BioLiP

>protein
LPEQFRIRQAKRADLLAQGRQPYPVDVPRTHTLLEIRQAYPDLPVDARTGEIVGVTGRVVFARNSGKLCFATLQEGDGTQ
LQAMISLAEVGQEALDNWKTYVDIGDIVFVHGEVITSKRGELSVLADSWQMAAKALRPLPVAHKEMSEESRVRQRYVDLI
VRDQARKVARQRIAVMRAIRSALERRGFLEVETPMLQTLAGGAAARPFVTHSNALDTELYLRIAPELFLKRCLVGGFERV
FELNRVFRNEGADSTHSPEFVMLETYQAYGTYDDSAVVTRELIQEVADEAIGTRQVPLPDGTVYDLDGEWESIQMYPSLS
EALGEEITPDTPAETLWAIADRLGLDIPRDRGYGHGKLVEELWEHTVGAKLWAPTFVKDFPVETTPLTRSHRSIPGVTEK
WDLYVRRIELATGYSELTDPIIQRERFEAQARAAAAGDDEAMALDEDFLAALEYGMPPSTGTGMGIDRLMMTLTGLSIRE
TVLFPIV

The query sequence (length=487) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6aqh:B	490	487	1.0000	0.9939	1.0000	0.0	6aqh:A, 6aqh:C, 6aqh:D
2	6aqg:C	490	488	0.8111	0.8061	0.8094	0.0	6aqg:A, 6aqg:B, 6aqg:D, 5vl1:A, 5vl1:B, 5vl1:C, 5vl1:D
3	7qh8:A	471	486	0.7988	0.8259	0.8004	0.0	7qhn:A, 7qi8:A
4	3a74:A	484	488	0.4168	0.4194	0.4160	2.27e-122	3a74:B, 3a74:C, 3a74:D, 3e9h:A, 3e9h:B, 3e9h:C, 3e9h:D, 3e9i:A, 3e9i:B, 3e9i:C, 3e9i:D
5	4ex5:A	486	476	0.4333	0.4342	0.4433	8.14e-121	4ex5:B
6	1e1t:A	485	492	0.3984	0.4000	0.3943	8.16e-116	1e1o:A, 1e22:A, 1e24:A, 1lyl:A, 1lyl:B, 1lyl:C, 5yzx:A, 5yzx:B, 5yzx:C
7	6wbd:B	485	443	0.4107	0.4124	0.4515	1.54e-114	6wbd:A
8	1bbu:A	486	490	0.3963	0.3971	0.3939	4.24e-114
9	6chd:A	506	504	0.4107	0.3953	0.3968	7.28e-106	3bju:A, 3bju:B, 3bju:C, 3bju:D, 6chd:B, 4dpg:A, 4dpg:B, 4dpg:C, 4dpg:D, 4dpg:E, 4dpg:F, 4dpg:G, 4dpg:H, 7ea9:A, 7ea9:B, 7ea9:C, 7ea9:D, 6ild:A, 6ild:B, 6ilh:A, 6ilh:B, 4ycu:A, 4ycu:B, 4ycw:A, 4ycw:B, 4ycw:E, 4ycw:F
10	5hgq:B	482	496	0.3984	0.4025	0.3911	3.46e-101	5hgq:A, 5hgq:D, 5hgq:C
11	4up7:A	529	483	0.3799	0.3497	0.3830	6.16e-101	4up9:A, 4upa:A
12	6bni:A	502	447	0.3573	0.3466	0.3893	1.04e-96	6bni:B, 6c86:A, 6c86:B, 5eln:A, 5eln:B, 5eln:C, 5eln:D, 5elo:A, 5elo:B, 5elo:C, 5elo:D, 6hcw:A, 6hcw:B, 7zog:A, 7zog:B, 7zog:C, 7zog:D
13	6agt:B	506	503	0.3655	0.3518	0.3539	9.44e-93	6agt:A, 6agt:C, 6agt:D, 7bt5:A, 7bt5:B, 6hcu:A, 6hcu:B, 6hcv:A, 6hcv:B, 8k9s:A, 8k9s:B, 8k9u:A, 8k9u:B, 8k9v:A, 8k9v:B, 8k9w:A, 8k9w:B, 8k9x:A, 8k9x:B, 6ka6:A, 6ka6:B, 6ka6:C, 6ka6:D, 6kab:A, 6kab:B, 6kab:C, 6kab:D, 6kbf:A, 6kbf:B, 6kcn:A, 6kcn:B, 6kcn:C, 6kcn:D, 6kct:A, 6kct:B, 6kct:C, 6kct:D, 6l3y:B, 6l3y:A, 6l4q:B, 6l4q:A, 6m0t:A, 6m0t:B, 6m0t:C, 6m0t:D, 4pg3:A, 4pg3:B, 4pg3:C, 4pg3:D, 4ycv:A, 4ycv:B, 4ycv:C, 4ycv:D, 5zh2:B, 5zh3:A, 5zh3:B, 5zh4:A, 5zh4:B, 5zh5:A, 5zh5:B
14	7f6w:A	506	462	0.3758	0.3617	0.3961	5.69e-91
15	6nrz:A	517	512	0.3696	0.3482	0.3516	8.60e-86	6nrz:B, 6ns0:A, 6ns0:B, 6o3f:A, 6o3f:B
16	5zh2:A	464	487	0.3470	0.3642	0.3470	1.04e-83
17	3a5z:C	324	329	0.2218	0.3333	0.3283	1.61e-33	3a5y:B, 3a5y:C, 3a5y:D, 3a5z:A, 3a5z:E, 3a5z:G, 3g1z:A, 3g1z:B
18	3a5y:A	297	326	0.2136	0.3502	0.3190	9.49e-32
19	1b8a:A	438	467	0.2382	0.2648	0.2484	7.94e-19	1b8a:B, 3nel:A, 3nem:A, 3nem:B
20	4o2d:B	515	519	0.2752	0.2602	0.2582	8.59e-17
21	1asy:A	490	357	0.1848	0.1837	0.2521	1.48e-14	1asy:B, 1asz:A, 1asz:B
22	1c0a:A	585	154	0.0986	0.0821	0.3117	2.98e-14	1il2:A, 1il2:B
23	1c0a:A	585	135	0.0780	0.0650	0.2815	1.24e-04	1il2:A, 1il2:B
24	4o2d:A	580	280	0.1643	0.1379	0.2857	1.88e-13	4rmf:A
25	4o2d:A	580	96	0.0616	0.0517	0.3125	0.016	4rmf:A
26	5w25:A	583	169	0.1088	0.0909	0.3136	3.99e-13	5w25:B
27	4wj3:M	589	175	0.0965	0.0798	0.2686	6.76e-13	4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
28	4wj3:M	589	137	0.0903	0.0747	0.3212	9.21e-08	4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
29	6sjc:B	581	131	0.0883	0.0740	0.3282	5.65e-11	7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
30	6sjc:B	581	86	0.0678	0.0568	0.3837	1.26e-07	7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
31	3kfu:C	377	384	0.1971	0.2546	0.2500	6.21e-11	3kfu:A, 3kfu:D, 3kfu:B
32	3m4p:A	435	358	0.1437	0.1609	0.1955	1.91e-04	3m4p:B, 3m4p:C, 3m4p:D
33	7u0r:B	278	133	0.0801	0.1403	0.2932	2.05e-04	8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
34	2xgt:B	433	451	0.2012	0.2263	0.2173	0.009	2xgt:A, 2xti:A, 2xti:B
35	7dpi:C	292	55	0.0411	0.0685	0.3636	0.031	7dpi:A
36	2zni:A	279	94	0.0616	0.1075	0.3191	0.040	2zni:B
37	8dqj:A	251	176	0.1047	0.2032	0.2898	0.097
38	7by6:A	299	27	0.0287	0.0468	0.5185	0.16
39	3l4g:C	508	26	0.0267	0.0256	0.5000	0.90	3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
40	7sud:A	3740	47	0.0287	0.0037	0.2979	1.9
41	8hfd:A	452	83	0.0554	0.0597	0.3253	2.0	3e74:B, 8hfd:B, 8hfd:C, 8hfd:D
42	3e74:A	429	83	0.0554	0.0629	0.3253	2.2	3e74:C, 3e74:D
43	1x54:A	434	41	0.0329	0.0369	0.3902	3.5	1x55:A
44	7vw6:A	913	27	0.0287	0.0153	0.5185	3.7	7e5z:A, 8j83:A, 7xqw:A
45	3p8v:A	294	152	0.0821	0.1361	0.2632	4.6	3p8v:B, 3p8y:A, 3p8y:B, 3reu:A, 3reu:B, 3rex:A, 3rex:B, 3rl6:A, 3rl6:B
46	7qwt:A	352	55	0.0411	0.0568	0.3636	6.4	7qwt:B, 7qwt:C, 7qwt:D, 7qwt:E, 7qwt:F, 7qwt:G, 7qwt:H, 7qwt:I
47	8f5v:A	167	16	0.0246	0.0719	0.7500	6.7	8f5v:B
48	8br8:LF	293	68	0.0513	0.0853	0.3676	7.5	8brm:LF, 8bsi:LF, 8bsj:LF, 8btd:LF, 8btr:LF, 8fru:D, 7pwg:D, 7pwo:D2
49	3ii1:A	522	47	0.0267	0.0249	0.2766	9.1	3fw6:A
50	4cs3:A	270	103	0.0616	0.1111	0.2913	9.3	6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A

[Back]