Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LEQLEAQTNFTKRELQVLYRGFKNECPSGVVNEETFKQIYAQFFPHGDASTYAHYLFNAFDTTQTGSVKFEDFVTALSIL
LRGTVHEKLRWTFNLYDINKDGYINKEEMMDIVKAIYDMMGPRQHVDVFFQKMDKNKDGIVTLDEFLESCQEDDNIMRSL
QLFQNVM

The query sequence (length=167) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1s1e:A 181 178 1.0000 0.9227 0.9382 2.23e-122 2i2r:E, 2i2r:F, 2i2r:G, 2i2r:H, 2i2r:M, 2i2r:N, 2i2r:O, 2i2r:P, 2nz0:A, 2nz0:C, 1s6c:A
2 3dd4:A 214 167 0.7904 0.6168 0.7904 1.10e-103
3 7ukh:I 181 178 0.7365 0.6796 0.6910 2.13e-93 7ukh:J, 7ukh:K, 7ukh:L
4 2jul:A 181 178 0.7246 0.6685 0.6798 7.85e-91 2e6w:A
5 2lcp:A 190 178 0.4731 0.4158 0.4438 1.41e-54 5aeq:A, 5aeq:B, 5aer:A, 5afp:B, 5afp:A, 8ahy:B, 8alh:B, 8alm:B, 1g8i:A, 1g8i:B, 4guk:A, 4guk:C, 4guk:B, 4guk:D, 4ov2:A, 4ov2:B, 4ov2:C, 4ov2:D, 6qi4:B, 6qi4:C, 4yru:A, 4yru:B, 4yru:C, 4yru:D
6 5g4p:A 184 172 0.4311 0.3913 0.4186 1.79e-51 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
7 1bjf:A 181 172 0.4192 0.3867 0.4070 8.73e-50 1bjf:B
8 5aan:A 183 172 0.4431 0.4044 0.4302 1.25e-49 4by4:A, 4by4:B, 4by5:A, 4by5:B, 4by5:C, 4by5:D, 6epa:A, 5fyx:A, 5g08:A
9 1fpw:A 190 178 0.4611 0.4053 0.4326 9.69e-49 2ju0:A
10 1omr:A 201 178 0.3713 0.3085 0.3483 5.06e-36 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
11 1jba:A 189 165 0.3413 0.3016 0.3455 5.01e-32
12 2r2i:A 184 168 0.3533 0.3207 0.3512 9.08e-30
13 7m2m:A 183 161 0.3174 0.2896 0.3292 6.44e-28
14 2ggz:A 165 145 0.2695 0.2727 0.3103 5.41e-23 2ggz:B
15 1v1f:A 188 175 0.2994 0.2660 0.2857 6.67e-17 2ehb:A, 1v1g:A
16 6tz8:B 174 169 0.3174 0.3046 0.3136 7.50e-16 6tz8:E
17 5x9a:B 198 149 0.2635 0.2222 0.2953 8.95e-16 5x9a:A, 5ypx:A, 5ypx:B
18 7u0u:A 195 169 0.2934 0.2513 0.2899 9.47e-15 6tz7:B
19 1uhn:A 189 173 0.2754 0.2434 0.2659 5.65e-13 2zfd:A
20 6tz6:E 146 133 0.2515 0.2877 0.3158 1.31e-12 6tz6:B
21 5b8i:B 171 161 0.2575 0.2515 0.2671 2.97e-12
22 7u0t:A 190 149 0.2575 0.2263 0.2886 2.65e-10
23 4il1:A 529 153 0.2695 0.0851 0.2941 2.92e-10 1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
24 1tn4:A 157 96 0.1677 0.1783 0.2917 2.76e-08 1tcf:A, 2tn4:A
25 2l4h:A 184 156 0.2335 0.2120 0.2500 3.85e-08 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
26 2l4h:A 184 110 0.1497 0.1359 0.2273 2.4 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
27 1la0:A 161 153 0.2335 0.2422 0.2549 1.56e-07 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
28 1ncy:A 162 96 0.1617 0.1667 0.2812 1.71e-07 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
29 2bl0:C 142 123 0.1677 0.1972 0.2276 1.02e-06
30 2bl0:C 142 60 0.0898 0.1056 0.2500 2.5
31 8u87:A 621 129 0.1737 0.0467 0.2248 2.60e-06 8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
32 6gez:B 532 117 0.1976 0.0620 0.2821 5.58e-06 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
33 2ct9:B 198 173 0.2216 0.1869 0.2139 1.67e-05 2ct9:A, 2e30:A
34 2bec:A 181 71 0.1257 0.1160 0.2958 5.04e-05
35 8aht:A 140 115 0.1677 0.2000 0.2435 9.65e-05 8aht:B
36 8c0t:A 281 82 0.1617 0.0961 0.3293 1.29e-04
37 2pmy:A 73 59 0.1018 0.2329 0.2881 5.05e-04 2pmy:B
38 4n5x:A 155 104 0.1856 0.2000 0.2981 5.97e-04 4zcu:A, 4zcu:B, 4zcu:C, 4zcv:A, 4zcv:B, 4zcv:C, 4zcv:D
39 3q5i:A 470 95 0.1617 0.0574 0.2842 7.48e-04
40 3q5i:A 470 93 0.1257 0.0447 0.2258 4.7
41 1s6i:A 182 91 0.1497 0.1374 0.2747 0.001
42 1s6i:A 182 98 0.1377 0.1264 0.2347 0.009
43 2jnx:A 134 97 0.1796 0.2239 0.3093 0.002
44 3kf9:A 149 87 0.1377 0.1544 0.2644 0.002 3kf9:C
45 5e37:A 313 68 0.1078 0.0575 0.2647 0.002 5e37:C
46 5e37:A 313 99 0.1437 0.0767 0.2424 0.31 5e37:C
47 2lv7:A 100 62 0.1078 0.1800 0.2903 0.003
48 4mvf:A 408 94 0.1437 0.0588 0.2553 0.005 3pm8:A, 3pm8:B
49 2m28:A 72 60 0.1078 0.2500 0.3000 0.005
50 2lmt:A 148 87 0.1257 0.1419 0.2414 0.005 2lmu:A, 2lmv:A
51 3ul4:B 63 60 0.1198 0.3175 0.3333 0.010
52 4ieb:A 472 104 0.1796 0.0636 0.2885 0.012 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
53 2aao:A 147 106 0.1437 0.1633 0.2264 0.012 2aao:B
54 2aao:A 147 96 0.1198 0.1361 0.2083 1.1 2aao:B
55 2aao:A 147 91 0.1377 0.1565 0.2527 5.4 2aao:B
56 4y5q:A 449 99 0.1497 0.0557 0.2525 0.014 9d8s:A, 3igo:A, 3mwu:A, 3ncg:A, 2wei:A
57 5z1q:A 75 57 0.1018 0.2267 0.2982 0.014 5z1q:B, 5z1q:C
58 5z1q:A 75 67 0.1018 0.2267 0.2537 0.83 5z1q:B, 5z1q:C
59 8tkp:B 187 127 0.1437 0.1283 0.1890 0.014 8tkp:E, 7usw:C, 7usw:E, 7usx:C, 7usx:E, 7usy:C, 7usy:E
60 5d43:A 150 88 0.1257 0.1400 0.2386 0.014 5d43:B
61 5mwc:D 275 100 0.1497 0.0909 0.2500 0.021
62 3jq3:A 364 57 0.1257 0.0577 0.3684 0.024
63 1jfk:A 134 60 0.1257 0.1567 0.3500 0.031 3li6:A, 3li6:D, 3li6:G, 3li6:J, 2m7m:A, 2m7n:A, 2nxq:A, 2nxq:B, 3ulg:A, 3ulg:B, 5xop:A, 5xop:B, 5xop:C, 5xop:D, 5xop:E, 5xop:F
64 6tj7:A 134 71 0.1138 0.1418 0.2676 0.032
65 2lvj:A 77 74 0.0958 0.2078 0.2162 0.038 1k9u:A, 1k9u:B, 2lvk:A, 5otj:D, 5otj:C
66 1hqv:A 178 127 0.1617 0.1517 0.2126 0.041 3aaj:A, 3aaj:B, 3aak:A, 5gqq:C, 5gqq:D, 5jjg:A, 3wxa:A, 3wxa:B, 2zn8:A, 2zn9:A, 2zn9:B, 2zne:A, 2zne:B, 2zrs:A, 2zrs:B, 2zrs:C, 2zrs:D, 2zrs:E, 2zrs:F, 2zrs:G, 2zrs:H, 2zrt:A, 2zrt:B, 2zrt:C, 2zrt:D, 2zrt:E, 2zrt:F, 2zrt:G, 2zrt:H
67 1hqv:A 178 77 0.1257 0.1180 0.2727 0.093 3aaj:A, 3aaj:B, 3aak:A, 5gqq:C, 5gqq:D, 5jjg:A, 3wxa:A, 3wxa:B, 2zn8:A, 2zn9:A, 2zn9:B, 2zne:A, 2zne:B, 2zrs:A, 2zrs:B, 2zrs:C, 2zrs:D, 2zrs:E, 2zrs:F, 2zrs:G, 2zrs:H, 2zrt:A, 2zrt:B, 2zrt:C, 2zrt:D, 2zrt:E, 2zrt:F, 2zrt:G, 2zrt:H
68 8s9w:A 98 44 0.1018 0.1735 0.3864 0.046 8s9w:B
69 6wu5:B 183 159 0.2036 0.1858 0.2138 0.051 6wu5:A, 6wu7:A, 6wu7:B, 6wud:A
70 2sas:A 185 79 0.1317 0.1189 0.2785 0.054
71 2opo:C 85 69 0.1018 0.2000 0.2464 0.089 2opo:A, 2opo:B, 2opo:D
72 3khe:B 191 101 0.1617 0.1414 0.2673 0.10 3khe:A
73 3k21:A 178 98 0.1557 0.1461 0.2653 0.12
74 3k21:A 178 74 0.1078 0.1011 0.2432 4.7
75 7d3e:C 1380 54 0.0838 0.0101 0.2593 0.14 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
76 3ox5:A 153 68 0.1257 0.1373 0.3088 0.15 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
77 3qrx:A 145 94 0.1257 0.1448 0.2234 0.16 1oqp:A
78 5xnd:A 110 70 0.1138 0.1727 0.2714 0.18
79 4oci:A 139 63 0.1078 0.1295 0.2857 0.19
80 7wbo:A 193 63 0.1198 0.1036 0.3175 0.19
81 7mf3:D 158 61 0.1018 0.1076 0.2787 0.19 7mf3:E, 6z47:E, 6z47:F
82 2hps:A 184 58 0.1198 0.1087 0.3448 0.20 2hq8:A, 2hq8:B
83 2hps:A 184 55 0.0898 0.0815 0.2727 1.1 2hq8:A, 2hq8:B
84 8ebs:J 149 87 0.1198 0.1342 0.2299 0.29 2a4j:A, 8ebt:J, 8ebv:J, 8ebw:J, 8ebx:J, 2ggm:A, 2ggm:B, 2k2i:A, 2obh:A, 2obh:B
85 8ebs:J 149 109 0.1437 0.1611 0.2202 0.66 2a4j:A, 8ebt:J, 8ebv:J, 8ebw:J, 8ebx:J, 2ggm:A, 2ggm:B, 2k2i:A, 2obh:A, 2obh:B
86 2l1w:A 149 58 0.0898 0.1007 0.2586 0.32 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
87 2l1w:A 149 100 0.1377 0.1544 0.2300 1.7 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
88 3o4y:A 172 91 0.1317 0.1279 0.2418 0.33
89 3mse:B 168 96 0.1437 0.1429 0.2500 0.34
90 4qox:A 462 94 0.1557 0.0563 0.2766 0.36
91 1qx2:A 76 69 0.1257 0.2763 0.3043 0.40 1qx2:B
92 1eg4:A 260 40 0.0719 0.0462 0.3000 0.43
93 1s3p:A 109 72 0.1018 0.1560 0.2361 0.44 1xvj:A, 1xvj:B
94 4jwq:C 73 68 0.1257 0.2877 0.3088 0.49 4jwq:A
95 1qx7:M 115 76 0.1198 0.1739 0.2632 0.50
96 4l9m:A 522 55 0.1018 0.0326 0.3091 0.55
97 7clt:A 102 61 0.0958 0.1569 0.2623 0.62 7ygv:A, 7ygw:A
98 3jtd:B 156 61 0.1018 0.1090 0.2787 0.67 1b7t:Y, 3jvt:B, 1kk7:Y, 1kk8:B, 1kqm:B, 1kwo:B, 1l2o:B, 1qvi:Y, 1s5g:Y, 1scm:B, 1sr6:B, 1wdc:B
99 3e3r:A 183 52 0.0958 0.0874 0.3077 0.73 3e3r:B
100 2doq:B 149 56 0.0958 0.1074 0.2857 0.73 2doq:A, 2doq:C, 4mbe:D, 4mbe:A
101 1nya:A 176 153 0.2096 0.1989 0.2288 0.73
102 2pas:A 109 72 0.1078 0.1651 0.2500 0.82 3pat:A, 1pva:A, 1pva:B
103 2l51:A 102 26 0.0599 0.0980 0.3846 1.6 2l51:B
104 4xvi:A 647 53 0.0958 0.0247 0.3019 1.8 4xvk:A, 4xvl:A, 4xvm:A
105 6iie:A 87 42 0.0838 0.1609 0.3333 2.0
106 5hlo:C 93 25 0.0659 0.1183 0.4400 2.1 6ds2:A, 6ds2:C, 6ds2:E, 6ds2:G, 4ggf:A, 4ggf:K, 4ggf:S, 4ggf:U, 5hlo:A, 5hlo:B, 5hlo:D, 5hlv:A, 5hlv:D, 5hlv:B, 5hlv:H, 5hlv:C, 5hlv:E, 5hlv:F, 5hlv:G, 1mr8:A, 1mr8:B, 7quv:A, 8sjb:A, 8sjb:B, 8sjc:A, 8sjc:B, 5w1f:A, 5w1f:C, 5w1f:G, 5w1f:E, 4xjk:A, 4xjk:C, 4xjk:E, 4xjk:G, 4xjk:I, 1xk4:A, 1xk4:B, 1xk4:E, 1xk4:F, 1xk4:I, 1xk4:J
107 5pal:A 109 71 0.0958 0.1468 0.2254 2.3 5zgm:A, 5zgm:B
108 2scp:A 174 67 0.1078 0.1034 0.2687 2.5 2scp:B
109 4ysm:A 475 95 0.1497 0.0526 0.2632 2.6 3ma6:A, 3ma6:B, 4ysj:A, 4ysj:B, 4ysm:B, 4yuq:A, 4yuq:B, 4yzb:A, 4yzb:B
110 7d5s:B2 851 70 0.1138 0.0223 0.2714 3.0 7ajt:UL, 7d4i:B2, 7d5t:B2, 7d63:B2, 6ke6:B2, 6lqp:B2, 6lqq:B2, 6lqr:B2, 6lqs:B2, 6lqt:B2, 6lqu:B2, 6lqv:B2, 7suk:LQ, 5wlc:LQ, 6zqa:UL, 6zqb:UL, 6zqc:UL
111 1rfj:A 148 107 0.1377 0.1554 0.2150 3.2 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
112 4p5w:A 312 83 0.1437 0.0769 0.2892 3.4 4p5w:B
113 4u3s:B 156 56 0.1018 0.1090 0.3036 3.4 4wi0:B
114 3fs7:A 108 71 0.0898 0.1389 0.2113 3.7 3fs7:B, 3fs7:C, 3fs7:D, 3fs7:E, 3fs7:F, 3fs7:G, 3fs7:H
115 2m29:A 72 57 0.0958 0.2222 0.2807 3.8
116 1ht9:A 76 21 0.0599 0.1316 0.4762 4.2 1b1g:A, 1ht9:B, 3icb:A, 4icb:A, 1ig5:A, 1igv:A, 1n65:A
117 8osi:A 400 135 0.1796 0.0750 0.2222 4.2
118 4v5o:A7 104 39 0.0719 0.1154 0.3077 4.2 4bts:A7, 4bts:B7, 4bts:C7, 4bts:D7, 4v5o:B7
119 6jlh:A 261 58 0.0958 0.0613 0.2759 4.5 6jlh:C
120 6jlh:A 261 96 0.1557 0.0996 0.2708 7.3 6jlh:C
121 5ve9:B 91 22 0.0539 0.0989 0.4091 4.6 5ve9:A
122 1ebf:A 358 21 0.0659 0.0307 0.5238 4.7 1ebu:D, 1q7g:A, 1tve:A, 1tve:B
123 6xu4:A 389 136 0.1737 0.0746 0.2132 5.0 6xu4:B, 6xu4:E
124 5dvr:A 386 61 0.1078 0.0466 0.2951 6.1
125 3lij:A 465 109 0.1497 0.0538 0.2294 6.4 3l19:A, 3l19:B
126 4msp:A 189 62 0.1078 0.0952 0.2903 7.0 4msp:B
127 1s6j:A 87 50 0.0719 0.1379 0.2400 7.3
128 5y7w:A 125 53 0.1078 0.1440 0.3396 8.0 5nwx:A, 1oj5:A, 5y7w:B
129 7s9w:A 1238 42 0.0778 0.0105 0.3095 8.0
130 7s9v:A 1296 42 0.0778 0.0100 0.3095 8.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218