Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LTNHHFYDESKPFTCLDGSATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGSFHCTNTGYKPLYIPSNRVNDGVCDCCDGTD
EYNSGVICENTCK

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8d43:B 100 93 1.0000 0.9300 1.0000 6.42e-65 8emr:B, 5f0e:B, 5h9o:B, 5h9o:D, 5hjo:B, 5hjo:D, 5hjr:B, 5hjr:D, 5ied:B, 5iee:B, 5ief:B, 5ieg:B, 7jty:B, 7jty:D, 7k9n:B, 7k9n:D, 7k9o:B, 7k9o:D, 7k9q:B, 7k9q:D, 7k9t:B, 7k9t:D, 7kad:B, 7kad:D, 7kb6:B, 7kb6:D, 7kb8:B, 7kb8:D, 7kbj:B, 7kbj:D, 7kbr:B, 7kbr:D, 7kry:B, 7kry:D, 7l9e:B, 7l9e:D
2 5jqp:B 131 118 0.5376 0.3817 0.4237 1.18e-17
3 8em7:A 4378 80 0.3441 0.0073 0.4000 3.52e-05 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
4 8em7:A 4378 82 0.3441 0.0073 0.3902 7.78e-04 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
5 8em7:A 4378 77 0.2903 0.0062 0.3506 0.013 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
6 8em7:A 4378 78 0.3118 0.0066 0.3718 0.040 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
7 8em7:A 4378 53 0.2366 0.0050 0.4151 0.062 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
8 8em7:A 4378 73 0.3226 0.0069 0.4110 0.064 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
9 8em7:A 4378 75 0.3011 0.0064 0.3733 0.10 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
10 8em7:A 4378 76 0.2903 0.0062 0.3553 0.11 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
11 8em7:A 4378 57 0.2473 0.0053 0.4035 0.34 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
12 8em7:A 4378 77 0.3226 0.0069 0.3896 0.85 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
13 8em7:A 4378 85 0.3011 0.0064 0.3294 2.1 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
14 8em7:A 4378 78 0.2903 0.0062 0.3462 2.4 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
15 8em7:A 4378 88 0.3011 0.0064 0.3182 2.5 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
16 8em7:A 4378 73 0.2903 0.0062 0.3699 2.8 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
17 8em7:A 4378 53 0.2151 0.0046 0.3774 6.8 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
18 8em4:A 3818 80 0.3441 0.0084 0.4000 3.88e-05 8em4:B
19 8em4:A 3818 79 0.3333 0.0081 0.3924 0.001 8em4:B
20 8em4:A 3818 77 0.2903 0.0071 0.3506 0.015 8em4:B
21 8em4:A 3818 74 0.3118 0.0076 0.3919 0.029 8em4:B
22 8em4:A 3818 73 0.3226 0.0079 0.4110 0.060 8em4:B
23 8em4:A 3818 76 0.2903 0.0071 0.3553 0.10 8em4:B
24 8em4:A 3818 57 0.2473 0.0060 0.4035 0.35 8em4:B
25 8em4:A 3818 62 0.2688 0.0065 0.4032 1.5 8em4:B
26 8em4:A 3818 85 0.3011 0.0073 0.3294 2.5 8em4:B
27 8em4:A 3818 73 0.2903 0.0071 0.3699 3.5 8em4:B
28 8em4:A 3818 83 0.3226 0.0079 0.3614 4.0 8em4:B
29 8jxc:A 1337 77 0.3226 0.0224 0.3896 2.78e-04 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
30 8jxc:A 1337 76 0.3441 0.0239 0.4211 0.009 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
31 8jxc:A 1337 82 0.3226 0.0224 0.3659 0.010 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
32 8jxc:A 1337 57 0.2473 0.0172 0.4035 0.36 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
33 8jxc:A 1337 35 0.1720 0.0120 0.4571 0.83 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
34 8jxc:A 1337 53 0.2258 0.0157 0.3962 1.1 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
35 8jxc:A 1337 73 0.2903 0.0202 0.3699 8.1 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
36 1f5y:A 85 77 0.3011 0.3294 0.3636 0.003
37 8jxd:B 156 78 0.3011 0.1795 0.3590 0.070
38 7qbg:D 81 75 0.2796 0.3210 0.3467 0.075 7qbd:C, 7qbd:D, 7qbf:C, 4zrp:C, 4zrp:D, 4zrq:C, 4zrq:D
39 7qbg:D 81 44 0.1613 0.1852 0.3409 5.2 7qbd:C, 7qbd:D, 7qbf:C, 4zrp:C, 4zrp:D, 4zrq:C, 4zrq:D
40 2xrc:C 454 69 0.2688 0.0551 0.3623 0.077
41 2xrc:B 485 69 0.2688 0.0515 0.3623 0.091 5o32:D, 5o32:H, 2xrc:A, 2xrc:D
42 1jrf:A 47 46 0.1828 0.3617 0.3696 0.13
43 8jxj:A 570 76 0.3226 0.0526 0.3947 0.15 8jxj:B
44 6j66:B 476 63 0.2258 0.0441 0.3333 0.31 6j66:A
45 7qbe:D 86 83 0.2796 0.3023 0.3133 0.78 7qbe:B, 7qbg:B
46 8xi4:M 79 75 0.2796 0.3291 0.3467 0.83 8ua4:R, 8ufb:V, 8ufb:W, 8ufb:X, 8ufb:Y, 8ufc:V, 8ufc:W, 8ufc:X, 8ufc:Y, 8xi4:N, 8xi4:O, 8xi4:P, 8ys2:M, 8ys2:N, 8ys2:O, 8ys2:P
47 4bzf:B 323 33 0.1720 0.0495 0.4848 0.89 4bzf:A, 4bzg:A, 4bzg:B, 4bzh:A, 4bzh:B
48 3hhs:A 669 18 0.1075 0.0149 0.5556 0.93
49 7oik:A 4426 67 0.2043 0.0043 0.2836 1.3 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
50 4yrd:B 346 28 0.1075 0.0289 0.3571 7.5 3vhr:A, 4yrd:A
51 3st7:A 369 28 0.1075 0.0271 0.3571 8.9 2zkl:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218