Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LRRRGIVVSFHSNMVTVEDEETGERILCKLRGKFRLQNLKIYVGDRVEYTPDETGSGVIENVLHRKNLLTKPHVANVDQV
ILVVTVKMPETSTYIIDKFLVLAEKNELETVMVINKMDLYDEDDLRKVRELEEIYSGLYPIVKTSAKTGMGIEELKEYLK
GKISTMAGLSGVGKSSLLNAINPGLKLRTTTTAQLLKFDFGGYVVDTPGFANLEINDIEPEELKHYFKEFGDKQCFFSDC
NHVDEPECGVKEAVENGEIAESRYENYVKMFYELLGRR

The query sequence (length=278) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1u0l:A 278 278 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1u0l:B, 1u0l:C
2 2yv5:A 293 274 0.4424 0.4198 0.4489 3.56e-63
3 1t9h:A 287 265 0.3669 0.3554 0.3849 3.71e-56
4 5uz4:Z 323 288 0.3849 0.3313 0.3715 7.94e-52 4a2i:V, 7boi:W, 7nar:W, 5no2:Z, 5no3:Z, 5no4:Z, 2rcn:A, 2ykr:W
5 6h4d:A 274 282 0.3381 0.3431 0.3333 1.11e-42
6 6zhm:A 269 259 0.3094 0.3197 0.3320 1.17e-42 6zhl:A, 6zjo:A, 6zjo:B
7 6g0z:A 290 156 0.1547 0.1483 0.2756 0.007 6g0z:B, 6g12:A, 6g12:B, 6g14:B, 6g14:A, 6g15:A, 6g15:B
8 8fkt:NB 387 131 0.1115 0.0801 0.2366 0.008 8fkp:NB, 8fku:NB, 8fkv:NB, 8fkw:NB, 8fkx:NB, 8fky:NB, 8fkz:NB, 8fl0:NB, 8ink:u, 8ipd:u, 8ipx:u, 8ipy:u
9 2ywf:A 532 68 0.0935 0.0489 0.3824 0.010 2ywg:A, 2ywh:A
10 3jce:x 586 58 0.0827 0.0392 0.3966 0.015 3deg:C
11 5w75:C 387 171 0.1583 0.1137 0.2573 0.032 5w75:B, 5w75:D, 5w75:A
12 8hkr:B 384 83 0.0935 0.0677 0.3133 0.050 8hkr:A
13 3a1s:A 255 103 0.1115 0.1216 0.3010 0.088 3a1s:B, 3a1t:A, 3a1u:A, 3a1u:B
14 3pqc:B 194 89 0.1043 0.1495 0.3258 0.097 3pqc:A
15 1hr0:W 71 68 0.0755 0.2958 0.3088 0.11 5lmn:W, 5lmo:W, 5lmp:W, 5lmq:W, 5lmr:W, 5lms:W, 5lmt:W, 5lmv:W, 5me0:V, 5me1:V, 6o7k:5
16 7szs:A 204 62 0.0791 0.1078 0.3548 0.12 7szs:B
17 3m6a:A 496 145 0.1439 0.0806 0.2759 0.14 3m6a:B, 3m6a:C, 3m6a:D, 3m6a:E, 3m6a:F
18 2e87:A 356 67 0.0827 0.0646 0.3433 0.15
19 5nl9:A 146 96 0.0935 0.1781 0.2708 0.22 5nl9:B
20 2zet:A 181 53 0.0755 0.1160 0.3962 0.22 2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
21 4ql5:B 66 56 0.0755 0.3182 0.3750 0.27
22 6gfu:A 386 104 0.1151 0.0829 0.3077 0.39 5w76:A, 5w7q:A
23 1plj:A 147 51 0.0612 0.1156 0.3333 0.46
24 4w2e:y 644 97 0.1115 0.0481 0.3196 0.52
25 5lmv:a 502 55 0.0683 0.0378 0.3455 0.52
26 5imr:C 570 97 0.1115 0.0544 0.3196 0.55
27 7unv:x 593 91 0.0971 0.0455 0.2967 0.58 7unq:x, 7unr:x, 7unt:x, 7unu:x, 7unw:x
28 5j8b:z 671 97 0.1115 0.0462 0.3196 0.62 5imq:B
29 4kjz:C 458 55 0.0683 0.0415 0.3455 0.69 4b43:A, 4b44:A, 4b47:A, 4b48:A, 4kjz:A
30 3cnl:A 233 141 0.1367 0.1631 0.2695 0.74 3cnn:A, 3cno:A
31 1g6h:A 254 67 0.0827 0.0906 0.3433 0.99 1g9x:A, 1g9x:B, 1g9x:C
32 7cb5:B 467 49 0.0647 0.0385 0.3673 1.3 7cb2:A, 7cb2:B, 7cb2:C, 7cb2:D, 7cb5:A, 7cb5:C, 7cb5:D
33 8v9l:x 387 158 0.1331 0.0956 0.2342 1.3 7vok:A, 7vok:B, 7vok:C, 7vok:D
34 5ady:6 426 61 0.0647 0.0423 0.2951 1.4 8g31:6, 8g34:6, 8g38:6, 7yla:6
35 7ygh:B 184 143 0.1403 0.2120 0.2727 1.5 7ygh:A, 7ygl:A, 7ygl:B, 7yhl:A, 7yhl:B
36 7oi6:y 331 136 0.1259 0.1057 0.2574 1.5 8pk0:t
37 3qsy:A 415 96 0.0935 0.0627 0.2708 1.5 2aho:A, 3cw2:B, 6i5m:A, 5jb3:7, 5jbh:7, 4m0l:A, 4m0l:B, 4m0l:C, 4m0l:D, 4m0l:E, 4m0l:F, 4m2l:A, 4m4s:A, 4nbs:A, 3pen:A, 2pmd:A, 2pmd:B, 4qfm:A, 4qhy:A, 2qmu:A, 2qn6:A, 6r8s:A, 6r8t:A, 4rcy:A, 4rcz:A, 4rd0:A, 4rd1:A, 4rd2:A, 4rd3:A, 4rd4:A, 4rd6:A, 4rjl:A, 3sjz:A, 6sw9:7, 6swc:7, 3v11:A
38 4zu9:A 582 66 0.0899 0.0430 0.3788 1.6
39 5cyp:A 248 53 0.0576 0.0645 0.3019 1.7 5cyp:B, 5cyp:C
40 3t5q:G 303 107 0.0899 0.0825 0.2336 1.9 3t5q:B, 3t5q:E, 3t5q:I, 3t5q:K
41 2x77:A 181 95 0.0899 0.1381 0.2632 2.1 2x77:B
42 9bht:A 220 47 0.0647 0.0818 0.3830 2.2 9bht:F
43 4v5p:AZ 385 71 0.0827 0.0597 0.3239 2.2 1ha3:B, 4v5g:AZ, 4v5g:CZ, 4v5p:CZ, 4v5q:AZ, 4v5q:CZ, 4v5r:AZ, 4v5r:CZ, 4v5s:AZ, 4v5s:CZ, 4v68:AZ
44 9bht:C 282 80 0.0863 0.0851 0.3000 2.3 9bht:D, 9bhw:A, 9bhw:D
45 7quj:A 259 101 0.1007 0.1081 0.2772 2.4 7quj:B, 7quj:C, 7quj:D
46 8ips:B 588 109 0.0899 0.0425 0.2294 2.4 8ipt:A, 8ipt:E, 7zda:D, 7zdb:D, 7zdc:D, 7zde:D, 7zdf:D, 7zdg:D, 7zdk:D, 7zdl:D, 7zdr:D, 7zdt:D, 7zdu:D, 7zdv:D, 7zdw:D, 7ze5:D, 7zec:D
47 8etc:b 415 113 0.0971 0.0651 0.2389 3.1 8esq:b, 8etj:b
48 2jf6:B 472 87 0.0935 0.0551 0.2989 3.2 2jf6:A, 3zj7:A, 3zj7:B, 3zj8:A, 3zj8:B
49 2fg5:A 165 79 0.0971 0.1636 0.3418 3.5
50 7of5:C 338 32 0.0432 0.0355 0.3750 3.6 7of0:C, 7of3:C, 7of7:C
51 7pd3:x 366 32 0.0432 0.0328 0.3750 3.6 4fp9:A, 4fp9:C, 4fp9:D, 4fp9:F, 4fzv:A, 7o9k:A1, 7o9m:A1, 7odr:x, 7ods:x, 7odt:x, 7oic:x, 8pk0:x, 8qsj:x
52 8eti:b 391 113 0.0971 0.0691 0.2389 3.8 8esr:b, 8etg:b
53 5z68:C 373 46 0.0612 0.0456 0.3696 3.9 5z68:A, 5z68:B, 5z68:D, 5z69:A
54 8vm2:B 176 54 0.0647 0.1023 0.3333 4.1 3con:A, 6e6h:A, 7f68:A, 8tbi:A, 8tbi:B, 5uhv:A, 8vm2:A, 8vm2:C, 6wgh:A, 6wgh:B, 6zio:A, 6zio:B, 6zir:A, 6ziz:A, 6ziz:B
55 3odm:C 530 62 0.0719 0.0377 0.3226 5.0 3odm:A, 3odm:D, 3odm:E, 3odm:H
56 7tby:A 1788 81 0.0899 0.0140 0.3086 5.2 7tc0:A
57 1s0u:A 391 106 0.0971 0.0691 0.2547 5.6
58 5oxf:B 591 64 0.0899 0.0423 0.3906 5.7
59 6p6j:A 571 72 0.0827 0.0403 0.3194 5.8 8vsi:A
60 7m6j:D 273 65 0.0755 0.0769 0.3231 5.9 7m6j:C, 6n0b:C, 6n0b:A, 6n0b:B, 6n0b:D, 6n12:A, 6n12:B, 3t5d:A, 3t5d:C, 6uqq:A, 6uqq:B
61 5cyp:D 227 51 0.0576 0.0705 0.3137 6.1
62 6qhd:B 532 110 0.0935 0.0489 0.2364 6.3
63 5oxf:A 703 64 0.0899 0.0356 0.3906 6.5
64 8ipr:C 515 31 0.0468 0.0252 0.4194 6.5 8ipr:E
65 1b23:P 405 149 0.1295 0.0889 0.2416 6.7 2c77:A, 2c78:A, 1eft:A, 1exm:A, 4h9g:A, 1ha3:A, 4lbv:A, 4lbw:A, 4lby:A, 4lbz:A, 4lc0:A, 1mj1:A, 1ob5:A, 1ob5:C, 1ob5:E, 2p8w:S, 2p8x:S, 2p8z:S, 1ttt:A, 1ttt:B, 1ttt:C, 1tui:A, 1tui:B, 1tui:C, 4v5l:AZ, 4v8q:BZ
66 3tw4:A 218 55 0.0683 0.0872 0.3455 7.5 3tw4:B
67 8csp:9 446 42 0.0576 0.0359 0.3810 8.3
68 8pv1:Cd 462 170 0.1511 0.0909 0.2471 9.8 8pv2:Cd, 8pv3:Cd, 8pv4:Cd, 8pv5:Cd, 8pv6:Cd, 8pv7:Cd, 8pv8:Cd, 8pvk:Cd, 8pvl:Cd
69 3e00:D 363 100 0.0971 0.0744 0.2700 9.9 4a4v:A, 4a4v:B, 4a4w:A, 4a4w:B, 7a7h:A, 3ads:A, 3ads:B, 3adt:A, 3adu:A, 3adu:B, 3adv:A, 3adv:B, 3adw:A, 3adw:B, 3adx:A, 3adx:B, 6ad9:A, 8adf:A, 8adf:B, 7ahj:A, 3an3:A, 3an4:A, 6an1:A, 8aqm:A, 8aqm:B, 8aqn:A, 8aqn:B, 2ath:A, 2ath:B, 8aty:A, 8atz:A, 6aug:A, 6aug:B, 6avi:A, 6avi:B, 7awc:A, 7awd:A, 5azv:A, 5azv:B, 3b0q:A, 3b0r:A, 3b0r:B, 3b1m:A, 3b3k:A, 8b8w:A, 8b8w:B, 8b8x:A, 8b8x:B, 8b8y:A, 8b8y:B, 8b8z:A, 8b8z:B, 8b90:A, 8b90:B, 8b91:A, 8b91:B, 8b92:A, 8b92:B, 8b93:A, 8b93:B, 8b94:A, 8b94:B, 8b95:A, 8b95:B, 3bc5:A, 8bf1:A, 8bf2:A, 8bf2:B, 8bff:A, 8c0c:B, 6c1i:A, 6c1i:B, 6c5q:A, 6c5t:A, 3cdp:A, 3cds:A, 4ci5:A, 4ci5:B, 9ck0:A, 8cph:A, 8cph:B, 8cpi:A, 3cs8:A, 3cwd:A, 3cwd:B, 9cwn:A, 7cxf:A, 7cxh:A, 7cxi:A, 7cxj:A, 7cxk:A, 7cxl:A, 6d3e:A, 3d6d:A, 6d8x:A, 6d94:A, 6dbh:A, 6dbh:B, 6dcu:A, 6dcu:B, 6dgl:A, 6dgl:B, 6dgo:A, 6dgp:A, 6dgp:B, 6dgq:A, 6dgr:A, 6dh9:A, 6dha:A, 6dha:B, 8dk4:A, 8dkn:A, 8dkv:A, 5dsh:A, 8dsy:A, 8dsy:B, 8dsz:A, 8dsz:B, 5dv3:A, 5dv6:A, 5dv8:A, 5dvc:A, 5dwl:A, 3dzu:D, 3dzy:D, 7e0a:A, 4e4k:A, 4e4q:A, 6e5a:A, 6e5a:B, 7efq:A, 4em9:A, 4em9:B, 4ema:A, 6enq:A, 3et0:A, 3et0:B, 3et3:A, 6f2l:A, 2f4b:A, 9f7w:A, 9f7x:A, 4f9m:A, 5f9b:B, 3fej:A, 4fgy:A, 8fhe:B, 8fhf:A, 8fhf:B, 8fhg:B, 8fkc:A, 8fkd:A, 8fke:A, 8fkf:A, 8fkg:A, 1fm6:D, 1fm6:X, 1fm9:D, 3fur:A, 2fvj:A, 6fzf:A, 6fzf:B, 6fzg:A, 6fzj:A, 6fzj:B, 6fzp:A, 2g0g:A, 2g0h:A, 2g0h:B, 3g9e:A, 3gbk:A, 2gtk:A, 5gtn:A, 5gto:A, 5gtp:A, 3h0a:D, 4hee:X, 2hfp:A, 8hhp:A, 8hhq:A, 8hhq:B, 3ho0:A, 3hod:A, 8hum:A, 8hup:A, 2hwq:A, 2hwr:A, 5hzc:A, 5hzc:B, 2i4j:A, 2i4p:A, 2i4z:A, 1i7i:A, 1i7i:B, 3ia6:A, 3ia6:B, 6icj:A, 6ijr:A, 6ijr:C, 6ijs:A, 6ilq:A, 6izm:A, 6izn:A, 4jaz:A, 6jey:A, 6jey:B, 6jf0:A, 6jf0:B, 5ji0:D, 4jl4:A, 6jq7:A, 7jqg:A, 7jqg:B, 6k0t:A, 6k0t:C, 1k74:D, 3k8s:A, 3k8s:B, 3kmg:A, 3kmg:D, 1knu:A, 6ktm:A, 6ktn:A, 6l89:A, 6l89:B, 4l96:A, 4l98:A, 4l98:B, 3lmp:A, 7lot:A, 7lot:B, 5lsg:A, 6mcz:A, 6mcz:B, 6md1:B, 6md2:A, 6md2:B, 6md4:A, 6ms7:A, 3noa:A, 3noa:B, 1nyx:A, 6o67:A, 6o68:A, 4o8f:A, 4o8f:B, 4oj4:A, 2om9:A, 2om9:B, 2om9:C, 2om9:D, 6oni:B, 6onj:A, 3osi:A, 3osw:A, 7p4e:A, 3pba:A, 8pbo:A, 6pdz:B, 6pdz:A, 2pob:A, 3po9:A, 3po9:B, 2prg:A, 2prg:B, 4prg:A, 4prg:B, 4prg:C, 4prg:D, 4pvu:B, 4pwl:A, 2q59:A, 2q59:B, 2q5p:A, 2q5p:B, 2q5s:A, 2q5s:B, 2q61:A, 2q61:B, 2q6r:A, 2q6r:B, 2q6s:B, 2q8s:A, 7qb1:AAA, 7qb1:BBB, 6qj5:A, 3qt0:A, 4r06:A, 4r2u:A, 4r2u:D, 3r5n:A, 4r6s:A, 4r6s:B, 3r8a:A, 3r8a:B, 3r8i:A, 1rdt:D, 7rle:A, 7rle:C, 3s9s:A, 8sc9:B, 7sqa:B, 7sqa:A, 7sqb:A, 3sz1:A, 3sz1:B, 3t03:A, 3t03:B, 6t1s:A, 6t1v:A, 6t6b:A, 6t9c:A, 6tdc:A, 6tsg:A, 5tto:A, 5tto:B, 5two:A, 3ty0:A, 3ty0:B, 5u5l:A, 8u57:A, 3u9q:A, 5ugm:A, 5ugm:B, 3v9t:A, 3v9v:A, 3v9y:A, 3vjh:A, 3vji:A, 3vn2:A, 2vsr:A, 2vsr:B, 2vst:A, 2vst:B, 3vso:A, 3vsp:A, 2vv0:A, 2vv0:B, 2vv1:A, 2vv1:B, 2vv2:A, 2vv2:B, 2vv3:A, 2vv4:A, 2vv4:B, 6vzl:A, 6vzl:B, 6vzm:A, 6vzm:B, 7wgo:A, 7wgp:A, 7wgq:A, 3wj4:A, 3wj4:B, 3wj5:A, 3wj5:B, 1wm0:X, 3wmh:A, 3wmh:B, 7wox:A, 5wqx:A, 5wr0:A, 5wr1:A, 3x1h:A, 3x1h:B, 3x1i:A, 3x1i:B, 2xkw:A, 2xkw:B, 4xld:A, 4xta:A, 4xta:B, 4xuh:A, 4xuh:B, 4xum:A, 4xum:B, 4y29:A, 5y2o:A, 5y2t:A, 5y2t:B, 6y3u:A, 5ycn:A, 5ycp:A, 2yfe:A, 2yfe:B, 4yt1:B, 5z5s:A, 5z6s:A, 1zeo:A, 8zfn:A, 8zfn:B, 8zfo:A, 8zfo:B, 8zfp:A, 8zfp:B, 8zfq:A, 8zfq:B, 8zfr:B, 8zfs:A, 8zfs:B, 8zft:A, 8zft:B, 1zgy:A, 2zk1:A, 2zk1:B, 2zk2:A, 2zk3:A, 2zk3:B, 2zk4:A, 2zk4:B, 2zk5:A, 2zk5:B, 2zk6:A, 2zk6:B, 6zly:A, 2zno:A, 2zno:B, 2zvt:A, 2zvt:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218