BioLiP

>protein
LKVSKSPSLVRLKTRGESVCPISKTVDSFEVSVEYIPRGAVLAIEEFKKMVDSYRGREILHEELAVDLLEKVKAAVNPPY
VKVTVKSYYIGVEVEVVAESGGV

The query sequence (length=103) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5jyx:B	109	103	1.0000	0.9450	1.0000	2.50e-68	5jyx:A, 5jyx:E, 5jyx:C, 5jyx:J, 5jyx:D, 5jyx:H, 5jyx:F, 5jyx:O, 5jyx:G, 5jyx:L, 5jyx:I, 5jyx:K, 5jyx:M, 5jyx:N
2	1wm9:A	185	48	0.1553	0.0865	0.3333	0.001	1wm9:B, 1wm9:C, 1wm9:D, 1wm9:E, 1wuq:A, 1wuq:B, 1wuq:E, 1wuq:C, 1wuq:D, 1wur:A, 1wur:B, 1wur:E, 1wur:C, 1wur:D
3	4f8b:B	145	69	0.1553	0.1103	0.2319	0.11	4f8b:A, 4f8b:C, 4f8b:D, 4f8b:E, 4fgc:A, 4fgc:B, 4fgc:C, 4fgc:D, 4fgc:E, 5udg:A, 5udg:D, 5udg:E
4	4g5d:A	283	38	0.1359	0.0495	0.3684	0.49	4g5d:B
5	4gba:B	206	33	0.1262	0.0631	0.3939	0.78	4gba:A
6	4g06:A	68	22	0.0874	0.1324	0.4091	0.94	6jip:A, 6jiq:A, 5zkl:A
7	8x2i:A	2303	83	0.2524	0.0113	0.3133	1.2
8	8x2h:A	2363	83	0.2524	0.0110	0.3133	1.3	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
9	2i89:A	90	36	0.1165	0.1333	0.3333	1.5	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
10	8jsg:A	167	25	0.0874	0.0539	0.3600	2.2	8jsh:A, 5me0:Z, 5me1:Z
11	1awp:A	86	36	0.1165	0.1395	0.3333	3.3	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
12	4rsm:A	315	54	0.1165	0.0381	0.2222	3.4	4rsm:B, 4rsm:C, 4rsm:D
13	7yb2:D	264	35	0.1359	0.0530	0.4000	3.8	8hfj:A, 8hfj:B, 8hfj:C, 8hfj:D, 8hfk:A, 8hfk:B, 8hfk:C, 8hfk:D, 7yb1:D, 7yb1:A, 7yb1:B, 7yb1:C, 7yb2:A, 7yb2:B, 7yb2:C
14	7ouj:AAA	540	31	0.1456	0.0278	0.4839	5.2
15	5ugh:B	365	59	0.2136	0.0603	0.3729	7.1	6fbn:B, 4ktt:A, 4ktt:C, 4ktv:C, 4ndn:C, 7rw5:D
16	8q6p:7	298	52	0.1650	0.0570	0.3269	7.4
17	2ohf:A	327	56	0.1650	0.0520	0.3036	8.3
18	8p4h:A	388	59	0.2136	0.0567	0.3729	8.6	5a19:A, 5a1g:A, 5a1i:A, 8axz:A, 7bhr:A, 7bhs:A, 7bht:A, 7bhu:A, 7bhv:A, 7bhw:A, 7bhx:A, 6fbn:A, 6fbo:A, 6fbp:A, 6fbp:B, 6fcb:A, 6fcd:A, 6g6r:A, 7kcc:A, 7kce:A, 7kcf:A, 7kda:A, 7kdb:A, 4ktt:B, 4ktt:D, 4ktv:A, 4ktv:B, 4ktv:D, 7l1a:A, 7lnh:A, 7lnh:B, 4ndn:A, 4ndn:B, 4ndn:D, 8oog:A, 2p02:A, 8p1t:AAA, 8p1v:AAA, 8p1w:AAA, 8p4h:B, 8p4h:C, 8p4h:D, 6p9v:A, 8qdy:A, 8qdz:A, 8qe0:A, 8qe1:A, 8qe2:A, 8qe3:A, 7rw5:A, 7rw5:B, 7rw5:C, 7rw7:A, 7rwg:A, 7rwh:A, 7rxv:A, 7rxw:A, 7rxx:A, 5ugh:A, 5ugh:C, 5ugh:D, 6wkb:A, 6wkb:B, 8xam:A, 8xam:B, 8xar:A, 8xb0:A
19	7mbm:A	339	29	0.0971	0.0295	0.3448	9.5	5ov3:B, 6pwv:A, 6pww:A, 6pwx:A, 6w5n:A

[Back]