Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LPEGKIMPNTVFVGGIDVRMDETEIRSFFARYGSVKEVKIITDRTGVSKGYGFVSFYNDVDVQKIVESQINFHGKKLKLG
PAIRKQH

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2xs2:A 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 5.88e-60 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
2 2fy1:A 108 74 0.2644 0.2130 0.3108 8.32e-12
3 2cjk:A 167 74 0.3103 0.1617 0.3649 8.88e-10 2km8:C
4 2cjk:A 167 74 0.2529 0.1317 0.2973 6.32e-07 2km8:C
5 5en1:A 184 81 0.3333 0.1576 0.3580 2.90e-09 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
6 5ith:A 80 58 0.2529 0.2750 0.3793 3.18e-09 5o3j:A
7 8fkp:SH 150 67 0.3103 0.1800 0.4030 3.41e-09 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
8 9gpj:A 184 87 0.3218 0.1522 0.3218 8.09e-09 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
9 9gpj:A 184 47 0.1609 0.0761 0.2979 0.002 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
10 2mb0:B 95 81 0.2874 0.2632 0.3086 2.05e-08
11 7q33:A 93 77 0.2759 0.2581 0.3117 6.16e-08 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
12 6jvx:A 87 58 0.2299 0.2299 0.3448 7.11e-08 6jvy:A
13 2n82:B 104 65 0.2644 0.2212 0.3538 9.61e-08 2err:A, 7vrl:B
14 2rs2:A 84 57 0.2184 0.2262 0.3333 3.09e-07
15 6n7p:A 186 48 0.1954 0.0914 0.3542 3.39e-07 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
16 6g90:B 193 65 0.2299 0.1036 0.3077 4.81e-07
17 6m75:A 167 76 0.2184 0.1138 0.2500 8.09e-07
18 6m75:A 167 63 0.2069 0.1078 0.2857 0.005
19 8i0v:4 161 76 0.2989 0.1615 0.3421 9.76e-07
20 8i0v:4 161 49 0.2069 0.1118 0.3673 0.002
21 7ohx:o 112 63 0.2414 0.1875 0.3333 1.13e-06
22 5x3z:A 96 64 0.2414 0.2188 0.3281 1.18e-06
23 7dvq:Y 140 78 0.2874 0.1786 0.3205 1.74e-06 8i0p:Y, 8i0r:Y
24 6c0f:o 133 63 0.2414 0.1579 0.3333 1.95e-06 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
25 1wtb:A 79 60 0.2184 0.2405 0.3167 2.54e-06 1x0f:A
26 2mgz:B 105 58 0.2069 0.1714 0.3103 2.75e-06 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
27 4lmz:A 176 58 0.1839 0.0909 0.2759 3.30e-06 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
28 4lmz:A 176 73 0.2759 0.1364 0.3288 1.65e-05 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
29 6r5k:H 394 78 0.2874 0.0635 0.3205 3.41e-06 6r5k:D, 6r5k:F
30 6r5k:H 394 87 0.2874 0.0635 0.2874 9.33e-06 6r5k:D, 6r5k:F
31 6r5k:H 394 80 0.2184 0.0482 0.2375 6.52e-04 6r5k:D, 6r5k:F
32 6r5k:H 394 86 0.2644 0.0584 0.2674 0.003 6r5k:D, 6r5k:F
33 8y6o:W 167 48 0.1839 0.0958 0.3333 4.76e-06
34 7dco:4 174 75 0.2644 0.1322 0.3067 9.02e-06 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
35 7s7b:C 79 72 0.2529 0.2785 0.3056 1.11e-05 7s7b:G, 7s7c:C
36 1fnx:H 174 73 0.2529 0.1264 0.3014 2.47e-05 1fxl:A, 1g2e:A
37 1fnx:H 174 60 0.2299 0.1149 0.3333 1.14e-04 1fxl:A, 1g2e:A
38 8i0s:Y 320 67 0.2299 0.0625 0.2985 3.34e-05 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
39 8ch6:V 285 67 0.2299 0.0702 0.2985 3.35e-05 7qtt:V
40 5kw6:A 201 78 0.2529 0.1095 0.2821 4.80e-05 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
41 4f02:A 175 58 0.1954 0.0971 0.2931 7.07e-05 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
42 7pcv:A 116 61 0.1954 0.1466 0.2787 9.21e-05 2lk0:A, 2lk1:A, 7pcv:B, 7pdv:E, 7pdv:A, 7pdv:C, 7pdv:G
43 2mki:A 203 68 0.2644 0.1133 0.3382 1.01e-04
44 1rk8:A 87 47 0.2184 0.2184 0.4043 1.04e-04
45 8h6e:4R 106 52 0.2299 0.1887 0.3846 1.08e-04 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
46 4ed5:B 169 50 0.2069 0.1065 0.3600 1.11e-04 4ed5:A
47 4ed5:B 169 67 0.1839 0.0947 0.2388 0.002 4ed5:A
48 6qx9:1K 201 55 0.1724 0.0746 0.2727 1.44e-04 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
49 2xb2:D 89 67 0.2414 0.2360 0.3134 1.49e-04 2xb2:Z
50 2mgz:A 94 82 0.2644 0.2447 0.2805 1.58e-04
51 5m8i:A 114 73 0.2414 0.1842 0.2877 1.89e-04
52 6xlv:A 203 68 0.1954 0.0837 0.2500 2.31e-04 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
53 8xxm:3G 84 58 0.1954 0.2024 0.2931 3.46e-04 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
54 2rqc:A 115 73 0.2414 0.1826 0.2877 3.87e-04
55 4qqb:A 169 66 0.2414 0.1243 0.3182 4.01e-04 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
56 7qde:B 169 79 0.2644 0.1361 0.2911 5.42e-04 7qdd:B
57 7zap:A 97 57 0.2299 0.2062 0.3509 7.87e-04
58 4pkd:B 240 55 0.1724 0.0625 0.2727 8.54e-04 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
59 8esq:o 137 73 0.2644 0.1679 0.3151 0.001 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
60 5x8p:v 190 78 0.2529 0.1158 0.2821 0.001 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
61 5x8p:v 190 72 0.1954 0.0895 0.2361 0.013 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
62 4bs2:A 174 56 0.2299 0.1149 0.3571 0.002 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
63 4bs2:A 174 60 0.2414 0.1207 0.3500 0.003 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
64 5ifm:C 256 71 0.2414 0.0820 0.2958 0.002 5ifm:A
65 4uer:b 572 56 0.2414 0.0367 0.3750 0.004
66 2x1f:A 94 68 0.2414 0.2234 0.3088 0.004 2km8:B, 2x1a:A
67 6gsn:p 658 56 0.2414 0.0319 0.3750 0.005 8cah:p, 8cas:p, 6fyx:p, 6fyy:p, 6gsm:p, 6zce:p, 6zu9:p
68 6gd2:A 84 63 0.2184 0.2262 0.3016 0.007 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
69 1fje:B 175 73 0.1839 0.0914 0.2192 0.021 1rkj:A
70 8ch6:U 295 40 0.1379 0.0407 0.3000 0.021 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
71 6hpj:B 84 71 0.1724 0.1786 0.2113 0.059
72 3d2w:A 72 72 0.2299 0.2778 0.2778 0.063
73 7uj1:B 270 46 0.1839 0.0593 0.3478 0.097 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
74 7q4l:A 227 63 0.1379 0.0529 0.1905 0.13
75 5o1y:A 163 64 0.1609 0.0859 0.2188 0.23 5o1z:A, 5o20:A
76 7csz:A 175 48 0.1724 0.0857 0.3125 0.26
77 2mkc:A 118 78 0.2184 0.1610 0.2436 0.53 2my3:A
78 7dco:X 128 47 0.1379 0.0938 0.2553 0.54 5gm6:V, 5zwm:X
79 2n7c:A 89 71 0.1609 0.1573 0.1972 0.91
80 3smz:A 280 26 0.1264 0.0393 0.4231 1.1
81 8ro0:O 342 59 0.1494 0.0380 0.2203 1.2 8ro1:O
82 7abi:P 237 31 0.0920 0.0338 0.2581 1.3 7aav:P, 7abg:P
83 5xy3:X 101 38 0.1724 0.1485 0.3947 1.8
84 5t2a:V 120 58 0.2069 0.1500 0.3103 2.9 8a3w:V, 8a98:V, 6az3:V, 3jcs:V, 8ovj:V, 8rxh:LV, 8rxx:LV
85 2i2y:A 150 56 0.1724 0.1000 0.2679 3.0 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
86 6mgj:A 747 48 0.2069 0.0241 0.3750 3.9 6mgj:B, 6mgj:C, 6mgj:D, 6mgj:E, 6mgj:F, 6mgj:G, 6mgj:H, 6mgk:A, 6mgk:B, 6mgk:C, 6mgk:D, 6mgl:A
87 8a57:H 206 44 0.2184 0.0922 0.4318 5.7 8a5i:H, 8a63:H, 7nhn:H, 8uu4:D, 8uu5:D, 8uu6:D, 8uu7:D, 8uu8:D, 8uu9:D, 8uua:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218