Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LRHTFVVADATLPDCPLVYASEGFYAMTGYGPDEVLGHNCRFLQGEGTDPKEVQKIRDAIKKGEACSVRLLNYRKDGTPF
WNLLTVTPIKTPDGRVSKFVGVQVDVTS

The query sequence (length=108) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8qi8:A 110 108 1.0000 0.9818 1.0000 1.53e-78 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
2 2z6d:A 118 107 0.6296 0.5763 0.6355 2.25e-48 2z6d:B
3 8j68:A 129 108 0.6389 0.5349 0.6389 3.19e-47 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
4 2z6c:A 121 107 0.5741 0.5124 0.5794 2.40e-44 2z6c:B
5 3ue6:E 138 106 0.5463 0.4275 0.5566 9.45e-40 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
6 6i21:A 135 106 0.5000 0.4000 0.5094 2.18e-38 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
7 6t74:B 141 106 0.5278 0.4043 0.5377 8.55e-38 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
8 7qf2:AAA 117 105 0.4630 0.4274 0.4762 3.69e-34 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
9 1g28:A 104 103 0.4630 0.4808 0.4854 2.65e-33 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
10 8pm1:A 109 104 0.4815 0.4771 0.5000 4.40e-33 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
11 4eeu:A 109 104 0.4444 0.4404 0.4615 4.80e-33 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
12 2mwg:A 261 107 0.4815 0.1992 0.4860 1.27e-32 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
13 4hhd:A 152 105 0.4352 0.3092 0.4476 3.72e-32 4hhd:B
14 4gcz:B 378 107 0.4815 0.1376 0.4860 9.14e-32 4gcz:A
15 6hmj:A 359 101 0.4722 0.1421 0.5050 2.23e-31 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
16 2wkp:A 320 108 0.4630 0.1562 0.4630 1.63e-30 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
17 6ph4:B 460 102 0.4259 0.1000 0.4510 3.27e-30 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
18 7oo9:A 106 104 0.5000 0.5094 0.5192 1.13e-29 7oo9:B
19 7tbq:A 375 107 0.4537 0.1307 0.4579 1.30e-29 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
20 5hzh:A 320 108 0.4537 0.1531 0.4537 2.71e-29
21 5hzi:A 476 107 0.4537 0.1029 0.4579 5.12e-29 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
22 7tcd:A 436 107 0.4444 0.1101 0.4486 1.36e-28 4wf0:A, 4wf0:B
23 8c05:A 305 107 0.4352 0.1541 0.4393 3.72e-28
24 6gb3:A 120 100 0.4167 0.3750 0.4500 1.37e-27 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
25 4r3a:A 318 103 0.4167 0.1415 0.4369 6.18e-27 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
26 7a6p:A 149 104 0.3981 0.2886 0.4135 9.87e-27 7a6p:B
27 7r56:A 137 103 0.4074 0.3212 0.4272 2.01e-26 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
28 8a5r:AAA 206 101 0.4167 0.2184 0.4455 1.46e-25 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
29 4wuj:C 145 108 0.4074 0.3034 0.4074 3.04e-25 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
30 7r5n:B 151 103 0.3981 0.2848 0.4175 4.41e-25 7r5n:A
31 8a6x:B 368 102 0.3981 0.1168 0.4216 1.48e-24 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
32 7yx0:A 166 103 0.4074 0.2651 0.4272 3.76e-24 7yx0:C
33 4r3a:B 278 103 0.4074 0.1583 0.4272 6.15e-24
34 5svu:B 135 108 0.4259 0.3407 0.4259 6.29e-23 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
35 7wa4:B 107 100 0.3981 0.4019 0.4300 3.36e-22
36 3hjk:A 150 112 0.3704 0.2667 0.3571 2.31e-19 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
37 4hj6:B 178 103 0.3704 0.2247 0.3883 1.70e-18 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
38 7yid:A 660 106 0.3056 0.0500 0.3113 5.36e-16 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
39 2gj3:A 119 108 0.3148 0.2857 0.3148 2.44e-10 2gj3:B
40 3ewk:A 227 92 0.2130 0.1013 0.2500 5.13e-09
41 3ewk:A 227 95 0.2315 0.1101 0.2632 9.59e-07
42 8dik:A 127 91 0.1944 0.1654 0.2308 0.002 8dik:B
43 6pl0:B 608 78 0.1759 0.0312 0.2436 0.003 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
44 1d06:A 130 109 0.2963 0.2462 0.2936 0.034 1ew0:A
45 6wmp:D 1159 78 0.2315 0.0216 0.3205 0.053 6wmr:D, 6wmt:D
46 6gsz:A 863 61 0.1759 0.0220 0.3115 0.13
47 1s66:L 119 74 0.1852 0.1681 0.2703 0.21 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
48 7qep:C3 146 55 0.1574 0.1164 0.3091 0.30
49 7qix:G 261 57 0.1296 0.0536 0.2456 1.2 7qiz:w
50 2h3h:A 313 74 0.2037 0.0703 0.2973 1.4 3c6q:C, 3c6q:D, 2h3h:B, 2qvc:A, 2qvc:B, 2qvc:C, 2qvc:D
51 8sy7:J 1052 92 0.2222 0.0228 0.2609 1.9 8sy5:J
52 7xi4:A 283 72 0.1852 0.0707 0.2778 1.9 8g4a:A, 8g4a:B, 5nj8:B, 5sy7:A, 5v0l:A, 7xhv:A, 4zph:A, 4zpk:A
53 8jiw:BE 263 57 0.1204 0.0494 0.2281 1.9 8auv:A, 8b2l:A1, 8ip8:ja, 8ip9:ja, 8ipa:ja, 8ipb:ja, 8r6f:E, 4v3p:SD, 4v7e:BE
54 8txo:J 1162 92 0.2222 0.0207 0.2609 2.2
55 4zpr:A 235 62 0.1852 0.0851 0.3226 2.3
56 1vr0:C 237 53 0.1574 0.0717 0.3208 2.5 1vr0:A, 1vr0:B
57 8sy6:J 1269 90 0.2315 0.0197 0.2778 2.5
58 7v7w:B 288 95 0.1759 0.0660 0.2000 3.3
59 7ok0:A 880 36 0.1296 0.0159 0.3889 3.4 7oq4:A, 7oqy:A
60 5kr7:A 340 42 0.1296 0.0412 0.3333 4.2 5fjh:A, 5fjh:B, 5fjk:A, 5kr7:B, 4xdo:A, 4xdo:B, 4xdp:A, 4xdp:B, 2xml:A, 2xml:B
61 3muo:A 684 25 0.1204 0.0190 0.5200 4.4 3iuq:A, 3iur:A, 3ivm:A
62 8osl:N 290 51 0.0833 0.0310 0.1765 5.2 4h10:A, 8osk:N, 8osl:P
63 4jdp:B 265 63 0.1667 0.0679 0.2857 7.7 4jdp:A, 3qgm:A, 3qgm:B, 3qgm:C, 3qgm:D
64 6vsu:E 318 25 0.1204 0.0409 0.5200 9.4 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
65 4tqm:A 402 32 0.1296 0.0348 0.4375 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218