BioLiP

>protein
LGSMSVQTVSIQPFTDQKPGTSGLRKKVKVFQQPHYSEAFVTSILLSIPEGAEGAFLVIGGDGRYYNPEVIQKIAKISAA
YGVKKLLIGQNGILSTPAASNLIRVRKATGGILLTASHNPGGPNADFGIKYNLCNGAPAPESVTNKIYETSKSLTSYKIA
EIPDVDTSTIGTKTYGPLEVEIVHSTSDYLKMLKEIFDFDLIKEFLSTHKDFKVLFDGMHGVTGPYGVDIFVKELGLPQD
STMNCVPSPDFNGGHPDPNLVYAHELVEAVDKKGIHFGAASDGDGDRNMIYGANTFVSPGDSLAIIAHHAKLIPWFQKQG
VYGLARSMPTSGAVDLVAKAQGLQSYEVPTGWKFFCNLFDNKKISICGEESFGTGSNHIREKDGVWAIVAWLNIIAGVAK
QKPNETPSIASIQNEFWQTYGRTFFTRYDYENVDSDAANKLIANLSEKINNKDSFVGSTVSGRKVADAGNFAYTDLDGSV
TKNQGLYVKFDDGSRLVVRLSGTGSSGATIRLYIEKYESDKSKFGMNTQDYLKDNVALAMSLLKFKEYIGREDPDVKT

The query sequence (length=558) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7p5o:B	558	558	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7p5o:A
2	7pjc:B	553	557	0.6559	0.6618	0.6571	0.0	7pjc:A
3	6sno:A	573	570	0.5358	0.5218	0.5246	0.0	1c47:A, 1c4g:A, 5epc:A, 5epc:B, 5f9c:A, 5jn5:A, 5jn5:B, 3pmg:A, 3pmg:B, 7s0w:A, 6snp:A, 6snq:A, 5tr2:A, 5tr2:B, 6uiq:B, 6uiq:A, 6uo6:A, 6uo6:B, 5vbi:A, 5vbi:B, 5vec:A, 5vec:B, 5vg7:A, 5vg7:B, 5vin:A, 5vin:B
4	7s0w:B	499	540	0.4821	0.5391	0.4981	5.82e-174
5	6y8y:A	572	571	0.4785	0.4668	0.4676	2.36e-171	6y8x:AA, 6y8z:A
6	1kfq:A	571	573	0.4767	0.4658	0.4642	4.37e-162	1kfi:A, 1kfi:B, 1kfq:B
7	4qg5:A	565	573	0.4785	0.4726	0.4660	3.59e-161	4qg5:B, 4qg5:C, 4qg5:D
8	2fuv:A	545	547	0.2348	0.2404	0.2395	6.50e-16	2fuv:B, 3na5:A, 3na5:B, 3olp:A, 3olp:B
9	1wqa:A	455	361	0.1720	0.2110	0.2659	1.71e-13	1wqa:B, 1wqa:C, 1wqa:D
10	4il8:A	459	257	0.1165	0.1416	0.2529	6.56e-07	3bkq:X, 3c04:A, 2fkf:A, 2fkm:X, 2h4l:X, 2h5a:X, 1k2y:X, 1k35:A, 4mrq:A, 1p5d:X, 1p5g:X, 1pcj:X, 1pcm:X, 3rsm:A
11	7ojr:A	445	322	0.1380	0.1730	0.2391	1.26e-05	7oml:A
12	5bmp:A	449	236	0.1111	0.1381	0.2627	0.004	5bmn:A, 5kl0:A, 6mlf:A, 6mlh:A, 6mlw:A, 6mnv:A, 6n1e:A, 6nn1:A, 6nn2:A, 6nnn:A, 6nno:A, 6nnp:A, 6nns:A, 6nnt:A, 6nnu:A, 6nol:A, 6noq:A, 6np8:A, 6npx:A, 6nqe:A, 6nqf:A, 6nqg:A, 6nqh:A
13	7mek:A	129	48	0.0269	0.1163	0.3125	1.2	7mek:B, 8um6:B
14	3uw2:A	458	105	0.0502	0.0611	0.2667	1.6
15	1ss9:A	280	87	0.0412	0.0821	0.2644	2.8	1g9r:A, 1ga8:A
16	3i3w:A	441	231	0.0860	0.1088	0.2078	2.9	3i3w:B
17	4pj3:A	1335	69	0.0287	0.0120	0.2319	3.1	7a5p:U, 6icz:Q, 6id1:Q, 7w59:Q, 7w5a:Q, 7w5b:Q, 5xjc:Q
18	4o2d:A	580	50	0.0287	0.0276	0.3200	9.7	4rmf:A

[Back]