Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LFKTRCLQCHTVEKGGPHKVGPNLHGIFGRHSGQAEGYSYTDANIKKNVLWDENNMSEYLTNPAKYIPGTAMAFGGLKKE
KDRNDLITYLKKATE

The query sequence (length=95) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2b0z:B 108 95 0.9579 0.8426 0.9579 5.90e-66 2b10:B, 2b10:D, 2b11:B, 2b11:D, 2b12:B, 7bbt:A, 7bbt:B, 7bbt:C, 7bbt:D, 2bcn:B, 1chh:A, 1chi:A, 1chj:A, 1cie:A, 1cif:A, 1cig:A, 1cih:A, 5cib:B, 5cib:D, 5cic:B, 5cic:D, 5cid:B, 5cid:D, 5cie:B, 5cie:D, 5cif:B, 5cif:D, 5cig:B, 5cig:D, 5cih:B, 5cih:D, 1crg:A, 1crh:A, 1cri:A, 1crj:A, 1csu:A, 1csv:A, 1csw:A, 1csx:A, 1cty:A, 1ctz:A, 3cx5:W, 6egy:A, 6egy:B, 6egz:A, 6egz:B, 1fhb:A, 2gb8:B, 6gd6:A, 6gd7:A, 6gd8:A, 6gd8:C, 6gd8:B, 6gd8:D, 6gd9:A, 6gda:A, 2hv4:A, 1irv:A, 1irw:A, 2jqr:A, 2jti:B, 5kke:A, 5klu:A, 5klu:B, 5kpf:A, 5kpf:B, 1kyo:W, 5lft:A, 2lir:A, 2lit:A, 1lms:A, 5lyc:A, 5lyc:B, 2mhm:A, 7mri:A, 7mri:C, 7mri:E, 4mu8:A, 4mu8:B, 4n0k:A, 4n0k:B, 2n18:B, 2n18:C, 5ncv:A, 5ncv:B, 1nmi:A, 2orl:A, 4p4q:B, 4p4q:D, 6p41:B, 6p41:D, 6p42:B, 6p42:D, 6p43:B, 2pcc:B, 2pcc:D, 7pr2:A, 7pr2:B, 7pr3:A, 7pr3:D, 7pr3:C, 7pr3:B, 7pr4:A, 4q5p:A, 4q5p:B, 4q5p:C, 4qao:A, 4qao:B, 4qao:C, 1rap:A, 1raq:A, 6rsi:A, 6rsj:A, 6rsk:A, 6rsk:B, 6rsl:A, 6rsl:B, 1s6v:B, 1s6v:D, 6s8y:A, 6suy:A, 6suy:B, 5t7h:A, 5t7h:D, 5t7h:B, 5t7h:C, 5t8w:A, 5t8w:B, 3tyi:A, 3tyi:B, 1u74:B, 1u74:D, 6y0j:A, 6y0j:B, 6y0j:C, 6y0j:D, 1ycc:A, 2ycc:A, 4ye1:A, 4ye1:B, 1yfc:A, 1yic:A
2 6c4w:A 109 95 0.8737 0.7615 0.8737 8.05e-60
3 3cxh:W 112 95 0.8211 0.6964 0.8211 1.21e-57 1yea:A, 1yeb:A, 1ytc:A
4 6rgi:A 92 95 0.8211 0.8478 0.8211 3.19e-52
5 1cyc:A 103 93 0.6421 0.5922 0.6559 6.68e-44 1cyc:B, 3cyt:O, 3cyt:I, 5cyt:R, 1i54:A, 1i54:B, 1i55:A, 1i55:B, 1lfm:A, 1lfm:B
6 1akk:A 104 94 0.6316 0.5769 0.6383 4.21e-43 2b4z:A, 5c0z:A, 5c0z:D, 5c0z:B, 5c0z:C, 5c9m:A, 5c9m:D, 5c9m:B, 5c9m:C, 1crc:A, 1crc:B, 5df5:A, 5df5:B, 5df5:C, 5df5:D, 8dvx:A, 8dvx:D, 8dvx:B, 8dvx:C, 8dzl:A, 8dzl:B, 8dzl:C, 8dzl:D, 6ff5:A, 1fi7:A, 1fi9:A, 2frc:A, 1giw:A, 2giw:A, 1hrc:A, 1i5t:A, 5iy5:1, 5iy5:2, 3j2t:H, 3j2t:I, 3j2t:J, 3j2t:K, 3j2t:L, 3j2t:M, 3j2t:N, 3jbt:B, 3jbt:D, 3jbt:F, 3jbt:H, 3jbt:J, 3jbt:L, 3jbt:N, 5juy:H, 5juy:I, 5juy:J, 5juy:K, 5juy:L, 5juy:M, 5juy:N, 6k9i:A, 6k9j:A, 1lc1:A, 1lc2:A, 7ljx:A, 7ljx:B, 1m60:A, 6n1o:A, 6n1o:B, 6n1o:C, 6n1o:D, 2n3b:A, 3nbs:A, 3nbs:B, 3nbs:C, 3nbs:D, 3nbt:A, 3nbt:E, 3nbt:B, 3nbt:C, 3nbt:D, 3nbt:F, 4nfg:B, 3o1y:A, 3o1y:B, 3o1y:C, 3o20:A, 3o20:B, 3o20:C, 1ocd:A, 2pcb:B, 4rsz:A, 4rsz:B, 4rsz:C, 4rsz:D, 4rsz:E, 4rsz:F, 6suv:AaA, 6suv:BaB, 6suv:CaC, 6suv:DaD, 6suv:EaE, 6suv:FaF, 6suv:GaG, 6suv:HaH, 1u75:B, 3wc8:A, 1wej:F, 3wui:A, 5wve:B, 5wve:D, 5wve:F, 5wve:H, 5wve:J, 5wve:L, 5wve:N, 2ybb:Y, 5zkv:A
7 5dfs:A 104 94 0.6211 0.5673 0.6277 1.07e-42 5dfs:B, 6duj:A, 6duj:C, 6ecj:A, 6ecj:B, 6ecj:C, 6ecj:D, 6ecj:E, 6ecj:F, 6ecj:G, 6ecj:H, 5exq:A, 5exq:B, 1j3s:A, 2n3y:A, 2n9i:A, 2n9j:A, 3nwv:A, 3nwv:B, 3nwv:C, 3nwv:D, 5o10:A, 5o10:B, 5ty3:A, 5ty3:B, 6xnk:A, 6xnk:C, 6xnk:E, 6xnk:G, 3zcf:A, 3zcf:B, 3zcf:C, 3zcf:D, 3zoo:A, 3zoo:B, 3zoo:C, 3zoo:D
8 2aiu:A 104 94 0.6316 0.5769 0.6383 1.08e-42
9 1ccr:A 111 94 0.6000 0.5135 0.6064 7.27e-40
10 2yk3:A 110 91 0.4947 0.4273 0.5165 3.75e-33 2yk3:B, 2yk3:C
11 4dy9:A 108 91 0.4842 0.4259 0.5055 4.32e-31 4ged:B
12 1co6:A 107 92 0.4632 0.4112 0.4783 1.11e-28 1cry:A, 1io3:A
13 1hro:A 105 91 0.4316 0.3905 0.4505 6.30e-26 1hro:B
14 8ed4:I 105 94 0.4632 0.4190 0.4681 3.74e-25 8ed4:J, 8ed4:K, 8ed4:L
15 1qn2:A 99 87 0.3789 0.3636 0.4138 1.01e-20 1qn2:B, 1qn2:C
16 7tlx:1 102 90 0.3579 0.3333 0.3778 4.05e-18
17 3m97:X 118 87 0.3579 0.2881 0.3908 5.43e-17 1c7m:A, 1i6d:A, 1i6e:A, 1ql3:A, 1ql3:B, 1ql3:C, 1ql3:D, 1ql4:A, 1ql4:B, 1ql4:C, 1ql4:D
18 2c2c:A 112 98 0.3368 0.2857 0.3265 7.77e-15 3c2c:A
19 7u2v:A 114 95 0.3158 0.2632 0.3158 4.25e-12 7u2v:B
20 7txe:A 131 104 0.3263 0.2366 0.2981 5.59e-11 7txe:B
21 1fj0:A 114 107 0.3368 0.2807 0.2991 3.95e-10 1fj0:B, 1fj0:C, 1fj0:D, 1hh7:A, 1i8o:A, 1i8p:A, 1i8p:B, 1i8p:C, 1i8p:D
22 1jdl:A 118 109 0.3368 0.2712 0.2936 1.01e-09
23 2bh4:X 121 76 0.2737 0.2149 0.3421 2.12e-09 2bgv:X, 2bh5:X
24 155c:A 134 106 0.3368 0.2388 0.3019 1.83e-08 1cot:A
25 1cxa:A 124 106 0.3684 0.2823 0.3302 1.93e-08 1cxc:A, 2cxb:A, 2cxb:B, 1l9b:C, 1l9j:C, 1l9j:D
26 1c2n:A 116 103 0.2947 0.2414 0.2718 2.13e-06 1c2r:A, 1c2r:B, 1vyd:A, 1vyd:B
27 5aur:A 83 42 0.1474 0.1687 0.3333 0.001 2ai5:A, 5aur:C, 5aur:E, 5aur:G, 5aus:A, 5aus:C, 1ayg:A, 3vym:A, 1ynr:A, 1ynr:B, 1ynr:C, 1ynr:D, 4zid:A
28 2yev:B 319 92 0.2737 0.0815 0.2826 0.003 2yev:E
29 2l4d:A 106 30 0.1579 0.1415 0.5000 0.016
30 5xec:A 82 48 0.1579 0.1829 0.3125 0.048 5xed:A
31 7qhm:C 233 40 0.1474 0.0601 0.3500 0.76 7q21:C, 7q21:c, 7qhm:P, 7qho:C, 7qho:P
32 2bgl:A 267 64 0.2000 0.0712 0.2969 1.1 2bgm:A
33 3nnl:B 291 27 0.1158 0.0378 0.4074 1.9
34 3nnf:A 318 27 0.1158 0.0346 0.4074 2.1 3nnl:A
35 2w3z:A 238 28 0.1053 0.0420 0.3571 2.2
36 6xkw:p 254 65 0.2211 0.0827 0.3231 2.2 6xkx:p, 6xkz:p
37 7e1w:O 223 62 0.1684 0.0717 0.2581 2.5 7e1v:O, 7e1v:C, 7e1w:C, 7e1x:O, 7e1x:C, 8hcr:C, 8hcr:O
38 7a23:C 693 34 0.1368 0.0188 0.3824 2.8 7a24:C, 7aqr:G, 7ar7:G, 7ar8:G, 7arb:G, 8bed:G, 8bpx:G, 8bq5:G, 8bq6:G
39 6adq:C 223 26 0.1158 0.0493 0.4231 3.4 6adq:O, 6hwh:M, 6hwh:K, 8ovc:O, 8ovc:C, 8ovd:O, 8ovd:C, 7rh5:O, 7rh5:I, 7rh6:O, 7rh6:I, 7rh7:O, 7rh7:I
40 6hwh:i 162 26 0.1158 0.0679 0.4231 3.5 6hwh:j
41 6eo0:B 275 26 0.1158 0.0400 0.4231 4.7 6enx:A, 6eo0:A, 6eo0:C, 6eo0:D, 6fky:A, 6fky:B, 6fkz:A, 6fkz:B, 6flg:A, 6flg:B, 5ojo:A, 5ojo:B, 4utn:A, 4utn:B, 4utr:A, 4utr:B, 4utv:A, 4utv:B, 4utx:A, 4utx:B, 4utz:A, 4utz:B, 4uu7:A, 4uu7:B, 4uu8:A, 4uu8:B, 4uua:A, 4uua:B, 4uub:A, 4uub:B
42 6yxx:BT 173 37 0.1158 0.0636 0.2973 5.7 7aoi:BT, 6hiv:BT, 6hix:BT, 6yxy:BT
43 7bjq:B 445 29 0.1158 0.0247 0.3793 7.7 7bhi:A, 7bhi:B, 7bih:A, 7bih:B, 7bjq:A, 7bmf:A, 7bmf:B
44 6x89:S1 688 34 0.1263 0.0174 0.3529 8.1 8e73:S1
45 6eqs:D 275 26 0.1158 0.0400 0.4231 9.6 6ace:A, 6acl:A, 6aco:A, 6acp:A, 2b4y:A, 2b4y:B, 2b4y:C, 2b4y:D, 5bwl:A, 6eqs:A, 6eqs:B, 6eqs:C, 4f4u:A, 4f4u:B, 4f56:A, 4f56:B, 4g1c:A, 4g1c:B, 8gbl:A, 8gbl:B, 8gbn:A, 8gbn:B, 4hda:A, 4hda:B, 6ljk:A, 6ljm:A, 6ljn:A, 2nyr:A, 2nyr:B, 3rig:A, 3rig:B, 3riy:B, 3riy:A, 7x3p:A, 5xhs:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218