BioLiP

>protein
LQKEEEARKVKSGIRQMRLFSQDECAKIEARIDEVVSRAEKGLYNEHTVDRAPLRNKYFFGEGYTGPGQERLYPPGDVDE
IPEWVHQLVIQKLVEHRVIPEGFVNSAVINDYQPGGCIVSHVDPIHIFERPIVSVSFFSDSALCFGCKFQFKPIRVSEPV
LSLPVRRGSVTVLSGYAADEITHCIRPQDIKERRAVIILRKTRLDAPRLE

The query sequence (length=210) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7wkv:A	219	217	0.9952	0.9543	0.9631	2.73e-152	4nj4:A, 4nj4:B, 4nro:A, 4nrp:A, 4nrq:A, 4o7x:A, 4oct:A, 4oct:B, 7v4g:A, 7v4g:B, 7v4g:C, 7wkv:C, 7wkv:E, 7wl0:A, 7wl0:C, 7wl0:E, 7wl0:G, 7wl0:I
2	4npl:A	213	209	0.8238	0.8122	0.8278	7.84e-128	4npl:B, 4npm:A, 4npm:B
3	3tht:B	312	81	0.1333	0.0897	0.3457	0.005	3thp:A, 3tht:A, 3tht:C, 3tht:D
4	8aa2:E	497	42	0.0714	0.0302	0.3571	2.3	8aa2:M, 6r3r:A, 6r3u:A, 7znr:A, 7znr:B, 7zns:A, 7zns:B
5	6f2a:C	326	39	0.0667	0.0429	0.3590	4.6	6f2a:A, 6f2a:B, 6f2a:D, 6f2b:A, 6f2b:B, 6f2b:C, 6f2b:D, 6f6j:A, 6f6j:B, 6f6j:C, 6f6j:D
6	3j79:a	106	73	0.0857	0.1698	0.2466	5.8	3jbn:Aa, 3jbo:Aa, 3jbp:Aa, 8tpu:Aa, 5umd:a
7	7evv:A	489	64	0.0857	0.0368	0.2812	6.4	6a88:A, 6a88:B, 6a88:C, 6a88:D, 7evu:A, 7evu:B, 7f9p:A, 7f9q:A, 7f9q:B, 7f9r:A, 7f9s:A, 7f9t:A, 7f9t:B, 7f9u:A, 7f9u:B, 7f9u:C, 7f9u:D, 7f9v:A, 7f9v:B, 7fak:A, 7fal:A, 7fal:B, 7fam:A, 7fan:A, 7v8j:A, 7v8j:B, 7v8k:A, 7v8k:B, 7vc1:A, 7vc2:A, 7vc2:B, 7vc3:A, 7vc5:A, 5xig:A, 5xig:B, 5xig:C, 5xig:D, 5xih:A, 5xih:B, 5xih:C, 5xih:D, 5xii:A, 5xii:B, 5xii:C, 5xii:D, 5xij:A, 5xij:B, 5xij:C, 5xij:D, 5xik:A, 5xik:B, 5xik:C, 5xik:D, 5xiq:A, 5xiq:B, 5xiq:C, 5xiq:D

[Back]