BioLiP

>protein
LGKDHEILRRRIENGAKELWFFLQSELKKLKNLEGNELQRHADEFLLDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDL
TELVQRRITYLQNPKDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCT
DRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAVPEDLADRLVRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIE
EATKKLGFKHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKYPNYEFI
SDNSISWSAGLHNRYTENSLRGVILDIHFLSQADFLVCTFSSQVCRVAYEIMQTLHPDASANFHSLDDIYYFGGQNAHNQ
IAIYAHQPRTADEIPMEPGDIIGVAGNHWDGYSKGVNRKLGRTGLYPSYKVREKIETVKYPTYPEA

The query sequence (length=466) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6vld:B	469	466	1.0000	0.9936	1.0000	0.0	6tkv:A, 6tkv:B, 6vld:A, 6vlg:A, 6vlg:B, 6vlg:C, 6vlg:D, 6x5h:A, 6x5h:B, 6x5h:C, 6x5r:B, 6x5r:A, 6x5s:A, 6x5s:B, 6x5t:A, 6x5t:B, 6x5t:C, 6x5t:D, 6x5t:E, 6x5t:F, 6x5t:G, 6x5t:H, 6x5u:E, 6x5u:B, 6x5u:D, 6x5u:F, 6x5u:A, 6x5u:G, 6x5u:C, 6x5u:H
2	5xhz:A	60	54	0.0429	0.3333	0.3704	6.19e-04	5xhz:B
3	2d1x:C	66	48	0.0408	0.2879	0.3958	0.013	2d1x:A, 2d1x:B, 2d1x:D, 5nv1:A, 7pll:A, 3ulr:B
4	1zsg:A	65	65	0.0494	0.3538	0.3538	0.019	2p4r:A, 5sxp:B, 5sxp:D, 5sxp:A, 5sxp:C
5	2lcs:A	67	47	0.0300	0.2090	0.2979	0.059
6	2ak5:B	64	61	0.0451	0.3281	0.3443	0.12	2df6:A, 2df6:B
7	2fpd:C	62	57	0.0365	0.2742	0.2982	0.15	7nyl:AAA
8	4x1v:A	59	52	0.0386	0.3051	0.3462	0.34	3u23:A
9	4f14:A	56	47	0.0322	0.2679	0.3191	0.37
10	6dsz:B	1072	102	0.0601	0.0261	0.2745	0.88
11	2xmf:A	60	47	0.0322	0.2500	0.3191	1.0
12	6b27:A	118	53	0.0322	0.1271	0.2830	1.4	6b27:B, 6b27:C, 6b27:D, 6b27:E, 6b27:F
13	8bu1:D	827	105	0.0601	0.0339	0.2667	1.7	8bu1:A, 8bu1:G, 8bu2:A, 8bu2:D, 8bu2:G, 8bu3:A, 8bu3:D, 8bu3:G, 8bu4:A, 8bu4:D, 8bu4:G, 8bu5:A, 8bu5:D, 8bu5:G, 8bu6:G, 8bu6:D, 8bu6:A, 8bu7:A, 8bu7:D, 8bu7:G, 8bua:A, 8bua:D, 8bua:G, 8bub:A, 8bub:D, 8bub:G, 8buc:A, 8buc:D, 8buc:G, 8bud:A, 8bud:D, 8bud:G, 8bue:A, 8bue:D, 8bue:G, 8buf:D, 8bug:A, 8bug:D, 8bug:G, 8buh:A, 8buh:D, 8buh:G, 8bui:A, 8bui:D, 8bui:G, 8buj:A, 8buj:G, 8buk:D, 8bul:A, 8bul:D, 8bul:G, 8bum:A, 8bum:D, 8bum:G, 8bun:A, 8bun:D, 8bun:G, 8buo:A, 8buo:D, 8buo:G, 8bup:A, 8bup:D, 8bup:G, 8buq:A, 8buq:D, 8buq:G, 8bur:D, 8bur:A, 8bur:G, 8bus:D, 8bus:A, 8bus:G, 8but:A, 8but:D, 8but:G, 6td3:A, 6td3:D, 6td3:G
14	8tl6:A	798	105	0.0622	0.0363	0.2762	1.7	8g46:A
15	7pwy:C	301	138	0.0901	0.1395	0.3043	2.2
16	1eep:A	314	26	0.0258	0.0382	0.4615	2.4
17	7ukn:A	1059	105	0.0601	0.0264	0.2667	2.6
18	7pkt:p	204	62	0.0408	0.0931	0.3065	3.6
19	1tpy:A	285	160	0.0730	0.1193	0.2125	5.2
20	1q9o:B	226	92	0.0408	0.0841	0.2065	5.4	2bmk:B, 2bmk:H, 2g5b:B, 2g5b:D, 2g5b:F, 2g5b:H, 3hzy:B, 1kel:H, 3okl:B, 1q9o:D, 2r1w:B, 2r23:B, 2r2e:B, 3t65:B, 1wc7:B, 1wc7:H, 1wcb:B, 1wcb:H
21	3i7h:A	1114	105	0.0579	0.0242	0.2571	5.5	4a0b:A, 9bbe:A, 9bbg:A, 9bbh:A, 9bbi:A, 6dsz:A, 3i7k:A, 3i7l:A, 3i7n:A, 3i7o:A, 3i7p:A, 3i89:A, 3i8c:A, 3i8e:A, 3i8e:B
22	3s27:H	797	51	0.0300	0.0176	0.2745	5.9	3s27:A, 3s27:B, 3s27:C, 3s27:D, 3s27:E, 3s27:F, 3s27:G, 3s28:A, 3s28:B, 3s28:C, 3s28:D, 3s28:E, 3s28:F, 3s28:G, 3s28:H, 3s29:A, 3s29:B, 3s29:C, 3s29:D, 3s29:E, 3s29:F, 3s29:G, 3s29:H
23	5foe:B	435	65	0.0386	0.0414	0.2769	7.2	5foe:A
24	8p5d:LR0	164	47	0.0365	0.1037	0.3617	7.5	8p60:LR0, 8p60:KR0, 7qca:LR0
25	3aw8:A	360	91	0.0644	0.0833	0.3297	8.3	3aw8:B
26	6wxv:A	1091	47	0.0343	0.0147	0.3404	10.0	6wxr:A, 6wxu:C, 6wxu:A

[Back]