BioLiP

>protein
LLTCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRA

The query sequence (length=75) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2mf8:A	75	75	1.0000	1.0000	1.0000	1.99e-49	2jx1:A
2	2jyd:A	46	37	0.4933	0.8043	1.0000	3.54e-21
3	2jyd:A	46	33	0.4000	0.6522	0.9091	1.43e-15
4	2cs8:A	108	81	0.5467	0.3796	0.5062	8.77e-21
5	2cs8:A	108	31	0.2800	0.1944	0.6774	2.27e-09
6	2cs8:A	108	33	0.2267	0.1574	0.5152	2.42e-07
7	1pxe:A	48	44	0.3467	0.5417	0.5909	2.94e-13
8	1pxe:A	48	27	0.2933	0.4583	0.8148	1.15e-10
9	6zxd:z	292	21	0.1200	0.0308	0.4286	0.51	4otp:A, 6zv6:h, 6zxe:z
10	6zxf:z	373	21	0.1200	0.0241	0.4286	0.52	6zxg:z, 6zxh:z
11	1e1d:A	553	54	0.2667	0.0362	0.3704	0.67	1e2u:A, 1e9v:A, 1gnt:A, 1oa1:A, 1w9m:A
12	1e1d:A	553	24	0.1333	0.0181	0.4167	7.7	1e2u:A, 1e9v:A, 1gnt:A, 1oa1:A, 1w9m:A
13	1gn9:A	543	55	0.2800	0.0387	0.3818	0.80	1gn9:B, 1gnl:A, 1gnl:B, 1oa0:A, 1oa0:B, 1upx:A, 1upx:B
14	4bp9:A	710	41	0.2000	0.0211	0.3659	1.3	4bp9:B, 4bp9:C, 4bp9:D, 4bp9:E, 4bp9:F
15	6zu5:SGG	307	57	0.2000	0.0489	0.2632	4.2
16	4oli:A	539	38	0.1867	0.0260	0.3684	5.2	6aam:A, 7ax4:A, 7ax4:B, 5c03:A, 5c03:B, 6dbk:A, 6dbm:A, 5f1z:A, 5f20:A, 4gfo:A, 4gih:A, 4gii:A, 4gj2:A, 4gj3:A, 4gvj:A, 7k7o:A, 7k7o:B, 7k7q:A, 7k7q:B, 3lxn:A, 3lxp:A, 6nsl:A, 6nsl:B, 3nyx:A, 3nz0:A, 6nze:A, 6nze:B, 6nzf:A, 6nzf:B, 6nzh:A, 6nzh:B, 6nzp:A, 6nzp:B, 6nzq:A, 6nzq:B, 6nzr:A, 6nzr:B, 6ova:A, 4py1:A, 8s98:A, 8s98:B, 8s98:C, 8s99:A, 8s99:B, 8s99:C, 8s9a:A, 8s9a:B, 8s9a:C, 8tb5:A, 8tb5:B, 8tb6:A, 8tb6:B, 5tkd:A, 5tkd:B, 7uyr:A, 7uys:A, 7uyt:A, 7uyu:A, 6vns:A, 6vnv:A, 6vnx:A, 6vny:A, 5wal:A, 4wov:A, 4wov:B, 6x8f:A, 6x8f:C, 6x8g:A, 3zon:A
17	6yfm:AA	150	50	0.1733	0.0867	0.2600	6.8	6yfm:AB, 6yfm:AC, 6yfm:AD, 6yfm:AE, 6yfm:AF, 6yfm:AG, 6yfm:AH, 6yfm:AI, 6yfm:AJ, 6yfm:AK, 6yfm:AL, 6yfm:AM, 6yfm:AN, 6yfm:AO, 6yfm:AP, 6yfm:AQ, 6yfm:AR, 6yfm:AS, 6yfm:AT, 6yfm:AU, 6yfm:AV, 6yfm:AW, 6yfm:AX, 6yfm:AY, 6yfm:AZ, 6yfm:BA, 6yfm:BB, 6yfm:BC, 6yfm:BD, 6yfm:BE, 6yfm:BF, 6yfm:BG, 6yfm:BH, 6yfm:BI, 6yfm:BJ, 6yfm:BK, 6yfm:BL, 6yfm:BM, 6yfm:BN, 6yfm:BO, 6yfm:BP, 6yfm:BQ, 6yfm:BR, 6yfm:BS
18	8dyu:A	2562	15	0.1067	0.0031	0.5333	7.8	8dyv:A
19	8fcy:A	2864	15	0.1067	0.0028	0.5333	7.8	8fd6:A, 8fdt:A
20	8pqw:A	2892	15	0.1067	0.0028	0.5333	7.8	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
21	5nug:A	2920	15	0.1067	0.0027	0.5333	7.8	5nug:B
22	7z8g:A	3047	15	0.1067	0.0026	0.5333	7.8	8fdu:A, 7z8l:f
23	8ptk:f	4502	15	0.1067	0.0018	0.5333	7.8	8ptk:e
24	7z8f:e	4579	15	0.1067	0.0017	0.5333	7.8	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A

[Back]