BioLiP

>protein
LRLDRLRDFVSALGELLDRHPDEESVLREGRSLLGELVRHDDWLPEEFAQPDPERYQQYLLHADSRQRFSVVSFVWGPGQ
TTPVHDHRVWGLIGMLRGAEDAQSFEEGLRPIGDPVRLSPGQVEAVSPRIGDIHRVFNASPDQPSISIHVYGANIGAVRR
AVYLPDGSEKPFISGYSNQFLPNIWD

The query sequence (length=186) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7kov:B	194	189	1.0000	0.9588	0.9841	1.48e-132	7kov:A, 7kov:C, 7kov:D, 6xb9:A, 6xb9:B, 6xb9:C, 6xb9:D, 6xb9:E, 6xb9:F, 6xb9:G, 6xb9:H, 6xb9:I, 6xb9:J, 6xb9:K, 6xb9:L
2	4wvz:D	203	190	0.7151	0.6552	0.7000	8.80e-90	4tlf:A, 4tlf:B, 4tlf:C, 4tlf:D, 3uss:A, 3uss:B, 4wvz:A, 4wvz:B, 4wvz:C
3	4qma:A	192	188	0.6613	0.6406	0.6543	8.99e-83
4	6bgf:A	188	111	0.1559	0.1543	0.2613	6.03e-06	2atf:A, 2b5h:A, 6bgm:A, 6bpr:A, 6bps:A, 6bpt:A, 6bpu:A, 6bpv:A, 6bpw:A, 6bpx:A, 6cdh:A, 6cdn:A, 6e87:A, 5efu:A, 3eln:A, 5ezw:A, 2gh2:A, 5i0r:A, 5i0s:A, 5i0t:A, 5i0u:A, 2ic1:A, 4ieo:A, 4iep:A, 4ieq:A, 4ier:A, 4ies:A, 4iet:A, 4ieu:A, 4iev:A, 4iew:A, 4iex:A, 4iey:A, 4iez:A, 4jtn:A, 4jto:A, 4kwj:A, 4kwk:A, 4kwl:A, 6n42:A, 6n43:A, 4pix:A, 4piy:A, 4piz:A, 4pjy:A, 6u1m:A, 6u4l:A, 6u4s:A, 6u4v:A, 4ubg:A, 4ubh:A, 8vl9:D, 8vlb:D, 4xet:A, 4xez:A, 4xf0:A, 4xf1:A, 4xf3:A, 4xf4:A, 4xf9:A, 4xfa:A, 4xfb:A, 4xfc:A, 4xff:A, 4xfg:A, 4xfh:A, 4xfi:A, 4ysf:A, 4yyo:A, 4z82:A
5	1lr5:D	160	63	0.0968	0.1125	0.2857	0.12	1lr5:C, 1lr5:B, 1lr5:A, 1lrh:D, 1lrh:C, 1lrh:B, 1lrh:A
6	8hey:D	1270	63	0.0914	0.0134	0.2698	1.8
7	7eto:a	1297	63	0.0914	0.0131	0.2698	2.1	7et3:a, 7etj:a
8	7qbz:A	638	120	0.1667	0.0486	0.2583	2.3	7qc0:A
9	8tzh:A	1485	41	0.1022	0.0128	0.4634	3.2	3d6t:B
10	8tzf:A	1589	41	0.1022	0.0120	0.4634	3.2
11	8u8b:A	1712	41	0.1022	0.0111	0.4634	3.2	8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
12	8fo9:F	2289	41	0.1022	0.0083	0.4634	3.2	9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
13	8tyq:A	957	41	0.1022	0.0199	0.4634	3.5	8tze:A
14	8dy7:C	1118	113	0.1720	0.0286	0.2832	3.6	8dy9:C, 8hvr:C, 8jke:C, 8k60:C, 7vpd:C, 7vpz:C, 7x74:C, 7x75:C, 7x76:C
15	8tzb:A	920	41	0.1022	0.0207	0.4634	3.8
16	8fo9:A	1173	41	0.1022	0.0162	0.4634	3.9	8fo9:C
17	8smc:C	1084	41	0.1022	0.0175	0.4634	4.0
18	8txz:A	858	41	0.1022	0.0221	0.4634	4.0
19	6vno:A	1084	41	0.1022	0.0175	0.4634	4.1	6vp6:A
20	8u7h:C	1111	41	0.1022	0.0171	0.4634	4.1
21	8eju:B	257	36	0.0860	0.0623	0.4444	5.4	8eju:A
22	7o6n:B	97	68	0.1129	0.2165	0.3088	5.7	7o6n:A
23	8xku:D	805	42	0.1022	0.0236	0.4524	6.5
24	8fit:A	229	44	0.0753	0.0611	0.3182	6.6	8fit:C
25	7chj:B	226	107	0.1505	0.1239	0.2617	6.6	7chj:A, 6s0p:A, 6s7e:A
26	4ofo:A	497	80	0.1183	0.0443	0.2750	7.8	4ofl:A, 4ofl:B, 4ofo:B, 4ofo:C, 4ofo:D
27	6dfl:A	241	36	0.0753	0.0581	0.3889	7.8
28	5nns:A	225	40	0.0645	0.0533	0.3000	9.7	5nns:B
29	7lvz:D	246	37	0.0699	0.0528	0.3514	9.9	7lvz:A, 7lvz:B, 7lvz:C

[Back]