BioLiP

>protein
LPDTVDWREKGCVTEVKYQGSCGACWAFSAVGALEGQLKLKTGKLISLSAQNLVDCSNEEKYGNKGCGGGYMTEAFQYII
DNGGIEADASYPYKAMDEKCHYNSKNRAATCSRYIQLPFGDEDALKEAVATKGPVSVGIDASHSSFFFYKSGVYDDPSCT
GNVNHGVLVVGYGTLDGKDYWLVKNSWGLNFGDQGYIRMARNNKNHCGIASYCSYPEI

The query sequence (length=218) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4bpv:A	219	218	1.0000	0.9954	1.0000	8.93e-165	4bpv:B, 4bpv:C, 4bpv:D, 4bpv:E, 4bqv:A, 4bqv:B, 4bqv:C, 4bqv:D, 4bqv:E, 4bqv:F, 4bqv:G, 4bqv:H, 4bs5:A, 4bs6:A, 4bs6:B, 4bsq:A, 4mzo:A, 4mzo:B, 4mzo:C, 4mzo:D, 4mzo:E, 4mzo:F, 4mzo:G, 4mzo:H, 4mzs:A, 4mzs:B
2	5qcd:A	223	218	0.8119	0.7937	0.8119	2.70e-132	2f1g:A, 2f1g:B, 2fq9:A, 2fq9:B, 2fra:A, 2fra:B, 2frq:A, 2frq:B, 2ft2:A, 2ft2:B, 2fud:A, 2fud:B, 2fye:A, 2g6d:A, 2g7y:A, 2g7y:B, 9gj2:A, 9gj2:B, 2h7j:A, 2h7j:B, 2hh5:B, 2hh5:A, 2hhn:B, 2hxz:A, 2hxz:B, 2hxz:C, 3iej:A, 3iej:B, 1ms6:A, 3n3g:A, 3n3g:B, 3n4c:A, 3n4c:B, 1npz:A, 1npz:B, 1nqc:A, 2op3:A, 2op3:B, 3ovx:A, 3ovx:B, 4p6e:A, 4p6e:B, 4p6g:A, 4p6g:B, 4p6g:C, 4p6g:D, 8pi3:A, 5qbu:A, 5qbu:B, 5qbv:A, 5qbv:B, 5qbw:A, 5qbx:A, 5qbx:B, 5qby:A, 5qby:B, 5qbz:A, 5qc0:A, 5qc0:B, 5qc1:A, 5qc1:B, 5qc2:A, 5qc2:B, 5qc3:A, 5qc3:B, 5qc4:A, 5qc4:B, 5qc5:A, 5qc5:B, 5qc6:A, 5qc6:B, 5qc7:A, 5qc7:B, 5qc8:A, 5qc8:B, 5qc9:A, 5qc9:B, 5qca:A, 5qca:B, 5qcb:A, 5qcb:B, 5qcc:A, 5qcc:B, 5qce:A, 5qce:B, 5qcf:A, 5qcg:A, 5qcg:B, 5qch:A, 5qch:B, 5qch:D, 5qch:C, 5qci:A, 5qcj:A, 5qcj:B, 5qcj:C, 2r9m:A, 2r9m:B, 2r9n:A, 2r9n:B, 2r9o:A, 2r9o:B, 8rnd:A, 6yyn:AAA, 6yyn:BBB, 6yyo:AAA, 6yyo:BBB, 6yyp:AAA, 6yyq:AAA, 6yyq:BBB, 6yyq:CCC, 6yyr:AAA, 6yyr:BBB
3	8iui:A	218	220	0.5917	0.5917	0.5864	3.16e-90	8iui:B
4	5j94:A	223	218	0.5917	0.5785	0.5917	2.97e-88	6ash:A, 1atk:A, 2ato:A, 1au0:A, 1au2:A, 1au3:A, 1au4:A, 2aux:A, 2auz:A, 1ayu:A, 1ayv:A, 1ayw:A, 2bdl:A, 1bgo:A, 8c3d:A, 3c9e:A, 4dmx:A, 4dmy:A, 4dmy:B, 2f7d:A, 2ftd:A, 2ftd:B, 3h7d:A, 3h7d:E, 6hgy:A, 5ja7:A, 5ja7:B, 3kw9:A, 3kwb:X, 3kwb:Y, 3kwz:A, 3kx1:A, 1mem:A, 1nl6:A, 1nl6:B, 1nlj:A, 1nlj:B, 7nxl:AAA, 7nxm:A, 3o0u:A, 3o1g:A, 3ovz:A, 6pxf:A, 1q6k:A, 6qbs:A, 6qbs:B, 7qbl:A, 7qbm:A, 7qbn:A, 7qbo:A, 6ql8:A, 6qlm:A, 6qlm:B, 6qlw:A, 6qlw:B, 6qlw:C, 6qlw:D, 6qlx:A, 6qm0:A, 6qm0:B, 2r6n:A, 1snk:A, 5tdi:A, 1tu6:A, 1tu6:B, 1u9v:A, 1u9w:A, 1u9x:A, 1vsn:A, 4x6h:A, 4x6i:A, 4x6j:A, 1yk7:A, 1yk8:A, 1yt7:A, 4yv8:A
5	6jd0:A	314	221	0.5780	0.4013	0.5701	1.25e-86	8a4u:A, 8a4u:B, 8a4u:C, 8a4u:D, 8a4v:A, 8a4v:B, 8a4v:C, 8a4v:D, 8a4w:A, 8a4w:B, 8a4w:C, 8a4w:D, 8a4x:A, 8a4x:B, 8a4x:C, 8a4x:D, 8a5b:A, 8a5b:B, 8a5b:C, 8a5b:D, 8ahv:A, 8ahv:B, 8ahv:C, 8ahv:D, 4axl:A, 4axm:A, 4axm:B, 4axm:F, 4axm:I, 4axm:L, 4axm:O, 8b4f:A, 8b4f:B, 8b4f:C, 8b4f:D, 3bc3:A, 3bc3:B, 8c77:A, 8c77:B, 8c77:C, 8c77:D, 6ezp:A, 6ezx:A, 6ezx:B, 5f02:A, 6f06:A, 6f06:B, 8gx2:A, 8gx2:B, 3h89:A, 3h89:B, 3h89:C, 3h89:D, 3h89:E, 3h89:F, 3h8b:A, 3h8b:B, 3h8b:C, 3h8b:F, 3h8b:D, 3h8b:E, 3h8c:A, 3h8c:B, 8het:A, 8hfv:A, 8hfv:B, 8hfv:C, 8hfv:D, 3hha:A, 3hha:B, 3hha:C, 3hha:D, 3hwn:A, 3hwn:B, 3hwn:C, 3hwn:D, 3k24:B, 3k24:A, 5mae:A, 5maj:A, 1mhw:A, 1mhw:B, 1mhw:C, 1mhw:D, 5mqy:A, 3of8:A, 3of9:A, 8ofa:A, 8ofa:B, 8ofa:C, 8ofa:D, 8oza:A, 8oza:B, 8oza:C, 8oza:D, 8prx:A, 8prx:B, 8prx:C, 8prx:D, 7qkb:A, 7qkb:B, 7qkb:C, 7qkb:D, 7qkc:A, 7qkc:B, 7qkc:C, 7qkc:D, 7qkd:A, 7qkd:B, 7qkd:C, 7qkd:D, 8qkb:A, 8qkb:B, 8qkb:C, 8qkb:D, 8uac:A, 8uac:B, 7w33:A, 7w34:A, 2xu1:A, 2xu1:B, 2xu1:C, 2xu1:D, 2xu3:A, 2xu4:A, 2xu5:A, 2yj2:A, 2yj8:A, 2yj9:A, 2yjb:A, 2yjc:A, 7z58:A, 7z58:B, 7z58:C, 7z58:D, 7zs7:A, 7zs7:B, 7zs7:C, 7zs7:D, 7zvf:A, 7zvf:B, 7zvf:C, 7zvf:D, 7zxa:A, 7zxa:B, 7zxa:C, 7zxa:D
6	7q8g:AA	222	223	0.5688	0.5586	0.5561	1.22e-85	1fh0:A, 1fh0:B, 7q8d:AA, 7q8d:BA, 7q8f:BA, 7q8f:AA, 7q8g:BA, 7q8h:AA, 7q8h:BA, 7q8i:AA, 7q8i:BA, 7q8j:AA, 7q8j:BA, 7q8k:AA, 7q8k:BA, 7q8l:AA, 7q8l:BA, 7q8m:AA, 7q8m:BA, 7q8n:AA, 7q8n:BA, 7q8o:BA, 7q8o:AA, 7q8p:AA, 7q8p:BA, 7q8q:AA, 7q8q:BA, 7q9c:AA, 7q9c:BA, 7q9h:AA, 7q9h:BA, 7qff:AA, 7qff:BA, 7qfh:AA, 7qfh:BA, 7qgw:A, 7qgw:B, 7qhj:AA, 7qhj:BA, 7qhk:AA, 7qhk:BA, 7qns:AA, 7qns:BA, 7qo2:AA, 7qo2:BA
7	3p5u:A	220	219	0.4817	0.4773	0.4795	9.69e-68	3p5v:A, 3p5x:A
8	1iwd:A	215	219	0.4908	0.4977	0.4886	4.38e-67
9	1s4v:B	226	221	0.5092	0.4912	0.5023	8.70e-67	1s4v:A
10	1aec:A	218	219	0.4771	0.4771	0.4749	1.51e-66
11	2pre:A	208	217	0.4954	0.5192	0.4977	1.44e-64	2pre:B
12	3bcn:A	209	218	0.5000	0.5215	0.5000	3.03e-62	3bcn:B
13	2fo5:A	224	224	0.4771	0.4643	0.4643	3.70e-61	2fo5:B, 2fo5:C, 2fo5:D
14	2b1n:A	227	228	0.4404	0.4229	0.4211	4.47e-57
15	6ycf:A	215	222	0.4358	0.4419	0.4279	2.85e-56	6ycf:B, 6ycg:B
16	5a24:A	222	224	0.4908	0.4820	0.4777	7.79e-56
17	2bdz:A	212	219	0.4404	0.4528	0.4384	1.03e-55	2bdz:D, 2bdz:B, 2bdz:C
18	6czs:A	312	219	0.4312	0.3013	0.4292	2.20e-55	1nb3:A, 1nb3:B, 1nb3:C, 1nb3:D, 1nb5:A, 1nb5:B, 1nb5:C, 1nb5:D, 8pch:A
19	6mis:A	215	222	0.4037	0.4093	0.3964	2.27e-53	6mis:B, 6ycc:A, 6ycc:B, 6ycd:A, 6ycd:B
20	8jcq:A	214	221	0.4312	0.4393	0.4253	1.16e-50	8jcr:A
21	6ex8:A	217	212	0.4174	0.4194	0.4292	3.98e-49	6ex8:B, 6exo:A, 6exo:B, 6exq:A, 6exq:B, 2p7u:A, 2p86:A
22	6p4e:B	217	218	0.4266	0.4286	0.4266	1.49e-48	6p4e:A
23	1meg:A	216	220	0.4358	0.4398	0.4318	3.11e-47
24	1aim:A	215	212	0.3991	0.4047	0.4104	5.80e-46	2aim:A, 1ewl:A, 1ewm:A, 1ewo:A, 1ewp:A, 1f29:A, 1f29:B, 1f29:C, 1f2a:A, 1f2b:A, 1f2c:A, 3hd3:A, 3hd3:B, 3i06:A, 3iut:A, 7juj:A, 7juj:B, 7juj:C, 7juj:D, 7juj:E, 7juj:F, 3kku:A, 4klb:A, 4klb:B, 4klb:C, 3lxs:A, 3lxs:C, 1me3:A, 1me4:A, 2oz2:A, 2oz2:C, 4pi3:A, 4pi3:B, 4qh6:A, 7s18:A, 7s19:A, 1u9q:X, 6ux6:A, 4w5b:A, 4w5b:B, 4w5b:C, 4w5c:A, 4w5c:B, 4w5c:C, 4w5c:D, 4xui:A, 4xui:B, 4xui:C
25	1bp4:A	212	220	0.4083	0.4198	0.4045	1.32e-44	1bqi:A, 2cio:A, 1cvz:A, 6h8t:A, 6h8t:J, 1khp:A, 1khq:A, 3lfy:C, 1pad:A, 2pad:A, 4pad:A, 5pad:A, 6pad:A, 1pe6:A, 1pip:A, 1pop:A, 1ppp:A, 6tcx:AAA
26	1gec:E	216	220	0.4220	0.4259	0.4182	1.76e-43
27	3bpm:A	243	225	0.4083	0.3663	0.3956	2.26e-43	3bpm:B, 3bwk:A, 3bwk:B, 3bwk:C, 3bwk:D
28	3ioq:A	213	220	0.3945	0.4038	0.3909	9.61e-42
29	7ei0:A	241	227	0.3807	0.3444	0.3656	5.75e-41	3bpf:A, 3bpf:B, 3bpf:C, 3bpf:D, 8gt7:C, 6jw9:A
30	1m6d:A	214	214	0.3578	0.3645	0.3645	4.78e-36	1m6d:B
31	5vpl:A	223	200	0.3165	0.3094	0.3450	9.10e-30
32	3pdf:A	351	231	0.3624	0.2251	0.3420	2.36e-28	4cdc:B, 4cdc:E, 4cdc:F, 4cdc:H, 4cdc:K, 4cdd:A, 4cdd:B, 4cdd:D, 4cdd:E, 4cde:B, 4cde:C, 4cde:E, 4cde:F, 4cdf:A, 4cdf:B, 4cdf:C, 4cdf:D, 4cdf:E, 4cdf:F, 2djf:B, 2djf:C, 6ic5:A, 6ic5:B, 6ic5:C, 6ic6:A, 6ic6:B, 6ic7:A, 6ic7:B, 6ic7:C, 4oel:A, 4oem:A, 6rn6:E, 6rn6:F, 6rn7:A, 6rn7:B, 6rn7:C, 6rn9:A, 6rn9:B, 6rn9:C, 6rne:B, 6rne:C, 6rni:A, 6rni:B
33	2as8:A	222	205	0.3119	0.3063	0.3317	3.84e-28	2as8:B, 3f5v:A, 3f5v:B, 5vcn:A, 5vcn:B, 5vco:E, 5vco:F, 5vpg:A, 5vph:A
34	3ai8:B	256	248	0.3349	0.2852	0.2944	3.49e-25	3ai8:A, 6ay2:A, 6ay2:B, 8b4t:A, 8b5f:A, 1csb:A, 1csb:B, 1csb:D, 1csb:E, 1gmy:A, 1gmy:B, 1gmy:C, 8he9:A, 8hei:A, 8hen:A, 2ipp:A, 1sp4:A
35	1cte:A	253	248	0.3394	0.2925	0.2984	1.80e-23	1cte:B, 1the:A, 1the:B
36	8cc2:AAA	254	253	0.2982	0.2559	0.2569	9.53e-23	8ccu:AAA, 8cd9:AAA, 5ogq:A, 5ogq:B, 5ogq:C, 5ogr:A, 5ogr:B, 5ogr:C, 3qsd:A, 3s3q:A, 3s3r:A, 3s3r:C, 3s3r:B, 6yi7:A
37	2dc6:A	251	246	0.3073	0.2669	0.2724	5.99e-20	2dc7:A, 2dc8:A, 2dc9:A, 2dca:A, 2dcb:A, 2dcc:A, 2dcd:A, 1ito:A, 1qdq:A, 1sp4:B
38	3hhi:B	260	239	0.3073	0.2577	0.2803	5.71e-19	3hhi:A
39	2wbf:X	265	233	0.2844	0.2340	0.2661	1.91e-11	3ch3:X, 6x42:X
40	4ci7:A	456	214	0.2523	0.1206	0.2570	1.10e-08	4ci7:B, 4d59:A, 4d59:B, 4d5a:A, 4d5a:B
41	3ois:A	268	225	0.2569	0.2090	0.2489	0.001	3ois:B, 3ois:C, 3ois:D
42	3pw3:D	353	32	0.0642	0.0397	0.4375	0.84	6w4n:A, 6w4n:B, 6w4n:C, 6w4n:D, 5wdk:B, 5wdk:C, 5wdk:E
43	3pw3:D	353	38	0.0688	0.0425	0.3947	2.6	6w4n:A, 6w4n:B, 6w4n:C, 6w4n:D, 5wdk:B, 5wdk:C, 5wdk:E
44	3pw3:A	374	32	0.0642	0.0374	0.4375	0.88	3pw3:B, 3pw3:C, 3pw3:E, 3pw3:F, 6w4n:E, 6w4n:F, 5wdk:A, 5wdk:D, 5wdk:F, 5wdl:A, 5wdl:B, 5wdl:C, 5wdl:D, 5wdl:E, 5wdl:F
45	3pw3:A	374	38	0.0688	0.0401	0.3947	2.6	3pw3:B, 3pw3:C, 3pw3:E, 3pw3:F, 6w4n:E, 6w4n:F, 5wdk:A, 5wdk:D, 5wdk:F, 5wdl:A, 5wdl:B, 5wdl:C, 5wdl:D, 5wdl:E, 5wdl:F
46	8jhz:A	2615	24	0.0459	0.0038	0.4167	3.4
47	8h8i:A	431	21	0.0459	0.0232	0.4762	8.0	8hbt:A
48	2z51:A	154	42	0.0596	0.0844	0.3095	8.3

[Back]