Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LIKHMRAEALFDFTGNSKLELNFKAGDVIFLLSRINKDWLEGTVRGATGIFPLSFVKILK

The query sequence (length=60) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1w70:A 60 60 1.0000 1.0000 1.0000 1.37e-38 1w70:B
2 2o9v:A 67 56 0.3500 0.3134 0.3750 3.84e-11 4ln2:A
3 4lnp:A 61 53 0.3167 0.3115 0.3585 4.34e-11
4 2sem:B 59 49 0.3667 0.3729 0.4490 8.91e-10 1sem:A, 1sem:B, 2sem:A, 3sem:A, 3sem:B
5 5xhz:A 60 57 0.3167 0.3167 0.3333 4.22e-09 5xhz:B
6 1ssh:A 60 56 0.3833 0.3833 0.4107 1.07e-08
7 2jma:A 62 51 0.3333 0.3226 0.3922 1.81e-08 5ihk:A, 3thk:A, 3thk:B, 1u06:A
8 1zsg:A 65 52 0.3500 0.3231 0.4038 7.34e-08 2p4r:A, 5sxp:B, 5sxp:D, 5sxp:A, 5sxp:C
9 4iio:B 57 55 0.3500 0.3684 0.3818 7.66e-08
10 2ak5:B 64 52 0.3500 0.3281 0.4038 1.04e-07 2df6:A, 2df6:B
11 1uj0:A 58 51 0.3333 0.3448 0.3922 1.49e-07
12 8dgo:B 218 49 0.3167 0.0872 0.3878 1.50e-07 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
13 8dgo:B 218 55 0.2667 0.0734 0.2909 1.71e-04 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
14 4x1v:A 59 55 0.3000 0.3051 0.3273 2.42e-07 3u23:A
15 4f14:A 56 53 0.2667 0.2857 0.3019 2.64e-07
16 2drk:A 59 53 0.2833 0.2881 0.3208 3.50e-07 2drm:A, 2drm:B, 2drm:C, 2drm:D
17 2w10:B 62 53 0.3000 0.2903 0.3396 3.62e-07 2d0n:A, 2d0n:C, 1h3h:A, 1oeb:B, 1oeb:A, 1uti:A, 2w10:A
18 4iim:A 57 55 0.3333 0.3509 0.3636 5.03e-07 4iim:B
19 6f55:A 67 58 0.3167 0.2836 0.3276 5.90e-07
20 8hlo:A 67 57 0.3167 0.2836 0.3333 9.33e-07 2rqu:A
21 6a9c:B 66 57 0.3167 0.2879 0.3333 9.65e-07
22 1b07:A 59 50 0.2833 0.2881 0.3400 1.89e-06 6atv:A, 1cka:A, 1ckb:A, 5ih2:A, 5ih2:B, 5l23:A, 5ul6:A
23 2d1x:C 66 56 0.2667 0.2424 0.2857 1.90e-06 2d1x:A, 2d1x:B, 2d1x:D, 5nv1:A, 7pll:A, 3ulr:B
24 5ixf:A 68 51 0.3000 0.2647 0.3529 2.90e-06
25 2xmf:A 60 51 0.2667 0.2667 0.3137 5.87e-06
26 2bz8:B 57 50 0.2667 0.2807 0.3200 6.42e-06 2bz8:A
27 2lcs:A 67 61 0.3333 0.2985 0.3279 1.06e-05
28 1gbr:A 74 58 0.2667 0.2162 0.2759 1.93e-05
29 4wci:C 63 51 0.2833 0.2698 0.3333 2.05e-05 2j6f:A, 2j6o:A, 2j7i:A, 2j7i:B, 4wci:A, 4wci:E
30 6b27:A 118 52 0.2833 0.1441 0.3269 2.78e-05 6b27:B, 6b27:C, 6b27:D, 6b27:E, 6b27:F
31 2kxc:A 67 63 0.4333 0.3881 0.4127 3.09e-05
32 4hvw:A 61 56 0.2667 0.2623 0.2857 5.52e-04 6xx2:A, 6xx3:A
33 2rpn:A 59 54 0.2667 0.2712 0.2963 0.005
34 8bq3:A 60 53 0.2333 0.2333 0.2642 0.008
35 7pvx:A 60 50 0.2333 0.2333 0.2800 0.008 7pvx:C
36 3rnj:A 67 59 0.3500 0.3134 0.3559 0.012
37 6ipz:Z 63 50 0.2500 0.2381 0.3000 0.014 1a0n:B, 1azg:B, 4eik:A, 1fyn:A, 8kdx:A, 3ua7:A, 3ua7:D, 3ua7:C, 4znx:A, 4znx:D, 4znx:B, 4znx:C
38 7uy0:A 448 50 0.2500 0.0335 0.3000 0.019 7uy0:B, 7uy3:A
39 5i22:A 81 67 0.3000 0.2222 0.2687 0.020 1mv0:B
40 1y57:A 452 50 0.2333 0.0310 0.2800 0.033 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
41 1zuk:A 65 55 0.2667 0.2462 0.2909 0.036 1zuk:B
42 7a2w:A 61 50 0.2167 0.2131 0.2600 0.074 7a2x:A, 7a2y:A, 7a2z:A
43 2rqw:A 105 58 0.2667 0.1524 0.2759 0.090
44 1wlp:B 138 51 0.2167 0.0942 0.2549 0.092 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
45 5qu2:A 56 49 0.2167 0.2321 0.2653 0.13 5qu2:B
46 7pvt:C 56 50 0.2167 0.2321 0.2600 0.15 7pvt:A
47 4z8a:A 75 60 0.2667 0.2133 0.2667 0.24
48 6kad:R 240 32 0.1833 0.0458 0.3438 0.61 6kac:R, 6kac:r, 6kad:r, 6kaf:r, 6kaf:R
49 3uat:A 276 39 0.2333 0.0507 0.3590 1.2
50 6m48:A 813 35 0.2000 0.0148 0.3429 1.3 6m3y:A, 6m48:B
51 7ud6:A 265 50 0.2167 0.0491 0.2600 1.8 3a7d:A, 2cl5:A, 2cl5:B, 5fhq:A, 5fhr:A, 5fhr:B, 6gy1:A, 1h1d:A, 3hvh:A, 3hvi:A, 3hvj:A, 3hvj:B, 3hvk:A, 1jr4:A, 5k01:A, 5k03:A, 5k05:A, 5k05:B, 5k09:A, 5k09:B, 5k09:C, 5k09:D, 5k09:E, 5k09:F, 5k09:G, 5k09:H, 5k09:I, 5k09:J, 5k09:K, 5k09:L, 5k09:M, 5k09:N, 5k09:O, 5k09:P, 5k09:Q, 5k09:R, 5k09:S, 5k09:T, 5k09:U, 5k09:V, 5k09:W, 5k09:X, 5k0b:A, 5k0b:B, 5k0b:C, 5k0b:D, 5k0b:E, 5k0b:F, 5k0b:G, 5k0b:H, 5k0c:A, 5k0c:B, 5k0e:A, 5k0f:A, 5k0f:B, 5k0g:A, 5k0l:A, 5k0l:B, 5k0l:C, 5k0l:D, 5k0n:A, 5k0n:B, 5k0n:C, 5k0n:D, 6lfe:A, 5lqa:A, 5lqc:A, 5lqj:B, 5lqj:C, 5lqj:D, 5lqk:A, 5lqn:A, 5lqr:A, 5lqu:A, 5lqu:B, 5lr6:A, 5lr6:B, 5lr6:C, 5lr6:D, 3nw9:A, 3nwb:A, 3nwe:A, 3oe4:A, 3oe5:A, 3ozr:A, 3ozs:A, 3ozt:A, 4p58:A, 5p8w:A, 5p8w:B, 5p8w:C, 5p8x:A, 5p8y:A, 5p8z:A, 5p90:A, 5p91:A, 5p92:A, 5p93:A, 5p94:A, 5p95:A, 5p96:A, 5p97:A, 5p98:A, 5p99:A, 5p9a:A, 5p9b:A, 5p9c:A, 5p9d:A, 5p9e:A, 5p9n:A, 5p9o:A, 5p9p:A, 5p9q:A, 5p9r:A, 5p9r:B, 5p9s:A, 5p9t:A, 5p9u:A, 5p9v:A, 5p9w:A, 5p9x:A, 5p9y:A, 5p9z:A, 5pa0:A, 5pa1:A, 5pa2:A, 5pa3:A, 5pa4:A, 5pa5:A, 5pa6:A, 5pa7:A, 5pa7:B, 4pyl:A, 4pyn:A, 4pyo:A, 4pyo:B, 4pyq:A, 4pyq:B, 3r6t:A, 3s68:A, 3u81:A, 1vid:A, 7xgi:A, 7xjb:A, 7xjb:B, 7xjb:C, 7xjb:D, 2zth:A, 2zvj:A
52 7tzk:A 64 54 0.2000 0.1875 0.2222 2.3 7tzk:B
53 6yp7:R 222 20 0.1667 0.0450 0.5000 2.4 6yp7:r
54 7u5d:I 387 22 0.1500 0.0233 0.4091 3.1 7u5e:I
55 7kmq:B 754 21 0.1667 0.0133 0.4762 3.7 7kmq:A
56 2rol:A 64 46 0.2167 0.2031 0.2826 4.1
57 4wsi:A 372 37 0.1667 0.0269 0.2703 4.7 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
58 4rf7:B 700 20 0.1667 0.0143 0.5000 5.3 4rf7:A, 4rf8:A, 4rf8:B, 4rf9:A, 4rf9:B
59 6k0v:A 562 23 0.1833 0.0196 0.4783 5.4 6k0m:A, 6k0n:A, 6k0p:A, 6k0q:A, 6k0s:A, 6k0u:A, 6k0v:B, 6k0v:C, 6k0v:D
60 8bd3:R 236 33 0.1667 0.0424 0.3030 6.0 8bd3:r
61 8gmb:A 438 49 0.2000 0.0274 0.2449 6.1 6aua:A, 6aub:A, 6bik:A, 6bke:A, 6bkh:A, 6bkw:A, 6bln:A, 5bpy:A, 5bpy:B, 5bq0:A, 6di0:A, 6di1:A, 6di3:A, 6di5:A, 6di9:A, 8dso:B, 8e2m:A, 6e4f:A, 8ejb:A, 6ep9:A, 5fbn:C, 5fbn:D, 5fbo:A, 8fd9:A, 8ff0:A, 8flg:A, 8flh:A, 8fll:A, 8fln:A, 8flv:A, 8gc7:A, 8gc8:A, 3gen:A, 6hrp:A, 6hrt:A, 6j6m:A, 5j87:A, 5j87:B, 5j87:C, 5j87:D, 5jrs:A, 5kup:A, 7kxl:A, 7kxm:A, 7kxn:A, 7kxo:A, 7kxp:A, 7kxq:A, 7l5o:A, 7l5p:A, 7l5p:B, 7lty:A, 7ltz:A, 6mny:A, 7n4q:A, 7n4r:A, 7n4s:A, 7n5o:A, 7n5r:A, 7n5x:A, 7n5y:A, 6n9p:A, 6nfh:A, 4nwm:A, 4nwm:B, 6nzm:A, 6nzm:D, 6o8i:A, 3ocs:A, 3oct:A, 6omu:A, 4ot5:A, 4ot6:A, 4otf:A, 4otq:A, 4otr:A, 5p9f:A, 5p9g:A, 5p9h:A, 5p9i:A, 5p9j:A, 5p9k:A, 5p9l:A, 5p9m:A, 3pix:A, 3piy:A, 7r60:A, 7r61:A, 4rfy:A, 4rfz:A, 4rg0:A, 4rx5:A, 6s90:A, 6s90:B, 8s9f:B, 8s9f:A, 5t18:A, 6tfp:A, 6tfp:B, 6tfp:C, 6tfp:D, 6tfp:E, 8tu3:A, 8tu4:A, 8tu5:A, 8u2d:A, 8u2e:A, 5u9d:A, 5vfi:A, 5vgo:A, 6vxq:A, 6w06:A, 6w07:A, 6w7o:A, 6w7o:B, 6w8i:C, 6w8i:A, 6w8i:B, 6x3n:A, 6x3o:A, 6x3o:B, 6x3p:A, 6xe4:A, 4y95:A, 4y95:B, 4y95:C, 4y95:D, 7yc9:A, 4yhf:A, 4yhf:B, 4z3v:A, 4zly:A, 4zlz:A, 5zz4:A, 5zz4:B, 5zz4:C, 5zz4:D, 5zz4:E, 5zz4:F
62 6zea:A 308 18 0.1667 0.0325 0.5556 6.8
63 7dn9:A 299 31 0.1667 0.0334 0.3226 7.1 7dn9:C, 7dn9:E, 7dn9:G
64 8bnx:A 422 33 0.2000 0.0284 0.3636 7.6 8bnv:A
65 8fn6:2 428 28 0.1500 0.0210 0.3214 7.7
66 1oqc:A 112 29 0.1667 0.0893 0.3448 7.9 1oqc:B, 1oqc:C, 1oqc:D, 3r7c:A, 3r7c:B, 3r7c:C, 3r7c:D
67 2oi3:A 86 31 0.1500 0.1047 0.2903 8.8 2oj2:A
68 6i5b:A 484 21 0.1667 0.0207 0.4762 9.4 6i5b:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218