BioLiP

>protein
LGSMSVQTVSIQPFTDQKPGTSGLRKKVKVFQQPHYSEAFVTSILLSIPEGAEGAFLVIGGDGRYYNPEVIQKIAKISAA
YGVKKLLIGQNGILSTPAASNLIRVRKATGGILLTASHNPGGPNADFGIKYNLCNGAPAPESVTNKIYETSKSLTSYKIA
EIPDVDTSTIGTKTYGPLEVEIVHSTSDYLKMLKEIFDFDLIKEFLSTHKDFKVLFDGMHGVTGPYGVDIFVKELGLPQD
STMNCVPSPDFNGGHPDPNLVYAHELVEAVDKKGIHFGAASDGDGDRNMIYGANTFVSPGDSLAIIAHHAKLIPWFQKQG
VYGLARSMPTSGAVDLVAKAQGLQSYEVPTGWKFFCNLFDNKKISICGEESFGTGSNHIREKDGVWAIVAWLNIIAGVAK
QKPNETPSIASIQNEFWQTYGRTFFTRYDYENVDSDAANKLIANLSEKINNSFVGSTVSGRKVADAGNFAYTDLDGSVTK
NQGLYVKFDDGSRLVVRLSGTGSSGATIRLYIEKYESDKSKFGMNTQDYLKDNVALAMSLLKFKEYIGREDPDVKT

The query sequence (length=556) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7p5o:B	558	558	1.0000	0.9964	0.9964	0.0	7p5o:A
2	7pjc:B	553	556	0.6583	0.6618	0.6583	0.0	7pjc:A
3	6sno:A	573	569	0.5360	0.5201	0.5237	0.0	1c47:A, 1c4g:A, 5epc:A, 5epc:B, 5f9c:A, 5jn5:A, 5jn5:B, 3pmg:A, 3pmg:B, 7s0w:A, 6snp:A, 6snq:A, 5tr2:A, 5tr2:B, 6uiq:B, 6uiq:A, 6uo6:A, 6uo6:B, 5vbi:A, 5vbi:B, 5vec:A, 5vec:B, 5vg7:A, 5vg7:B, 5vin:A, 5vin:B
4	7s0w:B	499	538	0.4838	0.5391	0.5000	2.40e-174
5	6y8y:A	572	571	0.4766	0.4633	0.4641	1.56e-170	6y8x:AA, 6y8z:A
6	1kfq:A	571	571	0.4784	0.4658	0.4658	1.52e-162	1kfi:A, 1kfi:B, 1kfq:B
7	4qg5:A	565	573	0.4838	0.4761	0.4695	4.74e-162	4qg5:B, 4qg5:C, 4qg5:D
8	2fuv:A	545	547	0.2356	0.2404	0.2395	1.13e-14	2fuv:B, 3na5:A, 3na5:B, 3olp:A, 3olp:B
9	1wqa:A	455	361	0.1727	0.2110	0.2659	1.36e-13	1wqa:B, 1wqa:C, 1wqa:D
10	4il8:A	459	257	0.1169	0.1416	0.2529	7.76e-07	3bkq:X, 3c04:A, 2fkf:A, 2fkm:X, 2h4l:X, 2h5a:X, 1k2y:X, 1k35:A, 4mrq:A, 1p5d:X, 1p5g:X, 1pcj:X, 1pcm:X, 3rsm:A
11	7ojr:A	445	322	0.1385	0.1730	0.2391	1.20e-05	7oml:A
12	5bmp:A	449	236	0.1115	0.1381	0.2627	0.005	5bmn:A, 5kl0:A, 6mlf:A, 6mlh:A, 6mlw:A, 6mnv:A, 6n1e:A, 6nn1:A, 6nn2:A, 6nnn:A, 6nno:A, 6nnp:A, 6nns:A, 6nnt:A, 6nnu:A, 6nol:A, 6noq:A, 6np8:A, 6npx:A, 6nqe:A, 6nqf:A, 6nqg:A, 6nqh:A
13	7mek:A	129	48	0.0270	0.1163	0.3125	1.1	7mek:B, 8um6:B
14	3uw2:A	458	105	0.0504	0.0611	0.2667	1.7
15	1ss9:A	280	87	0.0414	0.0821	0.2644	2.6	1g9r:A, 1ga8:A
16	3i3w:A	441	231	0.0863	0.1088	0.2078	2.7	3i3w:B
17	4pj3:A	1335	69	0.0288	0.0120	0.2319	3.1	7a5p:U, 6icz:Q, 6id1:Q, 7w59:Q, 7w5a:Q, 7w5b:Q, 5xjc:Q
18	4o2d:A	580	50	0.0288	0.0276	0.3200	9.3	4rmf:A

[Back]