BioLiP

>protein
LRLDRLRDFVSALGELLDRHPDEESVLREGRSLLGELVRHDDWLPEEFAQPDPERYQQYLLHADSRQRFSVVSFVWGPGQ
TTPVHDHRVWGLIGMLRGAEDAQSFELGGLRPIGDPVRLSPGQVEAVSPRIGDIHRVFNASPDQPSISIHVYGANIGAVR
RAVYLEKPFISGYSNQFLPNIWDQSKE

The query sequence (length=187) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7kov:B	194	193	1.0000	0.9639	0.9689	3.14e-131	7kov:A, 7kov:C, 7kov:D, 6xb9:A, 6xb9:B, 6xb9:C, 6xb9:D, 6xb9:E, 6xb9:F, 6xb9:G, 6xb9:H, 6xb9:I, 6xb9:J, 6xb9:K, 6xb9:L
2	4wvz:D	203	194	0.7219	0.6650	0.6959	6.08e-89	4tlf:A, 4tlf:B, 4tlf:C, 4tlf:D, 3uss:A, 3uss:B, 4wvz:A, 4wvz:B, 4wvz:C
3	4qma:A	192	191	0.6791	0.6615	0.6649	5.25e-84
4	6bgf:A	188	112	0.1551	0.1543	0.2589	7.43e-05	2atf:A, 2b5h:A, 6bgm:A, 6bpr:A, 6bps:A, 6bpt:A, 6bpu:A, 6bpv:A, 6bpw:A, 6bpx:A, 6cdh:A, 6cdn:A, 6e87:A, 5efu:A, 3eln:A, 5ezw:A, 2gh2:A, 5i0r:A, 5i0s:A, 5i0t:A, 5i0u:A, 2ic1:A, 4ieo:A, 4iep:A, 4ieq:A, 4ier:A, 4ies:A, 4iet:A, 4ieu:A, 4iev:A, 4iew:A, 4iex:A, 4iey:A, 4iez:A, 4jtn:A, 4jto:A, 4kwj:A, 4kwk:A, 4kwl:A, 6n42:A, 6n43:A, 4pix:A, 4piy:A, 4piz:A, 4pjy:A, 6u1m:A, 6u4l:A, 6u4s:A, 6u4v:A, 4ubg:A, 4ubh:A, 8vl9:D, 8vlb:D, 4xet:A, 4xez:A, 4xf0:A, 4xf1:A, 4xf3:A, 4xf4:A, 4xf9:A, 4xfa:A, 4xfb:A, 4xfc:A, 4xff:A, 4xfg:A, 4xfh:A, 4xfi:A, 4ysf:A, 4yyo:A, 4z82:A
5	1lr5:D	160	64	0.0963	0.1125	0.2812	1.9	1lr5:C, 1lr5:B, 1lr5:A, 1lrh:D, 1lrh:C, 1lrh:B, 1lrh:A
6	8hey:D	1270	64	0.0909	0.0134	0.2656	2.3
7	7eto:a	1297	64	0.0909	0.0131	0.2656	2.5	7et3:a, 7etj:a
8	8tzh:A	1485	41	0.1016	0.0128	0.4634	3.2	3d6t:B
9	8u8b:A	1712	41	0.1016	0.0111	0.4634	3.2	8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
10	8fo9:F	2289	41	0.1016	0.0083	0.4634	3.3	9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
11	8tzf:A	1589	41	0.1016	0.0120	0.4634	3.4
12	8tyq:A	957	41	0.1016	0.0199	0.4634	3.8	8tze:A
13	8tzb:A	920	41	0.1016	0.0207	0.4634	4.0
14	8smc:C	1084	41	0.1016	0.0175	0.4634	4.1
15	8fo9:A	1173	41	0.1016	0.0162	0.4634	4.2	8fo9:C
16	8txz:A	858	41	0.1016	0.0221	0.4634	4.2
17	6vno:A	1084	41	0.1016	0.0175	0.4634	4.3	6vp6:A
18	8u7h:C	1111	41	0.1016	0.0171	0.4634	4.3
19	8fit:A	229	44	0.0749	0.0611	0.3182	6.7	8fit:C

[Back]