BioLiP

>protein
LPALKLALEYIVPCMNKHGICVVDDFLGKETGQQIGDEVRALHDTGKFTDGQLVSQKSDSSKDIRGDKITWIEGKEPGCE
TIGLLMSSMDDLIRHCNGKLGSYKINGRTKAMVACYPGNGTGYVRHVDNPNGDGRCVTCIYYLNKDWDAKVSGGILRIFP
EGKAQFADIEPKFDRLLFFWSDRRNPHEVQPAYATRYAITVWYFDADERARAKVKYLVRVE

The query sequence (length=221) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4kbz:A	231	223	0.9910	0.9481	0.9821	8.72e-165	5a3u:B, 5a3u:C, 4bqw:A, 4bqx:A, 4bqy:A, 2g19:A, 2g1m:A, 2hbt:A, 2hbu:A, 3hqr:A, 3hqu:A, 4jzr:A, 5l9b:A, 5l9b:B, 5l9r:A, 5l9v:A, 5l9v:B, 5la9:A, 5la9:B, 5las:A, 5las:B, 5lat:A, 5lb6:A, 5lbb:A, 5lbc:A, 5lbe:A, 5lbf:A, 6nmq:A, 3ouh:A, 3oui:A, 3ouj:A, 5ox5:A, 5ox6:A, 7q5v:A, 7q5x:A, 8q5s:A, 8q64:A, 8q6d:A, 8q6e:A, 6st3:A, 6st3:B, 7ujv:B, 7ump:A, 4uwd:A, 5v18:A, 2y33:A, 2y34:A, 6yvt:B, 6yvt:D, 6yvw:A, 6yvx:A, 6yvz:A, 6yw0:A, 6yw1:A, 6yw2:A, 6yw3:A, 6yw4:A, 6zbn:B, 6zbn:D, 6zbo:A, 6zbo:C, 6zbo:D
2	5a3u:A	215	226	0.9050	0.9302	0.8850	4.75e-145	8j1k:A, 6qgv:A, 6yvt:A, 6yvt:C, 6yvt:E, 6yvt:F, 6zbn:A, 6zbn:C, 6zbn:E, 6zbn:F, 6zbo:B, 6zbo:E, 6zbo:F
3	5v1b:A	226	212	0.6787	0.6637	0.7075	3.17e-111
4	6f0w:A	220	200	0.4977	0.5000	0.5500	1.08e-80	6ey1:A
5	6iuq:B	296	189	0.2308	0.1723	0.2698	8.32e-11	6iuq:A
6	4iw3:A	201	198	0.2398	0.2637	0.2677	9.65e-08	4iw3:J, 4j25:E, 4j25:F, 4j25:G, 4j25:H
7	4j25:A	181	140	0.1900	0.2320	0.3000	6.68e-05	4j25:B, 4j25:C, 4j25:D
8	8k0e:A	646	97	0.1312	0.0449	0.2990	0.18	8k0f:A, 8k0m:A, 8k17:A, 8kc9:A
9	5xdc:B	402	111	0.1493	0.0821	0.2973	1.00	5xdb:A, 5xdb:B, 5xdb:C, 5xdb:D, 5xdc:A, 5xdc:C, 5xdc:D, 5xdd:A, 5xdd:B, 5xdd:C, 5xdd:D, 5xde:A, 5xde:B, 5xde:C, 5xde:D, 5xdg:A, 5xdg:B, 5xdg:C, 5xdg:D
10	6kc4:A	101	62	0.0860	0.1881	0.3065	1.3	6kc4:C, 6kc4:E, 6kc4:G, 6kc4:I, 6kc4:K
11	8gjz:B	182	42	0.0633	0.0769	0.3333	1.8	8efm:A, 8efm:B, 8gjz:A
12	7ohx:W	122	63	0.0860	0.1557	0.3016	2.7
13	6gfu:A	386	93	0.1312	0.0751	0.3118	3.3	5w76:A, 5w7q:A
14	3ly1:D	354	72	0.0950	0.0593	0.2917	3.6	3ly1:A, 3ly1:B, 3ly1:C
15	8u7h:C	1111	84	0.0905	0.0180	0.2381	3.9
16	4nhy:A	461	79	0.0905	0.0434	0.2532	4.5	4nhx:A, 4nhy:B, 4nhy:C, 4nhy:D
17	8ppb:A	276	75	0.0860	0.0688	0.2533	5.0	8pp8:A, 8pp8:B, 8pp9:A, 8pp9:B, 8ppa:A, 8ppa:B, 8ppb:B, 8ppc:A, 8ppc:B, 8ppd:A, 8ppd:B, 8ppe:A, 8ppe:B, 8ppf:A, 8ppf:B, 8ppg:A, 8pph:A, 8pph:B, 8ppi:A, 8ppi:B, 8ppj:A, 8ppj:B, 1tzd:A, 1tzd:B, 1w2c:A, 1w2c:B, 1w2d:A, 1w2d:B
18	5n0k:A	1034	44	0.0633	0.0135	0.3182	5.2	5n4l:A, 5n4l:B
19	8ppg:B	243	76	0.0860	0.0782	0.2500	8.3
20	9cc9:A	850	60	0.0724	0.0188	0.2667	8.5	9cc8:A, 9cc8:B, 9cc8:C, 9cc8:D, 9cc8:E, 9cc8:F, 9cc9:B, 9cc9:C, 9cc9:D, 9cc9:E, 9cc9:F, 9cc9:G, 9cc9:H, 9cc9:I, 9cc9:J, 9cc9:K, 9cc9:L

[Back]