BioLiP

>protein
LQLAAHSDARSGPVGSNGGQFWSFRPVRPLNKIVLSFSGSPDQTLNLISITFSSNPTDIITVGGVGPEPLTYTETVNIDG
DIIEISGMIANYKGYNVIRSIKFTTNKKEYGPYGANAGTPFNIKIPDGNKIVGFFGNSGWYVDAIGAYYTAK

The query sequence (length=152) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ddn:A	154	152	1.0000	0.9870	1.0000	7.11e-109	4ddn:B, 4ddn:C, 4ddn:D, 3r51:A, 3r52:A, 3r52:B, 3r52:C, 3r52:D
2	5xfi:A	152	155	0.5329	0.5329	0.5226	3.95e-40	5av7:A, 5av7:B, 5av7:C, 5av7:D, 5xfi:B
3	4pit:B	144	141	0.3421	0.3611	0.3688	3.69e-17	2bmz:A, 2bmz:B, 2bn0:A, 2bn0:B, 8hyf:A, 3mit:A, 3mit:B, 3miu:A, 3miu:B, 3miv:B, 4pik:B, 4pik:C, 4pik:D, 4pik:A, 4pit:A, 4pit:C, 4pit:D, 1x1v:A, 1x1v:B
4	7v4s:A	143	147	0.3224	0.3427	0.3333	5.01e-15
5	1jot:A	133	67	0.2171	0.2481	0.4925	8.01e-15	3lly:A, 3llz:A, 3lm1:A, 3lm1:E, 3lm1:M, 3lm1:C, 3lm1:G, 3lm1:K, 3lm1:I, 3lm1:O
6	1zgs:A	442	144	0.3553	0.1222	0.3750	1.09e-14	4mq0:A, 1zgs:B
7	1zgs:A	442	144	0.3355	0.1154	0.3542	1.49e-14	4mq0:A, 1zgs:B
8	1zgs:A	442	89	0.2500	0.0860	0.4270	2.79e-14	4mq0:A, 1zgs:B
9	4ak4:A	133	67	0.2171	0.2481	0.4925	2.45e-14	4ak4:C, 4ak4:E, 4ak4:G, 4ak4:I, 4ak4:K, 4ak4:M, 4ak4:O, 4akb:A, 4akb:C, 4akb:E, 4akb:G, 4akc:A, 4akc:C, 4akc:E, 4akc:G, 5bn6:E, 5bn6:F, 5bn6:H, 5bn6:G, 5j4t:A, 5j4t:C, 5j4t:E, 5j4t:G, 5j4x:A, 5j4x:C, 5j4x:E, 5j4x:G, 5j50:A, 5j50:C, 5j50:E, 5j50:G, 5j51:A, 5j51:C, 5j51:E, 5j51:G, 1jac:A, 1jac:C, 1jac:E, 1jac:G, 5jm1:A, 5jm1:C, 5jm1:E, 5jm1:G, 1ku8:A, 1ku8:C, 1ku8:E, 1ku8:G, 1kuj:A, 1kuj:C, 1kuj:E, 1kuj:G, 1m26:A, 1m26:C, 1m26:E, 1m26:G, 1pxd:A, 4r6n:A, 4r6n:C, 4r6n:E, 4r6n:G, 4r6o:A, 4r6o:C, 4r6o:E, 4r6o:G, 4r6p:A, 4r6p:C, 4r6p:E, 4r6p:G, 4r6q:A, 4r6q:C, 4r6q:E, 4r6q:G, 4r6r:A, 4r6r:C, 4r6r:E, 4r6r:G, 1toq:A, 1toq:C, 1toq:E, 1toq:G, 1tp8:A, 1tp8:C, 1tp8:E, 1tp8:G, 1ugw:A, 1ugw:C, 1ugw:E, 1ugw:G, 1ugx:A, 1ugy:A, 1ugy:C, 1ugy:E, 1ugy:G, 1uh0:A, 1uh0:C, 1uh0:E, 1uh0:G, 1uh1:A, 1uh1:C, 1uh1:E, 1uh1:G, 1ws4:A, 1ws4:C, 1ws4:E, 1ws4:G, 1ws5:A, 1ws5:C, 1ws5:E, 1ws5:G
10	1xxr:B	154	66	0.2303	0.2273	0.5303	4.48e-13	1xxr:C, 1xxr:D
11	1c3m:A	145	144	0.3289	0.3448	0.3472	7.21e-13	1c3n:A
12	6fly:A	144	53	0.1579	0.1667	0.4528	1.39e-09	6fly:B, 6flz:A, 6flz:B
13	5m6o:A	150	72	0.1974	0.2000	0.4167	2.83e-08	5m6o:B, 5m6o:C, 5m6o:D, 5tqz:A, 5tqz:B, 5tqz:C, 5tqz:D
14	1j4u:A	149	55	0.1776	0.1812	0.4909	1.61e-07	1j4u:B, 1j4u:C, 1j4u:D, 1vbo:A, 1vbo:B, 1vbo:C, 1vbo:E, 1vbo:G, 1vbo:H, 1vbo:D, 1vbo:F, 1vbp:A, 1vbp:B
15	5gvy:A	145	68	0.1645	0.1724	0.3676	4.20e-04	5gvy:B, 5xfh:A
16	3apa:A	138	69	0.1579	0.1739	0.3478	8.96e-04	3vy6:A, 3vy7:A, 3vze:A, 3vzf:A, 3vzg:A
17	6roh:A	1112	26	0.0789	0.0108	0.4615	0.63	7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
18	3ll2:A	123	55	0.1118	0.1382	0.3091	0.64	2guc:A, 2guc:B, 2gud:A, 2gud:B, 2hyq:A, 2hyq:B, 2hyr:A, 2hyr:B, 2nuo:A, 2nuo:B, 7ria:A, 7ria:B, 7rib:A, 7rib:B, 7rib:C, 7rkg:A, 7rkg:B, 7rki:A, 7rki:B
19	6lcp:A	1140	26	0.0724	0.0096	0.4231	3.6	6lcr:A
20	7p0h:A	411	69	0.1447	0.0535	0.3188	4.4	7p0h:B, 7p0h:C, 7p0h:D
21	6k7l:A	992	26	0.0592	0.0091	0.3462	6.2	6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
22	8oxa:A	1035	26	0.0658	0.0097	0.3846	6.7	8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
23	8ox8:A	1125	26	0.0658	0.0089	0.3846	6.8	8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
24	7vgh:B	1183	26	0.0658	0.0085	0.3846	6.8	7vgi:B
25	3ju8:A	486	51	0.1053	0.0329	0.3137	7.7	3ju8:B
26	5ckn:A	278	75	0.1316	0.0719	0.2667	8.3	5cis:A, 5ckm:A, 5ckn:D, 1nt0:A, 1nt0:G

[Back]