Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LPDLKIEKLDEGVYVHTSFEEVNGWGVVPKHGLVVLVNAEAYLIDTPFTAKDTEKLVTWFVERGYKIKGSISSHFHSDST
GGIEWLNSRSIPTYASELTNELLKKDGKVQATNSFSGVNYWLVKNKIEVFYPGPGHTPDNVVVWLPERKILFGGCFIKPY
GLGNLGDANIEAWPKSAKLLKSKYGKAKLVVPSHSEVGDASLLKLTLEQAVKGLNE

The query sequence (length=216) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6jka:C 228 216 1.0000 0.9474 1.0000 8.76e-158 4c1f:A, 4c1f:B, 4c1g:A, 4c1g:B, 1dd6:A, 1dd6:B, 1ddk:A, 2doo:A, 2doo:B, 7dtm:A, 7dtm:B, 7dtm:C, 7dtm:D, 7dtn:A, 7dtn:B, 7dtn:C, 7dtn:D, 5ev6:A, 5ev6:B, 5ev6:C, 5ev6:D, 5ev8:A, 5ev8:C, 5ev8:B, 5ev8:D, 5ewa:A, 5ewa:B, 5ewa:C, 5ewa:D, 4f6h:A, 4f6z:A, 5hh4:A, 5hh4:B, 5hh4:C, 5hh4:D, 8hyb:A, 8hyb:B, 8hyb:C, 8hyb:D, 8jao:A, 8jao:B, 6jed:A, 1jje:A, 1jje:B, 1jjt:A, 1jjt:B, 6jka:A, 6jka:B, 6jka:D, 6lbl:A, 4uam:A, 4uam:B, 4uam:C, 4uam:D, 1vgn:A, 1vgn:B, 1wuo:A, 1wuo:B, 1wuo:C, 1wuo:D, 1wup:A, 1wup:B, 1wup:C, 1wup:D, 3wxc:A, 3wxc:B, 7wzu:A, 7wzu:B, 7wzu:C, 7wzu:D, 7xhw:A, 7xhw:B, 7xhw:C, 7xhw:D, 7xhx:A, 7xhx:B, 7xhx:C, 7xhx:D, 8y0s:A, 8y0s:B, 8y0s:C, 8y0s:D, 5y5b:A, 7yh9:A, 7yh9:B, 7yh9:C, 7yh9:F, 7yh9:D, 7yh9:E, 7yha:A, 7yha:B, 7yha:C, 7yha:D, 8z5l:A, 8z5l:B, 8z5l:C, 8z5l:D, 6zyr:A, 6zyr:B, 6zyr:C, 6zyr:D, 6zys:A, 6zys:B, 6zys:C, 6zys:D
2 6r79:A 220 216 0.8657 0.8500 0.8657 1.05e-136 6r73:A, 6r73:B, 6r78:A, 6r78:B, 6r79:D, 6r79:B, 6r79:C, 6rzr:A, 6rzr:B, 6rzs:A, 6rzs:B, 6s0h:A, 6s0h:B, 4ubq:A, 6yi4:AAA, 6yi4:BBB, 6yi4:CCC
3 6l3s:A 218 216 0.8287 0.8211 0.8287 5.18e-134 6l3s:B
4 5b3r:B 219 216 0.8426 0.8311 0.8426 1.64e-133 5b3r:A
5 5mmd:E 221 219 0.5231 0.5113 0.5160 2.71e-78 5mmd:F
6 4wd6:A 219 209 0.4815 0.4749 0.4976 1.71e-72 4wd6:B, 4zej:A, 4zej:B
7 2ynt:A 221 215 0.4722 0.4615 0.4744 9.42e-69 5acp:A, 5acp:B, 5acq:A, 5acq:B, 5acr:A, 5acr:B, 5acs:A, 5acs:B, 5act:A, 5act:B, 2ynt:B, 2ynt:C, 2ynv:A, 2ynv:B, 2ynw:A, 2ynw:B
8 6jv4:A 221 207 0.4583 0.4480 0.4783 6.79e-65 6jv4:B, 6jv4:C, 6jv4:D, 6lf4:A, 6lf4:B, 6lf4:C, 6lf4:D, 6lfd:A, 6lfd:B, 6lfd:C, 6lfd:D
9 1a8t:A 230 209 0.3565 0.3348 0.3684 2.34e-47 1a7t:A, 1a7t:B, 1a8t:B, 2bmi:A, 2bmi:B, 1hlk:A, 1hlk:B, 1kr3:A, 1kr3:B, 1znb:A, 1znb:B, 2znb:A, 2znb:B, 3znb:A, 3znb:B, 4znb:A, 4znb:B
10 6xfr:B 216 202 0.3704 0.3704 0.3960 2.51e-45 6xfr:A
11 6t5k:C 224 206 0.3565 0.3438 0.3738 9.29e-44
12 6v3q:A 226 211 0.3287 0.3142 0.3365 1.74e-39 6v3q:B
13 9c3d:A 224 214 0.3333 0.3214 0.3364 3.47e-39
14 2m5c:A 227 202 0.3565 0.3392 0.3812 1.01e-37 1bc2:A, 1bc2:B, 2bc2:A, 2bc2:B, 3bc2:A, 2bfk:A, 2bfk:B, 2bfl:A, 2bfl:B, 2bfz:A, 2bfz:B, 2bg2:A, 2bg2:B, 2bg6:A, 2bg6:B, 2bg7:A, 2bg7:B, 2bg8:A, 2bg8:B, 2bga:A, 2bga:B, 1bmc:A, 1bvt:A, 4c09:A, 4c1c:A, 4c1h:A, 6dja:A, 1dxk:A, 6eum:A, 6ewe:A, 6f2n:A, 3fcz:A, 3fcz:B, 5fqa:A, 5fqb:A, 3i11:A, 3i13:A, 3i14:A, 3i15:A, 5jmx:A, 3knr:A, 3knr:B, 3knr:C, 3knr:D, 3kns:A, 3kns:B, 3kns:C, 3kns:D, 2m5d:A, 4nq4:A, 4nq5:A, 4nq6:A, 2nxa:A, 2nyp:A, 2nze:A, 2nze:B, 2nzf:A, 4tyt:A, 2uyx:A, 5w8w:A
15 6v73:A 228 219 0.3333 0.3158 0.3288 3.07e-37 6v3u:A, 6v3u:B, 6v72:A
16 5lsc:A 235 211 0.3241 0.2979 0.3318 3.90e-36 8a4m:A, 7a5z:A, 7a60:A, 7a60:B, 5a87:A, 5a87:B, 5acu:A, 5acv:A, 5acv:B, 5acw:A, 5acw:B, 5acx:A, 5acx:B, 7afx:A, 7afx:B, 7afy:A, 7ayj:A, 6bm9:A, 6bm9:B, 6bm9:C, 6bm9:D, 4bz3:A, 4bz3:B, 4c1d:A, 4c1d:B, 4c1e:A, 4c1e:B, 7chv:A, 7cjl:B, 7cjl:A, 6dd0:A, 6dd0:B, 6dd1:A, 6dd1:B, 7du1:A, 7du1:B, 7dub:A, 7dub:B, 7due:A, 7due:B, 7dux:A, 7duy:A, 7duz:A, 7duz:B, 7dv0:A, 7dv1:A, 7dv1:B, 7dyy:A, 7dyy:B, 7dyz:A, 7dz0:A, 7dz0:B, 7dz1:A, 7dz1:B, 6ew3:A, 6ew3:B, 5fqc:A, 5fqc:B, 4fr7:A, 4fsb:A, 4fsb:B, 6hf5:A, 8hx5:A, 8hx5:B, 8hxo:A, 8hxo:B, 8hxp:A, 8hxp:B, 8hxu:A, 8hxu:B, 8hxv:A, 8hxv:B, 8hxw:A, 8hxw:B, 8hy1:A, 8hy1:B, 8hy2:A, 8hyd:A, 8i52:A, 8i52:D, 6j8r:A, 6jn6:A, 6jn6:B, 5k48:A, 5k48:B, 1ko2:A, 1ko3:A, 6kw1:A, 6kw1:B, 6kxo:A, 6kxo:B, 6kzn:A, 6kzn:B, 5lca:A, 5lcf:A, 5lch:A, 5le1:A, 5lm6:B, 5lm6:A, 5lsc:B, 5mm9:A, 5mm9:B, 5mxq:A, 5mxr:A, 5n4s:A, 5n4s:B, 5n4t:A, 5n4t:B, 5n55:A, 5n55:B, 5n55:C, 5n58:A, 5n58:B, 5n5g:A, 5n5h:A, 5n5i:A, 5nai:A, 5nhz:A, 5nhz:B, 5ni0:A, 5ni0:E, 4nq2:A, 6o5t:A, 6o5t:B, 5o7n:A, 5o7n:B, 6op6:A, 6op7:A, 7ove:A, 7ovf:A, 7ovh:A, 8p8y:A, 8p8z:A, 8p92:A, 8p93:A, 8p95:A, 8p9p:A, 8p9q:A, 8p9s:A, 8p9t:A, 8pa3:A, 8pa4:A, 8pa5:A, 8pa7:A, 8pa8:A, 8paa:A, 8pac:A, 8pad:A, 8pah:A, 8pal:A, 8pam:A, 8pan:A, 8pao:A, 8pb0:A, 8pb2:A, 8pg2:A, 8pg3:A, 8pg4:A, 8pg5:A, 8pg6:A, 8pg7:A, 8pg8:A, 8pg9:A, 8pga:A, 8pgb:A, 8pgc:A, 8pge:A, 8pgf:A, 8pgg:A, 8pgh:A, 8pgi:A, 8pgj:A, 8pgk:A, 8pgl:A, 8pgm:A, 8pgn:A, 8pgo:A, 8pgp:A, 8pgq:A, 8pgr:A, 8pgs:A, 8pgt:A, 8pgu:A, 8pgv:A, 8pgw:A, 8pgx:A, 8pgy:A, 8pgz:A, 8ph0:A, 8ph1:A, 8ph2:A, 8ph3:A, 8pjm:AAAA, 7pp0:A, 4pvo:A, 4pvo:B, 4pvt:A, 4pvt:B, 8r5u:A, 8r5u:B, 6rpn:A, 6rpn:B, 6sp7:A, 6sp7:E, 6tgi:A, 6tgi:B, 6tm9:A, 6tma:A, 6tma:B, 6tmb:A, 6tmb:B, 6tmc:A, 4ua4:A, 4ua4:B, 7up2:A, 4uwo:B, 4uwp:B, 4uwr:B, 4uws:B, 7uya:A, 7uyb:A, 7uyc:A, 7uyd:A, 7uyd:B, 6v1p:A, 6v1p:B, 2whg:A, 2whg:B, 2wrs:A, 2wrs:B, 5y6d:A, 5y6d:B, 5y6d:C, 5y6d:D, 5y6e:A, 5y6e:B, 6y6j:A, 5yd7:A, 5yd7:B, 7yhb:A, 7yhb:B, 7yhc:A, 7yhc:B, 7yhc:C, 7yhc:D, 7yhc:E, 7yhc:F, 7yhc:G, 7yhc:H, 7yhd:A, 6yrp:A, 7yrp:A, 7yrp:B, 2yz3:A, 2yz3:B, 6zgm:A, 6zyn:A, 6zyn:B, 6zyo:A, 6zyo:B
17 6jkb:A 244 221 0.3519 0.3115 0.3439 4.49e-36 5a5z:A, 5a5z:C, 8a76:A, 8a76:B, 7aez:A, 8b1w:A, 8b1w:B, 8b1z:A, 8b1z:B, 8b20:A, 8b20:B, 6c6i:A, 6c6i:B, 6c89:A, 6c89:B, 6c89:C, 6c89:D, 6cac:A, 6cac:B, 6cac:C, 6cac:D, 6d1a:A, 6d1b:A, 6d1c:A, 6d1d:A, 6d1e:A, 6d1f:A, 6d1g:A, 6d1h:A, 6d1i:A, 6d1j:A, 6d1k:A, 6efj:A, 4exs:B, 4exs:A, 4exy:A, 4exy:B, 4ey2:A, 4ey2:B, 4eyb:A, 4eyb:B, 4eyf:A, 4eyf:B, 4eyl:A, 4eyl:B, 8gpc:A, 8gpc:B, 8gpd:A, 8gpd:B, 8gpe:A, 8gpe:B, 4h0d:A, 4h0d:B, 4hky:A, 4hky:B, 4hl1:A, 4hl1:B, 4hl2:A, 4hl2:B, 8hy6:A, 8hy6:B, 8hyc:A, 8hyc:B, 8i8f:A, 8i8f:B, 6ibs:A, 6ibs:B, 6ibv:A, 6ibv:B, 6jkb:B, 5jqj:A, 5k4m:A, 6kxi:A, 6kxi:B, 6kzl:A, 6kzl:B, 6lip:A, 6liz:A, 6lj0:A, 6lj1:A, 6lj2:A, 6lj4:A, 6lj5:A, 6lj6:A, 6lj7:A, 6lj8:A, 6mdu:A, 6mgx:A, 6mgx:B, 6mgy:A, 6mgy:B, 6mgy:C, 6mgy:D, 6mgz:A, 6mgz:B, 6mh0:A, 6mh0:B, 5n0h:A, 5n0h:B, 5n0i:A, 5n0i:B, 5nbk:A, 5nbk:C, 6ny7:A, 5o2e:A, 5o2e:B, 5o2f:A, 5o2f:B, 6o3r:A, 6ogo:A, 6ogo:B, 6ogo:C, 6ol8:A, 6ol8:B, 6ovz:A, 6ovz:B, 6q2y:A, 6q2y:B, 6q30:A, 6q30:B, 8r5t:A, 8r5t:B, 4ram:A, 4ram:B, 4raw:A, 4raw:B, 4rbs:A, 4rbs:B, 4rl0:A, 4rl0:B, 4rl2:A, 4rl2:B, 4rm5:A, 4rm5:B, 4rm5:C, 4rm5:D, 6rmf:A, 6rmf:B, 3s0z:A, 3s0z:B, 3sfp:A, 3sfp:B, 3sfp:C, 3sfp:D, 8sk2:A, 8sko:A, 8sko:B, 8skp:A, 3spu:A, 3spu:B, 3spu:C, 3spu:D, 3spu:E, 6tgd:A, 6tgd:B, 6tt8:A, 6tta:A, 6ttc:A, 6twt:A, 6twt:B, 4tyf:A, 4tz9:A, 4tzb:A, 4tze:A, 4tze:B, 4tzf:A, 4u4l:A, 4u4l:B, 4u4l:C, 4u4l:D, 7uox:A, 7uox:B, 7uoy:A, 7uoy:B, 7up1:A, 7up1:B, 7up3:A, 7up3:B, 6v1m:A, 7vqj:A, 7vqj:B, 5wig:A, 5wig:B, 5wih:A, 6xbe:A, 6xbe:B, 6xbe:C, 6xbe:D, 6xbf:A, 6xbf:B, 6xbf:C, 6xbf:D, 6xci:A, 6xci:B, 5xp6:A, 5xp9:A, 5ypi:A, 5ypi:E, 5ypi:B, 5ypi:C, 5ypi:D, 5ypi:F, 5ypi:G, 5ypi:H, 5ypk:A, 5ypk:H, 5ypk:B, 5ypk:C, 5ypk:D, 5ypk:E, 5ypk:F, 5ypk:G, 5ypl:A, 5ypl:B, 5ypm:A, 5ypm:B, 5ypm:C, 5ypm:D, 5ypm:E, 5ypm:F, 5ypm:G, 5ypm:H, 5ypn:A, 5ypn:B, 5zge:A, 5zge:B, 5zgf:A, 5zgi:A, 5zgp:A, 5zgp:B, 5zgq:A, 5zgq:B, 5zgr:A, 5zgr:B, 5zgt:A, 5zgt:B, 5zgu:A, 5zgu:B, 5zgv:A, 5zgv:B, 5zgw:A, 5zgx:A, 5zgy:A, 5zgz:A, 5zh1:A, 5zh1:B, 5zio:A, 5zj1:A, 5zj2:A, 5zj7:A, 5zj8:A, 5zjc:A, 3zr9:A, 5zr8:A, 5zr8:E, 6zyp:A, 6zyp:B, 6zyq:A, 6zyq:B
18 1m2x:A 219 212 0.3287 0.3242 0.3349 1.22e-35 1m2x:B, 1m2x:C, 1m2x:D
19 4d1t:A 229 211 0.3333 0.3144 0.3412 1.41e-35 4d1u:A, 4d1v:A, 4d1w:A, 2y87:A, 2y8a:A, 2y8b:A
20 5nde:B 247 243 0.3889 0.3401 0.3457 7.89e-35 4bp0:A, 4bp0:C, 4bp0:B, 4bp0:D, 2fhx:A, 2fhx:B, 5ls3:B, 5ls3:A, 5ndb:A, 5ndb:B, 5nde:A
21 6t5l:A 224 213 0.3750 0.3616 0.3803 1.49e-34 6t5l:B
22 6v5m:A 221 205 0.3241 0.3167 0.3415 1.67e-34 6v54:A, 6v61:A, 6v71:A
23 3l6n:A 218 171 0.2963 0.2936 0.3743 6.34e-31
24 6cqs:A 242 216 0.3148 0.2810 0.3148 3.25e-25
25 3fai:A 227 166 0.2130 0.2026 0.2771 1.61e-17 3f9o:A, 2gkl:A, 3iof:A, 3iog:A, 2qds:A, 1x8g:A, 1x8h:A, 1x8i:A
26 8d2z:A 306 208 0.2500 0.1765 0.2596 1.82e-11 8d2z:B
27 7bj9:B 230 144 0.1759 0.1652 0.2639 9.79e-10 7bj9:A, 5ew0:A, 5ew0:B, 8hxn:A, 3q6v:A, 3q6v:B, 3sd9:A, 3sd9:B
28 6k6w:C 444 147 0.1574 0.0766 0.2313 3.70e-04 6k6w:A, 6k6w:B, 6k6w:D
29 3zq4:A 550 98 0.1389 0.0545 0.3061 0.006 3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
30 4xww:A 545 51 0.0787 0.0312 0.3333 0.044 4xwt:A, 4xwt:B, 4xww:B
31 2q42:A 254 125 0.1204 0.1024 0.2080 0.071 2q42:B, 1xm8:A, 1xm8:B
32 8c8b:A 341 83 0.1065 0.0674 0.2771 0.13 5ahr:A, 4b87:A, 8c8d:A, 8c8s:A, 8cew:A, 8cf0:A, 8cg9:A, 5nzw:A, 5nzx:A, 5nzy:A, 5q1j:A, 5q1k:A, 5q1l:A, 5q1m:A, 5q1n:A, 5q1o:A, 5q1p:A, 5q1q:A, 5q1r:A, 5q1s:A, 5q1t:A, 5q1u:A, 5q1v:A, 5q1w:A, 5q1x:A, 5q1y:A, 5q1z:A, 5q20:A, 5q22:A, 5q23:A, 5q24:A, 5q25:A, 5q26:A, 5q27:A, 5q28:A, 5q29:A
33 7ev5:A 209 130 0.1343 0.1388 0.2231 0.13
34 4ad9:A 288 167 0.1991 0.1493 0.2575 1.0 4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
35 3tp9:A 473 139 0.1620 0.0740 0.2518 1.1 3tp9:B
36 6sg9:FL 320 98 0.1065 0.0719 0.2347 1.2 6sgb:FL
37 7a1f:L 335 51 0.0787 0.0507 0.3333 1.7 7a1f:A, 5aho:A
38 3t3o:A 553 54 0.0741 0.0289 0.2963 1.9 3bk1:A, 3bk2:A, 3t3n:A
39 7p1g:M 347 49 0.0741 0.0461 0.3265 3.2 7p1g:K, 7p1g:L, 7p1g:N, 7p1g:O
40 5aij:A 630 77 0.1111 0.0381 0.3117 4.5 5a23:A, 5a23:B, 5a23:C, 5a23:D, 5ajl:A, 5ajl:B, 2cfu:A, 2cfz:A, 2cg2:A, 2cg3:A
41 6k6s:A 443 158 0.1759 0.0858 0.2405 4.9 6k6s:B
42 3r2u:A 348 128 0.1481 0.0920 0.2500 5.2 3r2u:B, 3r2u:C, 3r2u:D
43 2ivf:A 912 68 0.0833 0.0197 0.2647 5.6
44 5a0t:A 454 49 0.0741 0.0352 0.3265 6.9 5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
45 6cgy:A 276 59 0.0787 0.0616 0.2881 7.4 6cgy:H, 6cgy:L, 6cgz:A, 6cgz:B, 6cgz:C, 6ch0:C, 6ch0:F, 6ch0:I
46 3dha:A 254 81 0.0972 0.0827 0.2593 8.5 2a7m:A, 2br6:A, 2btn:A, 3dhb:A, 3dhc:A, 5eh9:A, 5eht:A, 4j5f:A, 4j5h:A, 7l5f:A
47 7el9:A 1731 35 0.0556 0.0069 0.3429 8.6 7el9:D, 7elc:A
48 7elb:A 1937 35 0.0556 0.0062 0.3429 8.6 7ckm:A, 7elb:C, 6kld:A, 6kle:A, 6klh:A, 6klh:C
49 8bwy:C 4264 38 0.0694 0.0035 0.3947 9.4
50 7moq:C 4159 38 0.0694 0.0036 0.3947 9.6 6zyy:C
51 6zyw:C 4433 38 0.0694 0.0034 0.3947 9.6
52 8bx8:A 4453 38 0.0694 0.0034 0.3947 9.6 7k58:A, 7k5b:A, 7kek:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218