BioLiP

>protein
LRSTPQDELHDLLCVGFGPASLAIAIALHDALDPRLNQPKICFLERQKQFAWHSGMLVPGSKMQISFIKDLATLRDPRSS
FTFLNYLHQKGRLIHFTNLSTFLPARLEFEDYMRWCAQQFSDVVAYGEEVVEVIPGKSDPSSSVVDFFTVRSRNVETGEI
SARRTRKVVIAIGGTAKMPSGLPQDPRIIHSSKYCTTLPALLKDKSKPYNIAVLGSGQSAAEIFHDLQKRYPNSRTTLIM
RDSAMRPSDDSPFVNEIFNPERVDKFYSQSAAERQRSLLADKATNYSVVRLELIEEIYNDMYLQRVKNPDETQWQHRILP
ERKITRVEHHGPQSRMRIHLKSSKPKETLEVDALMVATGYNRNAHERLLSKVQHLRPTGQDQWKPHRDYRVEMDPSKVSS
EAGIWLQGCNERTHGLSDSLLSVLAVRGGEMVQSIFGEQLE

The query sequence (length=441) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4b65:A	456	451	1.0000	0.9671	0.9778	0.0	4b63:A, 4b64:A, 4b66:A, 4b67:A, 4b68:A, 4b69:A, 5cku:A, 7jvk:A, 7jvk:B, 7jvk:C, 7jvk:D, 7jvl:A, 7jvl:B, 7jvl:C, 7jvl:D, 4nzh:A, 6x0h:A, 6x0h:B, 6x0h:C, 6x0h:D, 6x0i:A, 6x0i:B, 6x0i:C, 6x0i:D, 6x0j:A, 6x0j:B, 6x0j:C, 6x0j:D, 6x0k:A, 6x0k:B, 6x0k:C, 6x0k:D, 6x0k:E, 6x0k:F, 6x0k:G, 6x0k:H
2	3s5w:B	414	431	0.3968	0.4227	0.4060	1.71e-98	3s5w:A, 3s61:A, 3s61:B
3	4tlx:A	415	432	0.3469	0.3687	0.3542	2.49e-77	4tlx:B, 4tlx:C, 4tlx:D, 4tlz:A, 4tlz:B, 4tlz:C, 4tlz:D, 4tm0:A, 4tm0:B, 4tm0:C, 4tm0:D, 4tm1:A, 4tm1:B, 4tm1:C, 4tm1:D, 4tm3:A, 4tm3:B, 4tm3:C, 4tm3:D, 4tm4:A, 4tm4:B, 4tm4:C, 4tm4:D
4	6xbb:H	420	434	0.2744	0.2881	0.2788	6.36e-47	6xbb:A, 6xbb:B, 6xbb:C, 6xbb:D, 6xbb:E, 6xbb:F, 6xbb:G, 6xbc:A, 6xbc:B, 6xbc:C, 6xbc:D, 6xbc:E, 6xbc:F, 6xbc:G, 6xbc:H
5	5o8p:B	428	440	0.2562	0.2640	0.2568	8.64e-38	5o8r:A, 5o8r:B
6	7us3:A	428	435	0.2540	0.2617	0.2575	5.31e-35	7us3:B, 7us3:C, 7us3:D
7	4d7e:C	377	297	0.1406	0.1645	0.2088	0.21
8	5gsn:A	445	223	0.1179	0.1169	0.2332	0.22	5gsn:B, 5gsn:C, 5gsn:D, 5ipy:A, 5ipy:B, 5iq1:A, 5iq1:B, 5iq4:A, 5iq4:B
9	1svu:A	307	44	0.0363	0.0521	0.3636	1.1
10	7sa3:B	450	38	0.0363	0.0356	0.4211	1.1
11	8eqm:B	483	38	0.0363	0.0331	0.4211	1.2	8eqm:b
12	10mh:A	327	56	0.0385	0.0520	0.3036	2.4	2c7o:A, 2c7p:A, 2c7q:A, 2c7r:A, 5ciy:A, 3eeo:A, 1fjx:A, 1hmy:A, 2hmy:B, 2hr1:A, 2i9k:A, 1m0e:A, 1mht:A, 3mht:A, 4mht:A, 5mht:A, 6mht:A, 7mht:A, 8mht:A, 9mht:A, 1skm:A, 1svu:B, 2uyc:A, 2uyh:A, 2uz4:A, 2z6a:A, 2z6q:A, 2z6u:A, 2zcj:A
13	7xpi:A	363	78	0.0408	0.0496	0.2308	2.4	7ytl:A
14	3u4j:A	505	55	0.0385	0.0337	0.3091	2.9
15	3mcr:A	154	73	0.0431	0.1234	0.2603	3.0
16	8fcv:R	343	110	0.0748	0.0962	0.3000	3.7	8fcu:Q, 8fcv:Q, 8fcv:S, 8fcv:T, 8fcv:U, 8fcv:V, 8fcv:W, 8fcw:R, 8fcw:S, 8fcw:T, 8fcw:U, 8fcw:V, 8fcx:R, 8fcx:S, 8fcx:T, 8fcx:U, 8fcx:V, 8ff4:Q, 8ff4:R, 8ff4:S, 8ff4:T, 8ff4:U, 8ff4:V, 8ff4:W
17	8jze:K	177	54	0.0340	0.0847	0.2778	4.1	8jw0:K, 8jzf:K
18	1aj8:A	371	166	0.0794	0.0943	0.2108	4.9	1aj8:B
19	1b74:A	252	67	0.0499	0.0873	0.3284	5.2
20	8jpb:G	658	40	0.0340	0.0228	0.3750	7.3	5he0:A, 5he2:A, 5he3:A, 8jpc:G, 8jpd:G, 7k7z:A, 4mk0:A, 4pnk:A, 6u7c:A, 5ukl:A, 5ukm:A, 5uuu:A, 3v5w:A, 5wg4:A
21	3uzs:A	609	36	0.0340	0.0246	0.4167	8.4	3uzt:A

[Back]