BioLiP

>protein
LEVLLGSGDGSLVFVPSEFSVPSGEKIVFKNNAGFPHNVVFDEDEIPAGVDAVKISMPEEELLNAPGETYVVTLDTKGTY
SFYCSPHQGAGMVGKVTVN

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	9pcy:A	99	99	1.0000	1.0000	1.0000	2.26e-68
2	6yez:P	99	99	0.8182	0.8182	0.8182	2.31e-56	6zoo:P
3	1ag6:A	99	99	0.8283	0.8283	0.8283	2.39e-56	1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
4	1byo:A	99	98	0.7778	0.7778	0.7857	9.77e-54	1byo:B, 1byp:A
5	4dp0:X	99	99	0.7677	0.7677	0.7677	7.20e-53	4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
6	1jxg:A	100	99	0.7778	0.7700	0.7778	1.81e-52	4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
7	1pla:A	97	98	0.7172	0.7320	0.7245	5.74e-46	1plb:A
8	2plt:A	98	97	0.5758	0.5816	0.5876	2.68e-36	7zqe:M
9	1iuz:A	98	97	0.5859	0.5918	0.5979	8.06e-34
10	7pcy:A	98	96	0.5758	0.5816	0.5938	2.33e-33
11	1j5c:A	98	98	0.4444	0.4490	0.4490	1.25e-22	1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
12	2gim:A	106	99	0.4444	0.4151	0.4444	1.87e-22	2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
13	4r0o:A	106	99	0.3838	0.3585	0.3838	2.96e-22	1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
14	1b3i:A	97	98	0.4343	0.4433	0.4388	4.67e-22	2b3i:A, 2jxm:A
15	1bxu:A	91	97	0.3535	0.3846	0.3608	3.48e-18	1bxv:A
16	2bz7:A	102	104	0.3838	0.3725	0.3654	6.88e-15	2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
17	6akn:A	124	91	0.3434	0.2742	0.3736	4.44e-09	6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
18	3c75:A	106	91	0.2626	0.2453	0.2857	1.02e-06	3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
19	1pmy:A	123	97	0.3434	0.2764	0.3505	1.81e-06
20	8k9n:A	125	102	0.2828	0.2240	0.2745	4.11e-06	8k9p:A, 3nyk:A, 2p80:D, 1paz:A, 3paz:A, 4paz:A, 5paz:A, 6paz:A, 7paz:A, 8paz:A, 1py0:A, 1pza:A, 1pzb:A, 4rh4:A, 5x31:A, 5x31:B
21	1adw:A	123	96	0.3131	0.2520	0.3229	6.21e-06	1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
22	3tu6:A	127	100	0.2929	0.2283	0.2900	1.23e-05
23	1aac:A	105	81	0.2727	0.2571	0.3333	5.74e-05	1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
24	5fc9:A	95	93	0.2323	0.2421	0.2473	0.001	5fc9:B, 5fc9:C, 5fc9:D
25	5b1j:C	124	88	0.2828	0.2258	0.3182	0.006	3ef4:A, 3ef4:B, 3ef4:C
26	4hcf:B	96	87	0.2424	0.2500	0.2759	0.14	4hcf:A, 4hcg:A, 4hcg:B
27	6hbe:C	427	80	0.2626	0.0609	0.3250	0.19	6hbe:A, 6hbe:B
28	2q9u:A	409	34	0.1212	0.0293	0.3529	2.3	2q9u:B
29	7syv:x	627	51	0.1818	0.0287	0.3529	7.0	8pj3:0, 8pj4:0, 8pj5:0, 7syw:x, 7syx:x, 7tql:1, 4ujc:AB, 4ujd:BB
30	3gs2:A	109	38	0.1212	0.1101	0.3158	8.2	3gs2:C
31	7nii:A	663	52	0.1212	0.0181	0.2308	9.4	7nii:D, 7nii:F

[Back]