Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LIKEDMRVKVHMEGNVNGHAFVIEGEGKGKPYEGTQTLNLTVKEGAPLPFSYDILTTAL

The query sequence (length=59) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5exc:E 59 59 1.0000 1.0000 1.0000 5.67e-39 5exc:F, 5exc:G, 5exc:H
2 4q9x:A 213 59 0.7797 0.2160 0.7797 5.75e-29 4r6d:A
3 4dxp:A 216 59 0.7627 0.2083 0.7627 2.56e-28
4 8hgi:A 220 59 0.7797 0.2091 0.7797 9.47e-28 8hgi:B, 8tjh:A, 8tjh:B
5 7dna:I 207 58 0.7627 0.2174 0.7759 1.85e-27 7dna:F
6 4ljb:C 223 58 0.6441 0.1704 0.6552 5.75e-24 4ljb:A, 4ljc:C, 4ljd:A, 4ljd:B, 4ljd:C, 4ljd:D, 3p8u:A, 3p8u:B, 3p8u:D, 3tmr:A, 3tmr:B, 3tmr:C, 3tmr:D, 2vvh:A, 2vvh:B, 2vvh:C, 2vvh:D, 2vvi:A, 2vvi:B, 2vvi:C, 2vvi:D, 2vvj:A, 2vvj:B, 2vvj:C, 2vvj:D
7 5hzt:A 192 59 0.6441 0.1979 0.6441 6.75e-23 5hzt:K
8 2gx2:F 217 59 0.6441 0.1751 0.6441 9.72e-23 2gx2:A, 2gx2:D, 2gx2:H, 2gx2:K, 5hzs:A, 5hzs:B, 5hzs:C, 5hzs:D, 5hzs:E, 5hzs:F, 5hzs:G, 5hzs:H, 5hzs:I, 5hzs:J, 5hzs:K, 5hzs:L, 5hzt:B, 5hzt:C, 5hzt:D, 5hzt:E, 5hzt:F, 5hzt:G, 5hzt:H, 5hzt:I, 5hzt:J, 5hzt:L
9 2vad:A 217 59 0.6441 0.1751 0.6441 1.82e-21
10 7qgk:A 217 59 0.6271 0.1705 0.6271 3.28e-21
11 7x2b:A 217 55 0.5932 0.1613 0.6364 1.61e-20
12 3u0k:A 397 59 0.6102 0.0907 0.6102 5.06e-20
13 6u1a:A 220 59 0.5932 0.1591 0.5932 5.41e-20
14 2arl:A 218 56 0.5763 0.1560 0.6071 2.08e-19
15 1uis:A 224 59 0.5932 0.1562 0.5932 2.36e-19 1uis:B
16 5ukg:A 393 59 0.5932 0.0891 0.5932 2.70e-19 5ukg:B
17 1xmz:B 231 59 0.4746 0.1212 0.4746 1.64e-14 1xmz:A
18 4q7r:A 223 56 0.6441 0.1704 0.6786 1.34e-13 8bgl:A, 8bgl:B, 4q7r:B
19 4i2y:A 381 56 0.6271 0.0971 0.6607 2.36e-12 4i2y:B
20 6wv7:B 388 52 0.3390 0.0515 0.3846 9.17e-06 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
21 6wvb:A 408 52 0.3390 0.0490 0.3846 1.55e-05 6wv8:A
22 7ydq:A 598 52 0.3390 0.0334 0.3846 2.34e-05 4as8:A, 2b3q:A, 2b3q:D, 8dhy:A, 8dpd:A, 4eul:A, 6gqg:A, 6ir7:A, 4jfg:A, 4jfg:B, 4jfg:C, 4jfg:D, 4jfg:E, 4jfg:F, 4jfg:G, 4jfg:H, 6jgj:A, 4ka9:A, 4kw9:A, 1kyr:A, 1kys:A, 4l1i:A, 5nhn:B, 5nhn:A, 5ni3:A, 5ni3:D, 5ni3:B, 5ni3:C, 2o24:A, 7pca:A, 6sm0:A, 5t3i:A, 4w7c:D, 4w7e:A
23 6gez:B 532 52 0.3559 0.0395 0.4038 2.36e-05 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
24 6gez:B 532 52 0.3390 0.0376 0.3846 1.22e-04 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
25 8ovo:A 503 50 0.3390 0.0398 0.4000 3.78e-05 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
26 6wvf:A 386 52 0.3390 0.0518 0.3846 3.89e-05 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
27 6m63:A 359 52 0.3390 0.0557 0.3846 4.00e-05 6m63:B
28 7e9y:A 563 52 0.3390 0.0355 0.3846 4.31e-05
29 3o78:A 402 50 0.3559 0.0522 0.4200 4.34e-05 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
30 6quh:B 228 52 0.3390 0.0877 0.3846 4.96e-05 6quh:E, 6qui:B, 6qui:E, 6quj:B, 6quj:E
31 8xld:A 213 51 0.3051 0.0845 0.3529 6.46e-05 8ill:B
32 8b6s:A 517 52 0.3390 0.0387 0.3846 7.10e-05 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
33 7bwn:J 280 50 0.3390 0.0714 0.4000 7.18e-05 7bwn:O, 7bwn:C, 7bwn:M, 4gf6:B, 4w74:A, 4w74:B, 4w74:H, 4w74:C, 4w74:D, 4w74:E, 4w76:A, 4w76:B, 4w77:A, 4w77:B, 4w7a:A, 4w7a:B, 4w7c:B, 4w7d:A, 4w7f:A, 4w7r:A, 4w7r:B, 4w7r:C, 4w7r:D
34 4anj:A 995 52 0.3220 0.0191 0.3654 7.87e-05 1jbz:A
35 3osr:A 603 50 0.3390 0.0332 0.4000 9.77e-05 3osr:B
36 6xu4:A 389 50 0.3390 0.0514 0.4000 1.00e-04 6xu4:B, 6xu4:E
37 7vcm:A 371 50 0.3390 0.0539 0.4000 1.01e-04 7pvc:A, 7vcm:B
38 3osq:A 607 50 0.3390 0.0329 0.4000 1.04e-04
39 7s7t:A 509 50 0.3390 0.0393 0.4000 1.31e-04 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
40 4pa0:B 920 52 0.3220 0.0207 0.3654 2.80e-04 8qyu:B
41 4pa0:A 974 52 0.3220 0.0195 0.3654 2.89e-04 4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
42 4z4k:A 282 50 0.3220 0.0674 0.3800 3.15e-04 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
43 6hr1:A 406 50 0.3220 0.0468 0.3800 3.44e-04 6hr1:B
44 4w75:B 187 52 0.3051 0.0963 0.3462 4.07e-04
45 8c0t:A 281 47 0.3220 0.0676 0.4043 0.004
46 8osi:A 400 47 0.3220 0.0475 0.4043 0.011
47 5mwc:D 275 47 0.3220 0.0691 0.4043 0.012
48 6xw2:A 387 47 0.3220 0.0491 0.4043 0.013
49 3u8p:A 336 20 0.1864 0.0327 0.5500 0.035 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
50 8smu:D 394 27 0.2034 0.0305 0.4444 0.057 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
51 8axb:A 430 16 0.1695 0.0233 0.6250 0.21
52 8axa:A 465 16 0.1695 0.0215 0.6250 0.21 7n3o:A, 7n3p:A, 7pla:A
53 8bd6:A 560 16 0.1695 0.0179 0.6250 0.21
54 8bd5:A 605 16 0.1695 0.0165 0.6250 0.21 8ea3:O, 8ea4:O, 8rdu:A, 8rkt:A
55 6q63:A 751 39 0.2034 0.0160 0.3077 0.71 6q63:B, 6q63:C
56 2rhu:A 325 23 0.1525 0.0277 0.3913 1.9 6byb:A, 3oq5:A, 3oq5:C, 3p8h:A, 3p8h:B, 2pqw:A, 2rhi:A, 2rhx:A, 2rhy:A, 2rje:A, 2rje:B, 2rjf:A, 2rjf:C, 3uwn:A
57 3asq:A 311 21 0.1695 0.0322 0.4762 7.3 3asq:B, 3asr:A, 3asr:B, 3ass:A, 3ass:B, 3ast:A, 3ast:B
58 4k2m:A 442 22 0.1695 0.0226 0.4545 7.6 4k2i:A, 4k2i:B, 4k2m:B
59 8uat:F 351 24 0.1525 0.0256 0.3750 9.0 3hf3:A, 3hf3:B, 3hf3:C, 3hf3:D, 3hgj:A, 3hgj:B, 3hgj:C, 3hgj:D, 5nux:A, 5nux:B, 5nux:C, 5nux:D, 5ogt:A, 5ogt:B, 5ogt:C, 5ogt:D, 8uaj:A, 8uaj:B, 8uaj:C, 8uaj:D, 8uat:B, 8uat:C, 8uat:D, 8uat:E, 8uat:G, 8uat:H, 8uat:A
60 6wmi:A 146 35 0.1695 0.0685 0.2857 9.1 6wmi:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218