Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAI
IRAMGRLKIDFGDAARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQ
PNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGAQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMH
ESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFT
CATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNL

The query sequence (length=344) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1agr:A 350 344 0.9971 0.9800 0.9971 0.0 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
2 3ffb:A 327 343 0.9273 0.9755 0.9300 0.0 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
3 3v00:C 353 343 0.7384 0.7195 0.7405 0.0 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3c7k:C 311 312 0.6628 0.7331 0.7308 1.01e-166 3c7k:A
5 1shz:D 327 327 0.6512 0.6850 0.6850 9.05e-165 1shz:A
6 8iys:A 355 333 0.5552 0.5380 0.5736 4.47e-128 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
7 7rkf:A 350 346 0.5494 0.5400 0.5462 3.65e-125
8 8pjk:A 222 169 0.4797 0.7432 0.9763 4.01e-123 7e2x:A, 7e2z:A
9 8pjk:A 222 58 0.1453 0.2252 0.8621 5.98e-24 7e2x:A, 7e2z:A
10 1zca:A 318 321 0.3924 0.4245 0.4206 2.61e-87 1zca:B
11 3ab3:A 322 326 0.3953 0.4224 0.4172 2.06e-86 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
12 8fn0:B 212 167 0.3663 0.5943 0.7545 6.69e-86
13 8fn0:B 212 52 0.1250 0.2028 0.8269 2.13e-19
14 6eg8:I 372 360 0.4390 0.4059 0.4194 5.98e-85 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
15 8htg:B 334 327 0.4186 0.4311 0.4404 1.71e-84 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
16 2xtz:A 343 332 0.3808 0.3819 0.3946 2.44e-74
17 4fid:A 318 321 0.3547 0.3836 0.3801 2.44e-70 4fid:B
18 8uo1:A 334 359 0.4070 0.4192 0.3900 1.08e-68 8gga:A
19 2xtz:B 291 325 0.3721 0.4399 0.3938 3.24e-68
20 8ggb:A 310 357 0.3953 0.4387 0.3810 3.82e-66 8gg9:A, 8ggc:A
21 2xtz:C 270 325 0.3430 0.4370 0.3631 8.04e-58
22 8uo4:A 292 356 0.3576 0.4212 0.3455 1.19e-51 8uo2:A
23 8xql:A 240 184 0.2413 0.3458 0.4511 3.39e-42
24 8xql:A 240 55 0.0785 0.1125 0.4909 4.18e-07
25 8unx:A 244 183 0.2297 0.3238 0.4317 3.82e-42 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
26 8unx:A 244 48 0.0785 0.1107 0.5625 1.74e-07 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
27 3lvq:E 420 97 0.0872 0.0714 0.3093 3.33e-08 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 3lvq:E 420 99 0.0756 0.0619 0.2626 5.6 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
29 6bbp:A 520 97 0.0843 0.0558 0.2990 5.22e-07 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
30 6bbp:A 520 91 0.0727 0.0481 0.2747 1.8 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
31 8d4c:C 180 97 0.0843 0.1611 0.2990 1.96e-06 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
32 3lrp:A 181 97 0.0843 0.1602 0.2990 3.10e-06
33 6a8d:A 181 110 0.0872 0.1657 0.2727 8.73e-06
34 6a8d:A 181 50 0.0465 0.0884 0.3200 1.7
35 2k5u:A 181 99 0.0843 0.1602 0.2929 2.53e-05 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
36 7rll:B 177 95 0.0814 0.1582 0.2947 2.75e-05 7rll:A
37 7rll:B 177 43 0.0378 0.0734 0.3023 7.4 7rll:A
38 1z6x:A 175 97 0.0785 0.1543 0.2784 3.99e-05 1z6x:B
39 2h57:B 167 145 0.1047 0.2156 0.2483 1.33e-04 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
40 2h57:B 167 44 0.0465 0.0958 0.3636 8.0 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
41 3aq4:A 170 97 0.0785 0.1588 0.2784 1.94e-04 3aq4:B
42 5uf8:D 160 97 0.0785 0.1688 0.2784 2.15e-04
43 3o47:A 289 97 0.0814 0.0969 0.2887 3.47e-04 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
44 8e0c:A 185 102 0.0698 0.1297 0.2353 6.84e-04 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
45 1upt:G 170 97 0.0756 0.1529 0.2680 7.09e-04 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
46 1upt:G 170 29 0.0291 0.0588 0.3448 9.1 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
47 2b6h:A 171 97 0.0727 0.1462 0.2577 0.002
48 5di3:B 204 103 0.0785 0.1324 0.2621 0.002 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
49 1yzg:A 168 84 0.0698 0.1429 0.2857 0.002
50 6pta:A 165 97 0.0727 0.1515 0.2577 0.004 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
51 4y0v:A 165 97 0.0756 0.1576 0.2680 0.005 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
52 4ile:A 176 95 0.0640 0.1250 0.2316 0.011 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
53 5de3:A 166 79 0.0581 0.1205 0.2532 0.012 5di3:A
54 3doe:A 189 86 0.0669 0.1217 0.2674 0.017 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
55 3doe:A 189 21 0.0320 0.0582 0.5238 7.6 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
56 6zga:C 168 115 0.0814 0.1667 0.2435 0.026 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
57 2x77:A 181 85 0.0610 0.1160 0.2471 0.035 2x77:B
58 8oun:A 181 193 0.1017 0.1934 0.1813 0.15 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
59 6mao:A 137 58 0.0523 0.1314 0.3103 0.26
60 8oul:A 185 99 0.0785 0.1459 0.2727 0.30 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
61 4v0l:A 168 95 0.0698 0.1429 0.2526 0.52 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
62 6i3p:C 630 87 0.0610 0.0333 0.2414 0.56 6i3p:A, 6i3p:B, 6i3p:D, 6qic:A, 6qic:B, 6qic:C, 6qic:D
63 3lkb:A 382 114 0.0930 0.0838 0.2807 0.61 3lkb:B
64 1moz:A 178 96 0.0669 0.1292 0.2396 0.66 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
65 4wnr:A 323 29 0.0378 0.0402 0.4483 0.85
66 8e0a:A 168 84 0.0552 0.1131 0.2262 1.5 8e0b:A
67 4bas:A 172 55 0.0465 0.0930 0.2909 1.5
68 5z3g:X 202 39 0.0320 0.0545 0.2821 1.8
69 4zi2:A 185 31 0.0378 0.0703 0.4194 2.2 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
70 4zi2:A 185 79 0.0494 0.0919 0.2152 8.8 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
71 8dr5:A 646 38 0.0436 0.0232 0.3947 2.4 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
72 4q66:C 134 69 0.0523 0.1343 0.2609 2.5
73 7tfk:A 360 38 0.0436 0.0417 0.3947 2.7 7tfl:A
74 5djs:A 520 96 0.0756 0.0500 0.2708 4.3 5djs:B, 5djs:C, 5djs:D
75 5i8f:A 164 32 0.0407 0.0854 0.4375 6.5 4n3e:A, 4n3e:B, 4n3e:Z, 4n3e:b, 4n3e:C, 4n3e:D, 4n3e:E, 4n3e:F, 4n3e:G, 4n3e:H, 4n3e:I, 4n3e:J, 4n3e:K, 4n3e:L, 4n3e:P, 4n3e:M, 4n3e:N, 4n3e:O, 4n3e:Q, 4n3e:S, 4n3e:R, 4n3e:U, 4n3e:V, 4n3e:W, 4n3e:X, 4n3e:Y, 4n3e:a, 6sjj:B, 6sjj:j, 6sjj:A, 6sjj:R, 6sjj:Q, 6sjj:P, 6sjj:O, 6sjj:N, 6sjj:M, 6sjj:L, 6sjj:K, 6sjj:J, 6sjj:I, 6sjj:a, 6sjj:Y, 6sjj:H, 6sjj:G, 6sjj:F, 6sjj:D, 6sjj:f, 6sjj:E, 6sjj:C, 6sjj:e, 6sjj:d, 6sjj:c, 6sjj:b, 6sjj:Z, 6sjj:X, 6sjj:W, 6sjj:V, 6sjj:U, 6sjj:T, 6sjj:S, 6sjj:i, 6sjj:h, 6sjj:g

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218