BioLiP

>protein
LPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPDEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGY
DEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGAIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKEL
SEALDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDW
S

The query sequence (length=241) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ftp:A	243	241	1.0000	0.9918	1.0000	0.0	8ftp:B, 8tav:A
2	1tqh:A	242	241	0.5768	0.5744	0.5768	8.41e-103
3	3dlt:A	239	240	0.2863	0.2887	0.2875	3.83e-29
4	4ke8:C	249	236	0.2946	0.2851	0.3008	3.63e-28	4ke6:A, 4ke7:A, 4ke7:B, 4ke8:A, 4ke8:B, 4ke8:D, 4ke9:A, 4ke9:B, 4ke9:C, 4ke9:D
5	2ocg:A	254	209	0.2199	0.2087	0.2536	5.90e-06	2oci:A, 2ock:A, 2ocl:A
6	7p0y:A	278	245	0.2158	0.1871	0.2122	3.38e-05	7p0y:B
7	2wtn:B	250	229	0.2158	0.2080	0.2271	1.24e-04	2wtn:A
8	7prm:A	295	246	0.2199	0.1797	0.2154	0.001	8aqf:A, 6ax1:A, 6ax1:B, 6bq0:A, 6bq0:B, 3hju:A, 3hju:B, 3jwe:A, 3jwe:B, 7l4t:A, 7l4u:A, 7l4u:B, 7l4w:A, 7l4w:B, 7l50:A, 7l50:B, 7l50:C, 7l50:D, 3pe6:A, 8ptc:A, 8ptq:A, 8ptr:A, 4uuq:A, 4uuq:B, 7zpg:A, 5zun:A
9	6qe2:A	257	244	0.1992	0.1868	0.1967	0.002	6qe2:B
10	4zxf:C	307	63	0.0747	0.0586	0.2857	0.067
11	7ute:A	190	50	0.0830	0.1053	0.4000	0.13	8eum:A, 8eum:B, 8eum:C, 8eum:D, 8eun:A, 8eun:B, 7ute:B, 7ute:C, 7ute:D
12	8qd2:A	398	87	0.0996	0.0603	0.2759	0.15	8qd2:B, 8qd2:C, 8qd2:D, 8qd3:A, 8qd3:B, 8qd3:C, 8qd3:D
13	2rau:A	350	101	0.1120	0.0771	0.2673	0.54
14	8fjd:A	298	93	0.1079	0.0872	0.2796	0.54	8fjd:B
15	8c16:D	327	99	0.1079	0.0795	0.2626	1.2	8c16:A, 8c16:B, 8c16:C, 6gas:A, 6gas:B, 6gas:C, 6gas:D
16	8b9s:A	259	89	0.0996	0.0927	0.2697	1.6	8b9s:B, 8b9s:C, 8b9s:E, 8b9s:F, 7q4h:A, 7q4h:B, 7q4j:A, 7q4j:B
17	4idb:A	321	72	0.0913	0.0685	0.3056	2.3	4idc:A, 4idd:A, 4ide:A, 4idf:A
18	3dm5:A	416	39	0.0622	0.0361	0.3846	3.5	3dm5:B
19	5h3h:B	269	94	0.0954	0.0855	0.2447	3.7	5h3h:A
20	8q4d:L	247	135	0.1286	0.1255	0.2296	4.2	5bq5:A, 5bq5:B, 5bq5:C, 8q3w:J, 8q3w:A, 8q3w:B, 8q3w:D, 8q3w:C, 8q3w:E, 8q3w:F, 8q3w:G, 8q3w:H, 8q3w:I, 8q4d:N, 8q4d:I, 8q4d:K, 8q4d:V, 8q4d:X, 8q4d:S, 8q4d:U, 8q4d:E, 8q4d:F, 8q4d:G, 8q4d:H, 8q4d:J, 8q4d:M, 8q4d:O, 8q4d:P, 8q4d:Q, 8q4d:R, 8q4d:T, 8q4d:W
21	3kfl:A	530	46	0.0747	0.0340	0.3913	5.3	6swx:A
22	7v6g:B	338	64	0.0705	0.0503	0.2656	6.5	6lnk:A, 6lnk:B, 7v6f:A, 7v6f:B, 7v6g:A, 7yva:A, 7yva:B
23	5gvi:A	326	37	0.0539	0.0399	0.3514	7.3
24	1tjy:A	316	32	0.0622	0.0475	0.4688	8.9	5gta:A

[Back]