Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LPDLKIEKLEEGVFVHTSFEEVNGWGVVTKHGLVVLVNTDAYLIDTPFTATDTEKLVNWFVERGYEIKGTISSHFHSDST
GGIEWLNSQSIPTYASELTNELLKKSGKVQAKYSFSEVSYWLVKNKIEVFYPGPGHTQDNLVVWLPESKILFGGCFIKPH
GLGNLGDANLEAWPKSAKILMSKYGKAKLVVSSHSEKGDASLMKRTWEQALKGLKE

The query sequence (length=216) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6r79:A 220 216 1.0000 0.9818 1.0000 1.52e-159 6r73:A, 6r73:B, 6r78:A, 6r78:B, 6r79:D, 6r79:B, 6r79:C, 6rzr:A, 6rzr:B, 6rzs:A, 6rzs:B, 6s0h:A, 6s0h:B, 4ubq:A, 6yi4:AAA, 6yi4:BBB, 6yi4:CCC
2 6l3s:A 218 216 0.8611 0.8532 0.8611 2.99e-140 6l3s:B
3 6jka:C 228 216 0.8657 0.8202 0.8657 2.94e-136 4c1f:A, 4c1f:B, 4c1g:A, 4c1g:B, 1dd6:A, 1dd6:B, 1ddk:A, 2doo:A, 2doo:B, 7dtm:A, 7dtm:B, 7dtm:C, 7dtm:D, 7dtn:A, 7dtn:B, 7dtn:C, 7dtn:D, 5ev6:A, 5ev6:B, 5ev6:C, 5ev6:D, 5ev8:A, 5ev8:C, 5ev8:B, 5ev8:D, 5ewa:A, 5ewa:B, 5ewa:C, 5ewa:D, 4f6h:A, 4f6z:A, 5hh4:A, 5hh4:B, 5hh4:C, 5hh4:D, 8hyb:A, 8hyb:B, 8hyb:C, 8hyb:D, 8jao:A, 8jao:B, 6jed:A, 1jje:A, 1jje:B, 1jjt:A, 1jjt:B, 6jka:A, 6jka:B, 6jka:D, 6lbl:A, 4uam:A, 4uam:B, 4uam:C, 4uam:D, 1vgn:A, 1vgn:B, 1wuo:A, 1wuo:B, 1wuo:C, 1wuo:D, 1wup:A, 1wup:B, 1wup:C, 1wup:D, 3wxc:A, 3wxc:B, 7wzu:A, 7wzu:B, 7wzu:C, 7wzu:D, 7xhw:A, 7xhw:B, 7xhw:C, 7xhw:D, 7xhx:A, 7xhx:B, 7xhx:C, 7xhx:D, 8y0s:A, 8y0s:B, 8y0s:C, 8y0s:D, 5y5b:A, 7yh9:A, 7yh9:B, 7yh9:C, 7yh9:F, 7yh9:D, 7yh9:E, 7yha:A, 7yha:B, 7yha:C, 7yha:D, 8z5l:A, 8z5l:B, 8z5l:C, 8z5l:D, 6zyr:A, 6zyr:B, 6zyr:C, 6zyr:D, 6zys:A, 6zys:B, 6zys:C, 6zys:D
4 5b3r:B 219 216 0.8519 0.8402 0.8519 2.33e-135 5b3r:A
5 5mmd:E 221 209 0.5000 0.4887 0.5167 3.04e-76 5mmd:F
6 4wd6:A 219 209 0.4815 0.4749 0.4976 7.95e-74 4wd6:B, 4zej:A, 4zej:B
7 2ynt:A 221 210 0.4491 0.4389 0.4619 7.06e-67 5acp:A, 5acp:B, 5acq:A, 5acq:B, 5acr:A, 5acr:B, 5acs:A, 5acs:B, 5act:A, 5act:B, 2ynt:B, 2ynt:C, 2ynv:A, 2ynv:B, 2ynw:A, 2ynw:B
8 6jv4:A 221 207 0.4352 0.4253 0.4541 7.63e-62 6jv4:B, 6jv4:C, 6jv4:D, 6lf4:A, 6lf4:B, 6lf4:C, 6lf4:D, 6lfd:A, 6lfd:B, 6lfd:C, 6lfd:D
9 1a8t:A 230 209 0.3380 0.3174 0.3493 1.27e-44 1a7t:A, 1a7t:B, 1a8t:B, 2bmi:A, 2bmi:B, 1hlk:A, 1hlk:B, 1kr3:A, 1kr3:B, 1znb:A, 1znb:B, 2znb:A, 2znb:B, 3znb:A, 3znb:B, 4znb:A, 4znb:B
10 6xfr:B 216 201 0.3611 0.3611 0.3881 6.88e-43 6xfr:A
11 6t5k:C 224 206 0.3287 0.3170 0.3447 8.56e-42
12 6jkb:A 244 221 0.3519 0.3115 0.3439 3.70e-37 5a5z:A, 5a5z:C, 8a76:A, 8a76:B, 7aez:A, 8b1w:A, 8b1w:B, 8b1z:A, 8b1z:B, 8b20:A, 8b20:B, 6c6i:A, 6c6i:B, 6c89:A, 6c89:B, 6c89:C, 6c89:D, 6cac:A, 6cac:B, 6cac:C, 6cac:D, 6d1a:A, 6d1b:A, 6d1c:A, 6d1d:A, 6d1e:A, 6d1f:A, 6d1g:A, 6d1h:A, 6d1i:A, 6d1j:A, 6d1k:A, 6efj:A, 4exs:B, 4exs:A, 4exy:A, 4exy:B, 4ey2:A, 4ey2:B, 4eyb:A, 4eyb:B, 4eyf:A, 4eyf:B, 4eyl:A, 4eyl:B, 8gpc:A, 8gpc:B, 8gpd:A, 8gpd:B, 8gpe:A, 8gpe:B, 4h0d:A, 4h0d:B, 4hky:A, 4hky:B, 4hl1:A, 4hl1:B, 4hl2:A, 4hl2:B, 8hy6:A, 8hy6:B, 8hyc:A, 8hyc:B, 8i8f:A, 8i8f:B, 6ibs:A, 6ibs:B, 6ibv:A, 6ibv:B, 6jkb:B, 5jqj:A, 5k4m:A, 6kxi:A, 6kxi:B, 6kzl:A, 6kzl:B, 6lip:A, 6liz:A, 6lj0:A, 6lj1:A, 6lj2:A, 6lj4:A, 6lj5:A, 6lj6:A, 6lj7:A, 6lj8:A, 6mdu:A, 6mgx:A, 6mgx:B, 6mgy:A, 6mgy:B, 6mgy:C, 6mgy:D, 6mgz:A, 6mgz:B, 6mh0:A, 6mh0:B, 5n0h:A, 5n0h:B, 5n0i:A, 5n0i:B, 5nbk:A, 5nbk:C, 6ny7:A, 5o2e:A, 5o2e:B, 5o2f:A, 5o2f:B, 6o3r:A, 6ogo:A, 6ogo:B, 6ogo:C, 6ol8:A, 6ol8:B, 6ovz:A, 6ovz:B, 6q2y:A, 6q2y:B, 6q30:A, 6q30:B, 8r5t:A, 8r5t:B, 4ram:A, 4ram:B, 4raw:A, 4raw:B, 4rbs:A, 4rbs:B, 4rl0:A, 4rl0:B, 4rl2:A, 4rl2:B, 4rm5:A, 4rm5:B, 4rm5:C, 4rm5:D, 6rmf:A, 6rmf:B, 3s0z:A, 3s0z:B, 3sfp:A, 3sfp:B, 3sfp:C, 3sfp:D, 8sk2:A, 8sko:A, 8sko:B, 8skp:A, 3spu:A, 3spu:B, 3spu:C, 3spu:D, 3spu:E, 6tgd:A, 6tgd:B, 6tt8:A, 6tta:A, 6ttc:A, 6twt:A, 6twt:B, 4tyf:A, 4tz9:A, 4tzb:A, 4tze:A, 4tze:B, 4tzf:A, 4u4l:A, 4u4l:B, 4u4l:C, 4u4l:D, 7uox:A, 7uox:B, 7uoy:A, 7uoy:B, 7up1:A, 7up1:B, 7up3:A, 7up3:B, 6v1m:A, 7vqj:A, 7vqj:B, 5wig:A, 5wig:B, 5wih:A, 6xbe:A, 6xbe:B, 6xbe:C, 6xbe:D, 6xbf:A, 6xbf:B, 6xbf:C, 6xbf:D, 6xci:A, 6xci:B, 5xp6:A, 5xp9:A, 5ypi:A, 5ypi:E, 5ypi:B, 5ypi:C, 5ypi:D, 5ypi:F, 5ypi:G, 5ypi:H, 5ypk:A, 5ypk:H, 5ypk:B, 5ypk:C, 5ypk:D, 5ypk:E, 5ypk:F, 5ypk:G, 5ypl:A, 5ypl:B, 5ypm:A, 5ypm:B, 5ypm:C, 5ypm:D, 5ypm:E, 5ypm:F, 5ypm:G, 5ypm:H, 5ypn:A, 5ypn:B, 5zge:A, 5zge:B, 5zgf:A, 5zgi:A, 5zgp:A, 5zgp:B, 5zgq:A, 5zgq:B, 5zgr:A, 5zgr:B, 5zgt:A, 5zgt:B, 5zgu:A, 5zgu:B, 5zgv:A, 5zgv:B, 5zgw:A, 5zgx:A, 5zgy:A, 5zgz:A, 5zh1:A, 5zh1:B, 5zio:A, 5zj1:A, 5zj2:A, 5zj7:A, 5zj8:A, 5zjc:A, 3zr9:A, 5zr8:A, 5zr8:E, 6zyp:A, 6zyp:B, 6zyq:A, 6zyq:B
13 6v3q:A 226 211 0.3194 0.3053 0.3270 5.23e-36 6v3q:B
14 6v73:A 228 219 0.3194 0.3026 0.3151 1.54e-35 6v3u:A, 6v3u:B, 6v72:A
15 4d1t:A 229 211 0.3241 0.3057 0.3318 3.28e-35 4d1u:A, 4d1v:A, 4d1w:A, 2y87:A, 2y8a:A, 2y8b:A
16 1m2x:A 219 211 0.3009 0.2968 0.3081 3.86e-35 1m2x:B, 1m2x:C, 1m2x:D
17 6v5m:A 221 205 0.3148 0.3077 0.3317 2.19e-34 6v54:A, 6v61:A, 6v71:A
18 9c3d:A 224 209 0.3009 0.2902 0.3110 3.47e-33
19 2m5c:A 227 202 0.3380 0.3216 0.3614 4.12e-33 1bc2:A, 1bc2:B, 2bc2:A, 2bc2:B, 3bc2:A, 2bfk:A, 2bfk:B, 2bfl:A, 2bfl:B, 2bfz:A, 2bfz:B, 2bg2:A, 2bg2:B, 2bg6:A, 2bg6:B, 2bg7:A, 2bg7:B, 2bg8:A, 2bg8:B, 2bga:A, 2bga:B, 1bmc:A, 1bvt:A, 4c09:A, 4c1c:A, 4c1h:A, 6dja:A, 1dxk:A, 6eum:A, 6ewe:A, 6f2n:A, 3fcz:A, 3fcz:B, 5fqa:A, 5fqb:A, 3i11:A, 3i13:A, 3i14:A, 3i15:A, 5jmx:A, 3knr:A, 3knr:B, 3knr:C, 3knr:D, 3kns:A, 3kns:B, 3kns:C, 3kns:D, 2m5d:A, 4nq4:A, 4nq5:A, 4nq6:A, 2nxa:A, 2nyp:A, 2nze:A, 2nze:B, 2nzf:A, 4tyt:A, 2uyx:A, 5w8w:A
20 5lsc:A 235 211 0.3056 0.2809 0.3128 6.37e-32 8a4m:A, 7a5z:A, 7a60:A, 7a60:B, 5a87:A, 5a87:B, 5acu:A, 5acv:A, 5acv:B, 5acw:A, 5acw:B, 5acx:A, 5acx:B, 7afx:A, 7afx:B, 7afy:A, 7ayj:A, 6bm9:A, 6bm9:B, 6bm9:C, 6bm9:D, 4bz3:A, 4bz3:B, 4c1d:A, 4c1d:B, 4c1e:A, 4c1e:B, 7chv:A, 7cjl:B, 7cjl:A, 6dd0:A, 6dd0:B, 6dd1:A, 6dd1:B, 7du1:A, 7du1:B, 7dub:A, 7dub:B, 7due:A, 7due:B, 7dux:A, 7duy:A, 7duz:A, 7duz:B, 7dv0:A, 7dv1:A, 7dv1:B, 7dyy:A, 7dyy:B, 7dyz:A, 7dz0:A, 7dz0:B, 7dz1:A, 7dz1:B, 6ew3:A, 6ew3:B, 5fqc:A, 5fqc:B, 4fr7:A, 4fsb:A, 4fsb:B, 6hf5:A, 8hx5:A, 8hx5:B, 8hxo:A, 8hxo:B, 8hxp:A, 8hxp:B, 8hxu:A, 8hxu:B, 8hxv:A, 8hxv:B, 8hxw:A, 8hxw:B, 8hy1:A, 8hy1:B, 8hy2:A, 8hyd:A, 8i52:A, 8i52:D, 6j8r:A, 6jn6:A, 6jn6:B, 5k48:A, 5k48:B, 1ko2:A, 1ko3:A, 6kw1:A, 6kw1:B, 6kxo:A, 6kxo:B, 6kzn:A, 6kzn:B, 5lca:A, 5lcf:A, 5lch:A, 5le1:A, 5lm6:B, 5lm6:A, 5lsc:B, 5mm9:A, 5mm9:B, 5mxq:A, 5mxr:A, 5n4s:A, 5n4s:B, 5n4t:A, 5n4t:B, 5n55:A, 5n55:B, 5n55:C, 5n58:A, 5n58:B, 5n5g:A, 5n5h:A, 5n5i:A, 5nai:A, 5nhz:A, 5nhz:B, 5ni0:A, 5ni0:E, 4nq2:A, 6o5t:A, 6o5t:B, 5o7n:A, 5o7n:B, 6op6:A, 6op7:A, 7ove:A, 7ovf:A, 7ovh:A, 8p8y:A, 8p8z:A, 8p92:A, 8p93:A, 8p95:A, 8p9p:A, 8p9q:A, 8p9s:A, 8p9t:A, 8pa3:A, 8pa4:A, 8pa5:A, 8pa7:A, 8pa8:A, 8paa:A, 8pac:A, 8pad:A, 8pah:A, 8pal:A, 8pam:A, 8pan:A, 8pao:A, 8pb0:A, 8pb2:A, 8pg2:A, 8pg3:A, 8pg4:A, 8pg5:A, 8pg6:A, 8pg7:A, 8pg8:A, 8pg9:A, 8pga:A, 8pgb:A, 8pgc:A, 8pge:A, 8pgf:A, 8pgg:A, 8pgh:A, 8pgi:A, 8pgj:A, 8pgk:A, 8pgl:A, 8pgm:A, 8pgn:A, 8pgo:A, 8pgp:A, 8pgq:A, 8pgr:A, 8pgs:A, 8pgt:A, 8pgu:A, 8pgv:A, 8pgw:A, 8pgx:A, 8pgy:A, 8pgz:A, 8ph0:A, 8ph1:A, 8ph2:A, 8ph3:A, 8pjm:AAAA, 7pp0:A, 4pvo:A, 4pvo:B, 4pvt:A, 4pvt:B, 8r5u:A, 8r5u:B, 6rpn:A, 6rpn:B, 6sp7:A, 6sp7:E, 6tgi:A, 6tgi:B, 6tm9:A, 6tma:A, 6tma:B, 6tmb:A, 6tmb:B, 6tmc:A, 4ua4:A, 4ua4:B, 7up2:A, 4uwo:B, 4uwp:B, 4uwr:B, 4uws:B, 7uya:A, 7uyb:A, 7uyc:A, 7uyd:A, 7uyd:B, 6v1p:A, 6v1p:B, 2whg:A, 2whg:B, 2wrs:A, 2wrs:B, 5y6d:A, 5y6d:B, 5y6d:C, 5y6d:D, 5y6e:A, 5y6e:B, 6y6j:A, 5yd7:A, 5yd7:B, 7yhb:A, 7yhb:B, 7yhc:A, 7yhc:B, 7yhc:C, 7yhc:D, 7yhc:E, 7yhc:F, 7yhc:G, 7yhc:H, 7yhd:A, 6yrp:A, 7yrp:A, 7yrp:B, 2yz3:A, 2yz3:B, 6zgm:A, 6zyn:A, 6zyn:B, 6zyo:A, 6zyo:B
21 6t5l:A 224 210 0.3333 0.3214 0.3429 8.80e-31 6t5l:B
22 5nde:B 247 242 0.3472 0.3036 0.3099 1.83e-29 4bp0:A, 4bp0:C, 4bp0:B, 4bp0:D, 2fhx:A, 2fhx:B, 5ls3:B, 5ls3:A, 5ndb:A, 5ndb:B, 5nde:A
23 3l6n:A 218 179 0.2824 0.2798 0.3408 9.58e-27
24 6cqs:A 242 207 0.2870 0.2562 0.2995 9.72e-22
25 3fai:A 227 167 0.2037 0.1938 0.2635 3.65e-14 3f9o:A, 2gkl:A, 3iof:A, 3iog:A, 2qds:A, 1x8g:A, 1x8h:A, 1x8i:A
26 8d2z:A 306 208 0.2500 0.1765 0.2596 6.37e-13 8d2z:B
27 7bj9:B 230 144 0.1759 0.1652 0.2639 6.81e-09 7bj9:A, 5ew0:A, 5ew0:B, 8hxn:A, 3q6v:A, 3q6v:B, 3sd9:A, 3sd9:B
28 6k6w:C 444 109 0.1250 0.0608 0.2477 5.63e-04 6k6w:A, 6k6w:B, 6k6w:D
29 3zq4:A 550 98 0.1296 0.0509 0.2857 0.025 3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
30 2q42:A 254 104 0.0926 0.0787 0.1923 0.034 2q42:B, 1xm8:A, 1xm8:B
31 8c8b:A 341 41 0.0787 0.0499 0.4146 0.039 5ahr:A, 4b87:A, 8c8d:A, 8c8s:A, 8cew:A, 8cf0:A, 8cg9:A, 5nzw:A, 5nzx:A, 5nzy:A, 5q1j:A, 5q1k:A, 5q1l:A, 5q1m:A, 5q1n:A, 5q1o:A, 5q1p:A, 5q1q:A, 5q1r:A, 5q1s:A, 5q1t:A, 5q1u:A, 5q1v:A, 5q1w:A, 5q1x:A, 5q1y:A, 5q1z:A, 5q20:A, 5q22:A, 5q23:A, 5q24:A, 5q25:A, 5q26:A, 5q27:A, 5q28:A, 5q29:A
32 6cgy:A 276 83 0.0972 0.0761 0.2530 0.11 6cgy:H, 6cgy:L, 6cgz:A, 6cgz:B, 6cgz:C, 6ch0:C, 6ch0:F, 6ch0:I
33 6n9q:P 277 83 0.0926 0.0722 0.2410 0.14 6n9i:A, 6n9i:B, 6n9i:C, 6n9q:D, 6n9r:A, 6n9r:P, 6n9r:X
34 4xww:A 545 51 0.0694 0.0275 0.2941 0.21 4xwt:A, 4xwt:B, 4xww:B
35 6k6s:A 443 140 0.1528 0.0745 0.2357 0.35 6k6s:B
36 3dha:A 254 96 0.1250 0.1063 0.2812 0.59 2a7m:A, 2br6:A, 2btn:A, 3dhb:A, 3dhc:A, 5eh9:A, 5eht:A, 4j5f:A, 4j5h:A, 7l5f:A
37 7e2v:A 500 103 0.1296 0.0560 0.2718 0.95 7e2v:B
38 4ad9:A 288 127 0.1481 0.1111 0.2520 1.1 4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
39 5a0t:A 454 45 0.0694 0.0330 0.3333 1.9 5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
40 6jqm:A 678 105 0.1343 0.0428 0.2762 3.7 6jqm:B, 6jqm:C, 6jqm:D, 6jqm:E, 6jqm:F, 6jqn:A, 6jqn:B, 6jqn:C, 6jqn:D, 6jqn:E, 6jqn:F, 6jqo:A, 6jqo:B, 6jqo:C, 6jqo:D, 6jqo:E, 6jqo:F
41 7a1f:L 335 55 0.0741 0.0478 0.2909 3.9 7a1f:A, 5aho:A
42 3h3e:A 256 108 0.1296 0.1094 0.2593 5.6
43 7s1x:B 871 39 0.0694 0.0172 0.3846 6.1 7mxo:A, 7mxo:B, 7n3n:A, 7n3n:B, 7s1x:A, 7s1y:A, 7s1y:B, 7sfl:A, 7sfl:B, 7smp:B, 7smp:A, 8ste:A, 8ste:B, 7zgo:A, 7zgo:B
44 4i81:E 290 34 0.0694 0.0517 0.4412 6.5 4i81:D
45 5a22:A 2002 71 0.0926 0.0100 0.2817 6.7
46 6xyw:Ax 99 35 0.0602 0.1313 0.3714 7.3
47 3qhq:A 222 40 0.0694 0.0676 0.3750 7.9 3qhq:B
48 5vt6:A 245 48 0.0509 0.0449 0.2292 8.7 5vt6:B, 5vt6:C, 5vt6:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218