Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASYDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNI
QKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELERKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESEGV
NTPYLYFGMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRHKMTLISPLMLK
KYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYGKQAVLCSCRDMVKISMDVFVRKFQPERYKLW
KAGKDNTVIDHTLPTPEAAEF

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5f37:B 354 346 1.0000 0.9633 0.9855 0.0 5a7n:A, 5a7n:B, 5a7o:A, 5a7o:B, 5a7p:A, 5a7p:B, 5a7q:A, 5a7q:B, 5a7s:A, 5a7s:B, 5a7w:A, 5a7w:B, 5a80:A, 5a80:B, 4ai9:A, 4ai9:B, 5anq:A, 5anq:B, 4bis:A, 4bis:B, 6cg1:A, 6cg1:B, 6cg1:C, 6cg1:D, 6cg2:A, 6cg2:B, 6cg2:C, 6cg2:D, 7eqv:A, 5f2s:A, 5f2s:B, 5f2s:C, 5f2s:D, 5f2w:A, 5f2w:B, 5f2w:C, 5f2w:D, 5f32:A, 5f32:B, 5f32:C, 5f32:D, 5f37:A, 5f37:C, 5f37:D, 5f39:A, 5f39:B, 5f39:C, 5f39:D, 5f3c:A, 5f3c:B, 5f3c:C, 5f3c:D, 5f3e:A, 5f3e:B, 5f3e:C, 5f3e:D, 5f3g:A, 5f3g:B, 5f3g:C, 5f3g:D, 5f3i:A, 5f3i:B, 5f3i:C, 5f3i:D, 5f5i:A, 5f5i:B, 5fpv:A, 5fpv:B, 5fpv:C, 5fpv:D, 5fpv:E, 5fpv:F, 5fpv:G, 5fpv:H, 5fwe:A, 5fwe:B, 5fy8:A, 5fy8:B, 5fyc:A, 5fyc:B, 5fyh:A, 5fyh:B, 5fyi:A, 5fyi:B, 6g5w:A, 6g5w:B, 6g5x:A, 6g5x:B, 4gd4:A, 4gd4:B, 9gle:A, 9gle:B, 2gp3:A, 2gp3:B, 2gp5:A, 2gp5:B, 6h4o:A, 6h4o:B, 6h4o:C, 6h4o:D, 6h4p:A, 6h4p:B, 6h4p:C, 6h4p:D, 6h4q:A, 6h4q:B, 6h4q:C, 6h4q:D, 6h4r:A, 6h4r:B, 6h4r:C, 6h4r:D, 6h4s:A, 6h4s:B, 6h4s:C, 6h4s:D, 6h4t:A, 6h4t:B, 6h4t:C, 6h4t:D, 6h4u:A, 6h4u:B, 6h4u:C, 6h4u:D, 6h4v:A, 6h4v:B, 6h4v:C, 6h4v:D, 6h4w:A, 6h4w:B, 6h4w:C, 6h4w:D, 6h4x:A, 6h4x:B, 6h4x:C, 6h4x:D, 6h4y:A, 6h4y:B, 6h4y:C, 6h4y:D, 6h8p:A, 6h8p:B, 6hgt:A, 6hgt:B, 6hgt:C, 6hgt:D, 5ly1:C, 5ly1:D, 5ly1:A, 5ly1:B, 5ly2:A, 5ly2:B, 5ly2:C, 5ly2:D, 3njy:A, 3njy:B, 2oq6:A, 2oq6:B, 2oq7:A, 2oq7:B, 2os2:A, 2os2:B, 2ot7:A, 2ot7:B, 2ox0:A, 2ox0:B, 2p5b:A, 2p5b:B, 3pdq:A, 3pdq:B, 2pxj:A, 2pxj:B, 2q8c:A, 2q8c:B, 2q8d:A, 2q8d:B, 2q8e:A, 2q8e:B, 3rvh:A, 3rvh:B, 5tvr:A, 5tvr:B, 5tvs:A, 5tvs:B, 3u4s:A, 3u4s:B, 4ura:A, 4ura:B, 4v2v:A, 4v2v:B, 4v2w:A, 4v2w:B, 2vd7:A, 2vd7:B, 5vgi:A, 5vgi:B, 5vgi:C, 5vgi:D, 5vmp:A, 5vmp:B, 5vmp:C, 5vmp:D, 8wd3:A, 8wd3:B, 2wwj:A, 2wwj:B, 2ybk:A, 2ybk:B, 2ybp:A, 2ybp:B, 2ybs:A, 2ybs:B
2 5kr7:A 340 340 0.8006 0.8029 0.8029 0.0 5fjh:A, 5fjh:B, 5fjk:A, 5kr7:B, 4xdo:A, 4xdo:B, 4xdp:A, 4xdp:B, 2xml:A, 2xml:B
3 7jm5:A 343 338 0.7713 0.7668 0.7781 0.0 7jm5:B, 4lxl:A
4 3dxt:A 331 329 0.6452 0.6647 0.6687 2.85e-174 4d6q:A, 4d6r:A, 4d6s:A, 3dxu:A, 7dyg:A, 7dyq:A, 6ete:A, 6etg:A, 6ets:A, 6ett:A, 6etu:A, 6etv:A, 6etw:A, 5f5a:A, 5f5c:A, 6f5q:A, 6f5r:A, 6f5s:A, 6f5t:A, 5fp4:A, 5fp7:A, 5fp8:A, 5fp9:A, 5fpa:A, 5fpb:A, 6h0w:A, 6h0x:A, 6h0y:A, 6h0z:A, 6h10:A, 6h11:A, 4hon:A, 4hon:B, 4hoo:A, 4hoo:B, 5ph0:A, 5ph1:A, 5ph2:A, 5ph3:A, 5ph4:A, 5ph5:A, 5ph6:A, 5ph7:A, 5ph8:A, 5ph9:A, 5pha:A, 5phb:A, 5phc:A, 5phd:A, 5phe:A, 5phf:A, 5phg:A, 5phh:A, 5phi:A, 5phj:A, 5phk:A, 5phl:A, 5phm:A, 5phn:A, 5pho:A, 5php:A, 5phq:A, 5phr:A, 5phs:A, 5pht:A, 5phu:A, 5phv:A, 5phw:A, 5phx:A, 5phy:A, 5phz:A, 5pi0:A, 5pi1:A, 5pi2:A, 5pi3:A, 5pi4:A, 5pi5:A, 5pi6:A, 5pi7:A, 5pi8:A, 5pi9:A, 5pia:A, 5pib:A, 5pic:A, 5pid:A, 5pie:A, 5pif:A, 5pig:A, 5pih:A, 5pii:A, 5pij:A, 5pik:A, 5pil:A, 5pim:A, 5pin:A, 5pio:A, 5pip:A, 5piq:A, 5pir:A, 5pis:A, 5pit:A, 5piu:A, 5piv:A, 5piw:A, 5pix:A, 5piy:A, 5piz:A, 5pj0:A, 5pj1:A, 5pj2:A, 5pj3:A, 5pj4:A, 5pj5:A, 5pj6:A, 5pj7:A, 5pj8:A, 5pj9:A, 5pja:A, 5pjb:A, 5pjc:A, 5pjd:A, 5pje:A, 5pjf:A, 5pjg:A, 5pjh:A, 5pji:A, 5pjj:A, 5pjk:A, 5pjl:A, 5pjm:A, 5pjn:A, 5pjo:A, 5pjp:A, 5pjq:A, 5pjr:A, 5pjs:A, 5pjt:A, 5pju:A, 5pjv:A, 5pjw:A, 5pjx:A, 5pjy:A, 5pjz:A, 5pk0:A, 5pk1:A, 5pk2:A, 5pk3:A, 5pk4:A, 5pk5:A, 5pk6:A, 5pk7:A, 5pk8:A, 5pk9:A, 5pka:A, 5pkb:A, 5pkc:A, 5pkd:A, 5pke:A, 5pkf:A, 5pkg:A, 5pkh:A, 5pki:A, 5pkj:A, 5pkk:A, 5pkl:A, 5pkm:A, 5pkn:A, 5pko:A, 5pkp:A, 5pkq:A, 5pkr:A, 5pks:A, 5pkt:A, 5pku:A, 5pkv:A, 5pkw:A, 5pkx:A, 5pky:A, 5pkz:A, 5pl0:A, 5pl1:A, 5pl2:A, 5pl3:A, 5pl4:A, 5pl5:A, 5pl6:A, 5pl7:A, 5pl8:A, 5pl9:A, 5pla:A, 5plb:A, 5plc:A, 5pld:A, 5ple:A, 5plf:A, 5plg:A, 5plh:A, 5pli:A, 5plj:A, 5plk:A, 5pll:A, 5plm:A, 5pln:A, 5plo:A, 5plp:A, 5plq:A, 5plr:A, 5pls:A, 5plt:A, 5plu:A, 5plv:A, 5plw:A, 5plx:A, 5ply:A, 5plz:A, 5pm0:A, 5pm1:A, 5pm2:A, 5pm3:A, 5pm4:A, 5pm5:A, 5pm6:A, 5pm7:A, 5pm8:A, 5pm9:A, 5pma:A, 5pmb:A, 5pmc:A, 5pmd:A, 5pme:A, 5pmf:A, 5pmg:A, 5pmh:A, 5pmi:A, 5pmj:A, 5pmk:A, 5pml:A, 5pmm:A, 5pmn:A, 5pmo:A, 5pmp:A, 5pmq:A, 5pmr:A, 5pms:A, 5pmt:A, 5pmu:A, 5pmv:A, 5pmw:A, 5pmx:A, 5pmy:A, 5pmz:A, 5pn0:A, 5pn1:A, 5pn2:A, 5pn3:A, 5pn4:A, 5pn5:A, 5pn6:A, 5pn7:A, 5pn8:A, 5pn9:A, 5pna:A, 5pnb:A, 5pnc:A, 5pnd:A, 5pne:A, 5pnf:A, 5png:A, 5pnh:A, 5pni:A, 5pnj:A, 5pnk:A, 5pnl:A, 5pnm:A, 5pnn:A, 5pno:A, 5pnp:A, 5pnq:A, 5pnr:A, 5pns:A, 5pnu:A, 5pnv:A, 5pnw:A, 8wug:A
5 2w2i:C 314 319 0.6217 0.6752 0.6646 2.41e-163 2w2i:A, 2w2i:B
6 3opt:A 298 305 0.3548 0.4060 0.3967 1.42e-70
7 5fzi:A 461 325 0.3167 0.2343 0.3323 6.16e-44 5a1f:A, 5a3n:A, 5a3p:A, 5a3t:A, 5a3w:A, 6eiu:A, 6eiy:A, 6ej0:A, 6ej1:A, 6ek6:A, 5fpl:A, 5fpu:A, 5fun:A, 5fup:A, 5fv3:A, 5fy4:A, 5fy5:A, 5fy9:A, 5fyb:A, 5fys:A, 5fyt:A, 5fyu:A, 5fyv:A, 5fyy:A, 5fyz:A, 5fz0:A, 5fz1:A, 5fz3:A, 5fz4:A, 5fz6:A, 5fz7:A, 5fz8:A, 5fz9:A, 5fza:A, 5fzb:A, 5fzc:A, 5fzd:A, 5fze:A, 5fzf:A, 5fzg:A, 5fzh:A, 5fzk:A, 5fzl:A, 5fzm:A, 6h4z:A, 6h50:A, 6h51:A, 6h52:A, 5lw9:A, 5lwb:A, 6rbi:A
8 5yko:A 487 314 0.3021 0.2115 0.3280 1.83e-43 5ykn:A
9 5fwj:A 435 321 0.2933 0.2299 0.3115 2.05e-42 5fwj:B
10 6ein:A 439 318 0.3050 0.2369 0.3270 4.75e-42
11 4igq:A 273 279 0.2815 0.3516 0.3441 5.76e-41 4igo:A, 4igp:A
12 6bh0:A 291 303 0.2786 0.3265 0.3135 3.07e-40
13 6dq4:A 312 310 0.2698 0.2949 0.2968 1.83e-39 6bgu:A, 6bgv:A, 6bgw:A, 6bgx:A, 6bgy:A, 6bgz:A, 6bh1:A, 6bh2:A, 6bh3:A, 6bh4:A, 6bh5:A, 6dq5:A, 6dq6:A, 6dq7:A, 6dq8:A, 6dq9:A, 6dqa:A, 6dqb:A, 6dqc:A, 6dqd:A, 6dqe:A, 6dqf:A, 5e6h:A, 5isl:A, 5ivb:A, 5ivc:A, 5ive:A, 5ivf:A, 5ivj:A, 5ivv:A, 5ivy:A, 5iw0:A, 5iwf:A
14 6ip0:A 472 318 0.2845 0.2055 0.3050 1.20e-38 6ip4:A
15 5v9t:B 593 157 0.1877 0.1079 0.4076 2.97e-37 5ceh:A, 5k4l:B, 5k4l:A, 5v9p:A, 5v9t:A
16 5v9t:B 593 46 0.0469 0.0270 0.3478 0.26 5ceh:A, 5k4l:B, 5k4l:A, 5v9p:A, 5v9t:A
17 4z4k:A 282 95 0.0792 0.0957 0.2842 1.0 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
18 4aay:B 132 55 0.0557 0.1439 0.3455 3.9 4aay:D, 4aay:F, 4aay:H, 8ccq:B, 8ccq:D, 8ccq:F, 8ccq:H, 8ed4:B, 8ed4:D, 8ed4:F, 8ed4:H, 5nqd:B, 5nqd:D, 5nqd:F, 5nqd:H
19 8bgu:B 176 61 0.0528 0.1023 0.2951 3.9 7a01:Y2, 8a3d:q, 5aj0:AJ, 8b5l:J, 8b6c:J, 9bdl:AL11, 9bdn:AL11, 9bdp:AL11, 7bhp:LJ, 8bhf:s3, 8bpo:J2, 8btk:BJ, 7cpu:LJ, 7cpv:LJ, 4d5y:J, 4d67:J, 6d90:J, 6d9j:J, 9f1b:BJ, 9f1c:BJ, 9f1d:BJ, 7f5s:LJ, 8fl0:L5, 8fl2:L5, 8fl3:L5, 8fl4:L5, 8fl6:L5, 8fl7:L5, 8fl9:L5, 8fla:L5, 8flb:L5, 8flc:L5, 8fld:L5, 8fle:L5, 8flf:L5, 6frk:J, 6ftg:J, 6fti:J, 6ftj:J, 8g5y:LJ, 8g5z:LJ, 8g60:LJ, 8g61:LJ, 8g6j:LJ, 8glp:LJ, 6gz3:AJ, 6gz4:AJ, 6gz5:AJ, 6hcf:J3, 6hcj:J3, 6hcm:J3, 6hcq:J3, 8idt:N, 8idy:N, 8ie3:T, 8ifd:2E, 8ife:2E, 8ine:N, 8inf:N, 8ink:C, 6ip5:2E, 6ip6:2E, 6ip8:2E, 8ipd:C, 8ipx:C, 8ipy:C, 8ir1:A, 8ir3:A, 3j7o:J, 3j7p:J, 3j7q:J, 3j7r:J, 3j92:J, 3jag:J, 3jah:J, 3jai:J, 3jaj:J, 3jan:J, 8jdj:P, 8jdk:P, 8jdl:P, 8jdm:P, 8k2c:LJ, 5lks:LJ, 6lqm:N, 6lsr:N, 6lss:N, 7ls1:E1, 7ls2:E1, 6lu8:N, 5lzs:J, 5lzt:J, 5lzu:J, 5lzv:J, 5lzw:J, 5lzx:J, 5lzy:J, 5lzz:J, 7mdz:J, 6mtb:J, 6mtc:J, 6mtd:J, 6mte:J, 7nfx:J, 7nwg:J3, 7nwh:J, 7nwi:J, 7o7y:BJ, 7o7z:BJ, 7o80:BJ, 7o81:BJ, 7obr:J, 8ohd:LJ, 8oj0:LJ, 8oj5:LJ, 8oj8:LJ, 6ole:L, 6olf:L, 6olg:AJ, 6oli:L, 6olz:AJ, 6om0:L, 6om7:L, 7ow7:q, 7oya:J1, 7oyb:J1, 7oyc:J1, 7oyd:J, 8p2k:BJ, 6p5i:AJ, 6p5j:AJ, 6p5k:AJ, 6p5n:AJ, 8q7z:BJ, 8q87:BJ, 8qfd:J, 7qgg:L, 8qoi:LJ, 7qvp:LJ, 7qvp:MJ, 7qwq:J, 7qwr:J, 7qws:J, 6qzp:LJ, 6r5q:J, 6r6g:J, 6r6p:J, 6r7q:J, 8rjb:J, 8rjc:J, 8rjd:J, 8scb:J, 6sgc:J2, 6swa:J, 5t2c:q, 6t59:J3, 7tm3:J, 7toq:AL11, 7tor:AL11, 7tut:J, 7ucj:J, 7uck:J, 4ug0:LJ, 4ujc:BJ, 4ujd:AJ, 4uje:CJ, 4v5z:Bd, 4v6x:CJ, 6w6l:L, 6xa1:LJ, 7xnx:LJ, 7xny:LJ, 8xsx:LJ, 8xsy:LJ, 8xsz:LJ, 6y0g:LJ, 8y0w:LJ, 8y0x:LJ, 6y2l:LJ, 6y57:LJ, 6y6x:LJ, 8yoo:LJ, 8yop:LJ, 6z6l:LJ, 6z6m:LJ, 6z6n:LJ, 7zjw:LM, 7zjx:LM, 6zm7:LJ, 6zme:LJ, 6zmi:LJ, 6zmo:LJ, 6zvk:Y2
20 6zj3:LS 178 55 0.0469 0.0899 0.2909 4.1
21 3m6a:A 496 39 0.0440 0.0302 0.3846 7.2 3m6a:B, 3m6a:C, 3m6a:D, 3m6a:E, 3m6a:F
22 4v6w:CJ 182 58 0.0557 0.1044 0.3276 8.0 6xu6:CJ, 6xu7:CJ, 6xu8:CJ

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218