Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LKPHFANVQAHYDLSDDFFRLFLDPTQTYSCAYFERDDMTLQEAQIAKIDLALGKLGLQPGMTLLDVGCGWGATMMRAVE
KYDVNVVGLTLSKNQANHVQQLVANSENLRSKRVLLAGWEQFDEPVDRIVSIGAFEHFGHERYDAFFSLAHRLLPADGVM
LLHTITGLHPKEIHERGLPMSFTFARFLKFIVTEIFPGGRLPSIPMVQECASANGFTVTRVQSLQPHYAKTLDLWSAALQ
ANKGQAIALQSEEVYERYMKYLTGCAEMFRIGYIDVNQFTCQK

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1kpg:A 285 283 1.0000 0.9930 1.0000 0.0 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
2 1tpy:A 285 283 0.7420 0.7368 0.7420 1.50e-162
3 1l1e:A 272 272 0.7032 0.7316 0.7316 1.61e-149 1l1e:B
4 7q2d:A 286 276 0.5866 0.5804 0.6014 1.14e-121 2fk8:A, 3ha3:A, 3ha5:A, 3ha7:A, 7q2b:A, 7q2c:A, 7q2e:A, 7q2f:A, 7q2g:A, 7q2h:A
5 3hem:A 291 290 0.5689 0.5533 0.5552 1.80e-111 1kpi:A
6 7lxi:A 279 283 0.5512 0.5591 0.5512 1.15e-110 7mcj:A, 7mcj:B
7 7qos:A 352 265 0.3322 0.2670 0.3547 1.06e-51 7qos:B
8 5z9o:A 373 278 0.3428 0.2601 0.3489 3.84e-49 5z9o:B
9 6bqc:A 348 270 0.3286 0.2672 0.3444 2.33e-40
10 6gkv:A 351 241 0.2297 0.1852 0.2697 3.93e-16 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
11 6p3o:A 341 130 0.1484 0.1232 0.3231 9.69e-11 6p3m:A, 6p3n:A
12 5kok:A 348 154 0.1307 0.1063 0.2403 2.25e-10 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
13 5wp4:A 485 40 0.0742 0.0433 0.5250 7.72e-06
14 5wp5:A 463 85 0.1025 0.0626 0.3412 1.67e-05 5wp5:B
15 3bus:A 251 244 0.2014 0.2271 0.2336 2.38e-05 3bus:B
16 5mgz:A 230 141 0.1413 0.1739 0.2837 5.13e-05 5mgz:B
17 4f86:A 275 76 0.0919 0.0945 0.3421 9.46e-05 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
18 5dpl:A 520 116 0.1060 0.0577 0.2586 1.81e-04 5doo:A, 5dpl:B
19 4krh:A 430 201 0.1519 0.1000 0.2139 2.63e-04 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
20 5gm2:B 282 64 0.0742 0.0745 0.3281 7.17e-04 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
21 4pne:B 272 84 0.0919 0.0956 0.3095 0.001 4pne:A
22 3vc1:D 288 57 0.0813 0.0799 0.4035 0.001 4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
23 4ine:A 431 193 0.1484 0.0974 0.2176 0.001 4ine:B
24 7v6h:A 267 74 0.0919 0.0974 0.3514 0.004 7v6h:B
25 3uj7:A 259 206 0.1484 0.1622 0.2039 0.005 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
26 5m58:A 230 146 0.1449 0.1783 0.2808 0.007 5m58:B
27 6uv6:C 264 89 0.1025 0.1098 0.3258 0.012 6uv6:A, 6uv6:B
28 4iv8:A 245 118 0.1025 0.1184 0.2458 0.014 4iv8:B
29 5gm2:K 267 214 0.1625 0.1723 0.2150 0.032
30 6z9l:A 744 58 0.0601 0.0228 0.2931 0.19 6z9k:A, 6z9k:B
31 5i2h:A 335 114 0.0989 0.0836 0.2456 0.39 5i2h:B
32 6hp2:A 297 152 0.1307 0.1246 0.2434 0.41
33 1jg1:A 215 32 0.0459 0.0605 0.4062 1.0 1jg2:A, 1jg3:A, 1jg3:B, 1jg4:A
34 7fbo:A 282 106 0.0989 0.0993 0.2642 1.2 7fbh:B, 7fbh:C, 7fbo:B, 7fbo:C
35 4qnu:A 323 95 0.1025 0.0898 0.3053 1.4 4qnu:B, 4qnu:C, 4qnu:D, 4qnu:E, 4qnu:F, 4qnu:G, 4qnu:H, 4qnv:A, 4qnv:B
36 8hkr:B 384 105 0.0989 0.0729 0.2667 2.3 8hkr:A
37 3dxt:A 331 76 0.0777 0.0665 0.2895 2.9 4d6q:A, 4d6r:A, 4d6s:A, 3dxu:A, 7dyg:A, 7dyq:A, 6ete:A, 6etg:A, 6ets:A, 6ett:A, 6etu:A, 6etv:A, 6etw:A, 5f5a:A, 5f5c:A, 6f5q:A, 6f5r:A, 6f5s:A, 6f5t:A, 5fp4:A, 5fp7:A, 5fp8:A, 5fp9:A, 5fpa:A, 5fpb:A, 6h0w:A, 6h0x:A, 6h0y:A, 6h0z:A, 6h10:A, 6h11:A, 4hon:A, 4hon:B, 4hoo:A, 4hoo:B, 5ph0:A, 5ph1:A, 5ph2:A, 5ph3:A, 5ph4:A, 5ph5:A, 5ph6:A, 5ph7:A, 5ph8:A, 5ph9:A, 5pha:A, 5phb:A, 5phc:A, 5phd:A, 5phe:A, 5phf:A, 5phg:A, 5phh:A, 5phi:A, 5phj:A, 5phk:A, 5phl:A, 5phm:A, 5phn:A, 5pho:A, 5php:A, 5phq:A, 5phr:A, 5phs:A, 5pht:A, 5phu:A, 5phv:A, 5phw:A, 5phx:A, 5phy:A, 5phz:A, 5pi0:A, 5pi1:A, 5pi2:A, 5pi3:A, 5pi4:A, 5pi5:A, 5pi6:A, 5pi7:A, 5pi8:A, 5pi9:A, 5pia:A, 5pib:A, 5pic:A, 5pid:A, 5pie:A, 5pif:A, 5pig:A, 5pih:A, 5pii:A, 5pij:A, 5pik:A, 5pil:A, 5pim:A, 5pin:A, 5pio:A, 5pip:A, 5piq:A, 5pir:A, 5pis:A, 5pit:A, 5piu:A, 5piv:A, 5piw:A, 5pix:A, 5piy:A, 5piz:A, 5pj0:A, 5pj1:A, 5pj2:A, 5pj3:A, 5pj4:A, 5pj5:A, 5pj6:A, 5pj7:A, 5pj8:A, 5pj9:A, 5pja:A, 5pjb:A, 5pjc:A, 5pjd:A, 5pje:A, 5pjf:A, 5pjg:A, 5pjh:A, 5pji:A, 5pjj:A, 5pjk:A, 5pjl:A, 5pjm:A, 5pjn:A, 5pjo:A, 5pjp:A, 5pjq:A, 5pjr:A, 5pjs:A, 5pjt:A, 5pju:A, 5pjv:A, 5pjw:A, 5pjx:A, 5pjy:A, 5pjz:A, 5pk0:A, 5pk1:A, 5pk2:A, 5pk3:A, 5pk4:A, 5pk5:A, 5pk6:A, 5pk7:A, 5pk8:A, 5pk9:A, 5pka:A, 5pkb:A, 5pkc:A, 5pkd:A, 5pke:A, 5pkf:A, 5pkg:A, 5pkh:A, 5pki:A, 5pkj:A, 5pkk:A, 5pkl:A, 5pkm:A, 5pkn:A, 5pko:A, 5pkp:A, 5pkq:A, 5pkr:A, 5pks:A, 5pkt:A, 5pku:A, 5pkv:A, 5pkw:A, 5pkx:A, 5pky:A, 5pkz:A, 5pl0:A, 5pl1:A, 5pl2:A, 5pl3:A, 5pl4:A, 5pl5:A, 5pl6:A, 5pl7:A, 5pl8:A, 5pl9:A, 5pla:A, 5plb:A, 5plc:A, 5pld:A, 5ple:A, 5plf:A, 5plg:A, 5plh:A, 5pli:A, 5plj:A, 5plk:A, 5pll:A, 5plm:A, 5pln:A, 5plo:A, 5plp:A, 5plq:A, 5plr:A, 5pls:A, 5plt:A, 5plu:A, 5plv:A, 5plw:A, 5plx:A, 5ply:A, 5plz:A, 5pm0:A, 5pm1:A, 5pm2:A, 5pm3:A, 5pm4:A, 5pm5:A, 5pm6:A, 5pm7:A, 5pm8:A, 5pm9:A, 5pma:A, 5pmb:A, 5pmc:A, 5pmd:A, 5pme:A, 5pmf:A, 5pmg:A, 5pmh:A, 5pmi:A, 5pmj:A, 5pmk:A, 5pml:A, 5pmm:A, 5pmn:A, 5pmo:A, 5pmp:A, 5pmq:A, 5pmr:A, 5pms:A, 5pmt:A, 5pmu:A, 5pmv:A, 5pmw:A, 5pmx:A, 5pmy:A, 5pmz:A, 5pn0:A, 5pn1:A, 5pn2:A, 5pn3:A, 5pn4:A, 5pn5:A, 5pn6:A, 5pn7:A, 5pn8:A, 5pn9:A, 5pna:A, 5pnb:A, 5pnc:A, 5pnd:A, 5pne:A, 5pnf:A, 5png:A, 5pnh:A, 5pni:A, 5pnj:A, 5pnk:A, 5pnl:A, 5pnm:A, 5pnn:A, 5pno:A, 5pnp:A, 5pnq:A, 5pnr:A, 5pns:A, 5pnu:A, 5pnv:A, 5pnw:A, 8wug:A
38 8glo:A 255 49 0.0495 0.0549 0.2857 3.0
39 7vru:B 494 24 0.0389 0.0223 0.4583 4.5 7vs4:B
40 2b1g:A 590 104 0.1095 0.0525 0.2981 4.6 2b1g:D, 2b1i:A, 2b1i:B, 1g8m:A, 2iu0:B, 2iu3:B, 1m9n:A, 1m9n:B, 1oz0:A, 1oz0:B, 1thz:A, 1thz:B
41 3dh0:B 190 21 0.0424 0.0632 0.5714 5.0 3dh0:A
42 2zm5:A 306 42 0.0636 0.0588 0.4286 5.0 3foz:A, 3foz:B, 2zm5:B, 2zxu:A, 2zxu:B
43 3ggd:A 243 46 0.0530 0.0617 0.3261 5.9
44 7pd7:B 250 121 0.1201 0.1360 0.2810 7.2 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
45 2pbf:A 218 46 0.0565 0.0734 0.3478 8.7 2pbf:B
46 6jgz:B 3485 48 0.0530 0.0043 0.3125 9.4 6jg3:A, 6jg3:B, 6jg3:C, 6jg3:D, 6jgz:D, 6jgz:F, 6jgz:H, 6jh6:B, 6jh6:D, 6jh6:F, 6jh6:H, 6jhn:A, 6jhn:C, 6jhn:E, 6jhn:G, 6ji0:A, 6ji0:C, 6ji0:E, 6ji0:G, 6jrr:A, 6jrr:C, 6jrr:E, 6jrr:G
47 4mwz:B 265 113 0.0919 0.0981 0.2301 9.9 4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218