Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LPRVKHTLVPPPFAHAHEQVAASGPVINEFEMRIIEKEVQLDEDAYLQAMTFDGSIPGPLMIVHEGDYVELTLINPPENT
MPHNIDFHAATGALGGGGLTLINPGEKVVLRFKATRAGAFVYHCAPGGPMIPWHVVSGMAGCIMVLPRDGLKDHEGKPVR
YDTVYYIGESDHYIPKDEDGTYMRFSDPSEGYEDMVAVMDTLIPSHIVFNGAVGALTGEGALKAKVGDNVLFVHSQPNRD
SRPHLIGGHGDLVWETGKFHNAPERDLETWFIRGGSAGAALYKFLQPGVYAYVNHNLIEAVHKGATAHVLVEGEWDNDLM
EQVVAPVG

The query sequence (length=328) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1mzz:A 334 328 0.9939 0.9760 0.9939 0.0 2a3t:A, 2dws:A, 2dwt:A, 2dy2:A, 1mzy:A, 1mzz:B, 1mzz:C, 1n70:A, 1zv2:A
2 8rfv:A 345 327 0.6951 0.6609 0.6972 1.43e-172 9evm:A, 7qxk:A, 7qy4:A, 7qyc:A, 8r8s:A, 8rfl:A, 8rfo:A, 8rfp:A, 8rfq:A, 8rfr:A, 8rfs:A, 8rft:A, 8rfu:A, 8rfw:A, 8rfx:A, 8rfy:A, 8rg8:A, 8rg9:A, 8rgb:A, 8rgc:A, 8rgd:A, 8ru9:A, 8rur:A, 8ryj:A, 8ryr:A, 8ryu:A, 8ryv:A, 8s0w:A, 8s2q:A, 8s5x:A, 8s5y:A, 8s63:A, 8s64:A, 8s68:A, 8s69:A, 6thf:A, 6zar:A, 6zas:A, 6zat:A, 6zau:A, 6zav:A, 6zaw:A, 6zax:A, 7zcn:A, 7zco:A, 7zcp:A, 7zcq:A, 7zcr:A, 7zcs:A
3 2bo0:A 336 327 0.6646 0.6488 0.6667 3.27e-160 5b1j:A, 5b1j:B, 5b1k:A, 2bp0:A, 2bp0:B, 2bp8:A, 2bp8:B, 1bq5:A, 4csp:A, 4csp:F, 4csz:A, 1gs6:X, 1gs7:A, 1gs8:A, 1hau:A, 1haw:A, 2jfc:A, 2jfc:B, 2jfc:C, 2jfc:D, 2jfc:E, 2jfc:F, 1ndt:A, 1oe1:A, 1oe2:A, 1oe3:A, 5onx:A, 5ony:A, 2vm3:A, 2vm4:A, 2vmj:A, 2vn3:A, 2vw4:A, 2vw4:B, 2vw6:A, 2vw6:B, 2vw7:A, 2vw7:B, 1wa0:X, 1wa1:X, 1wa2:X, 1wae:A, 2xwz:A, 2xwz:E, 2xwz:D, 2xwz:B, 2xwz:F, 2xwz:C, 2xx0:A, 2xx0:B, 2xx1:A, 2xx1:D, 2xx1:B, 2xx1:C, 2xx1:E, 2xx1:F, 2xxf:A, 2xxf:B, 2xxg:A, 2xxg:C, 2zon:A, 2zon:B, 2zon:C
4 7p2f:A 329 329 0.6524 0.6505 0.6505 6.94e-159 7p2f:B, 7p2f:C
5 5akr:A 337 327 0.6677 0.6499 0.6697 1.70e-151 2avf:A, 2avf:B, 2avf:C, 2avf:D, 2avf:E, 2avf:F, 2bw4:A, 2bw5:A, 2bwd:A, 2bwi:A, 6gb8:A, 6gbb:A, 6gby:A, 6gcg:A, 6gsq:A, 6gt0:A, 6gt2:A, 6gti:A, 6gtj:A, 6gtk:A, 6gtl:A, 6gtn:A, 5i6k:A, 5i6l:A, 5i6m:A, 5i6n:A, 5i6o:A, 5i6p:A, 1kcb:A, 6knf:A, 6knf:B, 6knf:C, 6kng:A, 6kng:B, 6kng:C, 5n8f:A, 5n8g:A, 5n8h:A, 5n8i:A, 1nia:A, 1nia:B, 1nia:C, 1nib:A, 1nib:B, 1nib:C, 1nic:A, 1nid:A, 1nie:A, 1nif:A, 2nrd:A, 5of5:A, 5of6:A, 5of7:A, 5of8:A, 5ofc:A, 5ofd:A, 5ofe:A, 5off:A, 5ofg:A, 5ofh:A, 5og2:A, 5og3:A, 5og4:A, 5og5:A, 5og6:A, 5ogf:A, 5ogg:A, 6qwg:A, 1rzp:A, 1rzp:B, 1rzp:C, 1rzq:A, 1rzq:B, 1rzq:C, 2y1a:A, 6zu6:A, 6zua:A, 6zub:A, 6zud:A, 6zut:A
6 5d4h:B 341 329 0.6524 0.6276 0.6505 5.48e-148 2afn:A, 2afn:B, 2afn:C, 1aq8:A, 1aq8:B, 1aq8:C, 1as6:A, 1as6:B, 1as6:C, 1as7:A, 1as7:B, 1as7:C, 1as8:A, 1as8:B, 1as8:C, 2b08:A, 2b08:B, 2b08:C, 5d4h:A, 5d4h:C, 5d4i:A, 5d4i:C, 5d4i:B, 5d4j:A, 5d4j:B, 5d4j:C, 2e86:A, 2e86:B, 2e86:C, 1et5:A, 1et7:A, 1et8:A, 5f7a:A, 5f7a:C, 5f7a:B, 5f7b:A, 5f7b:B, 5f7b:C, 2fjs:A, 2fjs:B, 2fjs:C, 3h4f:A, 3h4f:B, 3h4f:C, 3h4h:A, 3h4h:B, 3h4h:C, 3h56:A, 1j9q:A, 1j9q:B, 1j9q:C, 1j9r:A, 1j9r:B, 1j9r:C, 1j9s:A, 1j9s:B, 1j9s:C, 1j9t:A, 1j9t:B, 1j9t:C, 1l9o:A, 1l9o:B, 1l9o:C, 1l9p:A, 1l9p:B, 1l9p:C, 1l9q:A, 1l9q:C, 1l9q:B, 1l9r:A, 1l9r:B, 1l9r:C, 1l9s:A, 1l9s:B, 1l9s:C, 1l9t:A, 1l9t:C, 1l9t:B, 1npj:A, 1npj:B, 1npj:C, 1npn:A, 1npn:B, 1npn:C, 1ntd:A, 2p80:A, 2p80:B, 2p80:C, 2pp7:A, 2pp7:B, 2pp7:C, 2pp8:A, 2pp8:B, 2pp8:C, 2pp9:A, 2pp9:B, 2pp9:C, 2ppa:A, 2ppa:B, 2ppa:C, 2ppc:A, 2ppc:B, 2ppc:C, 2ppd:A, 2ppd:B, 2ppd:C, 2ppe:A, 2ppe:B, 2ppe:C, 2ppf:A, 2ppf:B, 2ppf:C, 1sjm:A, 1sjm:B, 1sjm:C, 1snr:A, 1snr:B, 1snr:C, 4ysc:A, 4ysc:B, 4ysc:C, 4yse:A, 4yse:B, 4yse:C, 1zdq:A, 1zdq:B, 1zdq:C, 1zds:A, 1zds:B, 1zds:C
7 1ndr:A 330 327 0.6402 0.6364 0.6422 2.12e-145 1ndr:B, 1ndr:C, 1nds:A, 1nds:B, 1nds:C
8 4ax3:D 457 317 0.3445 0.2473 0.3565 1.72e-45 4ax3:A, 4ax3:B, 4ax3:C, 6f1q:A, 6fja:A, 5obo:A, 5ocb:A, 5ocf:A, 8qgf:A, 6qpt:A, 6qpt:B, 6qpt:C, 6qpt:D, 6qpt:E, 6qpt:F, 6qpu:A, 6qpu:B, 6qpu:C, 6qpu:D, 6qpu:E, 6qpu:F, 6qpv:A, 6qpv:I, 6qpx:A, 6qpx:I, 6qpz:A, 6qpz:I, 6qq0:A, 6qq1:A, 6qq2:A, 7qq2:A, 7r2u:A, 2yqb:A, 3zbm:A, 3ziy:A
9 5ue6:A 314 304 0.3140 0.3280 0.3388 2.84e-43 1kbv:A, 1kbv:B, 1kbv:C, 1kbv:D, 1kbv:F, 1kbv:E, 1kbw:A, 1kbw:B, 1kbw:C, 1kbw:D, 1kbw:E, 1kbw:F, 5tb7:A, 5tb7:C, 5tb7:B, 5ue6:C, 5ue6:B, 5ue6:D, 5ue6:F, 5ue6:E, 5ue6:G, 5ue6:I, 5ue6:H
10 2zoo:A 438 323 0.3293 0.2466 0.3344 1.27e-39
11 6the:A 299 313 0.3323 0.3645 0.3482 3.57e-35
12 2dv6:A 422 296 0.2896 0.2251 0.3209 2.87e-34 2dv6:B, 2dv6:C, 2dv6:D, 2dv6:E, 2dv6:F
13 2dv6:A 422 239 0.1890 0.1469 0.2594 1.27e-04 2dv6:B, 2dv6:C, 2dv6:D, 2dv6:E, 2dv6:F
14 6tfo:C 424 296 0.2927 0.2264 0.3243 9.18e-34 6tfd:A, 6tfd:C, 6tfd:B, 6tfo:A, 6tfo:B
15 6tfo:C 424 89 0.0854 0.0660 0.3146 4.10e-05 6tfd:A, 6tfd:C, 6tfd:B, 6tfo:A, 6tfo:B
16 5zl1:A 306 263 0.3049 0.3268 0.3802 4.32e-31 5zl1:B, 5zl1:C, 5zl1:D
17 4kns:A 285 299 0.2988 0.3439 0.3278 1.22e-27 4kns:B, 4kns:C, 4kns:D, 4kns:E, 4kns:F, 4knt:A, 4knt:B, 4knt:C, 4knu:A, 4knu:B, 4knu:C, 4knu:D, 4knu:E, 4knu:F
18 3wi9:A 303 302 0.2591 0.2805 0.2815 5.38e-22 6l46:A, 3wia:A, 3wia:B, 3wia:C, 3wia:D, 3wia:E, 3wia:F, 3wia:G, 3wia:H, 3wia:I, 3wkp:A, 3wkq:A, 3wni:A, 3wnj:A, 3x1e:A, 3x1f:A, 3x1g:A, 3x1n:A, 4ysa:A, 4ysd:A, 4yso:A, 4ysp:A, 4ysq:A, 4ysr:A, 4yss:A, 4yst:A, 4ysu:A, 5ytl:A, 5ytm:A, 5ytn:A, 4zk8:A
19 6hbe:C 427 234 0.1982 0.1522 0.2778 4.82e-16 6hbe:A, 6hbe:B
20 7rab:A 299 131 0.1311 0.1438 0.3282 3.23e-13 7rab:B, 7rab:C, 7rab:D, 7rab:E, 7rab:F, 7rab:G, 7rab:H, 7rac:A, 7rac:B, 7rac:C, 7rac:D, 7rac:E, 7rac:F, 7rac:G, 7rac:H, 7rac:I, 7rac:J, 7rac:K, 7rac:L
21 3gdc:A 288 142 0.1189 0.1354 0.2746 1.26e-11 3gdc:B, 3gdc:C
22 4e9v:A 317 132 0.1250 0.1293 0.3106 2.25e-09 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
23 3g5w:A 318 132 0.1250 0.1289 0.3106 7.76e-09 3g5w:B, 3g5w:C, 3g5w:D, 3g5w:E, 3g5w:F
24 3sqr:A 539 109 0.1067 0.0649 0.3211 0.002 3v9e:A, 4x4k:A
25 6w2k:A 440 101 0.0945 0.0705 0.3069 0.014 5afa:A, 5g3b:A, 5g3c:A, 5g3d:A, 5g3e:A, 5g3f:A, 5g3g:A, 5g3h:A, 5jrr:A, 5jx9:A, 5k0d:A, 5k15:A, 5k3k:A, 5k5k:A, 5k7a:A, 5k84:A, 6q29:A, 6tyr:A, 6w2k:B, 6w9x:A, 6wcg:A, 6wch:A, 6wcl:A, 6wcm:A, 6wcn:A, 6wcp:A, 2xu9:A, 2yae:A, 2yaf:A, 2yah:A, 2yam:A, 2yao:A, 2yap:A, 2yaq:A, 2yar:A
26 6vox:A 407 183 0.1341 0.1081 0.2404 0.047
27 1aoz:A 552 119 0.1037 0.0616 0.2857 0.056 1aoz:B, 1aso:A, 1aso:B, 1asp:A, 1asp:B, 1asq:A, 1asq:B
28 1aac:A 105 70 0.0823 0.2571 0.3857 0.066 1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
29 6f5k:A 558 107 0.0915 0.0538 0.2804 0.20
30 6f5k:A 558 45 0.0518 0.0305 0.3778 1.1
31 3pps:A 564 82 0.0671 0.0390 0.2683 0.20 3pps:B, 3pps:C, 3pps:D
32 3pps:A 564 104 0.0823 0.0479 0.2596 0.41 3pps:B, 3pps:C, 3pps:D
33 3pme:A 415 51 0.0549 0.0434 0.3529 0.25 4f83:A, 3obt:A
34 6xiz:A 477 122 0.0915 0.0629 0.2459 0.39 6xiz:B, 6z0j:A, 6z0k:A
35 6vow:A 409 103 0.0793 0.0636 0.2524 0.40
36 7pab:A 415 60 0.0427 0.0337 0.2333 0.43 7pab:C
37 3x1b:A 500 112 0.1037 0.0680 0.3036 0.54 3x1b:B
38 1zpu:A 529 150 0.1128 0.0699 0.2467 0.58 1zpu:B, 1zpu:C, 1zpu:D, 1zpu:E, 1zpu:F
39 1zpu:A 529 33 0.0366 0.0227 0.3636 3.0 1zpu:B, 1zpu:C, 1zpu:D, 1zpu:E, 1zpu:F
40 3ta4:F 282 59 0.0488 0.0567 0.2712 0.60 3t9w:A, 3ta4:E, 3ta4:D
41 1ov8:A 139 47 0.0427 0.1007 0.2979 0.83 1ov8:B, 1ov8:C, 1ov8:D, 1qhq:A
42 3fu7:A 559 50 0.0457 0.0268 0.3000 1.2 3dkh:A, 3dkh:B, 3fu7:B, 3fu8:A, 3fu8:B, 3fu9:A, 3fu9:B, 1gw0:A, 1gw0:B, 2ih8:A, 2ih8:B, 2ih9:A, 2ih9:B, 2q9o:A, 2q9o:B, 3qpk:A, 3qpk:B
43 3fu7:A 559 101 0.0762 0.0447 0.2475 2.1 3dkh:A, 3dkh:B, 3fu7:B, 3fu8:A, 3fu8:B, 3fu9:A, 3fu9:B, 1gw0:A, 1gw0:B, 2ih8:A, 2ih8:B, 2ih9:A, 2ih9:B, 2q9o:A, 2q9o:B, 3qpk:A, 3qpk:B
44 3kw7:A 502 38 0.0427 0.0279 0.3684 2.1 3kw7:B
45 3div:A 499 87 0.0823 0.0541 0.3103 2.4 3fpx:A, 2h5u:A, 5ldu:A, 3pxl:A, 3v9c:A
46 9f1t:A 477 23 0.0366 0.0252 0.5217 3.4 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
47 9f1t:A 477 102 0.0823 0.0566 0.2647 8.7 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
48 6l4u:1 141 91 0.0671 0.1560 0.2418 5.1
49 4p3x:A 305 58 0.0518 0.0557 0.2931 5.3 5f33:A, 5f35:A, 5f3d:A, 6f48:A, 6f4d:A, 6f4l:A, 6g74:A, 6g74:B, 6i0k:A, 6i0p:A, 6i0r:A, 5lqm:A, 5lqs:A, 7p4m:A, 7p4p:A, 7p4q:A
50 6qmm:B 280 55 0.0427 0.0500 0.2545 6.6 6qmm:A
51 5ehf:A 497 59 0.0579 0.0382 0.3220 7.3
52 2hzh:A 499 86 0.0762 0.0501 0.2907 7.3
53 3zx1:A 471 118 0.0915 0.0637 0.2542 7.5
54 1kya:A 499 87 0.0793 0.0521 0.2989 8.0 1kya:B, 1kya:C, 1kya:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218