BioLiP

>protein
LPALKLALEYIVPCMNKHGICVVDDFLGKETGQQIGDEVRALHDTGKFTDGQLVSQDSSKDIRGDKITWIEGKEPGCETI
GLLMSSMDDLIRHCNGKLGSYKINERTKAMVACYPGNGTGYVRHVDNPNGDGRCVTCIYYLNKDWDAKVSGGILRIFPEG
KAQFADIEPKFDRLLFFWSDRRNPHEVQPAYATRYAITVWYFDADERARAKVKYLGVRVE

The query sequence (length=220) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4kbz:A	231	223	0.9864	0.9394	0.9731	2.31e-161	5a3u:B, 5a3u:C, 4bqw:A, 4bqx:A, 4bqy:A, 2g19:A, 2g1m:A, 2hbt:A, 2hbu:A, 3hqr:A, 3hqu:A, 4jzr:A, 5l9b:A, 5l9b:B, 5l9r:A, 5l9v:A, 5l9v:B, 5la9:A, 5la9:B, 5las:A, 5las:B, 5lat:A, 5lb6:A, 5lbb:A, 5lbc:A, 5lbe:A, 5lbf:A, 6nmq:A, 3ouh:A, 3oui:A, 3ouj:A, 5ox5:A, 5ox6:A, 7q5v:A, 7q5x:A, 8q5s:A, 8q64:A, 8q6d:A, 8q6e:A, 6st3:A, 6st3:B, 7ujv:B, 7ump:A, 4uwd:A, 5v18:A, 2y33:A, 2y34:A, 6yvt:B, 6yvt:D, 6yvw:A, 6yvx:A, 6yvz:A, 6yw0:A, 6yw1:A, 6yw2:A, 6yw3:A, 6yw4:A, 6zbn:B, 6zbn:D, 6zbo:A, 6zbo:C, 6zbo:D
2	5a3u:A	215	224	0.9091	0.9302	0.8929	4.46e-145	8j1k:A, 6qgv:A, 6yvt:A, 6yvt:C, 6yvt:E, 6yvt:F, 6zbn:A, 6zbn:C, 6zbn:E, 6zbn:F, 6zbo:B, 6zbo:E, 6zbo:F
3	5v1b:A	226	210	0.6727	0.6549	0.7048	7.89e-110
4	6f0w:A	220	198	0.4955	0.4955	0.5505	6.73e-81	6ey1:A
5	6iuq:B	296	187	0.2273	0.1689	0.2674	3.12e-11	6iuq:A
6	4iw3:A	201	198	0.2545	0.2786	0.2828	5.21e-10	4iw3:J, 4j25:E, 4j25:F, 4j25:G, 4j25:H
7	4j25:A	181	182	0.2364	0.2873	0.2857	9.25e-07	4j25:B, 4j25:C, 4j25:D
8	8k0e:A	646	88	0.1182	0.0402	0.2955	0.21	8k0f:A, 8k0m:A, 8k17:A, 8kc9:A
9	7ohx:W	122	61	0.0909	0.1639	0.3279	0.81
10	3ly1:D	354	67	0.0909	0.0565	0.2985	2.4	3ly1:A, 3ly1:B, 3ly1:C
11	6gfu:A	386	91	0.1318	0.0751	0.3187	2.7	5w76:A, 5w7q:A
12	6rms:A	397	109	0.1364	0.0756	0.2752	2.8
13	8u7h:C	1111	84	0.0909	0.0180	0.2381	3.8
14	4nhy:A	461	79	0.0909	0.0434	0.2532	4.1	4nhx:A, 4nhy:B, 4nhy:C, 4nhy:D
15	6kc4:A	101	36	0.0591	0.1287	0.3611	5.0	6kc4:C, 6kc4:E, 6kc4:G, 6kc4:I, 6kc4:K
16	5n0k:A	1034	44	0.0636	0.0135	0.3182	5.2	5n4l:A, 5n4l:B
17	6h3o:F	650	123	0.1455	0.0492	0.2602	7.0	6h3g:A, 6h3g:B, 6h3g:C, 6h3g:F, 6h3g:D, 6h3g:E, 6h3g:G, 6h3g:H, 6h3o:A, 6h3o:B, 6h3o:C, 6h3o:D, 6h3o:E, 6h3o:G, 6h3o:H, 8il5:A
18	8sxz:c	699	93	0.1000	0.0315	0.2366	7.3	8sxz:b, 8sxz:f, 8sxz:g, 8sz8:b, 8sz8:c, 8sz8:f, 8sz8:g, 8t0k:b, 8t0k:c, 8t0k:f, 8t0k:g, 8t0r:b, 8t0r:c, 8t0r:f, 8t0r:g, 8tym:c, 8tym:f, 8tym:B, 8tym:C, 8tyn:c, 8tyn:f, 8tyn:C, 8tyn:F
19	9cc9:A	850	60	0.0727	0.0188	0.2667	8.2	9cc8:A, 9cc8:B, 9cc8:C, 9cc8:D, 9cc8:E, 9cc8:F, 9cc9:B, 9cc9:C, 9cc9:D, 9cc9:E, 9cc9:F, 9cc9:G, 9cc9:H, 9cc9:I, 9cc9:J, 9cc9:K, 9cc9:L
20	7ax3:D2	582	93	0.1000	0.0378	0.2366	8.4	7ax3:B2, 7ax3:B, 7ax3:D, 7ax3:F, 7ax3:H, 7ax3:J, 7ax3:M, 7ax3:O, 7ax3:Q, 7ax3:S, 7ax3:U, 7ax3:W, 7ax3:Y, 7ax3:E2, 7ax3:G2, 7ax3:H2, 7ax3:I2, 7ax3:J2

[Back]