>protein
LSTSLSALPAAARDFVEEAVRLCRPREVLLCDGSEEEGKELLRGLQDDGVLHPLPKYDNCWLARTDPRDVARVESKTVLV
TPEQSDAVPPPPPSGGPPQLGNWMSPNAFQAAVQERFPGCMAGRPLYVIPFSMGPPTSPLAKLGVQVTDSPYVVLSMRIM
TRVGPAVLQRLDDDFVRCLHSVGRPLPLTEPLVSSWPCDPSRVLVAHIPSERRIVSFGSGYGGNSLLGKKCFALRIASRM
AQQQGWLAEHMLILGVTSPSGEKRYMAAAFPSACGKTNLAMMTPSLPGWRIHCVGDDIAWMKFDDEGRLRAINPERGFFG
VAPGTSSRTNPNAMATIARNTIFTNVGLRSDGGVYWDGLDEPTEPGVTYTSWLGKPWKHGDPEPCAHPNSRFCAPADQCP
IMDPRWDDPEGVPIDAIIFGGRRPRGVPLVVEAFGWRHGVFMGSAMRSEATAAAEHKGGRLMHDPFAMRPFFGYNAGRYL
EHWLSTGLRSNARLPRLFHVNWFLRDNEGRFVWPGFGHNARVLAWIFGRIQGRDTARPTPIGWVPKEGDLDLGGLPGVDY
SQLFPMEKGFWEEECRQLREYYGENFGADLPRDVMAELEGLEERVRKM
The query sequence (length=608) is searched through a non-redundant set of database sequences
protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
# |
Hit |
Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value |
Homologs to hit |
1 |
2fah:C |
608 |
608 |
1.0000 |
1.0000 |
1.0000 |
0.0 |
2faf:A, 2faf:B, 2fah:D, 2fah:A, 2fah:B, 2qzy:A, 2qzy:B |
2 |
3dt7:A |
624 |
609 |
0.6497 |
0.6330 |
0.6486 |
0.0 |
3dt2:A, 3dt4:A, 3dt4:C, 3dt7:B, 3dtb:A, 3dtb:B, 5fh0:A, 5fh1:A, 5fh2:A, 5fh3:A, 5fh4:A, 5fh5:A, 2gmv:A, 2gmv:B, 4gmm:A, 4gmu:A, 4gmw:A, 4gmz:A, 4gnl:A, 4gnm:A, 4gno:A, 4gnp:A, 4gnq:A, 1khb:A, 1khe:A, 1khf:A, 1khg:A, 7l36:A, 7l3m:A, 7l3v:A, 1m51:A, 3moe:A, 3mof:A, 3mof:B, 3moh:A, 3moh:B, 1nhx:A, 4ox2:A, 4ox2:B, 6p5o:A, 2qew:A, 2qey:A, 2qf1:A, 2qf2:A, 2qf2:B, 2rk7:A, 2rk7:B, 2rk8:A, 2rk8:B, 2rka:A, 2rka:C, 2rkd:A, 2rke:A, 5v97:A, 5v9f:A, 5v9g:A, 5v9h:A, 5v9h:B, 4yw8:A, 4yw9:A, 4ywb:A, 4ywb:C, 4ywd:A |
3 |
5v95:A |
592 |
609 |
0.6283 |
0.6453 |
0.6273 |
0.0 |
|
4 |
4r43:A |
601 |
600 |
0.4885 |
0.4942 |
0.4950 |
0.0 |
5i67:A, 4rcg:A, 4wie:A, 4wiu:A, 4wl8:A, 4wou:A, 4wpt:A, 4wpu:A, 4wpv:A |
5 |
1os1:A |
537 |
171 |
0.0773 |
0.0875 |
0.2749 |
0.17 |
1aq2:A, 6asi:A, 6asm:A, 6asn:A, 6at2:A, 6at3:A, 6at3:B, 6at4:A, 6at4:B, 1ayl:A, 6com:A, 6crt:A, 1k3c:A, 1k3d:A, 2olq:A, 2olr:A, 2pxz:X, 2py7:X, 6v2l:A, 6v2m:A, 6v2n:A |
6 |
6xmt:A |
1092 |
77 |
0.0411 |
0.0229 |
0.3247 |
1.2 |
6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A |
7 |
6fm3:A |
304 |
46 |
0.0263 |
0.0526 |
0.3478 |
2.4 |
6fm0:A, 6fm0:B |
8 |
8cem:B |
974 |
75 |
0.0345 |
0.0216 |
0.2800 |
5.1 |
|
9 |
1ylh:A |
524 |
99 |
0.0461 |
0.0534 |
0.2828 |
7.0 |
|
10 |
8b0i:D |
282 |
20 |
0.0148 |
0.0319 |
0.4500 |
9.2 |
8b0i:A, 8b0i:B, 8b0j:A, 8b0j:B, 8b0j:D, 8b0j:C |
[Back]