BioLiP

>protein
LHRNSLIVLADVALFLALYHFLPFEHNVVLGISMLAFIAVLWLTEALHVTVTAILVPVMAVFFGIFETQAALNNFANSII
FLFLGGFALAAAMHHQGLDKVIADKVLAMAQGKMSVAVFMLFGVTALLSMWISNTATAAMMLPLVLGVLSKVDADKQRST
YVFVLLGVAYSASIGGIATLVGSPPNAIAAAEVGLSFTDWMKFGLPTAMMMLPMAIAILYFLLKPTLNGMFELDRAPVNW
DKGKVVTLGIFGLTVFLWIFSSPINAALGGFKSFDTLVALGAILMLSFARVVHWKEIQKTADWGVLLLFGGGLCLSNVLK
QTGTSVFLANALSDMVSHMGIFVVILVVATFVVFLTEFASNTASAALLIPVFATVAEAFGMSPVLLSVLIAVAASCAFML
PVATPPNAIVFASGHIKQSEMMRVGLYLNIACIGLLTAIAMLFWQ

The query sequence (length=445) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7t9g:A	445	445	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4f35:D, 4f35:A, 4f35:C, 6okz:C, 6okz:B, 7t9g:Y, 6wtx:C, 6wtx:D, 6wtx:A, 6wtx:B
2	4f35:B	414	444	0.9303	1.0000	0.9324	0.0
3	8w6h:A	462	413	0.2989	0.2879	0.3220	1.73e-53	8w6h:B, 8w6o:A, 8w6o:B
4	8w6h:A	462	196	0.0989	0.0952	0.2245	2.2	8w6h:B, 8w6o:A, 8w6o:B
5	8w6n:A	494	425	0.2989	0.2692	0.3129	5.88e-53	8w6n:B
6	7jsj:A	468	415	0.2921	0.2778	0.3133	3.01e-48	7jsj:B, 7jsk:A, 7jsk:B
7	8r34:A	485	418	0.2315	0.2124	0.2464	7.19e-26	8r34:B
8	8w6c:A	530	181	0.1438	0.1208	0.3536	7.34e-23	8w6c:B, 8w6d:A, 8w6d:B, 8w6g:A, 8w6g:B
9	8w6c:A	530	158	0.1393	0.1170	0.3924	3.48e-22	8w6c:B, 8w6d:A, 8w6d:B, 8w6g:A, 8w6g:B
10	8w6c:A	530	125	0.0629	0.0528	0.2240	0.27	8w6c:B, 8w6d:A, 8w6d:B, 8w6g:A, 8w6g:B
11	7srs:R	289	95	0.0697	0.1073	0.3263	1.0	7srr:R
12	6pk3:B	400	64	0.0449	0.0500	0.3125	1.6	6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
13	3wv5:B	359	42	0.0427	0.0529	0.4524	3.5	3wvn:B
14	7ym0:A	301	110	0.0562	0.0831	0.2273	4.4	7ym0:B, 7ymr:A, 7ymr:B, 7ymr:C, 7ymr:D
15	3wv5:A	387	42	0.0427	0.0491	0.4524	4.5	3wvn:A
16	8b4x:A	473	31	0.0315	0.0296	0.4516	5.5	8b4v:A, 8b4w:A, 6eqv:A, 6eqw:A, 6eqx:A, 6hlb:A, 6hld:A, 6hle:A, 6hza:A, 6hzb:A, 6hzc:A, 6hzd:A, 5jmo:A, 5jmo:B, 5jxg:A, 5jxh:A, 5jxi:A, 5jxj:A, 7lcu:A, 5mim:A, 7o1u:A, 7o1w:A, 7o1y:A, 7o20:A, 7o22:A, 4omc:A, 4omc:B, 4omc:C, 4omc:D, 4omc:E, 4omc:F, 4omd:A, 4omd:B, 4omd:C, 4omd:D, 4omd:E, 4omd:F, 8oyh:A, 1p8j:A, 1p8j:D, 1p8j:B, 1p8j:C, 1p8j:E, 1p8j:F, 1p8j:G, 1p8j:H, 7qxy:A, 7qxz:A, 7qy0:A, 7qy1:A, 7qy2:A, 4ryd:A, 4ryd:B, 4ryd:C, 4ryd:D, 4ryd:E, 4ryd:F, 6yd2:A, 6yd3:A, 6yd4:A, 6yd7:A, 4z2a:A
17	3pr3:A	578	42	0.0292	0.0225	0.3095	8.0	3pr3:B
18	7srq:R	254	58	0.0517	0.0906	0.3966	8.6

[Back]