A, 4yv1:B, 4yv1:C, 4yv1:D, 4yv2:A, 4yv2:B
51 3ixe:B 70 34 0.0329 0.1429 0.2941 6.0
52 3kjg:A 254 45 0.0559 0.0669 0.3778 6.4 3kjg:B, 3kjh:A, 3kji:A, 3kji:B
53 6d73:A 1227 269 0.2072 0.0513 0.2342 6.6 6d73:C, 6pkx:B, 6pkx:D
54 2v40:A 419 44 0.0461 0.0334 0.3182 6.7
55 5e7p:A 719 28 0.0395 0.0167 0.4286 7.3 5e7p:B
56 6j79:A 816 48 0.0526 0.0196 0.3333 7.3 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
57 6drj:A 1266 269 0.2072 0.0498 0.2342 8.0 6d73:B, 6d73:D, 6drj:B, 6drj:C, 6drj:D
58 7dut:A 220 44 0.0493 0.0682 0.3409 8.8 7dv3:A, 7dv3:B, 7dwr:A, 7dwr:D, 7dwr:B, 7dwr:C
59 5aup:I 241 21 0.0362 0.0456 0.5238 10.0 5aun:B, 5auo:B, 5aup:B, 3vx3:A, 3vx3:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218